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DNA二本鎖損傷依存性ヒストンユビキチン化による複製転写制御とゲノム安定性

公募研究

研究領域ゲノム複製・修復・転写のカップリングと普遍的なクロマチン構造変換機構
研究課題/領域番号 23131513
研究種目

新学術領域研究(研究領域提案型)

配分区分補助金
審査区分 生物系
研究機関大阪大学 (2012)
慶應義塾大学 (2011)

研究代表者

中田 慎一郎  大阪大学, 医学(系)研究科(研究院), 准教授 (70548528)

研究期間 (年度) 2011-04-01 – 2013-03-31
研究課題ステータス 完了 (2012年度)
配分額 *注記
13,390千円 (直接経費: 10,300千円、間接経費: 3,090千円)
2012年度: 6,630千円 (直接経費: 5,100千円、間接経費: 1,530千円)
2011年度: 6,760千円 (直接経費: 5,200千円、間接経費: 1,560千円)
キーワードDNA損傷応答 / OTUB1 / ユビキチン / DNA損傷 / UBC13
研究実績の概要

DNA二本鎖損傷部位では、損傷部位にある様々な分子がユビキチン化され、クロマチン構造の変換やシグナルの伝達などが行われている。ユビキチン化を行うE3 ubiquitin ligaseはRNF8,RNF168であり、E2 ubiquitin conjugating enzymeはUBC13-UEV1a(もしくはMMS2)複合体である。UBC13-UEV1a複合体は、脱ユビキチン化酵素OTUB1が結合するとOTUB1の脱ユビキチン活性非依存性に活性が抑制される。OTUB1の発現を抑制するとDNA損傷応答が促進される。この知見は、OTUB1とUBC13との結合部位を標的とする化合物があれば、細胞内のDNA損傷応答を人為的にコントロールすることが可能であることを示している。そこで、UBC13-MMS2-Ubiquitin-OTUB1が結合した結晶の構造解析を行った。その結果OTUB1のF133,F138、M211がUBC13との結合に重要なアミノ酸であることを見いだした。細胞生物学および分子生物学の手法を用い、これらの部位のアミノ酸がDNA損傷応答にも重要であることを確認した。
RNF168と結合する分子を質量分析法で解析したところ、RNF168はヒストンメチル化酵素の活性制御因子とDNA損傷依存性に結合することが示された。53BP1がDNA損傷部位へと局在するためになぜRNF168依存性のユビキチン化が必要なのかはこれまで判明していなかったが、本知見はこれを解明するための大きな手がかりになると考えられる。
また、本研究における実験結果を手がかりとして、OTUB1とは異なるDNA損傷応答を抑制的に制御する分子が存在することを発見した。これらの分子は他のDNA損傷応答分子のDNA損傷部位への局在を間接的に制御しており、クロマチンユビキチン化にも影響を及ぼすことを示す結果が集積しつつある。

現在までの達成度 (段落)

24年度が最終年度であるため、記入しない。

今後の研究の推進方策

24年度が最終年度であるため、記入しない。

報告書

(2件)
  • 2012 実績報告書
  • 2011 実績報告書
  • 研究成果

    (5件)

すべて 2013 2012 2011 その他

すべて 雑誌論文 (1件) (うち査読あり 1件) 学会発表 (3件) (うち招待講演 1件) 備考 (1件)

  • [雑誌論文] Molecular basis of Lys-63-linked polyubiquitination inhibition by the interaction between human deubiquitinating enzyme OTUB1 and ubiquitin-conjugating enzyme UBC13.2012

    • 著者名/発表者名
      Sato Y, Yamagata A, Goto-Ito S, Kubota K, Miyamoto R, Nakada S, Fukai S.
    • 雑誌名

      J Biol Chem.

      巻: 287(31) 号: 31 ページ: 25860-8

    • DOI

      10.1074/jbc.m112.364752

    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] Complex regulation of homologous recombination by E3 ligases2013

    • 著者名/発表者名
      Shinichiro Nakada
    • 学会等名
      AACR/JCA Joint Conference
    • 発表場所
      ハワイ マウイ島
    • 年月日
      2013-02-21
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 脱ユビキチン化酵素OTUB1によるDNA損傷依存性ユビキチン化反応の制御2011

    • 著者名/発表者名
      中田慎一郎
    • 学会等名
      第34回日本分子生物学会
    • 発表場所
      横浜パシフィコ横浜
    • 年月日
      2011-12-16
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] OTUB1 sequesters UBC13 and inhibits DNA-damage dependent ubiquitination2011

    • 著者名/発表者名
      Shinichiro Nakada
    • 学会等名
      The EMBO Meeting 2011
    • 発表場所
      Vienna, Austria
    • 年月日
      2011-09-11
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [備考] 大阪大学 医学系研究科 細胞応答制御学

    • URL

      http://www.bcr.med.osaka-u.ac.jp/public_html/index.html

    • 関連する報告書
      2012 実績報告書

URL: 

公開日: 2011-04-06   更新日: 2018-03-28  

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