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らせんねじれ角およびHOMOギャップ改変によるDNA分子ワイヤーの構築

公募研究

研究領域高次π空間の創発と機能開発
研究課題/領域番号 23108711
研究種目

新学術領域研究(研究領域提案型)

配分区分補助金
審査区分 理工系
研究機関大阪大学

研究代表者

川井 清彦  大阪大学, 産業科学研究所, 准教授 (50314422)

研究期間 (年度) 2011-04-01 – 2013-03-31
研究課題ステータス 完了 (2012年度)
配分額 *注記
4,680千円 (直接経費: 3,600千円、間接経費: 1,080千円)
2012年度: 2,340千円 (直接経費: 1,800千円、間接経費: 540千円)
2011年度: 2,340千円 (直接経費: 1,800千円、間接経費: 540千円)
キーワードDNA / 分子ワイヤー / 光電荷分離 / 光電子移動
研究実績の概要

種々のHOMOレベルを有する、天然および修飾核酸塩基を用いて、同一鎖上の核酸塩基間のHOMOレベルギャップがDNA内ホール移動速度に与える影響を調べた。GからGのホール移動において、介在するブリッジ塩基のHOMOレベルを様々に変化しホール移動速度を測定した。ホール移動速度は、HOMOギャップの減少に伴い高速化することがわかった。また、HOMOレベルギャップを調節することにより、DNA内ホール移動速度を3桁にわたり制御可能であることが示された。このように、核酸塩基間のHOMOギャップ縮小によりDNA内ホール移動の高速化が可能であることが明らかになった。
核酸塩基のπ平面の重なりが大きいほどホール移動速度が速くなることが示唆されていた。DNAはらせんを形成する際、塩基対ごとに約35度のねじれを生じ、結果として塩基間のπスタッキング面積の減少をまねいている。修飾核酸の一つであるLocked Nucleic Acid(LNA)は、糖部位のコンフォメーションが3'-endoに固定された構造をとり、結果としてらせん角が通常のB型DNAの約35度から約26度へと減少し、πスタッキング面積が増加する。一方、LNA修飾によりDNAの構造がより剛直化することが報告されていた。DNA内ホール移動速度はLNA修飾により低下し、11塩基対をLNA置換するとホール移動速度が100倍以上減少することがわかった。次にG-C塩基対の水素結合数を減らし、核酸をより柔軟にする5-Me-2'-deoxyzebularine(B)がDNA中のホール移動速度に与える影響を調べた。シトシンをBに置換すると、ホール移動速度が20倍以上増加することがわかった。以上の結果から、DNA内をホールが移動するためにはDNAの分子運動が必須であり、DNAの柔軟化によってホール移動を高速化可能であることが示された。

現在までの達成度 (段落)

24年度が最終年度であるため、記入しない。

今後の研究の推進方策

24年度が最終年度であるため、記入しない。

報告書

(2件)
  • 2012 実績報告書
  • 2011 実績報告書
  • 研究成果

    (32件)

すべて 2013 2012 2011

すべて 雑誌論文 (8件) (うち査読あり 8件) 学会発表 (22件) (うち招待講演 1件) 図書 (2件)

  • [雑誌論文] Kinetics of Charge Transfer through DNA across Guanine-Cytosine Repeats Intervened by Adenine-Thymine Base Pair(s)2013

    • 著者名/発表者名
      Y. Osakada, K. Kawai, T. Majima
    • 雑誌名

      Bull. Chem. Soc. Jpn.

      巻: 86 号: 1 ページ: 25-30

    • DOI

      10.1246/bcsj.20120224

    • NAID

      130004153124

    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Excess Electron Transfer Dynamics in DNA Hairpins Conjugated with N,N-Dimethylaminopyrene as a Photosensitizing Electron Donor2012

    • 著者名/発表者名
      M. Fujitsuka, K. Kawai, T. Majima
    • 雑誌名

      Chem. Commun

      巻: 48 号: 89 ページ: 11008-11010

    • DOI

      10.1039/c2cc36054c

    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Hole Transfer in LNA and 5-Me-2'-deoxyzebularine-Modified DNA2012

    • 著者名/発表者名
      K. Kawai, M. Hayashi, T. Majima
    • 雑誌名

      J. Am. Chem. Soc

      巻: 134 号: 22 ページ: 9406-9409

    • DOI

      10.1021/ja302641e

    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] HOMO Energy Gap Dependence of Hole-Transfer Kinetics in DNA2012

