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基質消費スクリーニングを用いたテルペン酵素の機能進化

公募研究

研究領域生合成マシナリー:生物活性物質構造多様性創出システムの解明と制御
研究課題/領域番号 23108507
研究種目

新学術領域研究(研究領域提案型)

配分区分補助金
審査区分 理工系
研究機関千葉大学

研究代表者

梅野 太輔  千葉大学, 工学(系)研究科(研究院), 准教授 (00400812)

研究期間 (年度) 2011-04-01 – 2013-03-31
研究課題ステータス 完了 (2012年度)
配分額 *注記
6,500千円 (直接経費: 5,000千円、間接経費: 1,500千円)
2012年度: 3,250千円 (直接経費: 2,500千円、間接経費: 750千円)
2011年度: 3,250千円 (直接経費: 2,500千円、間接経費: 750千円)
キーワードテルペン / 進化分子工学 / 代謝工学 / スクリーニング / 反応特異性 / カロテノイド / ランダム変異 / 進化工学
研究実績の概要

我々が開発したテルペン活性のスクリーニング法では、基質消費活性が高いほど、つまり細胞活性が高いほど「より白い」コロニを形成する。「白さ」を指標として、テルペン酵素の細胞活性をハイスループットに見積もることができる。これを用いて,以下2つの方向で実験を行った。
(1) タバコ由来5-epi-aristolochene(防カビ剤の前駆体)合成酵素(TEAS),イチイ由来のタキサジエン(抗がん剤タキソールの前駆体)合成酵素(TaxS)を変異PCR法によってランダム変異 (~2変異/gene/世代)を導入し,ライブラリ化(多様化)した。つぎに,それぞれを黄色ブドウ球菌由来のC30カロテノイド合成経路とともにひとつの大腸菌内に発現させた。活性の無い酵素変異体の導入された大腸菌は,色素由来の黄色いコロニを与えたが,活性をもつ変異体を導入した細胞は,白っぽいコロニを与える。白いコロニから得た配列をサンプリングして解読したところ,ストップコドンやフレームシフト,そして重篤な構造破壊/機能低下をもたらす変異は完全に除去されていた。こうして,世界で初めて,テルペン酵素としての機能におけるMutability mapが描けることができるようになった。
(2) ゲラニオール酵素とTEASの2つの酵素について,ランダム変異→活性スクリーニング活性変異体を調べたところ,親よりも白いコロニーを幾つも得た。これらを解析したところ,細胞活性は有意に向上していたが,おもに異種発現性の向上によって説明できるものが殆どであった。

現在までの達成度 (段落)

24年度が最終年度であるため、記入しない。

今後の研究の推進方策

24年度が最終年度であるため、記入しない。

報告書

(2件)
  • 2012 実績報告書
  • 2011 実績報告書
  • 研究成果

    (29件)

すべて 2013 2012 2011 その他

すべて 雑誌論文 (2件) (うち査読あり 1件) 学会発表 (25件) (うち招待講演 4件) 備考 (1件) 産業財産権 (1件)

  • [雑誌論文] Directed Evolution of Carotenoid Synthases for the Production of Unnatural Carotenoids2012

    • 著者名/発表者名
      Furubayashi M, Umeno D
    • 雑誌名

      Methods Mol Biol

      巻: 892 ページ: 879-5

    • DOI

      10.1007/978-1-61779-879-5_14

    • ISBN
      9781617798788, 9781617798795
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書 2011 実績報告書
  • [雑誌論文] A system for the rapid determination of the mutation spectrum in Escherichia coli2012

    • 著者名/発表者名
      Tashiro Y, Katabami A, Saito K, Umeno D
    • 雑誌名

      Anal Sci

      巻: 28 ページ: 95-101

    • NAID

      10030446436

    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] 改良型ケラニオール合成酵素を用いた関連物質の微生物生産2013

    • 著者名/発表者名
      岩嵜 美希,藤井 爽,梶原 順,古林 真衣子,斎藤 恭一,梅野 太輔
    • 学会等名
      日本農芸化学会大会2013 大会
    • 発表場所
      東北大学
    • 年月日
      2013-03-26
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] ヒト由来スクアレン合成酵素の生産物特異性部位の探索2013

    • 著者名/発表者名
      方波見 彰仁 斎藤 恭一 梅野 太輔
    • 学会等名
      日本農芸化学会大会2013 大会
    • 発表場所
      東北大学
    • 年月日
      2013-03-26
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] タイミング回路の進化工学と変異体解析2013

