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自在C-H結合官能基化を達成する人工金属酵素のデジタル設計的開発

公募研究

研究領域デジタル化による高度精密有機合成の新展開
研究課題/領域番号 22H05364
研究種目

学術変革領域研究(A)

配分区分補助金
審査区分 学術変革領域研究区分(Ⅱ)
研究機関大阪大学

研究代表者

大洞 光司  大阪大学, 大学院工学研究科, 准教授 (10631202)

研究期間 (年度) 2022-06-16 – 2024-03-31
研究課題ステータス 完了 (2023年度)
配分額 *注記
8,060千円 (直接経費: 6,200千円、間接経費: 1,860千円)
2023年度: 4,030千円 (直接経費: 3,100千円、間接経費: 930千円)
2022年度: 4,030千円 (直接経費: 3,100千円、間接経費: 930千円)
キーワード人工酵素 / 触媒 / 物質変換
研究開始時の研究の概要

本研究では、自在物質変換反応の実現をめざして、高活性な金属錯体とタンパク質マトリクスを組み合わせ、高活性かつ高選択性を達成する人工金属酵素を開発する。 具体的には、生体内で難易度の高いC-H結合水酸化反応を触媒する天然金属酵素(シトクロムP450)の反応性を参考に、C-H結合官能基化反応に高い触媒能を示す活性中心となる金属錯体と機械学習により設計したタンパク質マトリクスを組み合わせた人工金属酵素を調製し、評価する。高活性で、高い立体・位置選択性、さらには反応性を凌駕する官能基選択性を示す触媒系の自在設計法を開拓する。

研究実績の概要

持続可能社会の実現に向けて、環境調和型かつ貴金属を含まない触媒を用いた物資変換反応が注目されている。この条件は酵素と類似しているが、その一方で天然酵素の多くは基質適用範囲が狭く、有機合成への利用は限られている。本研究では、自在物質変換反応の実現をめざして、高活性な金属錯体とタンパク質マトリクスを組み合わせ、高活性かつ高選択的を達成する人工金属酵素の開発およびその設計法の確立を目的としている。本年度は前年度に探索した金属錯体とタンパク質マトリクスの組み合わせから、活性の高かったシトクロムP450あるいはミオグロビンと鉄ポルフィセンの組み合わせを選択した。特にC-H結合のアミノ化反応に注力して調査した。ミオグロビンの変異体では、三級のC-H結合に対し、最大数千の触媒回転数を示し、有効な人工金属酵素であることを確認した。シトクロムP450に関しては軸配位子を網羅的に変異導入し、その中からアスパラギン酸を軸配位子とする変異体が高い活性を示すことを確認した。シトクロムP450では二級のC-H結合のアミノ化を試みた。複数の変異点から有力な箇所を選定し、網羅的に一重変異体を作成し、それらの触媒活性、立体選択性を調べた。これらのデータと配列のみのデータから機械学習を実施し、多重変異体の予測を実施した。最終的に10倍を超える活性を示す変異体を発見した。また機械学習が変異体探索を加速させることを確認した。今後はより一般化した設計手法に展開することで、様々な反応に有用な人工金属酵素の開発に貢献すると期待される。これらの成果の一部は国際学術誌に学術論文として発表し、また学会等でも発表を行ない、高い評価を得た。

現在までの達成度 (段落)

令和5年度が最終年度であるため、記入しない。

今後の研究の推進方策

令和5年度が最終年度であるため、記入しない。

報告書

(2件)
  • 2023 実績報告書
  • 2022 実績報告書
  • 研究成果

    (19件)

すべて 2024 2023 2022 その他

すべて 国際共同研究 (2件) 雑誌論文 (5件) (うち国際共著 1件、 査読あり 5件、 オープンアクセス 4件) 学会発表 (10件) (うち国際学会 6件、 招待講演 5件) 備考 (2件)

  • [国際共同研究] RWTH Aachen(ドイツ)

    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
  • [国際共同研究] University of Groningen(オランダ)

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [雑誌論文] Intramolecular C-H bond amination catalyzed by myoglobin reconstituted with iron porphycene2024

    • 著者名/発表者名
      Kagawa Yoshiyuki、Oohora Koji、Hayashi Takashi
    • 雑誌名

      Journal of Inorganic Biochemistry

      巻: 252 ページ: 112459-112459

    • DOI

      10.1016/j.jinorgbio.2023.112459

    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Ethylbenzene oxidation by a hybrid catalysis system of reconstituted myoglobin and silica-protected PdAu nanoparticles under a hydrogen-oxygen mixed atmosphere2023

