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哺乳類MHC領域の多型の進化

公募研究

研究領域先端技術を駆使したHLA多型・進化・疾病に関する統合的研究
研究課題/領域番号 23133503
研究種目

新学術領域研究(研究領域提案型)

配分区分補助金
審査区分 生物系
研究機関東京大学

研究代表者

野中 勝  東京大学, 理学(系)研究科(研究院), 教授 (40115259)

研究期間 (年度) 2011-04-01 – 2013-03-31
研究課題ステータス 完了 (2012年度)
配分額 *注記
6,240千円 (直接経費: 4,800千円、間接経費: 1,440千円)
2012年度: 3,120千円 (直接経費: 2,400千円、間接経費: 720千円)
2011年度: 3,120千円 (直接経費: 2,400千円、間接経費: 720千円)
キーワードPSMB8 / 免疫プロテアソーム / 二型性 / MHC / プロテアソーム / クラスI抗原提示 / 平衡淘汰 / 多型性 / 有袋類 / 単孔類
研究実績の概要

免疫プロテアソームのプロテアーゼ活性を有するサブユニットの一つをコードするPSMB8遺伝子は、多くの顎口類において切断特異性を決定すると考えられる31番目の残基がアラニンのA型と、フェニルアラニンのF型の二種類のアレルが知られている。ところがこれまでに知られている真獣類のPSMB8は全てA型であり、当研究では有袋類、単孔類を調べることにより、哺乳類の進化過程のどの段階でF型の消失が生じたかを明らかにすることを目標にした。昨年は有袋類のワラビー、オポッサムおよび単孔類のカモノハシを解析し、A型しか存在しないと言う結果を得た。今年度は有袋類のタスマニアデビル、ウォンバット、コアラ、クァッカワラビー、セスジキノボリカンガルー、リングテイル、ハリモグラを解析した。オーストラリアの研究者から提供された、各種1から数個体の血球よりDNAを抽出し、PSMB8の様々なエクソン上に設計したuniversal primerを用いてPCRを行い、direct sequencingにより31番目のアミノ酸を推定することによりタイピングした。PCRでバンドが検出できなかったハリモグラを除く全ての種でPSMB8遺伝子の配列を得ることができたが、全てA型であった。半数以上の個体でイントロンに多型を検出することができ、両方のアリルともにA型であることが確認できた。以上より、F型の喪失は哺乳類の共通祖先で生じたと結論した。また、有袋類、単孔類のいくつかの種において、PSMB8とクラスI遺伝子の緊密な連鎖がたもたれていることから、真獣類に見られる両者の連鎖の喪失は、PSMB8遺伝子の二型の喪失にはるかに遅れて生じたことが明らかになった。

現在までの達成度 (段落)

24年度が最終年度であるため、記入しない。

今後の研究の推進方策

24年度が最終年度であるため、記入しない。

報告書

(2件)
  • 2012 実績報告書
  • 2011 実績報告書
  • 研究成果

    (11件)

すべて 2012 2011

すべて 雑誌論文 (4件) (うち査読あり 4件) 学会発表 (7件)

  • [雑誌論文] Highly divergent dimorphic alleles of the proteasome subunit beta type-8 (PSMB8) gene of the bichir Polypterus senegalus : implication for evolution of the PSMB8 gene of jawed vertebrates2012

    • 著者名/発表者名
      Fujito NT, Nonaka M
    • 雑誌名

      Immunogenetics

      巻: (in press) 号: 6 ページ: 447-453

    • DOI

      10.1007/s00251-012-0602-8

    • 関連する報告書
      2012 実績報告書 2011 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Long-lived dichotomous lineages of the proteasome subunit beta type 8 (PSMB8) gene surviving more than 500 million years as alleles or paralogs2012

    • 著者名/発表者名
      Tsukamoto, K.
    • 雑誌名

      Mol. Biol. Evol.

      巻: 29 号: 10 ページ: 3071-3079

    • DOI

      10.1093/molbev/mss113

    • 関連する報告書
      2012 実績報告書 2011 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] A population genetic study on the relationship between medaka fish and wet-rice-cultivation spreads over the Japanese archipelago2012

    • 著者名/発表者名
      Katsumura, T.
    • 雑誌名

      Anthropol. Sci.

      巻: 120 ページ: 81-89

    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Retained orthologous relationships of the MHC class I genes during euteleost evolution2011

    • 著者名/発表者名
      Nonaka, et al
    • 雑誌名

      Molecular Biology and Evolution

      巻: 28 ページ: 3099-3112

    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] The evolution of The Proteasome Subunit Beta Type 8 (PSMB8) Gene in Non-eutherian Mammals2012

    • 著者名/発表者名
      Ming-Hsuan Yu
    • 学会等名
      第35回日本分子生物学会年会
    • 発表場所
      マリンメッセ福岡(福岡)
    • 年月日
      2012-12-11
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] 鱗移植片の急性拒絶反応に関わるメダカMHC遺伝子の同定2012

    • 著者名/発表者名
      坂内英美
    • 学会等名
      第21回日本組織適合性学会大会
    • 発表場所
      明治大学駿河台キャンパス(東京)
    • 年月日
      2012-09-15
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] フグ目におけるPSMB8遺伝子の二型性の進化2012

    • 著者名/発表者名
      源島裕祐
    • 学会等名
      日本進化学会第14回東京大会
    • 発表場所
      首都大学東京(東京)
    • 年月日
      2012-08-21
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] Long-term trans-species dimorphism of the PSMB8 gene in the actinopterygian MHC region2012

    • 著者名/発表者名
      藤戸尚子
    • 学会等名
      The 12th international congress of International Society of Developmental and Comparative Immunology
    • 発表場所
      ヒルトン福岡シーホーク(福岡)
    • 年月日
      2012-07-09
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] Recurrent revival of dimorphism of the PSMB8 gene during tetrapod evolution2012

    • 著者名/発表者名
      Ching-Huei Huang
    • 学会等名
      The 12th international congress of International Society of Developmental and Comparative Immunology
    • 発表場所
      ヒルトン福岡シーホーク(福岡)
    • 年月日
      2012-07-09
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] Long-term Transspecies Dimorphism of the PSMB8 gene in Actinopterygii2011

    • 著者名/発表者名
      藤戸尚子
    • 学会等名
      Society for Molecular Biology and Evolution
    • 発表場所
      京都大学(京都)
    • 年月日
      2011-07-28
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] Recurrent Revival of Dimorphism of the PSMB8 Gene During Tetrapod Evolution2011

    • 著者名/発表者名
      Ching-Huei Huang
    • 学会等名
      Society for Molecular Biology and Evolution
    • 発表場所
      京都大学(京都)
    • 年月日
      2011-07-28
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書

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公開日: 2011-04-06   更新日: 2018-03-28  

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