    • 著者名/発表者名
      池 紘平,福冨 浩樹,河合 繁子,斎藤 恭一,梅野 太輔
    • 学会等名
      日本農芸化学会大会2013 大会
    • 発表場所
      東北大学
    • 年月日
      2013-03-26
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] 液体ハンドリングのみによって行う微生物ケノムの連続編集2013

    • 著者名/発表者名
      冨永 将大、嶋村 陽、曽和 義幸、川岸 郁朗、斎藤 恭一、梅野 太輔
    • 学会等名
      ゲノム微生物学会
    • 発表場所
      長浜バイオ大学
    • 年月日
      2013-03-08
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] Development of the evolutionary design platform for genetic switches and circuits2012

    • 著者名/発表者名
      Daisuke Umeno
    • 学会等名
      Cold Spring Harbor Symposium
    • 発表場所
      広州(中国)
    • 年月日
      2012-11-29
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Evolutionary pathway engineering: toward the fast-track construction of long-step, but high-fidelity pathway for non-natural compounds2012

    • 著者名/発表者名
      Daisuke Umeno, Maiko Furubayashi, and Kyoichi Saito
    • 学会等名
      SBJ/JST Joint Symposium IV -System Synthetic Biotechnology
    • 発表場所
      神戸国際会議場
    • 年月日
      2012-10-26
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 基質消費スクリーニングを用いたゲラニオール合成酵素の活性進化2012

    • 著者名/発表者名
      梶原 順,岩嵜 美希,古林 真衣子,斎藤 恭一,梅野 太輔
    • 学会等名
      第22回ドリコールおよひイソプレノイト研究会
    • 発表場所
      新潟大学
    • 年月日
      2012-09-29
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] 非天然骨格スクアレンおよびそれらを基にした非天然化合物の生合成2012

    • 著者名/発表者名
      方波見彰仁, 斎藤恭一, 高市真一, 梅野太輔
    • 学会等名
      第22回ドリコールおよひイソプレノイト研究会
    • 発表場所
      新潟大学
    • 年月日
      2012-09-29
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] 進化分子工学を援用した代謝経路と制御ネットワークの高速開発2012

    • 著者名/発表者名
      梅野太輔
    • 学会等名
      化学工学会第44回秋季大会
    • 発表場所
      東北大学
    • 年月日
      2012-09-20
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Evolving Escherichia coli Activity of Terpene Synthases Using Color Screening for Substrate Consumption2012

    • 著者名/発表者名
      Daisuke Umeno, Mayu Ikezumi, Maiko Furubayashi, Jun Kajiwara, Miki Iwasaki, and Kyoichi Saito
    • 学会等名
      International Conference of Natural Products Biosynthesis (ICNPB)
    • 発表場所
      淡路(夢舞台)
    • 年月日
      2012-06-17
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] Evolutionary engineering of biosynthetic pathways for non-natural C50 carotenoids2012

    • 著者名/発表者名
      Maiko Furubayashi, Li Ling, Shinichi Takaichi, Kyoichi Saito Daisuke Umeno
    • 学会等名
      International Conference of Natural Products Biosynthesis (ICNPB)
    • 発表場所
      淡路(夢舞台)
    • 年月日
      2012-06-17
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] 代謝経路路のコンテキストにおける酵素の進化#12079;学2012

    • 著者名/発表者名
      梅野太輔
    • 学会等名
      新資源生物変換研究会シンホシウム
    • 発表場所
      神戸大学
    • 年月日
      2012-06-15
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 非天然カロテノイド経路における不飽和化酵素の進化分子工学2012

    • 著者名/発表者名
      古林真衣子, 李伶, 高市真一, 斎藤恭一, 梅野太輔
    • 学会等名
      日本農芸化学会2012年度大会
    • 発表場所
      京都女子大学
    • 年月日
      2012-03-24
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] 基質消費活性スクリーニングを用いたゲラニオール合成酵素の進化工学2012

    • 著者名/発表者名
      岩寄美希, 梶原順, 生悦住茉友, 古林真衣子, 斎藤恭一, 梅野太輔
    • 学会等名
      日本農芸化学会2012年度大会
    • 発表場所
      京都女子大学
    • 年月日
      2012-03-24
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] 人工代謝経路による非天然C_<50>-β-Caroteneの生合成2011

