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ヒザラガイの磁鉄鉱歯特異的な鉄酸化酵素の機能解明

公募研究

研究領域「生命金属科学」分野の創成による生体内金属動態の統合的研究
研究課題/領域番号 22H04812
研究種目

新学術領域研究(研究領域提案型)

配分区分補助金
審査区分 複合領域
研究機関岡山大学

研究代表者

根本 理子  岡山大学, 環境生命自然科学学域, 准教授 (30625926)

研究期間 (年度) 2022-04-01 – 2024-03-31
研究課題ステータス 完了 (2023年度)
配分額 *注記
5,720千円 (直接経費: 4,400千円、間接経費: 1,320千円)
2023年度: 2,860千円 (直接経費: 2,200千円、間接経費: 660千円)
2022年度: 2,860千円 (直接経費: 2,200千円、間接経費: 660千円)
キーワードヒザラガイ / ヘファエスチン / 鉄酸化酵素 / 磁鉄鉱 / バイオミネラリゼーション
研究開始時の研究の概要

軟体動物の一種であるヒザラガイは歯舌と呼ばれる摂餌器官を持ち、その歯冠部に磁鉄鉱を沈着させる。本研究では、申請者が同定した歯冠部特異的に局在する鉄酸化酵素について、遺伝子ノックダウン、組換えタンパク質を用いた活性評価、および抗体を用いた局在解析を行ない、同タンパク質の磁鉄鉱形成における役割を明らかにする。

研究実績の概要

2023年度に遺伝子ノックダウン実験を複数回実施した結果、ノックダウン個体、および陰性対照ともに発現量のばらつきが大きい結果となった。ヘファエスチン様タンパク質の遺伝子は、これまで遺伝子ノックダウンを行った他の遺伝子に比べて歯舌組織における発現量が低く、ゲノムDNA混入の影響を大きく受ける事が明らかになった為、現在用いている歯舌組織からのRNA抽出方法の見直しを行い、より純度の高いRNAを多く抽出できる方法を検討した。また、RNAに混入したゲノムDNAの影響を最小限にするため、遺伝子ノックダウン後に発現量定量に用いている定量PCR用のプライマーについても、イントロンを跨ぐプライマーを再設計し、再度遺伝子ノックダウン実験を行っている。さらに今後の遺伝子ノックダウン個体の表現型解析のため、歯舌組織のPIXE(Particle Induced X-ray Emission)分析を実施した。その結果、PIXE分析によりヒザラガイ歯舌組織の鉄の分布を評価可能であることが示された。
GALプロモーターよりも強力なプロモーターであるWTC846プロモーターを用いて磁鉄鉱歯特異的フェロキシダーゼを酵母に組み換え発現させる系を構築した。組み換え酵母の破砕液を用いたフェロキシダーゼ活性評価の結果、GALプロモーターを用いた場合は全く活性が確認されなかったのに対し、WTC846プロモーターを用いて組み換え発現した場合に、わずかに時間依存的なFe2+の減少を示す結果が得られ、フェロキシダーゼ活性が確認された。そこでWTC846プロモーターを用いて組み換え発現させた磁鉄鉱歯特異的フェロキシダーゼの精製を試みたが、活性評価に用いる十分量のタンパク質を得ることができなかった。そのため、より多くの組み換えタンパク質が得られる昆虫細胞発現系に変更し、実験を進めている。

現在までの達成度 (段落)

令和5年度が最終年度であるため、記入しない。

今後の研究の推進方策

令和5年度が最終年度であるため、記入しない。

報告書

(2件)
  • 2023 実績報告書
  • 2022 実績報告書
  • 研究成果

    (20件)

すべて 2024 2023 2022

すべて 雑誌論文 (7件) (うち国際共著 4件、 査読あり 6件、 オープンアクセス 2件) 学会発表 (12件) (うち国際学会 3件、 招待講演 5件) 図書 (1件)

  • [雑誌論文] The Multiphasic Teeth of <i>Chiton Articulatus</i>, an Abrasion‐Resistant and Self‐Sharpening Tool for Hard Algae Collection2024

    • 著者名/発表者名
      Montroni Devis、Sarmiento Ezra、Zhao Ruoheng、Dasika Phani Saketh、Connolly John Michael、Wuhrer Richard、Zhang Yugang、Zhernenkov Mikhail、Wang Taifeng、Ramirez‐Santana Brenda Paola、Sheppard Leigh、Avila‐Poveda Omar Hernando、Arakaki Atsushi、Nemoto Michiko、Zavattieri Pablo、Kisailus David
    • 雑誌名

      Advanced Functional Materials

      巻: 2401658 号: 33

    • DOI

      10.1002/adfm.202401658

    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Nuclear Transformation of the Marine Pennate Diatom Nitzschia sp. Strain NIES-4635 by Multi-Pulse Electroporation2023

    • 著者名/発表者名
      Okada Koki、Morimoto Yu、Shiraishi Yukine、Tamura Takashi、Mayama Shigeki、Kadono Takashi、Adachi Masao、Ifuku Kentaro、Nemoto Michiko
    • 雑誌名

      Marine Biotechnology

      巻: 25 号: 6 ページ: 1208-1219

    • DOI

      10.1007/s10126-023-10273-w

    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] オミクス解析に基づく生体鉱物形成関連タンパク質の同定2023

    • 著者名/発表者名
      根本理子
    • 雑誌名

      化学と生物

      巻: 61 ページ: 439-444

    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
  • [雑誌論文] Mesocrystalline Ordering and Phase Transformation of Iron Oxide Biominerals in the Ultrahard Teeth of <i>Cryptochiton stelleri</i>2022