    • 著者名/発表者名
      K. Kawai, M. Hayashi, T. Majima
    • 雑誌名

      J. Am. Chem. Soc

      巻: 134 号: 10 ページ: 4806-4811

    • DOI

      10.1021/ja2109213

    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Excess-electroninjection and transfer in terthiophene-modified DNA : Terthiophene as a photosensitizingelectron donor for thymine, cytosine, and adenine2012

    • 著者名/発表者名
      Man Jae Park, Mamoru Fujitsuka, Tetsuro Majima
    • 雑誌名

      Chemistry-A European Journal

      巻: Vol.18 号: 7 ページ: 2056-2062

    • DOI

      10.1002/chem.201103663

    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Generation of singletoxygen during photosensitized one-electronoxidation of DNA2012

    • 著者名/発表者名
      Yasuko Osakada, Mamoru Fujitsuka, Tetsuro Majima
    • 雑誌名

      Chemistry-A EuropeanJournal

      巻: Vol.18 号: 4 ページ: 1060-1063

    • DOI

      10.1002/chem.201101964

    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Probing the Charge-Transfer Dynamics in DNA at the Single-Molecule Level2011

    • 著者名/発表者名
      K. Kawai, E. Matsutani, T. Majima
    • 雑誌名

      J. Am. Chem. Soc

      巻: 133 号: 39 ページ: 15568-15577

    • DOI

      10.1021/ja206325m

    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Direct measurement ofthe dynamics of excess electron transfer throughconsecutive thymine sequence in DNA2011

    • 著者名/発表者名
      Man Jae Park, Mamoru Fujitsuka, Tetsuro Majima
    • 雑誌名

      Journalof the American Chemical Society

      巻: Vol.133 号: 39 ページ: 15320-15323

    • DOI

      10.1021/ja2068017

    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] DNA内ホール移動における電荷非局在化2013

    • 著者名/発表者名
      川井清彦、小阪田泰子、真嶋哲朗
    • 学会等名
      日本化学会第93春季年会
    • 発表場所
      立命館大学(滋賀県)
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] DNA内π空間を介したホール移動の高速化2013

    • 著者名/発表者名
      川井清彦、林 光雄、真嶋哲朗
    • 学会等名
      高次π空間の創発と機能開発第9回公開シンポジウム
    • 発表場所
      シーサイドホテル舞子ビラ神戸(兵庫県)
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] Single molecule level DNA analysis based on charge transfer measurement2012

    • 著者名/発表者名
      Kiyohiko Kawai, Atsushi Maruyama, Tetsuro Majima
    • 学会等名
      The First International Symposium on Biofunctional Chemistry (ISBC2012)
    • 発表場所
      東京工業大学(東京都)
    • 年月日
      2012-11-28
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] CHARGE TRANSFER DYNAMICS IN DNA AT THE SINGLE MOLECULE LEVEL2012

    • 著者名/発表者名
      Kiyohiko Kawai, Atsushi Maruyama, Tetsuro Majima
    • 学会等名
      XX International Roundtable on Nucleosides, Nucleotides and Nucleic Acids
    • 発表場所
      Montreal (Canada)
    • 年月日
      2012-08-06
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] DNA内電荷移動速度のHOMOレベルギャップ依存性2012

    • 著者名/発表者名
      川井清彦、林光雄、真嶋哲朗
    • 学会等名
      日本化学会第91春季年会
    • 発表場所
      横浜
    • 年月日
      2012-03-26
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] HOMOレベル改変によるDNA内電荷移動の高速化2012

    • 著者名/発表者名
      川井清彦、林光雄、真嶋哲朗
    • 学会等名
      高次π空間の創発と機能開発第7回公開シンポジウム
    • 発表場所
      松山
    • 年月日
      2012-03-13
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] DNAが作り出すπ空間を通る電荷の移動2012

    • 著者名/発表者名
      川井清彦
    • 学会等名
      生体π空間のイノベーション
    • 発表場所
      つくば(招待講演)
    • 年月日
      2012-03-06
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] Hole-transfer dynamics determined by DNA flexibility2012

    • 著者名/発表者名
      Kiyohiko Kawai, Mitsuo Hayashi, Tetsuro Majima
    • 学会等名
      第39回国際核酸化学シンポジウム
    • 発表場所
      名古屋大学(愛知県)
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] Dynamics of Hole Transfer through DNA across Guanine-Cytosine Repeats2012

    • 著者名/発表者名
      Yasuko Osakada, Kiyohiko Kawai, and Tetsuro Majima
    • 学会等名
      高次π空間の創発と機能開発第4回国際シンポジウム
    • 発表場所
      浜名湖ロイヤルホテル(静岡県)
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] Hole Transfer through DNA: Mechanism and Single-Molecule Level Analysis2012

