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アミノ酸ー核酸ハイブリッド分子を用いたイムノモジュレーターの開発

公募研究

研究領域マテリアルシンバイオシスための生命物理化学
研究課題/領域番号 23H04076
研究種目

学術変革領域研究(A)

配分区分補助金
審査区分 学術変革領域研究区分(Ⅱ)
研究機関大阪大学

研究代表者

朴 昭映  大阪大学, 免疫学フロンティア研究センター, 特任准教授(常勤) (10628556)

研究期間 (年度) 2023-04-01 – 2025-03-31
研究課題ステータス 交付 (2024年度)
配分額 *注記
7,800千円 (直接経費: 6,000千円、間接経費: 1,800千円)
2024年度: 3,900千円 (直接経費: 3,000千円、間接経費: 900千円)
2023年度: 3,900千円 (直接経費: 3,000千円、間接経費: 900千円)
キーワード核酸 / バイオハイブリッド分子 / 核酸医薬 / アミノ酸 / 免疫タンパク質 / RNA / 免疫反応
研究開始時の研究の概要

本研究では、アミノ酸とDNAが持つ優れた特徴 (多様な高次構造、金属配位能、ルイス酸触媒機能など) に着目し、二つの生体分子を融合・精密制御することでシンバイオティックマテリアルライブラリーを構築し、免疫反応を制御するタンパク質を標的とするイムノモジュレーター(Immunomodulator) を開発する。核酸の高次構造内にアミノ酸を積み上げる技術はDNAナノテクノロジーと融合することにより生体内で細胞の運命を制御する新しいツールとしてナノ酵素を開発することなどが期待できる。

研究実績の概要

オリゴヌクレオチド治療剤は、活性物質を見つけるために複雑な探索過程が必要だった既存の創薬プロセスと比べ、遺伝子配列や機能を基盤として治療薬を設計することができる。そのため、アンチセンスオリゴヌクレオチド(ASO)やアプタマー(aptamer)、免疫活性制御物質(immunomodulating agent)など核酸オリゴマーに基づいた次世代分子標的薬の開発が活発に行われている。本研究では、アミノ酸と核酸を融合したバイオハイブリッド分子 (Amino acid-Nucleic acid Hybrids, 以下ANHsと表記) を設計・合成し、免疫反応を制御するタンパク質を標的とするイムノモジュレーター(Immunomodulator) を開発している。

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

2: おおむね順調に進展している

理由

本研究では、 アミノ酸を導入したRNA分子を設計し、免疫反応を制御する核酸分子としての評価する実験を行った。Regnase-1 は、ステムループ RNA や一本鎖 RNA を分解するエンドヌクレアーゼとして、炎症反応に関与する転写産物の制御に重要な役割を担うタンパク質である。Regnase-1をターゲットタンパク質として選定し、以下のように研究を行っている。
1) アミノ酸-核酸ハイブリッド分子の設計と合成:Fmoc基で保護されたアミノ酸とD-スレオニノールの縮合反応を行い、アミノ酸としてリシンを導入したホスホロアミダイトを合成した。ホスホロアミダイト化した後、合成機に導入することで、オリゴヌクレオチドが自動プロセスにより合成できた。
2) Regnase-1を標的とするアミノ酸-核酸ハイブリッド分子の開発:リジン残機は、Regnaseの活性部位に存在するアスパラギン酸との相互作用により炎症性mRNAの分解を阻害することが考えられる。今回は、先行研究で報告されているIL-6 RNA配列を選択し、それをリジン残基で修飾したリシン-核酸ハイブリッド分子を合成した。Regnase-1との結合性を評価するため、RNA切断基質を用いてRNA切断阻害能を調べた。その結果、リジン修飾RNAはRegnase-1と結合し、FAM-RNAのRNA切断を阻害することがわかった。しかし、ルシフェラーゼレポーターアッセイでは、明確な変化が得られなかったため、その原因を調べている。

今後の研究の推進方策

最近、マイクロスケール熱泳動法 (Microscale Thermophoresis, MST) を行い、Regnase-1タンパク質とRNAの相互作用を調べたところ、先行研究で報告されたRNAアプタマー配列が、既知のRNA切断基質と競合的にRegnase-1と結合することがわかった。今後は、RNAアプタマー配列にヒスチジン残基を導入したヒスチジン-核酸ハイブリッド分子を合成し、Regnase-1への結合性を評価する。ヒスチジン残基はRegnase-1の活性部位 (PIN domain) のMg2+の配位との相互作用によりRNA切断反応を阻害することが考えられる。また、分子モデリング研究によりアミノ酸修飾RNAとRegnase-1の複合体の分子間相互作用を予測可能なモデルを構築する。

