ゲノム情報科学に基づく環境応答性プロモーターの動作原理の還元論的解析

• 研究領域: 植物の環境感覚：刺激受容から細胞応答まで
• 研究課題/領域番号: 23120511
• 研究種目: 新学術領域研究(研究領域提案型)
• 配分区分: 補助金
• 審査区分: 生物系
• 研究機関: 岐阜大学
• 研究代表者: 山本 義治 岐阜大学, 応用生物科学部, 准教授 (50301784)
• 研究期間 (年度): 2011-04-01 – 2013-03-31
• 研究課題ステータス: 完了 (2012年度)
• 配分額: 9,360千円 (直接経費: 7,200千円、間接経費: 2,160千円); 2012年度: 4,680千円 (直接経費: 3,600千円、間接経費: 1,080千円); 2011年度: 4,680千円 (直接経費: 3,600千円、間接経費: 1,080千円)
• キーワード: 合成プロモーター / 植物ゲノム / 環境応答 / 転写制御

研究実績の概要

【目的】
植物の環境応答を支配する転写ネットワーク解明へ向けて、環境応答性プロモーターの総括的な理解のための解析の足場づくりを試みる。
［本年度の研究成果］
１）予測結果の実験的検証：強光ストレス・UV-B・低温・高浸透圧に応答するELIP2、及び低pH・Alなど土壌ストレス応答性のAtALMT1のプロモーターについてプロモーター予測を行い、両プロモーターから１１のシス配列候補を同定した。実験検証の結果、このうち１０については実際に機能配列であることが確認され、未知の制御配列の予測においても山本らの手法は高い正解率（９１％）を示すことがわかった。
２）合成プロモーター解析：ELIP2プロモーターの解析から、２種類の新規シス配列を組み合わせることで初めてストレス応答が「合成される」という例を発見した。同定された配列は新規のものである。また、同一の組合せが強光、UV-B、概日リズムのシグナルをすべて受けることが分かった。また、過酸化水素応答や耐病性誘導（ISR）時の応答を担うシス配列として予測されたものから概日リズム応答を示す新規配列が同定された。
３）シス配列を認識するトランス因子同定のための解析スキームの構築の試み：本プロジェクト等により今後新規シス制御配列が多数同定されることを想定している。従ってそれらに対応するトランス因子の同定を望むのであれば、高速かつ低負担で行う必要がある。そこで、Y1Hスクリーニング及びin vitroスクリーニングを試みた。

現在までの達成度 (段落)

24年度が最終年度であるため、記入しない。

今後の研究の推進方策

24年度が最終年度であるため、記入しない。

研究成果

• [雑誌論文] Identification of cis-acting promoter elements in cold- and dehydration-induced transcriptional pathways in Arabidopsis, rice and soybean (2012)
  • 著者名/発表者名: Maruyama K, Todaka D, Mizoi J, Yoshida T, Kidokoro S, Matsukura S, Takasaki H, Sakurai T, Yamamoto YY, Yoshikawa K, Kojima M, Sakakibara H, Shinozaki K, Yamaguchi-Shinozaki K
  • 雑誌名: DNA Res 巻: 19 号: 3 ページ: 37-49
  • DOI: 10.1093/dnares/2.3.147
  • 査読あり
• [雑誌論文] Identification of cis-acting promoter elements in cold-and dehydration-in duced transcriptional pathways in Arabidopsis, rice and soybean (2012)
  • 著者名/発表者名: Maruyama K, Todaka D, Mizoi J, Yoshida T, Kidokoro S, Matsukura S, Takasaki H, Sakurai T, Yamamoto YY, Yoshikawa K, Kojima M, Sakakibara H, Shinozaki K, Yamaguchi-Shinozaki K
  • 雑誌名: DNA Res 巻: 19 ページ: 37-49
  • 査読あり
• [雑誌論文] SD3, an Arabidopsis thaliana Homolog of TIM21, Affects Intracellular ATP Levels and Seedling Development (2012)
  • 著者名/発表者名: Hamasaki H, Yoshizumi T, Takahashi N, Higuchi M, Kuromori T, Imura Y, Shimada H, Matsui M
  • 雑誌名: Mol Plant 巻: (印刷中)
  • 査読あり
• [雑誌論文] Arabidopsis mitochondrial protein TIM50 affects hypocotyl cell elongation through intracellular ATP level (2012)
  • 著者名/発表者名: Kumar S, Yoshizumi T, Hongo H, Yoneda A, Hara H, Hamasaki H, Takahashi N, Nagata N, Shimada H, Matsui M
