• 研究課題をさがす
  • 研究者をさがす
  • KAKENの使い方
  1. 前のページに戻る

生殖細胞の減数分裂に伴うゲノム制御転換とシグナル応答のシステム解析

公募研究

研究領域遺伝情報収納・発現・継承の時空間場
研究課題/領域番号 23114706
研究種目

新学術領域研究(研究領域提案型)

配分区分補助金
審査区分 生物系
研究機関京都大学

研究代表者

中馬 新一郎  京都大学, 再生医科学研究所, 准教授 (20378889)

研究期間 (年度) 2011-04-01 – 2013-03-31
研究課題ステータス 完了 (2012年度)
配分額 *注記
11,180千円 (直接経費: 8,600千円、間接経費: 2,580千円)
2012年度: 5,590千円 (直接経費: 4,300千円、間接経費: 1,290千円)
2011年度: 5,590千円 (直接経費: 4,300千円、間接経費: 1,290千円)
キーワード減数分裂 / ゲノム / 組み換え / 生殖細胞 / シグナル伝達 / 発生
研究実績の概要

生殖幹細胞株の減数分裂移行はRARによる転写制御を介するがRAは生体ではpleiotropicな効果を示し例えば生殖細胞への分化能を持つ多能性幹細胞であるES細胞株では神経分化を誘導する。我々は生殖幹細胞のヒストンH3トリメチル化修飾、RNA pol II、RAR等のChIP-seq解析を進め、生殖幹細胞株とES細胞株の比較によりオープンなクロマチン修飾が両者で極めて類似していること、生殖幹細胞株のH3トリメチル化のbivalent修飾はES細胞と同様に初期発生で働く遺伝子群が占めること、RARは両細胞でターゲットが明瞭に異なり生殖幹細胞株では減数分裂遺伝子群に結合すること等が明らかとなった。減数分裂誘導に伴うRNA発現 の変化をマイクロアレイにより調べ上述のエピゲノム修飾等と共に変化する遺伝子群をクラスタリングしプロモーター/エンハンサー領域に共通するシスエレメントのde novoモチーフ抽出を行い哺乳類ゲノム相同性およびシスエレメント間の共起を組み入れた推定により複数の機能候補因子を同定した。一方、nanoLC-MS/MSを用いたoffline-mudpitによるショットガン質量分析により核動態の変化について包括的プロテオームデータの取得を進めた。特に核、クロマチン分画、部位特異的解析について密度勾配、pH、塩濃度、デタージェント、ヌクレアーゼ、超音波破砕等の各種条件を検討すると共に蛋白質複合体の解離を防ぐ為に質量分析を阻害せずターゲット特異性の高いcleavable クロスリンカーを用いる実験条件を定めた。これらの研究により哺乳類の減数分裂誘導の初期過程における分子メカニズム解明へ向けた重要な研究成果を得ると共に新たな実験手法の開発を進める事が出来た。

現在までの達成度 (段落)

24年度が最終年度であるため、記入しない。

今後の研究の推進方策

24年度が最終年度であるため、記入しない。

報告書

(2件)
  • 2012 実績報告書
  • 2011 実績報告書
  • 研究成果

    (8件)

すべて 2013 2012 2011

すべて 雑誌論文 (7件) (うち査読あり 7件) 学会発表 (1件)

  • [雑誌論文] piRNA and spermatogenesis in mice2013

    • 著者名/発表者名
      Chuma S, Nakano T
    • 雑誌名

      Philos Trans R Soc Lond B Biol Sci

      巻: in press

    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] GPAT2, a Mitochondrial Acyltransferase, in piRNA Biogenesis in Germline Stem Cells.2013

    • 著者名/発表者名
      Shiromoto Y, Kuramochi-Miyagawa S, Daiba A, Chuma S, Katanaya A, ......... Nakano T
    • 雑誌名

      RNA

      巻: in press

    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] A Role for Fkbp6 and the Chaperone Machinery in piRNA Amplification and Transposon Silencing2012

    • 著者名/発表者名
      Xiol J, Cora E, Koglgruber R, Chuma S, Subramanian S, Hosokawa M, Reuter M, Yang Z, Berninger P, Palencia A, Benes V, Penninger J, Sachidanandam R, Pillai RS
    • 雑誌名

      Mol Cell

      巻: 47 ページ: 970-979

    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Human PSF concentrates DNA and stimulates duplex capture in DMC1-mediated homologous pairing2012

    • 著者名/発表者名
      Morozumi Y, Ino R, Takaku M, Hosokawa M, Chuma S, Kurumizaka H.
    • 雑誌名

      Nucleic Acids Res

      巻: 40 ページ: 3031-3041

    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Human PSF concentrates DNA and stimulates duplex capture in DMC1-mediated homologous pairing2011

    • 著者名/発表者名
      Morozumi Y, et al
    • 雑誌名

      Nucleic Acids Res

      巻: 40 号: 7 ページ: 3031-3041

    • DOI

      10.1093/nar/gkr1229

    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Tudor domain containing 7 (Tdrd7) is essential for dynamic ribonucleoprotein (RNP) remodeling of chromatoid bodies during spermatogenesis2011

    • 著者名/発表者名
      Tanaka T, et al
    • 雑誌名

      Proc Natl Acad Sci USA

      巻: 108 号: 26 ページ: 10579-10584

    • DOI

      10.1073/pnas.1015447108

    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Miwi catalysis is required for piRNA amplification-independent LINE1 transposon silencing2011

    • 著者名/発表者名
      Reuter M, et al
    • 雑誌名

      Nature

      巻: 480 号: 7376 ページ: 264-267

    • DOI

      10.1038/nature10672

    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] Mammalian tudor related genes in the male germline2011

    • 著者名/発表者名
      Chuma S
    • 学会等名
      44th meeting of society for the study of reproduction
    • 発表場所
      Portland, USA(招待講演)
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書

URL: 

公開日: 2011-04-06   更新日: 2018-03-28  

サービス概要 検索マニュアル よくある質問 お知らせ 利用規程 科研費による研究の帰属

Powered by NII kakenhi