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寄生植物コシオガマの寄生形質獲得に関わる遺伝子の同定

公募研究

研究領域複合適応形質進化の遺伝子基盤解明
研究課題/領域番号 23128513
研究種目

新学術領域研究(研究領域提案型)

配分区分補助金
審査区分 生物系
研究機関独立行政法人理化学研究所

研究代表者

吉田 聡子  独立行政法人理化学研究所, 植物免疫研究グループ, 上級研究員 (20450421)

研究期間 (年度) 2011-04-01 – 2013-03-31
研究課題ステータス 完了 (2012年度)
配分額 *注記
11,440千円 (直接経費: 8,800千円、間接経費: 2,640千円)
2012年度: 5,720千円 (直接経費: 4,400千円、間接経費: 1,320千円)
2011年度: 5,720千円 (直接経費: 4,400千円、間接経費: 1,320千円)
キーワード植物 / 寄生植物 / RNASeq / 遺伝子発現 / トランスクリプトーム / コシオガマ / 条件的寄生植物 / ストライガ / 次世代シーケンサー / 発現解析
研究実績の概要

多くの高等植物は自ら光合成により有機栄養をつくりだして生活するが、寄生植物は他の植物から栄養を奪って生育する特殊な生存戦略を獲得している。寄生植物は吸器と呼ばれる宿主への侵入器官を発達させ、宿主の根や茎に付着・侵入し、維管束系をつなげて栄養を吸収する。ハマウツボ科絶対寄生植物であるストライガやオロバンキは穀物や野菜に寄生するため、甚大な農業被害をもたらしている。しかし、植物寄生の分子メカニズムはまだほとんど分かっていない。
本研究では、ストライガと同じハマウツボ科に属するコシオガマの大規模トランスクリプトーム解析をおこない、寄生過程で発現する遺伝子を同定する。絶対寄生植物であるストライガ、また独立栄養植物を比較解析することによって寄生形質の獲得の進化の過程を明らかにする。さらに、逆遺伝学的手法を用いて寄生形質獲得の鍵遺伝子の同定を目指す。
本年度は、大規模トランスクリプトームにより得られた候補遺伝子について、機能解析を行った。コシオガマの吸器形成過程における吸器を経時的にサンプリングしてRNA抽出し、おけるマイクロアレイ解析およびRNASeq解析をおこなった。さらに、リアルタイムRT-PCRにて発現を確認した。ここでも寄生特異的に発現の確認ができた遺伝子は、全長cDNAの単離、プロモーター領域の単離をおこない、プロモーターGUSコンストラクトを作成し、コシオガマに毛状根形質転換することにより根の中での発現パターンを検証した。また、遺伝子配列をもとに、RNA干渉のコンストラクトおよび過剰発現コンストラクトを作成し、同様に毛状根形質転換によりコシオガマに導入し、宿主に寄生させ、寄生の表現型に変化が起こるかどうかを確かめた。

現在までの達成度 (段落)

24年度が最終年度であるため、記入しない。

今後の研究の推進方策

24年度が最終年度であるため、記入しない。

報告書

(2件)
  • 2012 実績報告書
  • 2011 実績報告書
  • 研究成果

    (16件)

すべて 2013 2012 2011

すべて 雑誌論文 (4件) (うち査読あり 3件) 学会発表 (12件) (うち招待講演 1件)

  • [雑誌論文] Lotus japonicus E3 ligase SEVEN IN ABSENTIA4 destabilizes the symbiosis receptor-.like kinase SYMRK and negatively regulates rhizobial infection2012

    • 著者名/発表者名
      Den Herder, G., Yoshida, S., Antol#237;n-Llovera, M., Ried, M., Parniske, M.
    • 雑誌名

      Plant Cell

      巻: 24 号: 4 ページ: 1691-1707

    • DOI

      10.1105/tpc.110.082248

    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [雑誌論文] Plants that attack plants: molecular elucidation of plant parasitism.2012

    • 著者名/発表者名
      Yoshida, S., Shirasu, K.
    • 雑誌名

      Curr. Opin. Plant Biol.