  • 雑誌名: Plant Sci 巻: 183 ページ: 212-217
  • 査読あり
• [雑誌論文] ystemic resistance induced in Arabidopsis thaliana by Trichoderma asperellum SKT-1, a microbial pesticide of seedborne diseases of rice (2012)
  • 著者名/発表者名: Yoshioka Y, Ichikawa H, Naznin HA, Kogure A, Hyakucachi M
  • 雑誌名: Pest Manag Sci 巻: 68 ページ: 60-66
  • 査読あり
• [雑誌論文] Composite application of the plant growth-promoting fungus Phoma sp. GS8-2 and the arbuscular mycorrhizal fungus Glomus mosseae : impact on disease development, microbial population, and plant growth (2012)
  • 著者名/発表者名: Saldajeno MGB, Ito M, Hyakumachi M
  • 雑誌名: Austral Plant Pathol 巻: (印刷中)
  • 査読あり
• [雑誌論文] Induction of systemic resistance in Arabidopsis and tobacco plants against Cucumber mosaic virus by Penicillium simplicissimum GP17-2 (2012)
  • 著者名/発表者名: Elsharkawy MM, Shimizu M, Takahashi H, Hyakumachi M
  • 雑誌名: Plant Pathol 巻: (印刷中)
  • 査読あり
• [雑誌論文] Molecular characterization and pathogenicity of binucleate Rhizoctonia AG-F associated to the watermelon vine decline in Italy (2012)
  • 著者名/発表者名: Aiello D, Vitale A, Hyakumachi M, Polizzi G
  • 雑誌名: Plant Pathol 巻: (印刷中)
  • 査読あり
• [雑誌論文] Characteristics of core promoter types with respect to gene structure and expression in Arabidopsis thaliana (2011)
  • 著者名/発表者名: Yamamoto YY, Yoshioka Y, Hyakumachi M, Obokata J
  • 雑誌名: DNA Res 巻: 18 ページ: 333-342
  • 査読あり
• [雑誌論文] Prediction of transcriptional regulatory elements for plant hormone responses based on microarray data (2011)
  • 著者名/発表者名: Yamamoto YY, Yoshioka Y, Hyakumachi M, Maruyama K, Yamaguchi-Shinozaki K, Tokizawa M, Koyama H
  • 雑誌名: BMC Plant Biol 巻: 11 ページ: 39-39
  • NAID: 130006995311
  • 査読あり
• [雑誌論文] A common sequence motif involved in selection of transcription start sites of Arabidopsis and budding yeast tRNA genes (2011)
  • 著者名/発表者名: Yukawa Y, Dieci G, Alzapiedi M, Hiraga A, Hirai K, Yamamoto YY, Sugiura M
  • 雑誌名: Genomics 巻: 97172 ページ: 166-166
  • 査読あり
• [雑誌論文] A High-Throughput Screening System for Arabidopsis Transcription Factors and Its Application to Med25-Dependent Transcriptional Regulation (2011)
  • 著者名/発表者名: Ou B, Yin K-Q, Liu S-N, Yang Y, Gu T, Man J, Hui W, Zhang L, Miao J, Kondou Y, Matsui M, Gu H-Y, Qu L-J
  • 雑誌名: Mol Plant 巻: 4 ページ: 546-555
  • 査読あり
• [雑誌論文] CUP-SHAPED COTYLEDON1 transcription factor activates the expression of LSH4 and LSH3, two members of the ALOG gene family, in shoot organ boundary cells (2011)
