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GPIアンカー型タンパク質の輸送シグナルの提示と検知の構造生物学

公募研究

研究領域細胞シグナリング複合体によるシグナル検知・伝達・応答の構造的基礎
研究課題/領域番号 23121532
研究種目

新学術領域研究(研究領域提案型)

配分区分補助金
審査区分 生物系
研究機関名古屋市立大学

研究代表者

佐藤 匡史  名古屋市立大学, 薬学研究科(研究院), 准教授 (80532100)

研究期間 (年度) 2011-04-01 – 2013-03-31
研究課題ステータス 完了 (2012年度)
配分額 *注記
4,680千円 (直接経費: 3,600千円、間接経費: 1,080千円)
2012年度: 2,340千円 (直接経費: 1,800千円、間接経費: 540千円)
2011年度: 2,340千円 (直接経費: 1,800千円、間接経費: 540千円)
キーワード積荷受容体 / 糖タンパク質 / X線結晶構造解析 / NMR解析 / GPIアンカー型糖鎖 / N結合型糖鎖 / 構造細胞生物学
研究実績の概要

本研究では、小胞体積荷受容体によるGPIアンカー型およびN結合型糖タンパク質の分子認識および細胞内輸送機構の構造基盤の解明を目的としている。

糖タンパク質の細胞内輸送は、p24ファミリータンパク質やERGIC-53などの積荷受容体より担われていることが知られている。その中でも、ERGIC-53はカルシウム結合タンパク質MCFD2と複合体を形成することで、糖鎖とポリペプチド鎖を二重に認識していることが想定される特徴的な積荷受容体である。平成24年度は、主にERGIC-53による糖鎖認識の構造基盤を明らかにすることを目標とした。そこで、ERGIC-53、MCFD2、糖鎖リガンドモデル(α1-2マンノビオース)からなる三者複合体のX線結晶構造解析を行った。その結果、MCFD2および糖鎖リガンドと結合したERGIC-53の分子複合体の立体構造解析に成功し、本積荷受容体による糖鎖認識の構造基盤を初めて明らかにすることができた。

現在までの達成度 (段落)

24年度が最終年度であるため、記入しない。

今後の研究の推進方策

24年度が最終年度であるため、記入しない。

報告書

(2件)
  • 2012 実績報告書
  • 2011 実績報告書
  • 研究成果

    (32件)

すべて 2013 2012 2011 その他

すべて 雑誌論文 (8件) (うち査読あり 8件) 学会発表 (23件) (うち招待講演 2件) 備考 (1件)

  • [雑誌論文] An archaeal homolog of proteasome assembly factor functions as a proteasome activator2013

    • 著者名/発表者名
      K. Kumoi, T. Satoh, K. Murata, T. Hiromoto, T. Mizushima, Y. Kamiya, M. Noda, S. Uchiyama, H. Yagi, and K. Kato
    • 雑誌名

      PLoS ONE

      巻: 8 号: 3 ページ: e60294-e60294

    • DOI

      10.1371/journal.pone.0060294

    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Molecular and structural basis for N-glycan-dependent determination of glycoprotein fates in cells2012

    • 著者名/発表者名
      Y.Kamiya, T.Satoh, K.Kato
    • 雑誌名

      Biochim.Biophys.Acta-General Subjects

      巻: (in press) 号: 9 ページ: 1327-1337

    • DOI

      10.1016/j.bbagen.2011.12.017

    • 関連する報告書
      2012 実績報告書 2011 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] マンノース6 リン酸受容体相同ドメインを有するレクチンおよびタンパク質による糖鎖認識の分子構造基盤2012

    • 著者名/発表者名
      Tadashi Satoh
    • 雑誌名

      Trends in Glycoscience and Glycotechnology

      巻: 24 号: 139 ページ: 193-202

    • DOI

      10.4052/tigg.24.193

    • NAID

      10031146671

    • ISSN
      0915-7352, 1883-2113
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Overproduction of anti-Tn antibody MLS128 single-chain Fv fragment in Eschehchia coli cytoplasm using a novel pCold-PDI vector2012

    • 著者名/発表者名
      Subedi GP, Satoh T, Hanashima S, Ikeda A, Nakada H, Sato R, Mizuno M, Yuasa N, Fujita-Yamaguchi Y, Yamaguchi Y
    • 雑誌名

      Protein Expr.Purif.

      巻: 82 号: 1 ページ: 197-204

    • DOI

      10.1016/j.pep.2011.12.010

    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] 糖鎖を目印とするタンパク質の品質管理の仕組みを解く2012

    • 著者名/発表者名
      佐藤匡史, 山口芳樹
    • 雑誌名

      生物物理

      巻: 52 ページ: 32-33

    • NAID

      10030038155

    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Conformational dynamics of wild-type Lys-48-linked diubiquitin in solution.2011

    • 著者名/発表者名
      T.Hirano, O.Serve, M.Yagi-Utsumi, E.Takemoto, T.Hiromoto, T.Satoh, T.Mizushima, and K.Kato
    • 雑誌名

      J. Biol. Chem.

      巻: 286 号: 43 ページ: 37496-37502

    • DOI

      10.1074/jbc.m111.256354

    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Structural insights into recognition of triple-helical β-glucan by insect fugal receptor2011

    • 著者名/発表者名
      Kanagawa M, Satoh T, Ikeda A, Adachi Y, Ohno N, Yamaguchi Y
    • 雑誌名

      J.Biol.Chem.

