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合成分子と生体分子によって超越する遺伝子発現光制御システムの構築

公募研究

研究領域生物を陵駕する無細胞分子システムのボトムアップ構築学
研究課題/領域番号 22H05425
研究種目

学術変革領域研究(A)

配分区分補助金
審査区分 学術変革領域研究区分(Ⅱ)
研究機関大阪大学

研究代表者

蓑島 維文  大阪大学, 大学院工学研究科, 准教授 (20600844)

研究期間 (年度) 2022-06-16 – 2024-03-31
研究課題ステータス 完了 (2023年度)
配分額 *注記
9,620千円 (直接経費: 7,400千円、間接経費: 2,220千円)
2023年度: 4,810千円 (直接経費: 3,700千円、間接経費: 1,110千円)
2022年度: 4,810千円 (直接経費: 3,700千円、間接経費: 1,110千円)
キーワード光スイッチングリガンド / 転写制御 / フォトクロミック分子 / 合成生物学 / 光応答性色素 / 多剤結合転写因子
研究開始時の研究の概要

本研究では生体分子、低分子化合物、光を用いて可逆的に遺伝子発現を制御できる手法の構築に取り組む。天然の細胞が持たない、光の波長に応じた高い効率の遺伝子発現の活性化、不活性化の制御をシンプルな系で実現することを目指す。

研究実績の概要

細胞内における遺伝子発現は転写調節因子によって発現量が巧妙に調節されており、細胞機能を維持するための基盤となるシステムといえる。そのため、外部刺激を利用した転写量の自在な制御法を再構築できれば、無細胞も含めたさまざまな遺伝子発現系を任意に動かすことが可能となる。光は範囲、時間、量を選択して照射することができるため、時空間的な操作が可能な外部刺激源として生命活動の制御に利用されている。そこで、本研究では、光応答性のリガンドを利用した遺伝子発現の光制御システムの開発を行うことを目的とした。
近年超解像イメージング等へ応用されているphotoactivatableな蛍光色素に着目し、細菌由来の薬剤排出に関わる転写因子の機能と組み合わせることで光応答性の遺伝子発現制御システムの構築に取り組んだ。この転写因子は通常は対応するDNA配列に結合することで薬剤排出に関連する遺伝子を制御するリプレッサーとしてはたらいている。ここにリガンドが結合すると、DNAから解離し、下流の遺伝子発現が活性化される。芳香環を有するカチオン性の化合物がリガンドとしてはたらくことが知られており、光照射によってカチオン性を示す色素をリガンドとして利用できるのではないかと考えた。
上記のデザインに基づき、光応答性リガンドとなるphotoactivatableな色素を合成した。光照射を行ったところ速やかに変換が起こり、発色団の形成に伴い蛍光の大幅な増大が確認された。光照射前後における転写因子タンパク質との結合を評価したところ、光照射後の化合物は強く結合することが確認された、続いて無細胞転写系による遺伝子発現量を評価したところ、光照射後ではmRNA量の増加が見られ、本遺伝子発現制御システムの光駆動化に成功した。

現在までの達成度 (段落)

令和5年度が最終年度であるため、記入しない。

今後の研究の推進方策

令和5年度が最終年度であるため、記入しない。

報告書

(2件)
  • 2023 実績報告書
  • 2022 実績報告書
  • 研究成果

    (21件)

すべて 2024 2023 2022

すべて 雑誌論文 (13件) (うち国際共著 7件、 査読あり 11件、 オープンアクセス 5件) 学会発表 (6件) (うち国際学会 2件、 招待講演 2件) 産業財産権 (2件)

  • [雑誌論文] Activatable 19F MRI probe for detection of α-amylase activity2024

    • 著者名/発表者名
      Konishi Yuki、Otera Yuya、Minoshima Masafumi、Kikuchi Kazuya
    • 雑誌名

