• 研究課題をさがす
  • 研究者をさがす
  • KAKENの使い方
  1. 前のページに戻る

NMRによる電位依存性イオンチャネルの動的構造と機能発現機構の解明

公募研究

研究領域揺らぎが機能を決める生命分子の科学
研究課題/領域番号 23107708
研究種目

新学術領域研究(研究領域提案型)

配分区分補助金
審査区分 理工系
研究機関東京大学

研究代表者

大澤 匡範  東京大学, 薬学研究科(研究院), 助教 (60361606)

研究期間 (年度) 2011-04-01 – 2013-03-31
研究課題ステータス 完了 (2012年度)
配分額 *注記
7,020千円 (直接経費: 5,400千円、間接経費: 1,620千円)
2012年度: 3,510千円 (直接経費: 2,700千円、間接経費: 810千円)
2011年度: 3,510千円 (直接経費: 2,700千円、間接経費: 810千円)
キーワード電位依存性イオンチャネル / 構造揺らぎ / NMR / KcsA / VSOP / 電位センサードメイン / ポアドメイン
研究実績の概要

電位依存性イオンチャネルは、膜電位に応じてイオンの膜透過性を変えることにより活動電位などの生理現象において中心的な役割を担っている。一般に電位依存性イオンチャネルは、電位センサードメイン(VSD)と、イオン透過路(細胞内ゲートおよびイオン選択性フィルター(SF))を有するポアドメイン(PD)からなる。本研究では、VSD を有しPD を持たない電位依存性プロトンチャネルVSOP と、PD のみからなるpH 依存性カリウムチャネルKcsA を解析対象とし、溶液NMR 法を用い、電位依存性イオンチャネルの機能に直結したVSD とPD の構造揺らぎの解明を目的とする。

1 KcsAをディスク状の脂質二重膜に再構成し、NMRにより構造揺らぎを解析したところ、膜環境に摂動を与えるトリフルオロエタノールを添加した際に、その構造平衡が不活性型から活性型にシフトした。平面二重膜上での電気生理解析では、NMR解析と同じ濃度のトリフルオロエタノール添加時に、チャネルの開口確立の増大が観測された。このことは、KcsAの構造揺らぎが膜環境に依存して変化することを示している。イオンチャネルが機能するときの構造変化・構造揺らぎを、部位特異的にとらえることに初めて成功した。

2 VSOP(VSD)のIle, Leu, Valの1残基変異体のスペクトルと野生型のスペクトルを比較することにより、メチル基の帰属を行った。また、メチル基間のNOEの解析を行うことにより、電位依存性イオンチャネルの静止状態の立体構造を解明することに成功した。

現在までの達成度 (段落)

24年度が最終年度であるため、記入しない。

今後の研究の推進方策

24年度が最終年度であるため、記入しない。

報告書

(2件)
  • 2012 実績報告書
  • 2011 実績報告書
  • 研究成果

    (17件)

すべて 2013 2012 2011 その他

すべて 雑誌論文 (7件) (うち査読あり 7件) 学会発表 (7件) 図書 (1件) 備考 (2件)

  • [雑誌論文] Backbone resonance assignments for the cytoplasmic region of the Mg(2+) transporter MgtE in the Mg (2+)-unbound state2013

    • 著者名/発表者名
      Maruyama T, Imai S, Osawa M, Hattori M, Ishitani R, Nureki O, Shimada I.
    • 雑誌名

      Biomol NMR Assign

      巻: 7 号: 1 ページ: 93-96

    • DOI

      10.1007/s12104-012-9385-y

    • 関連する報告書
      2012 実績報告書 2011 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Functional equilibrium of the KcsA structure revealed by NMR2012

    • 著者名/発表者名
      Imai S, Osawa M, Mita K, Toyonaga S, Machiyama A, Ueda T, Takeuchi K, Oiki S, Shimada I.
    • 雑誌名

      J Biol Chem

      巻: 287 号: 47 ページ: 39634-39641

    • DOI

      10.1074/jbc.m112.401265

    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Biological role of the two overlapping poly(A)-binding protein interacting motifs 2 (PAM2) of eukaryotic releasing factor eRF3 in mRNA decay.2012

    • 著者名/発表者名
      Osawa M, Hosoda N, Nakanishi T, Uchida N, Kimura T, Imai S, Machiyama A, Katada T, Hoshino S, Shimada I.
    • 雑誌名

      RNA

      巻: 18 号: 11 ページ: 1957-1967

    • DOI

      10.1261/rna.035311.112

    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Functional dynamics of proteins revealed by solution NMR2012

    • 著者名/発表者名
      Osawa M, Takeuchi K, Ueda T, Nishida N, Shimada I.
    • 雑誌名

      Curr Opin Struct Biol

      巻: 22 号: 5 ページ: 660-669

    • DOI

      10.1016/j.sbi.2012.08.007

    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Spatial distribution of cytoplasmic domains of the Mg(2+)-transporter MgtE, in a solution lacking Mg(2+), revealed by paramagnetic relaxation enhancement2012

