研究領域 | 超地球生命体を解き明かすポストコッホ機能生態学 |
研究課題/領域番号 |
22H04886
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研究種目 |
新学術領域研究(研究領域提案型)
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配分区分 | 補助金 |
審査区分 |
複合領域
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研究機関 | 関西大学 |
研究代表者 |
岡野 憲司 関西大学, 化学生命工学部, 准教授 (40623335)
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研究期間 (年度) |
2022-04-01 – 2024-03-31
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研究課題ステータス |
完了 (2023年度)
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配分額 *注記 |
8,710千円 (直接経費: 6,700千円、間接経費: 2,010千円)
2023年度: 4,420千円 (直接経費: 3,400千円、間接経費: 1,020千円)
2022年度: 4,290千円 (直接経費: 3,300千円、間接経費: 990千円)
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キーワード | 菌叢改変 / ペプチド核酸 / 細胞膜透過ペプチド / バクテリオファージ / 膜透過ペプチド / 菌叢 |
研究開始時の研究の概要 |
本申請課題では、細胞膜透過ペプチドとペプチド核酸の融合体であるCPP-PNAを用いた菌叢改変技術を開発し、微生物増殖連関解析に応用する。モデル菌叢を用いた技術開発に始まり、実菌叢中の既知CPP-PNAが有効な微生物への技術適用、有効なCPP-PNA配列が明らかでない微生物への技術適用と徐々に一般化を図り、試験圃場由来の土壌菌叢の微生物増殖連関を明らかにする。
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研究実績の概要 |
土壌に棲息する微生物たちは、各々の相互作用により巨大なエコシステムを形成し、地球の元素循環や植物の生育を促進する。多くの微生物間相互作用は、微生物の増殖に対して正または負に作用するため、菌叢微生物の増殖連関を知ることが、生態系の理解と制御の第一歩となる。そこで、本申請課題では、菌叢の標的微生物のみを不活化させる菌叢改変技術を開発し、標的微生物の不活化に伴って増殖を変化させる微生物(群)を明らかとするというコンセプトのもと、種々の菌叢改変技術の開発を行った。 一つ目の技術として、標的微生物の必須遺伝子mRNAに結合し細胞死を誘導するアンチセンスペプチド核酸(PNA)に、細胞膜の透過作用のあるペプチド(CPP)を付加した複合材料(CPP-PNA)の利用を試みた。Escherichia coli、Pseudomonas putida、Pseudomonas fluorescens、Lactiplantibacillus plantarumの4菌からなる人工菌叢の改変を行った結果、E. coliおよびP. putidaの生育を抑制することに成功した。また、P. putidaの生育抑制に伴いP. flutorescensの増殖が向上し、L. plantarumの増殖が抑制されることがわかった。従って、本技術が微生物の増殖連関を解析する手法としても有効であることが示された。 また、微生物に感染し溶菌するバクテリオファージを用いた菌叢改変技術の開発も行った。E. coli、P. putida、Bacillus subtilis、L. plantarumの4菌に感染するファージを土壌や下水から単離し、これらの菌からなる人工菌叢の改変を行った。その結果、4菌の増殖を選択的に抑制することができた。今後、これらの技術を実菌叢に対して利用することで、微生物間の増殖連関が明らかになると期待できる。
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現在までの達成度 (段落) |
令和5年度が最終年度であるため、記入しない。
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今後の研究の推進方策 |
令和5年度が最終年度であるため、記入しない。
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