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ヒストン修飾を介した植物の乾燥ストレス適応機構の解析

公募研究

研究領域大地環境変動に対する植物の生存・成長突破力の分子的統合解析
研究課題/領域番号 23119522
研究種目

新学術領域研究(研究領域提案型)

配分区分補助金
審査区分 生物系
研究機関独立行政法人理化学研究所

研究代表者

関 原明  独立行政法人理化学研究所, 植物ゲノム発現研究チーム, チームリーダー (80281624)

研究期間 (年度) 2011-04-01 – 2013-03-31
研究課題ステータス 完了 (2012年度)
配分額 *注記
9,360千円 (直接経費: 7,200千円、間接経費: 2,160千円)
2012年度: 4,680千円 (直接経費: 3,600千円、間接経費: 1,080千円)
2011年度: 4,680千円 (直接経費: 3,600千円、間接経費: 1,080千円)
キーワード植物 / 環境ストレス / ヒストン修飾 / エピジェネティック制御 / 酢酸 / 乾燥ストレス / ヒストン修飾酵素 / シロイヌナズナ / マイクロアレイ / 遺伝子発現制御
研究実績の概要

植物には移動の自由がないため、様々な環境ストレス変化に対して適応する機構を備えている。近年の研究から、このシステムにはヒストン修飾を介したクロマチンリモデリングによる転写(後)制御機構が関与する事が示唆されてきている。これまでに本申請代表者らは、シロイヌナズナヒストン脱アセチル化酵素HDA6の変異株が乾燥ストレスに対して耐性を示すことを見出している。
本研究では、HDA6の乾燥ストレス耐性における機能の解明を目指して研究を進め、以下の新規な知見を得た。1)シロイヌナズナhda6変異株を用いた表現型解析から、この変異株が強い乾燥耐性を示すことを見いだした。2) hda6変異株を用いた乾燥ストレス条件下でのマイクロアレイ解析から、乾燥ストレス応答時に酢酸発酵経路の遺伝子が強く発現し、内在性の酢酸量が高度に蓄積していることがわかった。3) クロマチン免疫沈降実験の結果等から、シロイヌナズナの乾燥耐性付与には、HDA6によって制御される酢酸発酵経路の活性化が必須であることがわかった。4) 酢酸の直接投与による植物の乾燥耐性付与実験を行ったところ、比較的高濃度の酢酸を投与したシロイヌナズナで、乾燥耐性を示すことがわかった。
これまでの研究により、酢酸合成経路は植物の環境ストレス耐性に関与する主要な代謝パスウェイの一つであり、エピジェネティックな因子によって直接的に制御されていることを明らかにした。また、“酢酸”という代謝産物が、植物が環境変動を乗り越え生存(環境突破)するために機能する事を初めて明らかにした。酢酸の効果を利用した乾燥ストレス耐性植物の作出や、乾燥耐性付与法の開発につながり、低コストによる劣悪環境からの突破力の獲得が期待できる。

現在までの達成度 (段落)

24年度が最終年度であるため、記入しない。

今後の研究の推進方策

24年度が最終年度であるため、記入しない。

報告書

(2件)
  • 2012 実績報告書
  • 2011 実績報告書
  • 研究成果

    (21件)

すべて 2013 2012 2011 その他

すべて 雑誌論文 (6件) (うち査読あり 6件) 学会発表 (11件) (うち招待講演 7件) 図書 (1件) 備考 (3件)

  • [雑誌論文] Highly-reproducible ChIP-on-chip analysis to identify genome-wide protein binding and chromatin status in Arabidopsis.2013

    • 著者名/発表者名
      Kim, J.M. et al.
    • 雑誌名

      In "Methods in Molecular Biology- A third edition of the Arabidopsis Protocols (Edited by Drs. Jose J. Sanchez-Serrano and Julio Salinas)". Humana Press Inc., NJ.

      巻: in press

    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] An Epigenetic Integrator : New Insights into Genome Regulation, Environmental Stress Responses and Developmental Controls by HISTONE DEACETYLASE 6.2012

    • 著者名/発表者名
      Kim, et al.
    • 雑誌名

      Plant Cell Physiol.