  • 著者名/発表者名: Takeda S, Hanano K, Kariya A, Shimizu S, Zhao L, Matsui M, Tasaka M, Aida M
  • 雑誌名: Plant J 巻: 66 ページ: 1066-1077
  • 査読あり
• [雑誌論文] FOX-superroots of Lotus corniculatus, overexpressing Arabidopsis full-length cDNA, show stable variations in morphological traits (2011)
  • 著者名/発表者名: Himuro Y, Tanaka H, Hashiguchi M, Ichikawa T, Nakazawa M, Seki M, Fujita M, Shinozaki K, Matsui M, Akashi R, Hoffmann F
  • 雑誌名: J Plant Physiol 巻: 168 ページ: 181-187
  • 査読あり
• [雑誌論文] Programmed induction of endoreduplication by DNA double-strand breaks in Arabidopsis (2011)
  • 著者名/発表者名: Adachi S, Minamisawa K, Okushima Y, Inagaki S, Yoshiyama K, Kondou Y, Kaminuma E, Kawashima M, Toyoda T, Matsui M, Kurihara D, Matsunaga S, Umeda M
  • 雑誌名: Proc Natl Acad Sci USA 巻: 108 ページ: 10004-10009
  • 査読あり
• [雑誌論文] Primavesi LF, Paul MJ, Schluepmann H. (2011) Growth arrest by trehalose-6-phosphate : an astonishing case of primary metabolite control over growth by way of the SnRK1 signaling pathway (2011)
  • 著者名/発表者名: Delatte XL, Sedijani P, Kondou Y, Matsui M, de Jong GJ, Somsen GW, Wiese-Klinkenberg A, Primavesi LF, Paul MJ, Schluepmann H
  • 雑誌名: Plant Physiol 巻: 157 ページ: 160-174
  • 査読あり
• [雑誌論文] Functional analysis of two isoforms of leaf-type ferredoxin-NADP+-oxidoreductase in rice using heterologous expression system of Arabidopsis thaliana (2011)
  • 著者名/発表者名: Higuchi-Takeuchi M, Ichikavva T, Kondou Y, Matsui K, Hasegawa Y, Kawashima M, Sonoike K, Mori M, Hirochika H, Matsui M
  • 雑誌名: Plant Physiol 巻: 157 ページ: 96-108
  • 査読あり
• [雑誌論文] Metabolomics reveals comprehensive reprogramming involving two independent metabolic responses of Arabidopsis to UV-B light (2011)
  • 著者名/発表者名: Kusano M, Tohge T, Fukushima A, Kobayashi M, Hayashi N, Otsuki H, Kondou Y, Goto H, Kawashima M, Matsuda F, Niida R, Matsui M, Saito K, Fernie AR
  • 雑誌名: Plant J 巻: 67 ページ: 354-369
  • 査読あり
• [雑誌論文] Screening for resistance against Pseudomonas syringae in rice-FOX Arabidopsis lines identified a putative receptor-like cytoplasmic kinase gene that confers resistance to major bacterial and fungal pathogens in Arabidopsis and rice (2011)
  • 著者名/発表者名: Dubouzet JG, Maeda S, Sugano S, Ohtake M, Hayashi N, Ichikawa T, Kondou Y, Kuroda H, Horii Y, Matsui M, Oda K, Hirochika H, Takatsuji H, Mori M
  • 雑誌名: Plant Biotechnol J 巻: 9 ページ: 466-485
  • 査読あり
