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生体分子の構造や相互作用を変化させる場の水和状態の解析

公募研究

研究領域水圏機能材料:環境に調和・応答するマテリアル構築学の創成
研究課題/領域番号 22H04561
研究種目

新学術領域研究(研究領域提案型)

配分区分補助金
審査区分 理工系
研究機関東京薬科大学

研究代表者

藤田 恭子  東京薬科大学, 薬学部, 講師 (90447508)

研究期間 (年度) 2022-04-01 – 2024-03-31
研究課題ステータス 完了 (2023年度)
配分額 *注記
4,680千円 (直接経費: 3,600千円、間接経費: 1,080千円)
2023年度: 2,340千円 (直接経費: 1,800千円、間接経費: 540千円)
2022年度: 2,340千円 (直接経費: 1,800千円、間接経費: 540千円)
キーワード水和状態 / イオン構造 / 生体分子 / イオン液体 / 束縛水 / 分配制御 / 構造
研究開始時の研究の概要

場の水和状況が溶解している生体分子の構造や相互作用に及ぼす影響について解析する。有機塩からなる液体であるイオン液体を用い、その構造を選択することで溶媒特性をチューニングし、さらに添加する水分子の量を調整して、水和状態を制御した場を設計する。この場に性質の異なる生体分子を溶解して、構造や相互作用に及ぼす影響を解析することで、水和状態が生体分子に及ぼす影響について系統的に検討する。

研究実績の概要

本年度は単離した膜貫通型αヘリックスタンパク質をターゲットとして、水和イオン液体中への溶解と溶解後の構造、安定性について解析を行った。溶解後の膜タンパク質の二次構造に影響を及ぼすイオン構造の共通性について基礎知見を集積した。イオン構造を選択することで水溶液中と同様の二次構造を保持した溶解が可能であることを確認した。含水率を変化させてながら解析を行うことで、二次構造が変化する含水率域の存在を確認した。光駆動型膜タンパク質であるバクテリオロドプシンを用いた検討では、二次構造だけでなくタンパク質内部に位置する発色団レチナールが水溶液中と同様の状況で存在しており、光照射に伴うプロトンポンプ輸送に伴う構造変化も水和イオン液体中でも観測された。水和イオン液体中に溶解後、検討を行った膜貫通型αヘリックスタンパク質の変性温度は水中に比べて20℃以上向上することを確認した。
また領域内共同研究を進め、各種分光法やシミュレーションを用いて水和イオン液体中の水分子について解析を行った。分子間振動バンドをプローブとするフェムト秒ラマン誘起カー効果分光により、濃度の異なる水和イオン液体の低振動数スペクトルを測定し分子間振動バンドの評価を行い、カオトロピックとコスモトロピックなアニオンでは微視的な水和構造(第二、第三溶媒和圏)が異なることを明らかにした。得られた結果はJ. Phys. Chem. Bに掲載となった。

現在までの達成度 (段落)

令和5年度が最終年度であるため、記入しない。

今後の研究の推進方策

令和5年度が最終年度であるため、記入しない。

報告書

(2件)
  • 2023 実績報告書
  • 2022 実績報告書
  • 研究成果

    (22件)

すべて 2024 2023 2022

すべて 雑誌論文 (5件) (うち国際共著 1件、 査読あり 5件、 オープンアクセス 2件) 学会発表 (15件) (うち国際学会 3件、 招待講演 2件) 図書 (1件) 産業財産権 (1件)

  • [雑誌論文] Low-Frequency Spectra of Hydrated Ionic Liquids with Kosmotropic and Chaotropic Anions2024

    • 著者名/発表者名
      Koyakkat Maharoof、Ishida Tateki、Fujita Kyoko、Shirota Hideaki
    • 雑誌名

      The Journal of Physical Chemistry B

      巻: 128 号: 17 ページ: 4171-4182

    • DOI

      10.1021/acs.jpcb.4c01255

    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Hydrated Ionic Liquids: Perspective for Bioscience2023

    • 著者名/発表者名
      Fujita Kyoko、Ohno Hiroyuki
    • 雑誌名

      The Chemical Record

      巻: 23 号: 8

    • DOI

      10.1002/tcr.202200282

    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Improved renaturation process of aggregated recombinant proteins through the design of hydrated ionic liquids2023

    • 著者名/発表者名
      Fujita Kyoko、Kobayashi Kazune、Ito Anna、Yanagisawa Shun、Ichida Kimiyoshi、Takeda Kouta、Nakamura Nobuhumi、Ohno Hiroyuki
    • 雑誌名

      Journal of Molecular Liquids

      巻: 377 ページ: 121440-121440

    • DOI

      10.1016/j.molliq.2023.121440

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Investigation of Hydration States of Ionic Liquids by Fourier Transform Infrared Absorption Spectroscopy: Relevance to Stabilization of Protein Molecules2023

    • 著者名/発表者名
      Rajapriya Inbaraj Navin、Song Subin、Chang Ryongsok、Fujita Kyoko、Hayashi Tomohiro
    • 雑誌名

      Langmuir

      巻: 39 号: 7 ページ: 2558-2568

    • DOI

      10.1021/acs.langmuir.2c02851

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] The state of water molecules induces changes in the topologies and interactions of G-quadruplex DNA aptamers in hydrated ionic liquid2022

    • 著者名/発表者名
      Fujita Kyoko、Honda Takuya、Tsukakoshi Kaori、Ohno Hiroyuki、Ikebukuro Kazunori
    • 雑誌名

