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1分子リフォールディング実験によるミオグロビンの天然ー変性状態の揺らぎの解析

公募研究

研究領域揺らぎが機能を決める生命分子の科学
研究課題/領域番号 23107711
研究種目

新学術領域研究(研究領域提案型)

配分区分補助金
審査区分 理工系
研究機関北陸先端科学技術大学院大学

研究代表者

川上 勝  北陸先端科学技術大学院大学, マテリアルサイエンス研究科, 准教授 (70452117)

研究期間 (年度) 2011-04-01 – 2013-03-31
研究課題ステータス 完了 (2012年度)
配分額 *注記
5,850千円 (直接経費: 4,500千円、間接経費: 1,350千円)
2012年度: 2,730千円 (直接経費: 2,100千円、間接経費: 630千円)
2011年度: 3,120千円 (直接経費: 2,400千円、間接経費: 720千円)
キーワードミオグロビン / 1分子測定 / メカニカルアンフォールディング / リフォールディング / 原子間力顕微鏡 / 1分子計測 / フォールディング
研究実績の概要

24年度は、23年度に引き続き、ミオグロビンのホロ体に対し、1分子力学測定(メカニカルアンフォールディング)実験を行い、ミオグロビンをN末、C末方向から引っ張る事で、分子の力学安定性を調べ、さらに、メカニカルアンフォールディングがどの様に進行するかを調べた。300余りのアンフォールディングデータを調べた結果、ホロ体のミオグロビンは、張力に対し、まずその全体構造を30pN程度の張力までは保持し、その後、一斉に構造が壊れる、すなわちアンフォールディングピークが一度のみ出現する場合に加えて、第二、第三のアンフォールディングピークを伴う、すなわち構造は一度に全て壊れるのではなく、いくつかの中間体を経てメカニカルアンフォールディングが頻繁に起こる事を発見した。これらは、ミオグロビンのアンフォールディング経路が同時に複数存在することを示している。ミオグロビンがこのように複数の経路を取る事が出来る理由として、ミオグロビンの天然状態が、いくつかの準安定状態間を揺らいでおり、それぞれの状態に関して経路が決まっているためではないかと考えられる。さらには、この経路には、ヘムとの相互作用が大きく関わっている事が示唆される。
次にホロ体のメカニカルアンフォールディング実験を進展させ、グロビン鎖を引っ張って壊す事でヘムを一旦解離させ、張力を緩めて再びミオグロビンをリフォールディングさせるという実験を行う事で、ミオグロビンのアポ体のメカニカルアンフォールディング実験を実現した。その結果、アポ体のアンフォールディング経路はホロ体とは異なり、中間体を経ない、協同的なアンフォールディングのみであることを見出した。つまりヘムとの相互作用を失った状態の分子は、アンフォールディング中間体を経ずに壊れる事が分かり、上述の仮説を強く支持する結果が得られた。

現在までの達成度 (段落)

24年度が最終年度であるため、記入しない。

今後の研究の推進方策

24年度が最終年度であるため、記入しない。

報告書

(2件)
  • 2012 実績報告書
  • 2011 実績報告書
  • 研究成果

    (14件)

すべて 2012 2011 その他

すべて 雑誌論文 (5件) (うち査読あり 4件) 学会発表 (5件) (うち招待講演 1件) 図書 (2件) 備考 (2件)

  • [雑誌論文] Mechanical Unfolding Studies of Protein Molecules2012

    • 著者名/発表者名
      Yukinori Taniguchi, Akiko Kobayashi and Masaru Kawakami
    • 雑誌名

      BIOPHYSICS

      巻: 8 号: 11 ページ: 51-58

    • DOI

      10.1371/journal.pone.0049003

    • NAID

      130002061597

    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Prying open single GroES ring complexes by force reveals co-operativity across domains2012

    • 著者名/発表者名
      Akiko Ikeda-Kobayashi, Yukinori Taniguchi, David J.Brockwell, Emanuele Paci, Isao Sakane, Yasushi Kawata, Masaru Kawakami
    • 雑誌名