• [雑誌論文] A novel chloroplast protein, CEST induces tolerance to multiple environmental stresses and reduces photooxidative damage in transgenic Arabidopsis (2011)
  • 著者名/発表者名: Yokotani N, Higuchi M, Kondou Y, Ichikawa T, Iwabuchi M, Hirochika H, Matsui M, Oda K
  • 雑誌名: J Exp Bot 巻: 62 ページ: 557-569
  • 査読あり
• [雑誌論文] Condensin II Alleviates DNA Damage and Is Essential for Tolerance of Boron Overload Stress in Arabidopsis (2011)
  • 著者名/発表者名: Sakamoto T, Inui YT, Uraguchi S, Yoshizumi T, Matsunaga S, Mastui M, Umeda M, Fukui K, Fujiwara T
  • 雑誌名: Plant Cell 巻: 23 ページ: 3533-3546
  • 査読あり
• [雑誌論文] The plant growth-promoting fungus Fusarium equiseti and the arbuscular mycorrhizal fungus Glomus mosseae stimulate plant growth and reduce severity of anthracnose and damping-off diseases in cucumber (Cucumis sativus) seedlings (2011)
  • 著者名/発表者名: Saldajeno MGB, Hyakumachi M
  • 雑誌名: Annu Appl Biol 巻: 159 ページ: 28-40
  • 査読あり
• [雑誌論文] Biological control of Fusarium wilt of tomato with Fusarium equiseti GF191 in both rock wool and soil systems (2011)
  • 著者名/発表者名: Horinouchi H, Watanabe H, Taguchi Y, Muslim A, Hyakumachi M
  • 雑誌名: BioControl 巻: 56 ページ: 915-923
  • 査読あり
• [雑誌論文] Plant growth-promoting fungus, Trichoderma koningi suppresses isoflavonoid phytoalexin vestitol production for colonization on/in the roots of Lotus japonicus (2011)
  • 著者名/発表者名: Masunaka A, Hyakumachi M, Takenaka S
  • 雑誌名: Microbes Environ 巻: 26 ページ: 128-134
  • 査読あり
• [雑誌論文] The genetic profile and molecular diagnosis of thiophanate-methyl resistant strains of Fusarium asiaticum in Japan (2011)
  • 著者名/発表者名: Suga H, Nakajima T, Kageyama K, Hyakumachi M
  • 雑誌名: Fungal Biol 巻: 115 ページ: 1244-1250
  • 査読あり
• [雑誌論文] Talaromyces wortmannii FS2 emits β-caryphyllene, which promotes plant growth and induce resistance (2011)
  • 著者名/発表者名: Yamagiwa Y, Inagaki Y, Ichinose Y, Toyoda K, Hvakumachi M, Shiraishi T
  • 雑誌名: J Gen Plant Patho 巻: 77 ページ: 336-341
  • 査読あり
• [学会発表] 強光・紫外線・低温ストレス及び概日リズムに応答するELIP2のプロモーター解析」 (2013)
  • 著者名/発表者名: 坂井優作、吉岡洋平、百町満朗、時澤睦朋、小林祐理子、小山博之、井内聖、小林正智、速水菜月、齋藤竜典、山本義治
  • 学会等名: 日本植物生理学会
  • 発表場所: 岡山
  • 年月日: 2013-03-21
• [学会発表] 植物プロモーターデータベースppdb ver3.0の紹介 (2013)
  • 著者名/発表者名: 日恵野綾香・時澤睦朋・小山博之・小保方潤一・山本義治
  • 学会等名: 日本植物生理学会
  • 発表場所: 岡山
  • 年月日: 2013-03-21
• [学会発表] シロイヌナズナのアルミニウム耐性のゲノムワイド関連解析 (2013)
  • 著者名/発表者名: 山中啓史, A. Hoekenga Owen, Lipka Alex, Gore Michael, 山本義治, 小山博之, 小林佑理子
  • 学会等名: 日本植物生理学会
  • 発表場所: 岡山
  • 年月日: 2013-03-21
• [学会発表] 遺伝子重複型偽遺伝子の転写状態の維持におけるATG配列の役割 (2013)
  • 著者名/発表者名: 佐藤壮一郎, 松尾充啓, 山本義治, 小保方潤一