    • 著者名/発表者名
      Oohora Koji、Kagawa Yoshiyuki、Kuwahara Yasutaka、Yamashita Hiromi、Hayashi Takashi
    • 雑誌名

      Journal of Porphyrins and Phthalocyanines

      巻: 27 号: 07n10 ページ: 1313-1319

    • DOI

      10.1142/s1088424623500906

    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Rational design of an artificial ethylbenzene hydroxylase using a molecular dynamics simulation to enhance enantioselectivity2023

    • 著者名/発表者名
      Oohora Koji、Kagawa Yoshiyuki、Nishiura Takako、Mizohata Eiichi、Schwaneberg Ulrich、Hayashi Takashi
    • 雑誌名

      Chemistry Letters

      巻: 53 号: 2

    • DOI

      10.1093/chemle/upad042

    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Disulfide Bond-mediated Oligomerization of a Green Fluorescent Protein in Solution2023

    • 著者名/発表者名
      Soon Julian Wong、Oohora Koji、Uchihashi Takayuki、Hayashi Takashi
    • 雑誌名

      Chemistry Letters

      巻: 52 号: 2 ページ: 105-109

    • DOI

      10.1246/cl.220495

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] A disulphide bond-mediated hetero-dimer of a hemoprotein and a fluorescent protein exhibiting efficient energy transfer2022

    • 著者名/発表者名
      Soon Julian Wong、Oohora Koji、Hayashi Takashi
    • 雑誌名

      RSC Advances

      巻: 12 号: 44 ページ: 28519-28524

    • DOI

      10.1039/d2ra05249k

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [学会発表] Hemoprotein Assembly Containing Porphyrinoid Photosensitizers Toward an Artificial Light- Harvesting System2023

    • 著者名/発表者名
      Koji Oohora
    • 学会等名
      15th International Conference on Tetrapyrrole Photoreceptors in Photosynthetic Organisms
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] 鉄ポルフィセン錯体を含む再構成ヘムタンパク質によるC-H結合アミノ化触媒反応2023

    • 著者名/発表者名
      大洞 光司、香川佳之、林 高史
    • 学会等名
      第56回酸化反応討論会
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
  • [学会発表] Catalytic C-H bond amination by engineered hemoproteins containing iron porphycene as an artificial cofactor2023

    • 著者名/発表者名
      香川佳之、大洞光司、林 高史
    • 学会等名
      日本化学会 第103春季年会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] ヘムタンパク質の補因子置換による人工金属酵素の開発2023

    • 著者名/発表者名
      大洞光司、林 高史
    • 学会等名
      日本薬学会 第143年会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Construction of Stimuli-responsive Materials Containing a Metalloporphyrin- Peptide Conjugate as a Building Block2022

    • 著者名/発表者名
      Koji Oohora, Takashi Hayashi
    • 学会等名
      International Conference on Metal-Binding Peptides: Methodologies and Applications
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Reconstituted Myoglobin with Corrole Metal Complexes and its Reactivity toward Hydrogen Peroxide2022

    • 著者名/発表者名
      Koji Oohora, Takashi Hayashi
    • 学会等名
      Twelfths International Conference on Porphyrins and Phthalocyanines
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] 鉄ポルフィセン錯体を補因子として有するヘムタンパク質を用いたC-H結合アミノ化反応2022

    • 著者名/発表者名
      香川佳之、大洞光司、林 高史
    • 学会等名
      第16回バイオ関連化学シンポジウム
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] Catalytic C-H bond amination by hemoproteins reconstituted with iron porphycene2022

    • 著者名/発表者名
      Yoshiyuki Kagawa, Koji Oohora, Takashi Hayashi
    • 学会等名
      Active Enzyme Molecule 2022
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Hydrogen Peroxide-dependent Catalytic C-H Bond Hydroxylation by Hemoprotein Reconstituted with Mn Porphyrcene2022

    • 著者名/発表者名
      Koji Oohora, Takashi Hayashi
    • 学会等名
      10th Asian Biological Inorganic Chemistry Conference
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Catalytic amination of C-H bond by hemoproteins reconstituted with iron porphycene2022

    • 著者名/発表者名
      Yoshiyuki Kagawa, Koji Oohora, Takashi Hayashi
    • 学会等名
      10th Asian Biological Inorganic Chemistry Conference
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 国際学会
  • [備考]

    • URL

      http://www.applied-bioinorganic.jp/jp/profile/oohora/

    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
  • [備考] 大阪大学大学院工学研究科応用化学専攻林研究室

    • URL

      http://www.chem.eng.osaka-u.ac.jp/~hayashiken/index.html

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書

URL: 

公開日: 2022-06-20   更新日: 2024-12-25  

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