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大視野3次元蛍光イメージング法の開発

公募研究

研究領域散乱・揺らぎ場の包括的理解と透視の科学
研究課題/領域番号 23H04135
研究種目

学術変革領域研究(A)

配分区分補助金
審査区分 学術変革領域研究区分(Ⅱ)
研究機関大阪大学

研究代表者

市村 垂生  大阪大学, 先導的学際研究機構, 特任准教授(常勤) (50600748)

研究期間 (年度) 2023-04-01 – 2025-03-31
研究課題ステータス 交付 (2024年度)
配分額 *注記
9,100千円 (直接経費: 7,000千円、間接経費: 2,100千円)
2024年度: 4,550千円 (直接経費: 3,500千円、間接経費: 1,050千円)
2023年度: 4,550千円 (直接経費: 3,500千円、間接経費: 1,050千円)
キーワードバイオイメージング / 蛍光顕微鏡 / 三次元 / 光学 / 蛍光イメージング
研究開始時の研究の概要

近年の生命科学における多細胞システム研究では、システム全体の動作と個々の細胞の動作を同時に捉えるために、光学イメージングの大視野化が重要な技術の一つとなっている。従来の生物顕微鏡はレンズの性能、筐体の構造、イメージセンサーの画素数などの制限により、必ずしもその需要に応えられていなかった。申請者は、センチメーターを越える視野全域を1細胞分解能で観察できるイメージング系を開発してきた。このイメージング系を応用展開するために、本研究では、個体や組織などの散乱体内部を細胞観察可能な三次元分解能を実現する新規基盤技術を開発することを目的とする。

研究実績の概要

近年の生命科学における多細胞システム研究では、システム全体の動作と個々の細胞の動作を同時に捉えるために、光学イメージングの大視野化が重要な技術の一つとなっている。従来の生物顕微鏡はレンズの性能、筐体の構造、イメージセンサーの画素数などの制限により、必ずしもその需要に応えられていなかった。本研究では、研究代表者がこれまでに開発してきた、センチメーターを越える視野全域を1細胞分解能で観察できるイメージング系を基軸として、個体や組織などの散乱体内部を三次元イメージングを実現することを目指す。初年度は、下記の2つの要素技術開発課題を実施した。
(1)多点共焦点ディスクの設計
多点共焦点イメージングのためのピンホールディスクアレイを試作し、共焦点イメージング系を構築し、その深さ選択性を蛍光ビーズによって実証した。共焦点ディスクの透過率を上げるために、ピンホール径とピンホール間隔を変更したピンホールアレイを試作し、光学性能を調べた。高い透過率が必要な場合にピンホール径6um、ピンホール間隔18umのピンホールアレイが有効であることが分かった。
(2)励起光量の向上
現状のピンホールアレイディスクでは、励起光の多くがピンホールアレイのピンホールのない場所で反射されてしまうため、光の利用効率が数%に留まる。そこで、複数のレーザー光源を液体ライトガイドで結合する手法を提案した。これにより、従来よりも数倍の明るさで試料を照明できるようになった。
以上の2つの要素技術開発によって、従来よりも5倍程度の明るいイメージングを実現した。

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

2: おおむね順調に進展している

理由

当初の計画どおりに研究が進捗している。

今後の研究の推進方策

2年度は、これまでの要素技術開発を更に進めながら、並行して、モデル生物の胚発生における三次元タイムラプスイメージングに応用を進める。マウス、鳥類、魚類のモデル生物の観察を予定する。

報告書

(1件)
  • 2023 実績報告書
  • 研究成果

    (9件)

すべて 2024 2023

すべて 雑誌論文 (6件) (うち査読あり 3件、 オープンアクセス 3件) 学会発表 (3件) (うち国際学会 2件、 招待講演 2件)

  • [雑誌論文] Volumetric trans-scale imaging of massive quantity of heterogeneous cell populations in centimeter-wide tissue and embryo2024

    • 著者名/発表者名
      Ichimura Taro、Kakizuka Taishi、Sato Yuki、Itano Keiko、Seiriki Kaoru、Hashimoto Hitoshi、Itoga Hiroya、Onami Shuichi、Nagai Takeharu
    • 雑誌名

      eLife

      巻: -

    • DOI

      10.7554/elife.93633.1

    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Strength in numbers: Unleashing the potential of trans-scale scope AMATERAS for massive cell quantification2024

    • 著者名/発表者名
      Ichimura Taro、Kakizuka Taishi、Sato Yuki、Fujioka Yoichiro、Ohba Yusuke、Horikawa Kazuki、Nagai Takeharu
    • 雑誌名

      Biophysics and Physicobiology

      巻: 21 号: Supplemental ページ: n/a

    • DOI

      10.2142/biophysico.bppb-v21.s017

    • ISSN
      2189-4779
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] 細胞画像ビッグデータによるバイオDX2023

    • 著者名/発表者名
      市村垂生, 糸賀裕弥, 垣塚太志, 大浪修一, 永井健治
    • 雑誌名

      光アライアンス

      巻: 34 ページ: 48-52

    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Volumetric trans-scale imaging of massive quantity of heterogeneous cell populations in centimeter-wide tissue and embryo2023

    • 著者名/発表者名
      Ichimura Taro、Kakizuka Taishi、Sato YuKi、Itano Keiko、Seiriki Kaoru、Hashimoto Hitoshi、Itoga Hiroya、Onami Shuichi、Nagai Takeharu
    • 雑誌名

      bioRxiv

      巻: -

    • DOI

      10.1101/2023.08.21.553997

    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • オープンアクセス
  • [雑誌論文] センチメートルスケールの多細胞集団内のミクロ現象を捉えるトランススケールスコープ2023

    • 著者名/発表者名
      市村垂生, 垣塚太志, 橋本均, 永井健治
    • 雑誌名

      光学

      巻: 52 ページ: 322-331

    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
  • [雑誌論文] 巨大データを生み出すトランススケールスコープとその取扱いを可能にする情報プラットフォーム2023

    • 著者名/発表者名
      市村垂生, 糸賀裕弥, 垣塚太志, 大浪修一, 永井健治
    • 雑誌名

      光技術コンタクト

      巻: 61 ページ: 43-51

    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
  • [学会発表] Trans-scale scope for volumetric imaging of micrometer-scale cellular dynamics in centimeter-scale multicellular systems2023

    • 著者名/発表者名
      Taro Ichimura, T. Kakizuka, K. Itano, K. Seiriki, H. Hashimoto, Y. Sato, T. Nagai
    • 学会等名
      The 20th International Microscopy Congress (IMC20)
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Three-dimensional imaging of micrometer-scale cellular dynamics in centimeter-scale multicellular systems2023

    • 著者名/発表者名
      Taro Ichimura
    • 学会等名
      EMBO Satellite Meeting “New Approaches for the Properties of Bio-materials”
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] 大視野細胞イメージング法と生命科学への応用展開2023

    • 著者名/発表者名
      市村垂生
    • 学会等名
      第17回日本分子イメージング学会
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 招待講演

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公開日: 2023-04-13   更新日: 2024-12-25  

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