  • 学会等名: 日本植物生理学会
  • 発表場所: 岡山
  • 年月日: 2013-03-21
• [学会発表] 嚢舌亜目ウミウシの盗葉緑体メカニズムの超微構造学的解析 (2013)
  • 著者名/発表者名: 大出奈穂子、遊佐陽一、山本義治、永田典子
  • 学会等名: 第３７回日本顕微鏡学会関東支部講演会
  • 発表場所: 東京
  • 年月日: 2013-03-06
• [学会発表] “Arabidopsis Promoter Analysis (2012)
  • 著者名/発表者名: Yoshiharu Y. Yamamoto
  • 学会等名: Congress of International Plant Biology (ISPMB), Evening Seminar
  • 発表場所: Jeju, South Korea
  • 年月日: 2012-10-23
• [学会発表] Plant Promoter Analysis in the Genomic Age (2012)
  • 著者名/発表者名: Yoshiharu Y. Yamamoto
  • 学会等名: Symposium on Plant Biology and Agrobiotechnology
  • 発表場所: Peking (China)
  • 年月日: 2012-10-17
• [学会発表] 植物転写ネットワークの理解のためのプロモーター解析 (2012)
  • 著者名/発表者名: 山本義治
  • 学会等名: JSBiアグリバイオインフォマティクス研究会「モチーフ解析最前線」
  • 発表場所: 東京
  • 年月日: 2012-10-03
• [学会発表] In silico analysis of transcriptional regulatory elements related with disease resistance (2012)
  • 著者名/発表者名: Naznin HA, Yoshioka Y, Hieno A, Yamamoto YY, Hyakumachi M
  • 学会等名: 日本植物病理学会関西支部会
  • 発表場所: 鳥取
  • 年月日: 2012-09-27
• [学会発表] 合成プロモーターを利用した転写ネットワーク解析の試み (2012)
  • 著者名/発表者名: 吉岡洋平、百町満朗、時澤睦朋、小林佑理子、小山博之、井内聖、小林正智、趙成日、坂井優作、山本義治
  • 学会等名: 日本土壌肥料学会
  • 発表場所: 鳥取
  • 年月日: 2012-09-06
• [学会発表] マイクロアレイデータを用いた金属イオン応答に関わる転写制御配列の解析 (2012)
  • 著者名/発表者名: 時澤睦朋、趙成日、 澤木宣忠、小林安文、小林佑理子、小山博之、吉岡洋平、百町満朗、山本義治
  • 学会等名: 日本土壌肥料学会
  • 発表場所: 鳥取
  • 年月日: 2012-09-06
• [学会発表] シロイヌナズナにおけるアルミニウム耐性のゲノムワイド相関解析 (2012)
  • 著者名/発表者名: 山中啓史、 Hoekenga Owen,、Likpa Alex、Gore Michael、山本義治、小山博之、小林佑理子
  • 学会等名: 日本土壌肥料学会
  • 発表場所: 鳥取
  • 年月日: 2012-09-06
• [学会発表] In silico analysis of transcriptional regulatory elements related with disease resistance (2012)
  • 著者名/発表者名: Hushna Ara Naznin, Yohei Yoshioka, Ayaka Hieno, Mitsuro Hyakumachi, and Yoshiharu Y.Yamamoto
  • 学会等名: XV International Congress of Molecular Plant-Microbe Interactions
  • 発表場所: Kyoto
  • 年月日: 2012-07-29
• [学会発表] Plant promoter analysis in the genomic age (2012)
  • 著者名/発表者名: Yoshioka Y, Hyakucachi M, Kobayashi Y,Koyama K, Iuchi S, Kobayashi M, Suzuki Y, Sugano S, Sakurai T, Shinozaki K, Mitsuda N, Ohme-Takagi M, Tada Y, Yamamoto YY
  • 学会等名: 77th CSHL Symposium: The Biology of Plants 2012
  • 発表場所: Cold Spring Harbor, NY (USA)
  • 年月日: 2012-05-31
• [学会発表] In silico prediction of transcriptional regulatory elements for stomatal regulation in disease resistance induced by plant growth promoting fungi (2012)
  • 著者名/発表者名: Ayaka Hieno, Naznin Most. Hushna Ara, Yohei Yoshioka, Mitsuro Hyakumachi, Satoshi Iuchi, Masatomo Kobayashi, Nobutaka Mitsuda, Masaru Ohme-Takagi, Yoshiharu Y. Yamamoto