    • 著者名/発表者名
      Imai S, Maruyama T, Osawa M, Hattori M, Ishitani R, Nureki O, Shimada I.
    • 雑誌名

      Biochim Biophys Acta

      巻: 1824 号: 10 ページ: 1129-1135

    • DOI

      10.1016/j.bbapap.2012.06.008

    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Structural basis for the modulation of the gating property of G protein-gated inwardly rectifying potassium ion channel (GIRK)by the i/o-family G protein α subunit (Gdi_<i/o>)2012

    • 著者名/発表者名
      間瀬瑶子
    • 雑誌名

      The Journal of Biological Chemistry

      巻: 287 号: 23 ページ: 19537-19549

    • DOI

      10.1074/jbc.m112.353888

    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Backbone resonance assignments for G protein α(i3) subunit in the GTP-bound state2012

    • 著者名/発表者名
      Mase Y, Yokogawa M, Osawa M, Shimada I.
    • 雑誌名

      Biomol NMR Assign

      巻: 6 号: 2 ページ: 217-220

    • DOI

      10.1007/s12104-012-9361-6

    • 関連する報告書
      2012 実績報告書 2011 実績報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] ATP effect on Mg2+-dependent gating of a Mg2+ channel MgtE2012

    • 著者名/発表者名
      Maruyama T, Imai S, Osawa M, Hattori M, Ishitani R, Nureki O, Shimada I.
    • 学会等名
      第85回日本生化学会大会
    • 発表場所
      福岡国際会議場(福岡)
    • 年月日
      2012-12-14
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] Structural basis for modulation of gating property of G protein-gated inwardly rectifying potassium ion channel (GIRK) by i/o-family G protein α subunit (Gαi/o).2012

    • 著者名/発表者名
      Mase Y, Yokogawa M, Osawa M, Shimada I.
    • 学会等名
      The XXVth International Conference on Magnetic Resonance
    • 発表場所
      Lyon (フランス)
    • 年月日
      2012-08-19
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] Structural Elucidation of Mg2+-dependent Gating Mechanism of a Mg2+ Transporter MgtE2012

    • 著者名/発表者名
      Maruyama T, Imai S, Osawa M, Hattori M, Ishitani R, Nureki O, Shimada I.
    • 学会等名
      The XXVth International Conference on Magnetic Resonance
    • 発表場所
      Lyon (フランス)
    • 年月日
      2012-08-19
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] Structural analyses of the gating mechanism of inwardly rectifying potassium channel2012

    • 著者名/発表者名
      Y. Toyama, M. Osawa, M. Yokogawa, S. Toyanaga, A, Machiyama, I. Shimada
    • 学会等名
      Program for Young Researcher Symposium in Europe
    • 発表場所
      Oxford (英国)
    • 年月日
      2012-06-06
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] Structural analyses of the gating mechanism of inwardly rectifying potassium channel2012

    • 著者名/発表者名
      Y. Toyama, M. Osawa, M. Yokogawa, S. Toyanaga, A, Machiyama, I. Shimada
    • 学会等名
      第12回 日本蛋白質科学会年会
    • 発表場所
      名古屋国際会議場 (愛知)
    • 年月日
      2012-06-02
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] Structural investigation of voltage-sensing mechanism of voltage-dependent K^+ channels2011

    • 著者名/発表者名
      原田瞳, 大澤匡範, 小澤新一郎, 木村友美, 野崎智裕, 嶋田一夫
    • 学会等名
      第34回日本分子生物学会年会
    • 発表場所
      パシフィコ横浜(神奈川県)
    • 年月日
      2011-12-14
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] Structural basis for the inhibition of voltage-dependent potassium (Kv) channels by gating modifier toxins2011

    • 著者名/発表者名
      小澤新一郎, 大澤匡範, 木村友美, 原田瞳, 野崎智裕, 嶋田一夫
    • 学会等名
      第34回日本分子生物学会年会
    • 発表場所
      パシフィコ横浜(神奈川県)
    • 年月日
      2011-12-14
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [図書] 【試料分析講座】「蛋白質の分析」, 分析化学会2012

    • 著者名/発表者名
      大澤匡範、今井駿輔、嶋田一夫.
    • 総ページ数
      34
    • 出版者
      丸善
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [備考] 東京大学大学院薬学系研究科機能薬学専攻 生体分子機能学大講座 生命物理化学教室

    • URL

      http://ishimada.f.u-tokyo.ac.jp/public_html/index_j.html

    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [備考]

    • URL

      http://ishimada.f.u-tokyo.ac.jp/public_html/index_j.html

    • 関連する報告書
      2011 実績報告書

URL: 

公開日: 2011-04-06   更新日: 2018-03-28  

サービス概要 検索マニュアル よくある質問 お知らせ 利用規程 科研費による研究の帰属

Powered by NII kakenhi