      Journal of Molecular Liquids

      巻: 366 ページ: 120175-120175

    • DOI

      10.1016/j.molliq.2022.120175

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [学会発表] Low-Frequency Spectrum in Hydrated Ionic Liquids Having Different Kosmotropicity: Water Concentration Dependence2024

    • 著者名/発表者名
      9th International Discussion Meeting on Relaxations in Complex Systems Makuhari Messe, Chiba, Japan, 12th Aug 2023-18th Aug 2023, poster Maharoof Koyakkat, Kyoko Fujita, Hideaki Shirota
    • 学会等名
      17th DAE-BRNS Biennial Trombay Symposium on Radiation and Photochemistry
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Improved renaturation process of aggregated recombinant proteins through the design of hydrated ionic liquids2023

    • 著者名/発表者名
      Kyoko Fujita, Kazune Kobayashi, Anna Ito, Shun Yanagisawa, Kimiyoshi Ichida, Kouta Takeda, Nobuhumi Nakamura, Hiroyuki Ohno
    • 学会等名
      Improved renaturation process of aggregated recombinant proteins through the design of hydrated ionic liquids, 9th Congress on Ionic Liquids
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Low-Frequency Spectra of Hydrated Ionic Liquids Having Different Kosmotropicity2023

    • 著者名/発表者名
      Maharoof Koyakkat, Kyoko Fujita, Hideaki Shirota
    • 学会等名
      9th International Discussion Meeting on Relaxations in Complex System
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] バイオサイエンス分野における水和イオン液体の可能性2023

    • 著者名/発表者名
      藤田恭子
    • 学会等名
      日本薬剤学会第38年会
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Solubility and Structural Changes of Biomolecules as a Function of Water Content in Hydrated Ionic Liquids2023

    • 著者名/発表者名
      Kyoko Fujita
    • 学会等名
      第61回生物物理学会
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Water Concentration Dependence of Low-Frequency Spectrum in Hydrated Ionic Liquids Having Different Kosmotropicity2023

    • 著者名/発表者名
      Maharoof Koyakkat, Kyoko Fujita, Hideaki Shirota
    • 学会等名
      The 17th annual Meeting of Japan Society for Molecular Science
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
  • [学会発表] 水和イオン液体中におけるDNAアプタマーと標的分子の結合検出2023

    • 著者名/発表者名
      藤田 恭子、筑肱 秀紀、稲葉 真太朗、池袋 一典
    • 学会等名
      電気化学会第91回大会
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
  • [学会発表] 水和イオン液体中におけるDNAアプタマーと標的分子の結合解析2023

    • 著者名/発表者名
      筑肱 秀紀、稲葉 真太朗、誉田 拓也、塚越 かおり、大野 弘幸、池袋 一典
    • 学会等名
      日本薬学会第144年会
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
  • [学会発表] 水和イオン液体中における膜タンパク質の構造と熱安定性2023

    • 著者名/発表者名
      石井 佳穂、武部 豊、小林 和音、市田 公美、溝端 栄一、藤田 恭子
    • 学会等名
      日本化学会第103春季年会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] アンモニウム系イオン液体/緩衝液の二相系におけるタンパク質の分配解析2023

    • 著者名/発表者名
      佐々木 大吾、小林 和音、木本 祐一朗、市田 公美、藤田 恭子
    • 学会等名
      日本化学会第103春季年会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] 水和イオン液体を用いたセルラーゼ凝集体の溶解・リフォールディングに及ぼすイオン構造と含水量の影響2022

    • 著者名/発表者名
      小林 和音、伊藤 杏奈、柳澤 峻、市田 公美、藤田 恭子
    • 学会等名
      第71回高分子学会年次大会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] Low-Frequency Spectra of Hydrated Ionic Liquid with Various Water Concentrations2022

    • 著者名/発表者名
      Maharoof Koyakkat, Kyoko Fujita, Hideaki Shirota
    • 学会等名
      第44回溶液化学シンポジウム
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] 異なるアルキル鎖長を有するホスホニウム系及びアンモニウム系イオン液体の細胞毒性の評価2022

    • 著者名/発表者名
      須田 涼介、西山 貴仁、溝口 莉菜、河野 加奈美、大沼 友和、小倉 健一郎、藤田 恭子、市田 公美、山折 大
    • 学会等名
      第49回 日本毒性学会学術年会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] 水和イオン液体中の水和状態による核酸ア プタマーの四重鎖構造と相互作用変化2022

    • 著者名/発表者名
      藤田 恭子、誉田 拓也、塚越 かおり、大野 弘幸、池袋 一典
    • 学会等名
      第12回イオン液体討論会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] Hydration state of protein-stabilizing ionic liquids probed by ATR-IR and NMR spectroscopy2022

    • 著者名/発表者名
      Navin Rajapriya Inbaraj,Subin Song, Ryongsok Chang, Kyoko Fujita, Tomohiro Hayashi
    • 学会等名
      第12回イオン液体討論会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [図書] イオン液体の実用展開へ向けた最新動向2022

    • 著者名/発表者名
      藤田 恭子
    • 総ページ数
      7
    • 出版者
      シーエムシー出版
    • ISBN
      9784781316741
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [産業財産権] 膜タンパク質の安定化のための液体組成物および方法2023

    • 発明者名
      藤田 恭子,溝端 栄一,古谷 祐詞
    • 権利者名
      藤田 恭子,溝端 栄一,古谷 祐詞
    • 産業財産権種類
      特許
    • 産業財産権番号
      2023-030067
    • 出願年月日
      2023
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書

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公開日: 2022-04-19   更新日: 2024-12-25  

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