      Chemistry Letters

      巻: 53 号: 1

    • DOI

      10.1093/chemle/upae003

    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Rational Design of Hydroxylated Thiazole Orange Photocages for Green Light‐Triggered DNA Recombination2024

    • 著者名/発表者名
      Hashimoto Ryu、Minoshima Masafumi、Kikuchi Kazuya
    • 雑誌名

      ChemBioChem

      巻: 25 号: 4

    • DOI

      10.1002/cbic.202300799

    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Recent advancements of fluorescent biosensors using semisynthetic probes2024

    • 著者名/発表者名
      Reja Shahi Imam、Minoshima Masafumi、Hori Yuichiro、Kikuchi Kazuya
    • 雑誌名

      Biosensors and Bioelectronics

      巻: 247 ページ: 115862-115862

    • DOI

      10.1016/j.bios.2023.115862

    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] Elastic Polymer Coated Nanoparticles with Fast Clearance for 19F MR Imaging2023

    • 著者名/発表者名
      Konishi Yuki、Minoshima Masafumi、Fujihara Kohei、Uchihashi Takayuki、Kikuchi Kazuya
    • 雑誌名

      Angewandte Chemie International Edition

      巻: 62 号: 40

    • DOI

      10.1002/anie.202308565

    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Development of a Versatile Protein Labeling Tool for Live‐Cell Imaging Using Fluorescent β‐Lactamase Inhibitors2023

    • 著者名/発表者名
      Minoshima Masafumi、Umeno Taro、Kadooka Kohei、Roux Margaux、Yamada Namiko、Kikuchi Kazuya
    • 雑誌名

      Angewandte Chemie International Edition

      巻: 62 号: 18

    • DOI

      10.1002/anie.202301704

    • 関連する報告書
      2023 実績報告書 2022 実績報告書
    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] 生命機能を可視化するさまざまな化学蛍光プローブ2023

    • 著者名/発表者名
      蓑島維文、菊地和也
    • 雑誌名

      医学のあゆみ 生体イメージングの最前線

      巻: 286 ページ: 337-342

    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
  • [雑誌論文] MRIの現在と未来-マルチカラー19F MRIがもたらすもの2023

    • 著者名/発表者名
      小西祐輝、蓑島維文、菊地和也
    • 雑誌名

      化学12月号

      巻: 12 ページ: 62-63

    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
  • [雑誌論文] JAK inhibition ameliorates bone destruction by simultaneously targeting mature osteoclasts and their precursors2023

    • 著者名/発表者名
      Yari et al.
    • 雑誌名

      Inflammation and Regeneration

      巻: 43 号: 1 ページ: 18-18

    • DOI

      10.1186/s41232-023-00268-4

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Recent Advances in Activatable 19F Magnetic Resonance Imaging Nano‐Probes for the Detection of Biomarkers2022

    • 著者名/発表者名
      Salaam Jeremy、Minoshima Masafumi、Kikuchi Kazuya
    • 雑誌名

      Analysis & Sensing

      巻: 3 号: 4

    • DOI

      10.1002/anse.202200081

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] Hybrid, dual visible and near-infrared fluorescence emission of (6,5) single-walled carbon nanotubes modified with fluorescein through aryl diazonium salt chemistry2022

    • 著者名/発表者名
      Tomczyk Mateusz Michal、Minoshima Masafumi、Kikuchi Kazuya、Blacha-Grzechnik Agata、Starosolski Zbigniew、Bhavane Rohan、Zalewski Mariusz、Kuznik Nikodem
    • 雑誌名

      Nanotechnology

      巻: 34 号: 5 ページ: 055703-055703

    • DOI

      10.1088/1361-6528/ac9c6a

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Photoinitiator‐Free Two‐Photon Polymerization of Biocompatible Materials for 3D Micro/Nanofabrication2022

    • 著者名/発表者名
      Nakayama Atsushi、Kumamoto Yasuaki、Minoshima Masafumi、Kikuchi Kazuya、Taguchi Atsushi、Fujita Katsumasa
    • 雑誌名