    • 著者名/発表者名
      Wang Taifeng、Huang Wei、Pham Cong Huy、Murata Satoshi、Herrera Steven、Kirchhofer Nathan D.、Arkook Bassim、Stekovic Dejan、Itkis Mikhail E.、Goldman Nir、Zepeda-Ruiz Luis、Freychet Guillaume、Zhernenkov Mikhail、Nemoto Michiko、Arakaki Atsushi、Kisailus David
    • 雑誌名

      Small Structures

      巻: 3 号: 4 ページ: 2100202-2100202

    • DOI

      10.1002/sstr.202100202

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Nanoarchitected Tough Biological Composites from Assembled Chitinous Scaffolds2022

    • 著者名/発表者名
      Huang Wei、Montroni Devis、Wang Taifeng、Murata Satoshi、Arakaki Atsushi、Nemoto Michiko、Kisailus David
    • 雑誌名

      Accounts of Chemical Research

      巻: 55 号: 10 ページ: 1360-1371

    • DOI

      10.1021/acs.accounts.2c00110

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] Evaluation of the Geenius HIV 1/2 confirmatory assay for HIV-2 samples isolated in Japan2022

    • 著者名/発表者名
      Shigemi Urara、Yamamura Yoshimi、Matsuda Masakazu、Okazaki Reiko、Kubota Mai、Ibe Shiro、Nemoto Michiko、Maejima-Kitagawa Masami、Sukegawa Sayaka、Imahashi Mayumi、Kikuchi Tadashi、Sugiura Wataru、Iwatani Yasumasa、Hachiya Atsuko、Yokomaku Yoshiyuki
    • 雑誌名

      Journal of Clinical Virology

      巻: 152 ページ: 105189-105189

    • DOI

      10.1016/j.jcv.2022.105189

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Fibrous anisotropy and mineral gradients within the radula stylus of chiton: Controlled stiffness and damage tolerance in a flexible biological composite2022

    • 著者名/発表者名
      Lee Jung-Eun、Connolly John、Yang Wen、Freychet Guillaume、Wang Taifeng、Herrera Steven A、Murata Satoshi、Dasika Phani Saketh、Montroni Devis、Pohl Anna、Zhu Chenhui、Zhernenkov Mikhail、Wuhrer Richard、Sheppard Leigh、Nemoto Michiko、Arakaki Atsushi、Zavattieri Pablo、Kisailus David
    • 雑誌名

      Journal of Composite Materials

      巻: 57 号: 4 ページ: 565-574

    • DOI

      10.1177/00219983221121867

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 査読あり / 国際共著
  • [学会発表] ヒザラガイにおける鉄濃縮・沈着メカニズムの解析2024

    • 著者名/発表者名
      根本理子
    • 学会等名
      第65回日本植物生理学会年会
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 驚異的な鉄代謝能力を持つヒザラガイの鉄濃縮・沈着メカニズムの解析2024

    • 著者名/発表者名
      根本理子
    • 学会等名
      日本農芸化学会2024年大会創立100周年記念式典
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 海洋性Nitzschia属珪藻NOH-41株のエレクトロポレーション法による形質転換系の確立2023

    • 著者名/発表者名
      岡田航輝、森本佑、白石幸音、田村隆、角野貴志、足立真佐雄、伊福健太郎、根本理子
    • 学会等名
      第23回マリンバイオテクノロジー学会
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
  • [学会発表] ヒザラガイによる鉄濃縮・沈着機構の解析2023

    • 著者名/発表者名
      根本理子
    • 学会等名
      第47回日本鉄バイオサイエンス学会学術集会
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] ヒザラガイRTMP1ホモログの遺伝子ノックダウンが磁鉄鉱歯形成に及ぼす影響の評価2023

    • 著者名/発表者名
      赤嶺 晴香、金尾 忠芳、田村隆、鈴木 道生、David Kisailus、大越健嗣、根本理子
    • 学会等名
      第75回日本生物工学会大会
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
  • [学会発表] 生体鉱物形成に関わるタンパク質に関する研究2023

    • 著者名/発表者名
      根本理子
    • 学会等名
      農芸化学会中四国支部第64回支部講演会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] RNA干渉法を用いたヒザラガイのRTMP1ホモログ遺伝子の 機能解析2022

    • 著者名/発表者名
      赤嶺晴香
    • 学会等名
      第 22 回マリンバイオテクノロジー学会大会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] Identification of proteins involved in chiton tooth biomineralization by RNA-seq-based analyses2022

    • 著者名/発表者名
      Michiko Nemoto
    • 学会等名
      Gordon Research Conference Biomineralization
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Exploration of genes involved in radular teeth formation in chitons by cross-species transcriptome comparison2022

    • 著者名/発表者名
      Koki Okada
    • 学会等名
      Gordon Research Conference Biomineralization
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] ヒザラガイの磁鉄鉱歯形成関連タンパク質の同定2022

    • 著者名/発表者名
      根本理子
    • 学会等名
      第33回日本微量元素学会学術集会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] Exploration of genes involved in magnetite teeth formation in chitons by transcriptome comparison2022

    • 著者名/発表者名
      Koki Okada
    • 学会等名
      10th Asian Biological Inorganic Chemistry Conference
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] ヒザラガイ歯舌の磁鉄鉱形成関連タンパク質の同定2022

    • 著者名/発表者名
      根本理子
    • 学会等名
      動物学会 岡山県例会企画セミナー
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [図書] 貝の疑問502023

    • 著者名/発表者名
      根本理子(分担執筆)
    • 総ページ数
      211
    • 出版者
      成山堂書店
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書

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公開日: 2022-04-19   更新日: 2024-12-25  

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