報告書

(1件)
  • 2023 実績報告書
  • 研究成果

    (9件)

すべて 2023

すべて 雑誌論文 (6件) (うち国際共著 6件、 査読あり 6件、 オープンアクセス 2件) 学会発表 (3件) (うち国際学会 3件、 招待講演 3件)

  • [雑誌論文] Histidine-DNA nanoarchitecture as laccase mimetic DNAzymes2023

    • 著者名/発表者名
      Yum Ji Hye、Kumagai Tomotaka、Hori Daisuke、Sugiyama Hiroshi、Park Soyoung
    • 雑誌名

      Nanoscale

      巻: 15 号: 25 ページ: 10749-10754

    • DOI

      10.1039/d3nr01625k

    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Electrospun composite nanofibers of deoxyribonucleic acid and polylactic acid for skincare applications2023

    • 著者名/発表者名
      Ullah Sana、Ali Hina Ghulam、Hashmi Motahira、Haider Md. Kaiser、Ishaq Tehmeena、Tamada Yasushi、Park Soyoung、Kim Ick Soo
    • 雑誌名

      Journal of Biomedical Materials Research Part A

      巻: 111 号: 11 ページ: 1798-1807

    • DOI

      10.1002/jbm.a.37592

    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] Intercellular crosstalk in adult dental pulp is mediated by heparin-binding growth factors Pleiotrophin and Midkine2023

    • 著者名/発表者名
      Jiravejchakul Natnicha、Abe Gabriela L.、Loza Martin、Park Soyoung、Matangkasombut Ponpan、Sasaki Jun-Ichi、Imazato Satoshi、Diez Diego、Standley Daron M.
    • 雑誌名

      BMC Genomics

      巻: 24 号: 1 ページ: 184-184

    • DOI

      10.1186/s12864-023-09265-w

    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Thiophene-Extended Fluorescent Nucleosides as Molecular Rotor-Type Fluorogenic Sensors for Biomolecular Interactions2023

    • 著者名/発表者名
      Kumagai Tomotaka, Kinoshita Ban, Hirashima Shingo, Sugiyama Hiroshi, Park Soyoung
    • 雑誌名

      ACS Sensors

      巻: 8 号: 2 ページ: 923-932

    • DOI

      10.1021/acssensors.2c02617

    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] Fluorogenic bisazide cyanine probe as a highly efficient acrolein detection tool for diagnosing triple negative breast cancer2023

    • 著者名/発表者名
      Choi Hyun Sun、Yum Ji Hye、Jeong Yeonsu、Lim Soobin、Kumagai Tomotaka、Cha Hyung Joon、Park Soyoung
    • 雑誌名

      Sensors and Actuators B: Chemical

      巻: 380 ページ: 133404-133404

    • DOI

      10.1016/j.snb.2023.133404

    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] Evaluation by Experimentation and Simulation of a FRET Pair Comprising Fluorescent Nucleobase Analogs in Nucleosomes2023

    • 著者名/発表者名
      Hirashima Shingo, Park Soyoung, Sugiyama Hiroshi
    • 雑誌名

      Chemistry - A European Journal

      巻: 29 号: 24

    • DOI

      10.1002/chem.202203961

    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 査読あり / 国際共著
  • [学会発表] Fluorescent nucleosides to detect Z-DNA/RNA2023

    • 著者名/発表者名
      Soyoung Park
    • 学会等名
      ABZ meeting
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Amino acid-Nucleic acid Hybrids (ANHs) for Catalysis and Aptamer Applications2023

    • 著者名/発表者名
      Soyoung Park
    • 学会等名
      ISNAC2023 (The 50th International Symposium on Nucleic Acids Chemistry)
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Amino acid-Nucleic acid Hybrids (ANHs) as Versatile Biohybrid Materials2023

    • 著者名/発表者名
      Soyoung Park
    • 学会等名
      KIChE Spring Meeting and International Symposium
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演

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公開日: 2023-04-13   更新日: 2024-12-25  

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