      Advanced Optical Materials

      巻: 10 号: 18 ページ: 2200474-2200474

    • DOI

      10.1002/adom.202200474

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Efficient visible/NIR light-driven uncaging of hydroxylated thiazole orange-based caged compounds in aqueous media2022

    • 著者名/発表者名
      Hashimoto Ryu、Minoshima Masafumi、Sakata Souhei、Ono Fumihito、Ishii Hirokazu、Watakabe Yuki、Nemoto Tomomi、Yanaka Saeko、Kato Koichi、Kikuchi Kazuya
    • 雑誌名

      Chemical Science

      巻: 13 号: 25 ページ: 7462-7467

    • DOI

      10.1039/d2sc02364d

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] pH‐Sensitive Polymethacrylates as Potential Contrast Agents in 19F MRI2022

    • 著者名/発表者名
      Zalewski Mariusz、Janasik Dawid、Kapala Anna、Minoshima Masafumi、Sugihara Fuminori、Raj Wojciech、Pietrasik Joanna、Kikuchi Kazuya、Krawczyk Tomasz
    • 雑誌名

      Macromolecular Chemistry and Physics

      巻: 223 号: 14 ページ: 2200027-2200027

    • DOI

      10.1002/macp.202200027

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 査読あり / 国際共著
  • [学会発表] Development of pH-activatable Fluorescent Probes for in vivo Imaging-based Analysis of Osteoclastic Bone Resorption2023

    • 著者名/発表者名
      Masafumi Minoshima, Hatsune Miki, Yasutaka Yoshimura, Kazuya Kikuchi
    • 学会等名
      EMBL symposium: seeing is believing: imaging the molecular processes of life
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] β-ラクタマーゼ阻害剤を用いたタンパク質ラベル化法の開発とオートファジーに伴うタンパク質動態の可視化2023

    • 著者名/発表者名
      蓑島維文、梅野太朗、門岡康平、Margaux Roux、山田菜美子、菊地和也
    • 学会等名
      日本分子イメージング学会 第17回学術集会
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
  • [学会発表] Development of 19F Magnetic Resonance Imaging Probe for in vivo Sensing Biomarkers2022

    • 著者名/発表者名
      Masafumi Minoshima
    • 学会等名
      ASBIC10
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] β-ラクタマーゼ阻害剤を用いた タンパク質ラベル化プローブの開発とオートファジー検出への応用2022

    • 著者名/発表者名
      蓑島維文、梅野太朗、門岡康平、菊地和也
    • 学会等名
      日本ケミカルバイオロジー学会第16回年会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] 入れ替わり可能な蛍光プローブを用いた タンパク質標識法の開発2022

    • 著者名/発表者名
      蓑島維文、Shahi Imam Reja, 粟津利邦、神原丈敏、飯嶋康平、岨稔康、岡田康志、菊地和也
    • 学会等名
      第16回バイオ関連化学シンポジウム
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] 入れ替わり可能な蛍光標識法を利用した分子モーター解析2022

    • 著者名/発表者名
      蓑島維文
    • 学会等名
      第11回分子モーター討論会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 招待講演
  • [産業財産権] タンパク質間相互作用を可視化する方法2024

    • 発明者名
      蓑島維文、Jiatong Li、菊地和也
    • 権利者名
      蓑島維文、Jiatong Li、菊地和也
    • 産業財産権種類
      特許
    • 出願年月日
      2024
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
  • [産業財産権] タンパク質を蛍光標識する方法2023

    • 発明者名
      蓑島維文,飯嶋航平,Shahi Imam Reja,菊地和也
    • 権利者名
      蓑島維文,飯嶋航平,Shahi Imam Reja,菊地和也
    • 産業財産権種類
      特許
    • 産業財産権番号
      2023-034762
    • 出願年月日
      2023
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書

URL: 

公開日: 2022-06-20   更新日: 2024-12-25  

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