      Biophysical Journal

      巻: 102 号: 8 ページ: 1961-1968

    • DOI

      10.1016/j.bpj.2012.03.046

    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Recent advances in single-molecule biophysics with the use of Atomic Force Microscopy2012

    • 著者名/発表者名
      Masaru Kawakami and Yukinori Taniguchi
    • 雑誌名

      Advances in Chemical Physics

      巻: 146 ページ: 89-132

    • DOI

      10.1002/9781118131374.ch5

    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [雑誌論文] Mechanical unfolding studies of protein molecules2012

    • 著者名/発表者名
      Taniguchi, Yukinori; Kobayashi, Akiko; Kawakami, Masaru
    • 雑誌名

      BIOPHYSICS

      巻: 8 ページ: 51-58

    • DOI

      10.2142/biophysics.8.51

    • NAID

      130002061597

    • ISSN
      1349-2942
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書 2011 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] メカニカルアンフォールディング研究の最前線‐タンパク質を引っ張ってみてわかること‐2011

    • 著者名/発表者名
      谷口, 幸範; 小林, 亜紀子; 川上, 勝
    • 雑誌名

      生物物理

      巻: 51 号: 4 ページ: 168-173

    • DOI

      10.2142/biophys.51.168

    • NAID

      10029140069

    • ISSN
      0582-4052, 1347-4219
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] Mechanical Unfolding Pathways of Holo-myoglobin Explored by AFM-based Single Molecule Force Spectroscopy2012

    • 著者名/発表者名
      Yoshida Aya and Masaru Kawakami
    • 学会等名
      Indo-Japan Joint Workshop on “Recent Advances in Spectroscopy and Microscopy: Fundamentals and Applications to Materials and Biology”
    • 発表場所
      ハイデラバード、インド
    • 年月日
      2012-11-20
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Mechanotransduction uncovered by single molecule force spectroscopy2012

    • 著者名/発表者名
      Masaru Kawakami
    • 学会等名
      7th international Conference on High Pressure Bioscience and Biotechnology
    • 発表場所
      大津
    • 年月日
      2012-10-30
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] AFMを用いたホロミオグロビンの一分子力学計測によるアンフォールディング経路の探索2012

    • 著者名/発表者名
      吉田文、川上勝
    • 学会等名
      第50回日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      名古屋大学
    • 年月日
      2012-09-22
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] 生体分子の1分子ダイナミクス測定2011

    • 著者名/発表者名
      川上勝
    • 学会等名
      ATIバイオSPM研究会
    • 発表場所
      リゾーピア熱海(招待講演)
    • 年月日
      2011-09-28
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] 1分子動的力学測定法によるタンパク質分子の生物学的機能の探索2011

    • 著者名/発表者名
      川上勝
    • 学会等名
      日本顕微鏡学会第67回学術講演会
    • 発表場所
      福岡国際会議場(招待講演)
    • 年月日
      2011-05-16
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [図書] Single-Molecule Biophysics: Experiment and Theory, Volume 1462012

    • 著者名/発表者名
      T. Komatsuzaki, M. Kawakami, S. Takahashi, H. Yang , R. J. Silbey, S. A. Rice, A. R. Dinner
    • 総ページ数
      300
    • 出版者
      John Wiley Sons Inc.
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [図書] Single-Molecule Bophysics Advances in Chemical Physics Series vol.1462012

    • 著者名/発表者名
      Masaru Kawakami(共著)
    • 出版者
      John Wiley & Sons Inc.
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [備考]

    • URL

      http://www.jaist.ac.jp/ms/labo/kawakamim.html

    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [備考]

    • URL

      http://www.jaist.ac.jp/profiles/info.php?profile_id=00486

    • 関連する報告書
      2011 実績報告書

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公開日: 2011-04-06   更新日: 2018-03-28  

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