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低温ストレス応答におけるmRNA合成と分解の協調的制御システム

公募研究

研究領域大地環境変動に対する植物の生存・成長突破力の分子的統合解析
研究課題/領域番号 23119502
研究種目

新学術領域研究(研究領域提案型)

配分区分補助金
審査区分 生物系
研究機関北海道大学

研究代表者

千葉 由佳子  北海道大学, 創成研究機構, 特任助教 (70509546)

研究期間 (年度) 2011-04-01 – 2013-03-31
研究課題ステータス 完了 (2012年度)
配分額 *注記
9,360千円 (直接経費: 7,200千円、間接経費: 2,160千円)
2012年度: 4,680千円 (直接経費: 3,600千円、間接経費: 1,080千円)
2011年度: 4,680千円 (直接経費: 3,600千円、間接経費: 1,080千円)
キーワード低温ストレス / mRNA分解 / シロイヌナズナ
研究実績の概要

低温は、迅速に対応しなくてはならない主要な環境ストレスのひとつである。本研究ではマイクロアレイと転写阻害剤処理を組み合わせた“mRNA-decay array”によって,低温ストレスに応答してmRNA分解速度が大きく変化している遺伝子群を明らかにした。本年度は,mRNA-decay arrayの詳細な解析によって得られた知見を,論文として取り纏めて発表した (Chiba et al., 2013)。一方で,低温ストレスに応答して発現レベルを上昇させ,かつ不安定化される遺伝子群,なかでも低温ストレス応答に重要な転写制御機構であるCBFレギュロンの下流に位置する7つの遺伝子に焦点を絞り個別解析を行った。これらの遺伝子は,いずれも低温ストレスに応答してその発現レベルを上昇させるが,その上昇パターンは遺伝子により多様であることを見出した。発現の上昇にはCBFによる転写制御が関わっていることが明らかであり,同時にmRNAは不安定化されていることから,このような低温ストレスに応答した様々な遺伝子発現の変化パターンは転写と分解の協調制御によって実現されていると考えられる。各遺伝子の構造のうち,転写制御はプロモーター部位によって行われていると考えられるが,mRNA分解の制御に重要な領域はよくわかってはいない。実際に,低温ストレスに応答したmRNA分解制御に関わる遺伝子部位を決定するために,様々な部位をレポーター遺伝子に繋いだコンストラクトを作成した。当初はこれらの融合遺伝子を一過的発現系で発現させて,低温処理後の発現変化パターンを比較することにより,各遺伝子部位の役割評価する予定であったが,様々な実験条件を試みたにも拘らず,この方法が技術的に大変難しいことが明らかとなった。そこで,T87培養細胞を形質転換させることにより,これらの融合遺伝子の発現を調べるために,形質転換体の作成を進めた。

現在までの達成度 (段落)

24年度が最終年度であるため、記入しない。

今後の研究の推進方策

24年度が最終年度であるため、記入しない。

報告書

(2件)
  • 2012 実績報告書
  • 2011 実績報告書
  • 研究成果

    (13件)

すべて 2013 2012 2011 その他

すべて 雑誌論文 (5件) (うち査読あり 5件、 オープンアクセス 1件) 学会発表 (6件) (うち招待講演 1件) 備考 (2件)

  • [雑誌論文] Changes in mRNA stability associated with cold stress in Arabidopsis cells2013

    • 著者名/発表者名
      Chiba Y, Mineta K, Hirai MY, Suzuki S, Kanaya S, Takahashi H, Onouchi H, Yamaguchi J, Naito S
    • 雑誌名

      Plant Cell Physiol

      巻: 54 号: 2 ページ: 180-194

    • DOI

      10.1093/pcp/pcs164

    • NAID

      10031145661

    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] The Arabidopsis ubiquitin ligases ATL31 and ATL6 control the defense response as well as the C/N response2012

    • 著者名/発表者名
      Shugo Maekawa
    • 雑誌名

      Plant Mol. Biol.

      巻: 79 号: 3 ページ: 217-227

    • DOI

      10.1007/s11103-012-9907-0

    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Sugar-inducible RPT2a, a subunit of 26S proteasome, participates in sugar response in <i>Arabidopsis</i>2012

    • 著者名/発表者名
      Huihui Sun
    • 雑誌名

      Plant Biotechnology

      巻: 29 号: 3 ページ: 279-284

    • DOI

      10.5511/plantbiotechnology.12.0409a

    • NAID

      10030804760

    • ISSN
      1342-4580, 1347-6114
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Functional characterization of a silicon transporter gene implicated in Si distribution in barley.2012

    • 著者名/発表者名
      Yamaji, N.
    • 雑誌名

      Plant Physiol.

      巻: 160 号: 3 ページ: 1491-1497

    • DOI

      10.1104/pp.112.204578

    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Boron-Dependent Degradation of NIP5 ; 1 mRNA for Acclimation to Excess Boron Conditions in Arabidopsis2011

    • 著者名/発表者名
      Tanaka, M., Takano, J., Chiba, Y., Lombardo, F., Ogasawara, Y., Onouchi, H., Naito, S. and Fujiwara, T.
    • 雑誌名

      Plant Cell

      巻: 23(9) 号: 9 ページ: 3547-59

    • DOI

      10.1105/tpc.111.088351

    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] 低温ストレスに応答したmRNA分解制御の網羅的解析2013

    • 著者名/発表者名
      千葉 由佳子
    • 学会等名
      第54回日本植物生理学会年会
    • 発表場所
      岡山大学(岡山)
    • 年月日
      2013-03-22
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Cold stress-related mRNA stability changes in Arabidopsis2012

    • 著者名/発表者名
      Yukako Chiba
    • 学会等名
      Frontiers in Plant RNA Research 2012
    • 発表場所
      Conference Hall (Sapporo)
    • 年月日
      2012-10-16
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] CONTROL OF mRNA STABILITY ASSOCIATED WITH THE COLD STRESS RESPONSE IN ARABIDOPSIS2012

    • 著者名/発表者名
      Yukako Chiba
    • 学会等名
      Plant RNA workshop
    • 発表場所
      IMBA/GMI Lecture Hall (Austria)
    • 年月日
      2012-07-08
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] Cold stress-related mRNA stability changes in Arabidopsis2012

    • 著者名/発表者名
      Yukako Chiba
    • 学会等名
      Plant and Microbe Adaptation to the Cold 2012
    • 発表場所
      Conference Hall (Sapporo)
    • 年月日
      2012-06-25
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] Changes in mRNA stability associated with cold stress response in Arabidopsis

    • 著者名/発表者名
      Yukako Chiba
    • 学会等名
      International Symposium "Strategies of Plants against Global Environmental Change"
    • 発表場所
      倉敷市芸文館(倉敷)
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] 低温ストレス応答に関連したmRNA分解制御

    • 著者名/発表者名
      千葉 由佳子
    • 学会等名
      第53回日本植物生理学会年会
    • 発表場所
      京都産業大学(京都)
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [備考] Chiba Lab

    • URL

      https://www.sci.hokudai.ac.jp/~yukako/

    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [備考] Chiba Lab

    • URL

      https://www.sci.hokudai.ac.jp/~yukako/

    • 関連する報告書
      2011 実績報告書

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公開日: 2011-04-06   更新日: 2018-03-28  

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