  • 学会等名: 77th CSHL Symposium: The Biology of Plants 2012
  • 発表場所: Cold Spring Harbor, NY (USA)
  • 年月日: 2012-05-31
• [学会発表] マイクロアレイデータに基づいた植物生育促進菌類Penicillium simplicissimum GP17-2株によって誘導される植物の全身的抵抗性に関する転写制御配列の予測 (2012)
  • 著者名/発表者名: 吉岡洋平、日恵野綾香、Most.Hushna Ara Naznin、百町満朗、時澤睦朋、小林佑理子、小山博之、井内聖、小林正智、圓山恭之進、篠崎和子、坂井優作、趙成日、山本義治
  • 学会等名: 日本植物病理学会年会
  • 発表場所: 福岡
  • 年月日: 2012-03-29
• [学会発表] Large-scale analysis of transcription start sites of Arabidopsis thaliana by next generation sequencer (2012)
  • 著者名/発表者名: M Tokizawa, H Yamanaka, Y Kobayashi, H Koyama, T Sakurai, A Kurotani, K Shinozaki, Y Suzuki, S Sugano, J Obokata, YY Yamamoto
  • 学会等名: 1st International Symposium on Plant Environmental Sensing
  • 発表場所: 奈良
  • 年月日: 2012-03-20
• [学会発表] Prediction of transcriptional regulatory elements for response to environmental stress" 1st International Symposium on Plant Environmental Sensing (2012)
  • 著者名/発表者名: Y Yoshioka, A Hieno, Naznin HA, M Hyakumachi, M Tokizawa, Y Kobayashi, H Koyama, S Iuchi, M Kobayashi, K Maruyama, K Yamaguchi-Shinozaki, Y Sakai, C-R Zhao, YY Yamamoto
  • 学会等名: 1st International Symposium on Plant Environmental Sensing
  • 発表場所: 奈良
  • 年月日: 2012-03-20
• [学会発表] ppdb, Plant Promoter Database (2012)
  • 著者名/発表者名: A Hieno, N Sato, D Lang, S Rensing, T Nishiyama, M Hasebe, J Obokata, YY Yamamoto
  • 学会等名: 1st International Symposium on Plant Environmental Sensing
  • 発表場所: 奈良
  • 年月日: 2012-03-20
• [学会発表] マイクロアレイデータをもとにした金属イオンストレス応答を担う転写制御配列の予測 (2012)
  • 著者名/発表者名: 趙成口、時澤睦朋、澤木宣忠、小林安文、小林佑理子、小山博之、吉岡洋平、百町満朗、山本義治
  • 学会等名: 日本植物生理学会年会
  • 発表場所: 京都
  • 年月日: 2012-03-16
• [学会発表] 有用微生物による病害抵抗性誘導時の気孔開度を制御する転写制御配列のin silico予測 (2012)
  • 著者名/発表者名: 日恵野綾香、Most.Hushna Ara Naznin、吉岡洋平、百町満朗、時澤睦朋、小林佑理子、小山博之、井内聖、小林正智、光出展隆、高木優、坂井優作、趙成日、山本義治
  • 学会等名: 日本植物生理学会年会
  • 発表場所: 京都
  • 年月日: 2012-03-16
• [学会発表] 遺伝子重複領域内のATG開始コドンが転写状態に与える影響について (2012)
  • 著者名/発表者名: 佐藤壮一郎、松尾充啓、工藤久幸、木村宏、中邨真之、山本義治、小保方潤一
  • 学会等名: 日本植物生理学会年会
  • 発表場所: 京都
  • 年月日: 2012-03-16
• [学会発表] 高等植物において遺伝子コード領域の存在は転写型シーンサイレンシングを抑制する (2012)
  • 著者名/発表者名: 松尾充啓、佐藤壮一郎、工藤久幸、安井孝彰、中邨真之、木村宏、山本義治、小保方潤一
  • 学会等名: 日本植物生理学会年会
  • 発表場所: 京都
  • 年月日: 2012-03-16
• [学会発表] マイクロアレイデータに基づいた有用微生物によって誘導される植物の全身的抵抗性に関する転写制御配列の予測 (2012)
  • 著者名/発表者名: 吉岡洋平、日恵野綾香、Most.Hushna Ara Naznin、百町満朗、時澤睦朋、小林佑理子、小山博之、井内聖、小林正智、圓山恭之進、篠崎和子、坂井優作、趙成日、山本義治
  • 学会等名: 日本植物生理学会年会
  • 発表場所: 京都
  • 年月日: 2012-03-16