      巻: 286 号: 33 ページ: 29158-29165

    • DOI

      10.1074/jbc.m111.256701

    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Sorting of GPI-anchored proteins into ER-exit sites by p24 proteins is dependent on remodeled GPI2011

    • 著者名/発表者名
      Fujita, M., R. Watanabe, N. Jaensch, M. Romanova-Michaelides, T. Satoh, M. Kato, H. Riezman, Y. Yamaguchi, Y. Maeda and T. Kinoshita
    • 雑誌名

      J. Cell Biol

      巻: 194 号: 1 ページ: 61-75

    • DOI

      10.1083/jcb.201012074

    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] プロテアソーム集合因子Nas2を介したプロテアソームの分子集合機構の構造基盤2013

    • 著者名/発表者名
      佐藤匡史
    • 学会等名
      日本薬学会 第133回年会
    • 発表場所
      横浜
    • 年月日
      2013-03-29
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] プロテアソームを構成するサブユニットとその集合因子Ump1pの相互作用解析2013

    • 著者名/発表者名
      大川慶祐
    • 学会等名
      日本生物物理学会中部支部講演会
    • 発表場所
      名古屋
    • 年月日
      2013-02-19
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] Redox-dependent conformational dynamics of protein disulfide isomerase coupled with exposure of its substrate binding region2012

    • 著者名/発表者名
      Kouya Inagaki
    • 学会等名
      The 6th International Symposium, Molecular Science of Fluctuations toward Biological Functions
    • 発表場所
      京都
    • 年月日
      2012-12-06
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] Molecular mechanism of redox-dependent domainrearrangement of the substrate-binding region of protein disulfide isomerase2012

    • 著者名/発表者名
      Kouya Inagaki
    • 学会等名
      第50回 日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      名古屋
    • 年月日
      2012-09-22
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] 糖タンパク質の輸送と分解に関わる細胞内レクチンの構造生物学研究2012

    • 著者名/発表者名
      佐藤匡史
    • 学会等名
      第31回 日本糖質学会年会
    • 発表場所
      鹿児島
    • 年月日
      2012-09-19
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] タンパク質の機能拡張子としての糖鎖を観る2012

    • 著者名/発表者名
      加藤晃一
    • 学会等名
      第12回日本蛋白質科学会年会
    • 発表場所
      名古屋
    • 年月日
      2012-06-20
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 新規プロテアソーム活性化因子 PbaB の構造と機能2012

    • 著者名/発表者名
      雲井健太郎
    • 学会等名
      第12回日本蛋白質科学会年会
    • 発表場所
      名古屋
    • 年月日
      2012-06-20
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] 古細菌タンパク質PbaBによるATP非依存的プロテアソーム活性化機構の構造基盤2012

    • 著者名/発表者名
      雲井健太郎
    • 学会等名
      第76回日本生化学会 中部支部例会・シンポジウム
    • 発表場所
      岡崎
    • 年月日
      2012-05-26
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] プロテアソームの19S複合体基底部の形成を介助するシャペロン分子Nas2の構造生物学研究2012

    • 著者名/発表者名
      廣本武史, 矢木真穂, 植草義徳, 雲井健太郎, 佐藤匡史, 水島恒裕, 佐伯泰, 田中啓二, 加藤晃一
    • 学会等名
      日本薬学会第132年会
    • 発表場所
      札幌(口頭発表)
    • 年月日
      2012-03-30
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] 新規プロテアソーム活性化因子PbaBの構造生物学研究2012

    • 著者名/発表者名
      佐藤匡史, 雲井健太郎, 矢木宏和, 廣本武史, 水島恒裕, 内山進, 野田勝紀, 村田和義, 神谷由紀子, 加藤晃一
    • 学会等名
      日本薬学会第132年会
    • 発表場所
      札幌(口頭発表)
    • 年月日
      2012-03-30
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] 細胞内レクチンによる糖タンパク質品質管理の構造基盤2011

    • 著者名/発表者名
      佐藤匡史
    • 学会等名
      Glyco Tokyo 2011シンポジウム
    • 発表場所
      埼玉(招待講演)
    • 年月日
      2011-12-09
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] 糖鎖認識を介した糖タンパク質の輸送と分解の構造基盤2011

    • 著者名/発表者名
      佐藤匡史
    • 学会等名
      平成23年度日本結晶学会年会
    • 発表場所
      札幌(招待講演)
    • 年月日
      2011-11-25
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] NMR analysis of an anti-carbohydrate antibody MLS128 single-chain Fv fragment toward elucidation of the multivalent recognition mechanism2011