      巻: 15 号: 6 ページ: 708-713

    • DOI

      10.1016/j.pbi.2012.07.004

    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] The D3 F-box protein is a key component in host strigolactone responses essential for arbuscular mycorrhizal symbiosis.2012

    • 著者名/発表者名
      Yoshida, S., Kameoka, H., Tempo, M., Akiyama, K., Umehara, M., Yamaguchi, S., Hayashi, H., Kyozuka, J., Shirasu, K.
    • 雑誌名

      New Phytologist

      巻: 196 号: 4 ページ: 1208-1216

    • DOI

      10.1111/j.1469-8137.2012.04339.x

    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Agrobacterium rhizogenes-mediated transformation of the parasitic plant Phtheirospermum japonicum2011

    • 著者名/発表者名
      Ishida, J.K., Yoshida, S., Ito, M., Namba, S., Shirasu, K.
    • 雑誌名

      PLoS One

      巻: 6 号: 10 ページ: e25802-e25802

    • DOI

      10.1371/journal.pone.0025802

    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] 寄生植物ストライガにおける寄生成立時の遺伝子発現解析2013

    • 著者名/発表者名
      吉田聡子
    • 学会等名
      日本植物病理学会
    • 発表場所
      岐阜大学
    • 年月日
      2013-03-27
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] 寄生植物ストライガにおける寄生成立時のトランスクリプトーム解析2013

    • 著者名/発表者名
      吉田聡子
    • 学会等名
      日本植物生理学会
    • 発表場所
      岡山大学津島キャンパス
    • 年月日
      2013-03-21
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] 寄生植物コシオガマの寄生形質獲得に関わる遺伝子の同定2012

    • 著者名/発表者名
      吉田聡子
    • 学会等名
      新学術領域研究「複合適応形質進化の遺伝子基盤解明」 平成24年度 公開シンポジウム
    • 発表場所
      東京大学弥生講堂
    • 年月日
      2012-09-26
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 寄生植物ストライガの解析基盤の確立と寄生機構の解析2012

    • 著者名/発表者名
      吉田聡子
    • 学会等名
      日本植物学会第76回大会
    • 発表場所
      兵庫県立大学
    • 年月日
      2012-09-15
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] Draft genome sequences of the parasitic Striga species2012

    • 著者名/発表者名
      Satoko Yoshida
    • 学会等名
      XV International Congress of Molecular Plant-Microbal Interactions
    • 発表場所
      京都国際会議場
    • 年月日
      2012-07-29
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] 寄生植物ストライガのゲノムシーケンス解読2012

    • 著者名/発表者名
      吉田聡子
    • 学会等名
      第2回NGS現場の会
    • 発表場所
      ホテル阪急エキスポパーク
    • 年月日
      2012-05-24
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] ハマウツボ科寄生植物コシオガマの変異体解析による植物寄生におけるhaustorial hairの役割2012

    • 著者名/発表者名
      吉田聡子, 上野章子, 白須賢
    • 学会等名
      日本植物生理学会台53回年会
    • 発表場所
      京都産業大学京都市
    • 年月日
      2012-03-16
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] ハマウツボ科寄生植物のトランスクリプトーム解析2011

    • 著者名/発表者名
      吉田聡子, Juliane K.Ishida, Claude dePamphilis, Eric Waflila, 白須賢
    • 学会等名
      植物微生物研究会第21回交流会
    • 発表場所
      岡山大学(岡山市)
    • 年月日
      2011-09-21
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] ゲノミクス的アプローチによる寄生植物ストライガの寄生機構の解析2011

    • 著者名/発表者名
      吉田聡子, Juliane Ishida, 白須賢
    • 学会等名
      日本植物学会第75回大会
    • 発表場所
      東京大学駒場キャンパス(東京)(招待講演)
    • 年月日
      2011-09-18
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] Transcriptome analysis of the parasitic plant Phtheirospermum japonicum2011

    • 著者名/発表者名
      Ishida JK, Yoshida S, Wafula E, dePamphilis CW, Namba S, Shirasu K
    • 学会等名
      The 11th World Congress on parasitic plants
    • 発表場所
      イタリアマルティナフランカ
    • 年月日
      2011-06-11
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] Large-scale sequencing analysis of Striga species2011

    • 著者名/発表者名
      Satoko Yoshida, Juliane K.Ishida, Abdelbagi M.Ali, Shinichiro Maruyama, Hisayoshi Nozaki, Ken Shirasu
    • 学会等名
      The 11^<th> World Congress on parasitic plants
    • 発表場所
      イタリアマルティナフランカ
    • 年月日
      2011-06-08
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] 寄生植物コシオガマの次世代シーケンサーを用いた発現解析2011

    • 著者名/発表者名
      吉田聡子、Juliane Ishida, 白須賢
    • 学会等名
      NGS現場の会第一回研究会
    • 発表場所
      静岡県熱海市
    • 年月日
      2011-05-28
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書

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公開日: 2011-04-06   更新日: 2018-03-28  

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