    • 著者名/発表者名
      古林真衣子, 生悦住茉友, 高市真一, 斎藤恭一, 梅野太輔
    • 学会等名
      日本農芸化学会関東支部2011年度大会
    • 発表場所
      東洋大学板倉キャンパス
    • 年月日
      2011-10-15
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] 基質消費スクリーニングを用いたゲラニオール合成酵素の細胞活性進化2011

    • 著者名/発表者名
      梶原順, 生悦住茉友, 岩寄美希, 古林真衣子, 斎藤恭一, 梅野太輔
    • 学会等名
      日本農芸化学会関東支部2011年度大会
    • 発表場所
      東洋大学板倉キャンパス
    • 年月日
      2011-10-15
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] 非天然骨格をもつスクアレンおよびそれらを基にした非天然化合物の細胞内合成2011

    • 著者名/発表者名
      方波見彰仁, 高市真一, 斎藤恭一, 梅野太輔
    • 学会等名
      日本農芸化学会関東支部2011年度大会
    • 発表場所
      東洋大学板倉キャンパス
    • 年月日
      2011-10-15
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] Evolutionary Engineering of metabolic networks2011

    • 著者名/発表者名
      梅野太輔
    • 学会等名
      BioJapan 2011
    • 発表場所
      パシフィコ横浜(招待講演)
    • 年月日
      2011-10-07
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] 非天然カロテノイド合成経路の選択性と多様性の進化工学2011

    • 著者名/発表者名
      古林真衣子, 生悦住茉友, 高市真一, 斎藤恭一, 梅野太輔
    • 学会等名
      日本生物工学会2011年度大会
    • 発表場所
      東京農工大学小金井キャンパス
    • 年月日
      2011-09-26
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] 基質消費スクリーニングを用いたテルペン酵素の細胞活性進化2011

    • 著者名/発表者名
      梶原順, 生悦住茉友, 古林真衣子, 岩寄美希, 斎藤恭一, 青木考, 梅野太輔
    • 学会等名
      日本生物工学会2011年度大会
    • 発表場所
      東京農工大学小金井キャンパス
    • 年月日
      2011-09-26
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] 人工代謝経路を用いたC_<50>-β-Caroteneの全合成2011

    • 著者名/発表者名
      古林真衣子, 生悦住茉友, 高市真一, 斎藤恭一, 梅野太輔
    • 学会等名
      第25回カロテノイド研究談話会
    • 発表場所
      つくば国際会議場
    • 年月日
      2011-09-14
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] Specific non-natural C_<50> carotenoid pathways constructed by the combinatorial expression of laboratory-evolved enzymes2011

    • 著者名/発表者名
      Furubayashi M, Takaichi S, Misawa N, Umeno D
    • 学会等名
      The 16th International Symposium on Carotenoids
    • 発表場所
      Krakow, Poland
    • 年月日
      2011-07-17
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] Efficient and selective production of non-natural carotenoids by combinatorial expression of laboratory-evolved enzymes2011

    • 著者名/発表者名
      Furubayashi M, Ikezumi M, Saito K, Umeno D
    • 学会等名
      Synthetic Biology 5.0 Conference (SB5.0)
    • 発表場所
      Stanford, CA, USA
    • 年月日
      2011-06-15
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] Evolutionary design platform for genetic switches and circuits2011

    • 著者名/発表者名
      梅野太輔
    • 学会等名
      SB5.0
    • 発表場所
      Stanford, CA USA(招待講演)
    • 年月日
      2011-06-15
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] Directed Evolution of Carotenoid and Isoprenoid Synthases for Cellular Production of Novel Compounds2011

    • 著者名/発表者名
      Daisuke Umeno
    • 学会等名
      ECI Enzyme Engineering XXI
    • 発表場所
      Vail, Colorado USA
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [備考]

    • URL

      http://chem.tf.chiba-u.jp/~umeno/

    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [産業財産権] 炭素数50のカロテノイドの製造方法2011

    • 発明者名
      梅野太輔, 古林真衣子, 三沢典彦, 高市真一
    • 権利者名
      国立大学法人千葉大学
    • 産業財産権番号
      2011-130326
    • 出願年月日
      2011-06-10
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書

URL: 

公開日: 2011-04-06   更新日: 2018-03-28  

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