      巻: 53 号: 5 ページ: 794-800

    • DOI

      10.1093/pcp/pcs004

    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] An Epigenetic Integrator : New Insights into Genome Regulation, Environmental Stress Responses and Developmental Controls by HISTONE DEACETYLASE 62012

    • 著者名/発表者名
      Kim, et al
    • 雑誌名

      Plant Cell Physiol

      巻: (in press)

    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Arabidopsis HDA6 Regulates Locus-Directed Heterochromatin Silencing in Cooperation with MET12011

    • 著者名/発表者名
      To, et al
    • 雑誌名

      PLoS Genet

      巻: 7

    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Derepression of ethylene-stabilized transcription factors (EIN3/EIL1) mediates jasmonate and ethylene signaling synergy in Arabidopsis2011

    • 著者名/発表者名
      Zhu, et al
    • 雑誌名

      Proc.Natl.Acad.Sci.USA

      巻: 108 ページ: 12539-12544

    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] 局速シーケンサーを用いたシロイヌナズナにおけるエピゲノム解析の実際2011

    • 著者名/発表者名
      金鍾明, ら
    • 雑誌名

      植物の生長調節

      巻: 46 ページ: 142-148

    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] Novel antisense RNA and epigenetic regulation in plant abiotic stress responses2013

    • 著者名/発表者名
      Matsui, A. et al.
    • 学会等名
      Abiotic Stress Workshop, Plant Animal Genome ASIA 2013
    • 発表場所
      Singapore
    • 年月日
      2013-03-17
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Novel RNA and epigenetic regulation in plant abiotic stress responses2012

    • 著者名/発表者名
      Seki, M.
    • 学会等名
      GNU Plant Science Symposium 2012
    • 発表場所
      Jinju, Korea
    • 年月日
      2012-05-10
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] The HDA6 Function in Environmental Stress Response2012

    • 著者名/発表者名
      Kim, J.M., et al
    • 学会等名
      第53回日本植物生理学会年会
    • 発表場所
      京都産業大学(京都市)(招待講演)
    • 年月日
      2012-03-16
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] Novel RNA and epigenetic regulation in plant abiotic stress responses, and Establishiment of cassava functional genomics platform and its application to molecular breeding2012

    • 著者名/発表者名
      Seki, M.
    • 学会等名
      Seminar at Hanoi University of Agriculture, June 9, Hanoi University of Agriculture
    • 発表場所
      Hanoi Univ. of Agr., Hanoi, Vietnam
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Novel posttranscriptional and epigenetic regulation in plant abiotic stress responses2012

    • 著者名/発表者名
      Seki, M.
    • 学会等名
      AGI Workshop on Biotechnology Research and Application in Agriculture
    • 発表場所
      AGI, Hanoi, Vietnam
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Novel antisense RNA and epigenetic regulations in plant abiotic stress responses2012

    • 著者名/発表者名
      Seki, M.
    • 学会等名
      School of Biological Sciences Seminar, Royal Holloway, University of London
    • 発表場所
      Royal Holloway University of London, Egham, UK
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Novel RNA and Epigenetic Regulation in Plant Abiotic Stress Responses2012

    • 著者名/発表者名
      Seki, M.
    • 学会等名
      Seminar at University of Cambridge
    • 発表場所
      University of Cambridge, Cambridge, UK
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 植物の環境ストレス応答におけるエピジェネティック制御2012

    • 著者名/発表者名
      関 原明ら
    • 学会等名
      日本学術会議公開シンポジウム「植物保護におけるゲノム科学の利用」
    • 発表場所
      日本学術会議講堂、東京
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] RNA and epigenetic regulations in plant abiotic stress responses2011

    • 著者名/発表者名
      Seki, M., et al
    • 学会等名
      第6回ムギ類研究会
    • 発表場所
      横浜市立大学木原生物学研究所(横浜市)(招待講演)
    • 年月日
      2011-11-25
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] 植物の環境ストレス応答におけるRNAおよびエピジェネティック制御機構の解析2011

    • 著者名/発表者名
      関原明
    • 学会等名
      第230回京都大学生態学研究センターセミナー
    • 発表場所
      京都大学生態学研究センター(大津市)(招待講演)
    • 年月日
      2011-10-21
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] Arabidopsis transcriptome and epigenome analysis in abiotic stress responses2011

    • 著者名/発表者名
      Matsui, A., et al
    • 学会等名
      第1回モデル生物丸ごと一匹学会
    • 発表場所
      理研播磨研究所(佐用郡)(招待講演)
    • 年月日
      2011-08-20
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [図書] Methods in Molecular Biology-The third edition of the Arabidopsis Protocols(Edited by Drs.Jose J.Sanchez-Serrano and Julio Salinas)2012

    • 著者名/発表者名
      Kim, et al
    • 出版者
      Humana Press Inc(in press)
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [備考] 独立行政法人理化学研究所 植物科学研究センター 植物ゲノム発現研究チーム ホームページ(日本語)

    • URL

      http://labs.psc.riken.jp/pgnrt/

    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [備考] 独立行政法人理化学研究所 植物科学研究センター 植物ゲノム発現研究チーム ホームページ(英語)

    • URL

      http://labs.psc.riken.jp/pgnrt/English/index.html

    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [備考]

    • URL

      http://labs.psc.riken.jp/pgnrt/

    • 関連する報告書
      2011 実績報告書

URL: 

公開日: 2011-04-06   更新日: 2018-03-28  

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