• [学会発表] 次世代シークエンサーを用いたシロイヌナズナの転写開始位置のゲノムワイドな解析 (2012)
  • 著者名/発表者名: 時澤睦朋、山中啓史、小林佑理子、小山博之、櫻井哲也、黒谷篤之、篠崎一雄、鈴木穣、菅野純夫、小保方潤一、山本義治
  • 学会等名: 日本植物生理学会年会
  • 発表場所: 京都
  • 年月日: 2012-03-16
• [学会発表] 転写制御配列予測を用いた光ストレス応答性遺伝子ELIP2のプロモーター解析 (2012)
  • 著者名/発表者名: 坂井優作、吉岡洋平、百町満朗、時澤睦朋、小林佑理子、小山博之、井内聖、小林正智、石野はるか、山本義治
  • 学会等名: 日本植物生理学会年会
  • 発表場所: 京都
  • 年月日: 2012-03-16
• [学会発表] 遺伝子重複領域内のATG開始コドンの保存性が転写状態の持続性に及ぼす影響について (2011)
  • 著者名/発表者名: 佐藤壮一郎、松尾充啓、工藤久幸、木村宏、中邨真之、山本義治、小保方潤一
  • 学会等名: 日本分子生物学会年会
  • 発表場所: 横浜
  • 年月日: 2011-12-16
• [学会発表] 超並列型Illumina DNAシークエンサーを用いたシロイヌナズナ転写開始点の大規模解析 (2011)
  • 著者名/発表者名: 櫻井哲也、黒谷篤之、鈴木穣、菅野純夫、小保方潤一、時澤睦朋、山中啓史、小林佑理子、小山博之、山本義治
  • 学会等名: 日本分子生物学会年会
  • 発表場所: 横浜
  • 年月日: 2011-12-16
• [学会発表] 植物生育促進菌類Penicillium simplicissimum GP17-2株によって誘導される植物の全身的抵抗性に関するトランスクリプトーム解析 (2011)
  • 著者名/発表者名: 吉岡洋平、Naznin Hushna Ara、日恵野綾香、百町満朗、山本義治
  • 学会等名: 日本分子生物学会年会
  • 発表場所: 横浜
  • 年月日: 2011-12-16
• [学会発表] 移動型土壌病原菌を繰り返し接種した土壌に集積する微生物相の解析 (2011)
  • 著者名/発表者名: 吉岡洋平、久野修平、清水将文、百町満朗
  • 学会等名: 土壌微生物学会大会
  • 発表場所: 大崎
  • 年月日: 2011-11-26
• [学会発表] Rhizoctona solani、Sclerotium rolfsiiおよび非病原性2核Rhizoctoniaの繰返し接種に伴うTrichoderma spp.の選択的集積と発病抑止性との関連 (2011)
  • 著者名/発表者名: 矢野修平、吉岡洋平、清水将文、百町満朗
  • 学会等名: 日本病理学会関西支部会
  • 発表場所: 高松
  • 年月日: 2011-10-01
• [学会発表] 植物プロモーターをデコードする (2011)
  • 著者名/発表者名: 山本義治
  • 学会等名: 日本遺伝学会ワークショップ「植物ゲノム研究の最近のトピック」
  • 発表場所: 京都
  • 年月日: 2011-09-20
• [学会発表] 植物の核ゲノムにはATG開始コドンを介したプロモーター機能領域の出現メカニズムがある (2011)
  • 著者名/発表者名: 松尾充啓、佐藤壮一郎、工藤久幸、本村宏、中邨真之、山本義治、小保方潤一
  • 学会等名: 日本遺伝学会
  • 発表場所: 京都
  • 年月日: 2011-09-20
• [学会発表] 植物ゲノム上でのプロモーター機能領域の出現に対するATG開始コドンの役割 (2011)
  • 著者名/発表者名: 佐藤壮一郎、松尾充啓、工藤久幸、木村宏、中邨真之、山本義治、小保方潤一
  • 学会等名: 日本植物学会
  • 発表場所: 東京
  • 年月日: 2011-09-18
• [学会発表] ゲノム時代のプロモーター解析 (2011)
  • 著者名/発表者名: 山本義治
  • 学会等名: 日本植物細胞分子生物学会シンポジウム「植物の逆遺伝学的解析技術はどこまで来たか」
  • 発表場所: 福岡
  • 年月日: 2011-09-07
• [学会発表] 植物の環境応答:フィトクロムとフォトトロピン (2011)
  • 著者名/発表者名: 山本義治
  • 学会等名: 岐阜県高等学校生物部会研究大会
  • 発表場所: 岐阜
  • 年月日: 2011-08-18
• [学会発表] マイクロアレイデータを用いたイオンストレス転写制御配列予測 (2011)
  • 著者名/発表者名: 時澤睦朋、Radhouane Chaffai、趙成日、山本義治、小山博之
  • 学会等名: 日本土壌肥料学会
  • 発表場所: 筑波
  • 年月日: 2011-08-10
• [学会発表] シロイヌナズナのTSS解析 (2011)
  • 著者名/発表者名: 山本義治
  • 学会等名: 遺伝研研究会「次世代シーケンシング時代の分子進化研究」
  • 発表場所: 三島
  • 年月日: 2011-04-27
• [図書] Methods in Enzymology (2013)
  • 著者名/発表者名: Hieno A, Naznin HA, Sawaki K, Koyama H, Sakai Y, Ishino H, Hyakumachi M. Yamamoto YY
  • 出版者: Analysis of environmental stress in plants with the aid of marker genes for H2O2 responses
• [備考]
  • URL: http://www1.gifu-u.ac.jp/~yyy/