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対象の見え情報だけに依存しない自動計数,追跡,認識法の研究

公募研究

研究領域細胞内ロジスティクス:病態の理解に向けた細胞内物流システムの融合研究
研究課題/領域番号 23113727
研究種目

新学術領域研究(研究領域提案型)

配分区分補助金
審査区分 生物系
研究機関名城大学

研究代表者

堀田 一弘  名城大学, 理工学部, 准教授 (40345426)

研究期間 (年度) 2011-04-01 – 2013-03-31
研究課題ステータス 完了 (2012年度)
配分額 *注記
3,640千円 (直接経費: 2,800千円、間接経費: 840千円)
2012年度: 1,820千円 (直接経費: 1,400千円、間接経費: 420千円)
2011年度: 1,820千円 (直接経費: 1,400千円、間接経費: 420千円)
キーワード細胞内画像処理 / 輝点検出 / 輝点追跡 / 対象追跡 / 大きさ推定 / カーネル法
研究実績の概要

顕微鏡技術の進展に伴い、生きた細胞の内部を観察できるようになってきた。これにより、病気になる原因を細胞レベルで探ることが期待されている。しかし、細胞内画像を基に病気の原因を探るためには、細胞内画像から特定の粒子の計数や追跡等が必要になる。これまでは人によりその処理がなされてきたが、主観的なデータになってしまったり、大量のデータを得られない等の問題があった。そこで、ここでは細胞内画像から自動的に特定の粒子を検出、計数、追跡する方法について研究を行った。
主な成果としては、細胞内画像から機械学習法を用いて脂肪滴を検出し、さらに脂肪滴と背景との境目となる周辺エッジ情報から脂肪滴の大きさを推定した。これにより、様々な大きさの脂肪滴を精度良く計数できるようにになった。専門家により付けられた正解と照らし合わせて96%の精度が得られた。この方法では、教師有学習法が利用されたが、一般に教師有学習には多くの教師付きデータが必要となる。そこで、そうした情報に依存しない輝点検出法についても研究を行った。教師付きの方法に比べると精度は劣るものの、与えられた1枚だけから背景を推定し、それを基に背景と輝点の違いを強調するために、事前の情報を必要としない実用的な方法である。
また、メラノソーム追跡では、サポートベクター回帰を用いて対象の動き方を学習した。回帰による予測は完璧ではないので、予測した位置の周辺で探索して補正した。これにより、従来法に比べて大きく精度が向上した。これらの結果を国内外の会議および論文誌で発表した。

現在までの達成度 (段落)

24年度が最終年度であるため、記入しない。

今後の研究の推進方策

24年度が最終年度であるため、記入しない。

報告書

(2件)
  • 2012 実績報告書
  • 2011 実績報告書
  • 研究成果

    (10件)

すべて 2013 2012 2011

すべて 雑誌論文 (3件) (うち査読あり 3件) 学会発表 (7件)

  • [雑誌論文] 識別器を用いた細胞内画像からの輝点計数2013

    • 著者名/発表者名
      熊谷章平,堀田一弘
    • 雑誌名

      電子情報通信学会論文誌D

      巻: Vol.J96-D ページ: 904-908

    • NAID

      110009596339

    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Melanosome Tracking by Bayes Theorem and Estimation of Movable Region2012

    • 著者名/発表者名
      T.Okabe, K.Hotta
    • 雑誌名

      Proc.International Conference on Pattern Recognition Applications and Methods

      巻: 1 ページ: 482-487

    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] ight Spot Counting in Intracellular Images Using Regression and Classifie2011

    • 著者名/発表者名
      S.Kumagai, T.Itoh, K.Hotta
    • 雑誌名

      Proc.International Conference on Systems Biology

      巻: 12 ページ: 216-216

    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] Unsupervised Light Spot Detection Using Background Subtraction2013

    • 著者名/発表者名
      Takaya Niwa and Kazuhiro Hotta
    • 学会等名
      International Conference on Pattern Recognition Applications and Methods
    • 発表場所
      Barcelona
    • 年月日
      2013-02-15
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] Melanosome Tracking Using Prediction by Support Vector regression and Revision by Appearance Features2013

    • 著者名/発表者名
      M.Shimomura and K.Hotta
    • 学会等名
      International Conference on Signal Processing
    • 発表場所
      Austria
    • 年月日
      2013-02-12
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] 機械学習を用いた細胞内画像からの対象計数および追跡2012

    • 著者名/発表者名
      堀田一弘
    • 学会等名
      バイオイメージインフォマティクス2012
    • 発表場所
      兵庫県
    • 年月日
      2012-11-01
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] SIFT特徴統合とBayesの事後確率によるメラノソーム追跡2012

    • 著者名/発表者名
      岡部敏明, 堀田 一弘
    • 学会等名
      バイオイメージインフォマティクス2012
    • 発表場所
      兵庫県
    • 年月日
      2012-11-01
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] ロバスト統計を用いたwnt3a画像からの輝点検出法2012

    • 著者名/発表者名
      丹羽 貴也, 堀田 一弘.
    • 学会等名
      バイオイメージインフォマティクス2012
    • 発表場所
      兵庫県
    • 年月日
      2012-11-01
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] Counting and Radius Estimation of Lipid Droplet in Intracellular Images2012

    • 著者名/発表者名
      S.Kumagai and K.Hotta
    • 学会等名
      IEEE International Conference on Systems, Man, and Cybernetics
    • 発表場所
      Soul
    • 年月日
      2012-10-14
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] 細胞内画像からの対象計数と対象追跡2011

    • 著者名/発表者名
      堀田一弘
    • 学会等名
      日本生化学会
    • 発表場所
      京都
    • 年月日
      2011-09-01
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書

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公開日: 2011-04-06   更新日: 2018-03-28  

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