    • 著者名/発表者名
      Kiyohiko Kawai, Atsushi Maruyama, Tetsuro Majima
    • 学会等名
      Japan-India Bilateral Seminar on Supramolecular Nanomaterials for Energy Innovaiton
    • 発表場所
      アルファあなぶきホール(香川県)
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] DNAの柔軟性がホール移動速度に与える影響2012

    • 著者名/発表者名
      川井清彦、林 光雄、真嶋哲朗
    • 学会等名
      光化学討論会2012
    • 発表場所
      東京工業大学(東京都)
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] DNA内ホール移動速度の核酸塩基HOMOレベル依存性2012

    • 著者名/発表者名
      川井清彦、林 光雄、真嶋哲朗
    • 学会等名
      第6 回バイオ関連化学シンポジウム
    • 発表場所
      北海道大学(北海道)
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] Charge Transfer through DNA: Toward Single-Molecule Level DNA Analysis2012

    • 著者名/発表者名
      Kiyohiko Kawai
    • 学会等名
      Molecular Biology and Biochemistry, Simon Fraser University, Seminar
    • 発表場所
      Vancouver (Canada)
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] DNAの柔軟化によるDNA内ホール移動の高速化2012

    • 著者名/発表者名
      川井清彦、林 光雄、真嶋哲朗
    • 学会等名
      高次π空間の創発と機能開発第8回公開シンポジウム
    • 発表場所
      ホテルアローレ(石川県)
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] Single-molecule level measurement of charge-transfer dynamics in DNA2011

    • 著者名/発表者名
      Kiyohiko Kawai, Eri Matsutani, Atsushi Maruyama, Tetsuro Majima
    • 学会等名
      高次π空間の創発と機能開発第3回国際シンポジウム
    • 発表場所
      つくば
    • 年月日
      2011-11-18
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] Single-Molecule Level Measurement of Charge-Transfer Dynamics in DNA2011

    • 著者名/発表者名
      Kiyohiko Kawai, Eri Matsutani, Atsushi Maruyama, Tetsuro Majima
    • 学会等名
      第38回国際核酸化学シンポジウム
    • 発表場所
      札幌
    • 年月日
      2011-11-09
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] Single-molecule level measurement of charge-recombination dynamics in DNA2011

    • 著者名/発表者名
      Kiyohiko Kawai, Tetsuro Majima
    • 学会等名
      5th Pacific Symposium on Radical Chemistry
    • 発表場所
      白浜(招待講演)
    • 年月日
      2011-09-27
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] 1分子レベル蛍光観測によるDNA配列情報の読み出し2011

    • 著者名/発表者名
      川井清彦、松谷恵利、丸山厚、真嶋哲朗
    • 学会等名
      第5回バイオ関連化学シンポジウム
    • 発表場所
      つくば
    • 年月日
      2011-09-14
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] 蛍光分子を光増感剤とするDNA内電荷分離2011

    • 著者名/発表者名
      川井清彦、松谷恵利、真嶋哲朗
    • 学会等名
      光化学討論会2011
    • 発表場所
      宮崎
    • 年月日
      2011-09-08
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] Charge transfer dynamics in DNA at the single-molecule level2011

    • 著者名/発表者名
      Kiyohiko Kawai
    • 学会等名
      2^<nd> Seminar on Nanoparticles and Single Molecules
    • 発表場所
      高松(招待講演)
    • 年月日
      2011-08-09
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] 分子の輝き方の観測に基づくDNA配列情報の読み出し2011

    • 著者名/発表者名
      川井清彦、松谷恵利、丸山厚、真嶋哲朗
    • 学会等名
      第33回日本光医学・光生物学会
    • 発表場所
      吹田
    • 年月日
      2011-07-22
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] らせんねじれ角およびHOMOギャップ改変によるDNA分子ワイヤーの構築2011

    • 著者名/発表者名
      川井清彦、林光雄、真嶋哲朗
    • 学会等名
      高次π空間の創発と機能開発第6回公開シンポジウム
    • 発表場所
      岡崎
    • 年月日
      2011-07-15
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [図書] 高次π空間の創発と機能開発2013

    • 著者名/発表者名
      川井清彦
    • 総ページ数
      4
    • 出版者
      シーエムシー出版
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [図書] Electronic and Magnetic Properties of Chiral Molecules and Supramolecular Architectures for Topics in Current Chemistry2011

    • 著者名/発表者名
      K.Kawai
    • 出版者
      Springer-Verlag, Inc.
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書

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公開日: 2011-04-06   更新日: 2018-03-28  

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