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非ドメイン型バイオポリマーによるクロマチン制御と発がん機構の解明

公募研究

研究領域非ドメイン型バイオポリマーの生物学:生物の柔軟な機能獲得戦略
研究課題/領域番号 22H05592
研究種目

学術変革領域研究(A)

配分区分補助金
審査区分 学術変革領域研究区分(Ⅲ)
研究機関金沢大学

研究代表者

西山 正章  金沢大学, 新学術創成研究機構, 教授 (50423562)

研究期間 (年度) 2022-06-16 – 2024-03-31
研究課題ステータス 完了 (2023年度)
配分額 *注記
9,360千円 (直接経費: 7,200千円、間接経費: 2,160千円)
2023年度: 4,680千円 (直接経費: 3,600千円、間接経費: 1,080千円)
2022年度: 4,680千円 (直接経費: 3,600千円、間接経費: 1,080千円)
キーワード液-液相分離 / 発がん
研究開始時の研究の概要

クロマチンリモデリング因子CHDは、1)エピゲノム制御分子である、2)がんの原因遺伝子である、ことがわかっている。申請者はこの2点に加え、今回CHDが相分離することを世界ではじめて発見した。これら3点から、『CHDの相分離は高次クロマチン構造を制御しており、相分離不全によるエピジェネティック異常が発がんの原因になる』と推定した。この仮説を証明するために、CHDの相分離機能を喪失した変異体を用いてCHD相分離が高次クロマチン構造維持にどのように関わるのかを特定し、発がんのメカニズムを解明することを目指す。

研究実績の概要

ゲノムDNAへのアクセスを制御するクロマチンダイナミクスは、細胞運命決定過程における遺伝子転写など、さまざまな核内プロセスにおいて重要な役割を果たしている。クロマチンリモデラーは、ヌクレオソーム内のヒストンとDNAの結合を変化させることにより、クロマチンの再編成を制御する。CHDはクロマチンリモデラーのCHDファミリーに属し、遺伝子転写の制御におけるその重要性が広範な研究によって明らかにされている。CHDは、活性化した遺伝子プロモーターに取り込まれ、そこでクロマチン構造を開いた状態に保ち、転写の開始と伸長の両方においてRNAポリメラーゼⅡの活性をサポートする。CHD遺伝子の機能不全や変異は、がんや神経発達障害と関連している。特に前立腺がんでは、約8-18%の症例でCHDの機能喪失が観察され、細胞状況に応じて遺伝子発現に広範な変化をもたらしている。しかしながら、CHDの異常ががんの発生に寄与する正確なメカニズムは、まだ部分的にしか解明されていない。
われわれは、CHDのC末端の天然変性領域(IDR)を欠損した切断型タンパク質を産生するE1321フレームシフト変異の詳細な解析を通して、クロマチンリモデラーで起こる相分離例を初めて発見した。この変異は、C末端のIDRを欠損したトランケーションタンパク質を産生する。このトランケーションは、凝縮特性の喪失をもたらし、転写および腫瘍形成におけるがん原性障害を伴っていた。近接ビオチン化により、CHDの縮重依存性インタラクトームは、新生RNA、ロングノンコーディングRNA、ヒストン修飾タンパク質から構成されていることが明らかになり、エピジェネティックな過程への多面的な関与が明らかになった。MLLヒストンリジンメチルトランスフェラーゼは、CHDコンデンセートに関連しており、CHDとの有意な共変異を示し、腫瘍形成における両者の協調的役割を示唆した。

現在までの達成度 (段落)

令和5年度が最終年度であるため、記入しない。

今後の研究の推進方策

令和5年度が最終年度であるため、記入しない。

報告書

(2件)
  • 2023 実績報告書
  • 2022 実績報告書
  • 研究成果

    (11件)

すべて 2024 2023 2022 その他

すべて 雑誌論文 (5件) (うち国際共著 1件、 査読あり 5件、 オープンアクセス 4件) 学会発表 (4件) (うち招待講演 4件) 図書 (1件) 備考 (1件)

  • [雑誌論文] The complex etiology of autism spectrum disorder due to missense mutations of CHD82024

    • 著者名/発表者名
      Shiraishi Taichi、Katayama Yuta、Nishiyama Masaaki、Shoji Hirotaka、Miyakawa Tsuyoshi、Mizoo Taisuke、Matsumoto Akinobu、Hijikata Atsushi、Shirai Tsuyoshi、Mayanagi Kouta、Nakayama Keiichi I.
    • 雑誌名

      Molecular Psychiatry

      巻: - 号: 7 ページ: 2145-2160

    • DOI

      10.1038/s41380-024-02491-y

    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Chromatin remodeler CHD8 is required for spermatogonial proliferation and early meiotic progression2024

    • 著者名/発表者名
      Nitahara Kenta、Kawamura Atsuki、Kitamura Yuka、Kato Kiyoko、Namekawa Satoshi H、Nishiyama Masaaki
    • 雑誌名

      Nucleic Acids Research

      巻: 52 号: 6 ページ: 2995-3010

    • DOI

      10.1093/nar/gkad1256

    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Classification of multiple emotional states from facial expressions in head-fixed mice using a deep learning-based image analysis2023

    • 著者名/発表者名
      Tanaka Y, Nakata T, Hibino H, Nishiyama M, Ino D
    • 雑誌名

      PLoS ONE

      巻: 18 号: 7 ページ: e0288930-e0288930

    • DOI

      10.1371/journal.pone.0288930

    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Deletion of the autism-related gene Chd8 alters activity-dependent transcriptional responses in mouse postmitotic neurons2023

    • 著者名/発表者名
      Kawamura Atsuki、Nishiyama Masaaki
    • 雑誌名

      Communications Biology

      巻: 6 号: 1 ページ: 593-593

    • DOI

      10.1038/s42003-023-04968-y

    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] A fluorescent sensor for real-time measurement of extracellular oxytocin dynamics in the brain2022

    • 著者名/発表者名
      Daisuke Ino, Yudai Tanaka, Hiroshi Hibino, and Masaaki Nishiyama
    • 雑誌名

      Nature Methods

      巻: 19 号: 10 ページ: 1286-1294

    • DOI

      10.1038/s41592-022-01597-x

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [学会発表] ヒト型モデル動物を用いた自閉症の神経回路の同定と治療法開発への応用2024

    • 著者名/発表者名
      西山 正章
    • 学会等名
      第17回自閉症学研究会
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Identification of neural circuitry in autism spectrum disorder using human-animal models2023

    • 著者名/発表者名
      Masaaki Nishiyama
    • 学会等名
      第64回日本神経病理学会総会学術研究会/第66回日本神経化学会大会 合同大会
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 自閉症の発症メカニズムの解明と創薬開発への応用 自閉症は大人になっても治せるか?2022

    • 著者名/発表者名
      西山正章
    • 学会等名
      第7回連合大学院小児発達学研究科セミナー
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] ヒト型モデル動物を用いた自閉症の神経回路の同定と治療法開発への応用2022

    • 著者名/発表者名
      西山正章
    • 学会等名
      浜松医科大学研究戦略セミナー
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 招待講演
  • [図書] 論文図表を読む作法2022

    • 著者名/発表者名
      西山正章
    • 総ページ数
      288
    • 出版者
      羊土社
    • ISBN
      9784758122603
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [備考] 金沢大学医薬保健研究域医学系 組織細胞学

    • URL

      http://ana1.w3.kanazawa-u.ac.jp/

    • 関連する報告書
      2023 実績報告書 2022 実績報告書

URL: 

公開日: 2022-06-20   更新日: 2024-12-25  

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