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酸素非発生型の光合成反応中心-アンテナ超複合体の高速分子動画解析

公募研究

研究領域高速分子動画法によるタンパク質非平衡状態構造解析と分子制御への応用
研究課題/領域番号 22H04754
研究種目

新学術領域研究(研究領域提案型)

配分区分補助金
審査区分 複合領域
研究機関岡山大学

研究代表者

菅 倫寛  岡山大学, 異分野基礎科学研究所, 教授 (60634920)

研究期間 (年度) 2022-04-01 – 2024-03-31
研究課題ステータス 完了 (2023年度)
配分額 *注記
11,180千円 (直接経費: 8,600千円、間接経費: 2,580千円)
2023年度: 5,720千円 (直接経費: 4,400千円、間接経費: 1,320千円)
2022年度: 5,460千円 (直接経費: 4,200千円、間接経費: 1,260千円)
キーワードX線自由電子レーザー / 光合成 / 時間分解 / ダイナミクス / 高速分子動画 / 膜タンパク質 / X線自由レーザー
研究開始時の研究の概要

光合成細菌の行う酸素非発生型の光合成では、光合成反応中心が光エネルギーを高い効率で吸収し、電子を受け渡すことで反応が始まります。本研究では光合成反応中心と集光アンテナ複合体Iの超複合体の結晶をX線自由電子レーザーの技術で解析することで、これまでの解析技術では捉えることができなかった、光エネルギーを吸収した後の非常に速い立体構造の動きを明らかにすることを目指しています。この解析に必要な微小な結晶を得ることに成功しているので、これらの結晶の品質を改善して立体構造解析を行います。

研究実績の概要

光合成細菌の光合成反応中心(RC)は集光アンテナ複合体I(LH1)と超複合体をとっており、光エネルギーを高い効率で吸収して、電子伝達鎖を駆動し酸素非発生型の光合成の初発の反応を開始する。本研究ではLH1-RC超複合体を対象としX線自由電子レーザーを用いて時間分解シリアルフェムト秒結晶構造解析して励起後の構造解析を明らかにすることを目指し、本学術領域の第1期においてLH1-RC超複合体の微小結晶を作成することができるようになった。そこで今期は結晶の品質を改善してデータ収集と解析を行うことを目指した。

時間分解シリアルフェムト秒結晶構造解析に必要なLH1-RC超複合体の微小結晶を大量に調製することができるようになったので微小結晶を用いて室温でのシリアルフェムト秒構造解析を実施した。限られた実験時間の中で、5データセットを収集した。いずれも構造解析可能なデータではあったが、結晶の品質が室温では不安定なため、低分解能のデータしか収集できなかった。解析の結果、電子密度マップにてキノンやクロロフィルなどのリガンドを確認することができた。また並行して進めた光化学系IIのS状態遷移に関わる構造変化を時間分割シリアルフェムト秒で解析し、責任著者として論文にまとめた。また光化学系IIの変異体に関する構造解析内容を論文にまとめた。

現在までの達成度 (段落)

令和5年度が最終年度であるため、記入しない。

今後の研究の推進方策

令和5年度が最終年度であるため、記入しない。

報告書

(2件)
  • 2023 実績報告書
  • 2022 実績報告書
  • 研究成果

    (9件)

すべて 2024 2022 その他

すべて 雑誌論文 (3件) (うち国際共著 1件、 査読あり 3件、 オープンアクセス 2件) 学会発表 (5件) (うち国際学会 3件、 招待講演 4件) 備考 (1件)

  • [雑誌論文] Oxygen-evolving photosystem II structures during S1-S2-S3 transitions2024

    • 著者名/発表者名
      Li Hongjie、Nakajima Yoshiki、Nango Eriko、Owada Shigeki、Yamada Daichi、Tosha Takehiko、Tono Kensuke、Joti Yasumasa、Hatsui Takaki、Yabashi Makina、Kubo Minoru、Iwata So、Isobe Hiroshi、Yamaguchi Kizashi、Suga Michihiro、Shen Jian-Ren
    • 雑誌名

      Nature

      巻: 626 号: 7999 ページ: 670-677

    • DOI

      10.1038/s41586-023-06987-5

    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Crystal structures of photosystem II from a cyanobacterium expressing psbA in comparison to psbA reveal differences in the D1 subunit2022

    • 著者名/発表者名
      Nakajima Yoshiki、Ugai-Amo Natsumi、Tone Naoki、Nakagawa Akiko、Iwai Masako、Ikeuchi Masahiko、Sugiura Miwa、Suga Michihiro、Shen Jian-Ren
    • 雑誌名

      Journal of Biological Chemistry

      巻: 298 号: 12 ページ: 102668-102668

    • DOI

      10.1016/j.jbc.2022.102668

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Geometric, electronic and spin structures of the CaMn4O5 catalyst for water oxidation in oxygen-evolving photosystem II. Interplay between experiments and theoretical computations2022

    • 著者名/発表者名
      Yamaguchi Kizashi、Shoji Mitsuo、Isobe Hiroshi、Kawakami Takashi、Miyagawa Koichi、Suga Michihiro、Akita Fusamichi、Shen Jian-Ren
    • 雑誌名

      Coordination Chemistry Reviews

      巻: 471 ページ: 214742-214742

    • DOI

      10.1016/j.ccr.2022.214742

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] Structural dynamics and substrate binding to the oxygen-evolving complex studied by time-resolved X-ray crystallography of PSII2022

    • 著者名/発表者名
      菅 倫寛
    • 学会等名
      10th Asian Biological Inorganic Chemnistry Conference
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Time-resolved structural studies on photosystem II2022

    • 著者名/発表者名
      菅 倫寛
    • 学会等名
      The 22nd annual meeting of the photobiology association of Japan
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] X線自由電子レーザーを用いた解析におる光化学系IIの基質水分子の取り込みと水分子の酸化に関する構造的知見2022

    • 著者名/発表者名
      菅 倫寛, 中島芳樹, リホンジェ, 沈 建仁
    • 学会等名
      第60回 生物物理学会年会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] Time-resolved structural studies on photosystem II provide insights into the mechanism of water oxidation and substrate delivery2022

    • 著者名/発表者名
      菅 倫寛
    • 学会等名
      Satellite Meeting to 18th international congress on photosynthesis research 2022: Mechanism of water oxidation
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] X-ray free electron lasers reveal the molecular mechanism for water oxidation in photosystem II2022

    • 著者名/発表者名
      菅 倫寛
    • 学会等名
      International congress on photosynthesis research 2022
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [備考] 光合成を担う“ゆがんだイス”型の触媒が、水分子を取り込む瞬間をナノ秒レベルで捉えることに成功!

    • URL

      https://www.okayama-u.ac.jp/tp/release/release_id1185.html

    • 関連する報告書
      2023 実績報告書

URL: 

公開日: 2022-04-19   更新日: 2024-12-25  

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