    • 著者名/発表者名
      Ganesh Prasad Subedi, Tadashi Satoh, Shinya Hanashima, Akemi Ikeda, Hiroshi Nakada, Reiko Sato, Mamoru Mizuno, Noriyuki Yuasa, Yoko Fujita-Yamaguchi, Yoshiki Yamaguchi
    • 学会等名
      2011 Annual Conference of the Society for Glycobiology
    • 発表場所
      シアトル
    • 年月日
      2011-11-10
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] Structural basis of sugar recognition by intracellular lectins involved in glycoprotein transport and degradation2011

    • 著者名/発表者名
      Tadashi Satoh
    • 学会等名
      Nagoya University Global COE Mini-Symposium : Toward Systems Glycobiology
    • 発表場所
      名古屋(招待講演)
    • 年月日
      2011-11-07
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] レクチンとカルシウム結合タンパク質の協働的相互作用による血液凝固因子の細胞内輸送の構造基盤2011

    • 著者名/発表者名
      西尾美穂, 神谷由紀子, 佐藤匡史, 内海真穂, 加藤晃一
    • 学会等名
      糖鎖科学名古屋拠点"第9回若手の力フォーラム"
    • 発表場所
      岐阜
    • 年月日
      2011-10-22
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] A novel binding mode of beta-GRP/GNBP3 N-terminal domain with laminarihexaose-structural insight into recognition of triple-helical beta-glucan2011

    • 著者名/発表者名
      Mayumi Kanagawa, Tadashi Satoh, Akemi Ikeda, Yoshiyuki Adachi, Naohito Ohno, Yoshiki Yamaguchi
    • 学会等名
      第71回岡崎コンファレンス「糖鎖分子科学の新たな展望」
    • 発表場所
      岡崎
    • 年月日
      2011-10-13
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] ヒトZG16pレクチンのリガンド認識の多様性の構造基盤2011

    • 著者名/発表者名
      金川真由美, 池田明美, 佐藤匡史, 中野佑妃子, 相川京子, 山口芳樹
    • 学会等名
      第84回日本生化学会大会
    • 発表場所
      京都
    • 年月日
      2011-09-23
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] p24ファミリータンパク質は、リモデリングされたGPIアンカーに結合し、輸送小胞へ組込む積荷受容体である2011

    • 著者名/発表者名
      藤田盛久, 佐藤匡史, 加藤雅樹, 山口芳樹, 前田裕輔, 木下タロウ
    • 学会等名
      第84回日本生化学会大会
    • 発表場所
      京都
    • 年月日
      2011-09-22
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] ヒトZG16pとZG16bはJacalinと同様のβ-プリズムフォールドを有する2011

    • 著者名/発表者名
      金川真由美, 佐藤匡史, 池田明美, 中野佑妃子, 矢木宏和, 加藤晃一, 相川京子, 山口芳樹
    • 学会等名
      第30回日本糖質学会年会
    • 発表場所
      長岡
    • 年月日
      2011-07-12
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] GPIの構造変化と積荷受容体p24によるGPIアンカー型タンパク質輸送の制御2011

    • 著者名/発表者名
      藤田盛久, 佐藤匡史, 加藤雅樹, 山口芳樹, 前田裕輔, 木下タロウ
    • 学会等名
      第30回日本糖質学会年会
    • 発表場所
      長岡
    • 年月日
      2011-07-11
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] NMR法を用いた分子シャペロンUmp1とプロテアソームサブユニット複合体との相互作用解析2011

    • 著者名/発表者名
      大川慶祐, 矢木真穂, 廣本武史, 矢木宏和, 水島恒裕, 佐藤匡史, 加藤晃一
    • 学会等名
      第57回日本薬学会東海支部総会大会
    • 発表場所
      名古屋(口頭発表)
    • 年月日
      2011-07-09
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] GPIアンカー型タンパク質の輸送シグナルの提示と検知の構造生物学2011

    • 著者名/発表者名
      佐藤匡史
    • 学会等名
      新学術領域研究「構造細胞生物学」第2回全体会議
    • 発表場所
      奈良
    • 年月日
      2011-07-07
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] NMR analysis of an anti-carbohydrate antibody MLS128 single-chain Fv fragment toward elucidation of the multivalent recognition mechanism2011

    • 著者名/発表者名
      Ganesh Prasad Subedi, Tadashi Satoh, Shinya Hanashima, Akemi Ikeda, Hiroshi Nakada, Reiko Sato, Mamoru Mizuno, Noriyuki Yuasa, Yoko Fujita-Yamaguchi, Yoshiki Yamaguchi
    • 学会等名
      ISNMR2011第50回NMR討論会記念国際シンポジウム
    • 発表場所
      横浜
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [備考] ・理化学研究所プレスリリース,2011年6月24日,「真菌類などが持つ3重らせん型βグルカンを認識する仕組みを解明-生体防御システムにおける3重らせん構造認識の秘密が明らかに-」

    • URL

      http://www.riken.jp/r-world/research/results/2011/110624/index.html

    • 関連する報告書
      2011 実績報告書

URL: 

公開日: 2011-04-06   更新日: 2018-03-28  

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