公募研究
新学術領域研究(研究領域提案型)
水中におけるミオシンの長時間分子動力学シミュレーションを行い、ATP結合によって誘起されるミオシンのアロステリック応答を研究した。表面に生じる分極電荷とアクチン結合領域近傍にあるループ領域の応答を解析により、ミオシンがアクチンとの結合親和性を制御する分子機構についての新しい描像をえることができた。また、ミオシン周囲の水の物性、およびATP結合による影響の解析から、アクチンとミオシンの結合に水が積極的に関与している様子がうかびあがってきた。一方、アンブレラサンプリングを用いたミオシンの自由エネルギー計算からは、ミオシンのレバーアーム部位の変化により分子内の電荷分布の変化が誘起されることが示された。この応答もアクチンとの結合親和性の制御に重要であると考えられた。レバーアーム部位の構造変化を反応座標にとって計算した自由エネルギープロファイルもふまえて、アクトミオシンのエネルギー変換機構（力発生機構）について静電相互作用を基軸にした全体像を構築することができた。
25年度が最終年度であるため、記入しない。
すべて 2014 2012 2011 その他
すべて 雑誌論文 (3件) (うち査読あり 3件、 オープンアクセス 1件) 学会発表 (24件) (うち招待講演 2件) 図書 (1件)
PLoS Comput Biol
巻: 10 号: 4 ページ: e1003552-e1003552
10.1371/journal.pcbi.1003552
120005476003
J. Am. Chem. Soc
巻: 134 号: 21 ページ: 8918-8925
10.1021/ja301447j
日本生物物理学会誌
巻: 52 ページ: 196-197
10030494696
