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人工低分子抗体を介した酵素機能改変による次世代型オリゴ糖プレバイオティクスの創出

公募研究

研究領域生体反応の集積・予知・創出を基盤としたシステム生物合成科学
研究課題/領域番号 23H04559
研究種目

学術変革領域研究(A)

配分区分補助金
審査区分 学術変革領域研究区分(Ⅱ)
研究機関京都府立大学

研究代表者

田中 俊一  京都府立大学, 生命環境科学研究科, 准教授 (70591387)

研究期間 (年度) 2023-04-01 – 2025-03-31
研究課題ステータス 交付 (2024年度)
配分額 *注記
10,790千円 (直接経費: 8,300千円、間接経費: 2,490千円)
2024年度: 5,460千円 (直接経費: 4,200千円、間接経費: 1,260千円)
2023年度: 5,330千円 (直接経費: 4,100千円、間接経費: 1,230千円)
キーワードプレバイオティクス / オリゴ糖 / 酵素 / 人工結合タンパク質 / タンパク質工学
研究開始時の研究の概要

ミルクオリゴ糖には様々な結合様式と重合度のものがあり、その構造的多様性こそが数多の生理機能を発現する基盤となっている。一方、ミルクオリゴ糖を模倣する市販の「人工」オリゴ糖の構造的多様性は乏しい。本研究では、申請者独自のタンパク質工学技術を駆使したオリゴ糖合成酵素の機能改変を通して、人工オリゴ糖の構造的多様性を高めることで、次世代型プレバイオティクスの生産基盤を構築する。

研究実績の概要

本年度は、①分岐型結合に特異性をもったオリゴ糖合成酵素の開発、②グリコシルアクセプターの多様化、の2つの方向性で研究を進めた。
①分岐型結合に特異性をもったオリゴ糖合成酵素の開発
人工低分子抗体モノボディ(Mb)を利用する独自の酵素機能改変技術「Enzyme Engineering by Proxy」を用いることで、β-galactosidaseの特異性を直鎖型β-1,4から分岐型β-1,3へと改変できることを見出している。直鎖型から分岐型への改変度合いは70%近くを実現しており、さらに、酵素自体には全く手を加えていないために比活性への影響はなく、GOSの収量低下も見られない。今年度は、β-galactosidaseとGOS、β-galactosidase/Mb複合体、β-galactosidase/Mb複合体とGOS、の3つの構造決定に成功し、Mbが特異性を改変する分子機序を解明した。現在、同じβ-galactosidaseを対象に他の分岐型β-1,6への改変を試みている。
②グリコシルアクセプターの多様化
Aspergillus fijiensis由来β-fructofuranosidaseを対象に、低カロリーでありながらプレバイオティクスとしての機能も期待されている糖アルコールに焦点を当て、フラクトシル化を検証した。その結果、Maltitolにおいて新たなオリゴ糖の産生が確認された。NMR解析とMALDI-TOF/MS解析から、従来のFOSとは異なる3糖のフラクトシル化マルチトール(F-Mal)を特定した。その新規性は、SciFindernに未登録ということからも裏付けられた。純度95%以上のF-Mal溶液の調製にも成功し、現在はヒト腸内細菌叢モデルを用いてプレバイオティクス機能の評価を進めている。並行して、他のグリコシルアクセプターに対する反応性の検証も継続している。

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

1: 当初の計画以上に進展している

理由

上述の通り、①分岐型結合に特異性をもったオリゴ糖合成酵素の開発と、②グリコシルアクセプターの多様化、それぞれにおいて成果が得られており、特に②においては新規オリゴ糖の開発を初年度に達成できたことから、当初の計画以上に進展していると判断した。

今後の研究の推進方策

①分岐型結合に特異性をもったオリゴ糖合成酵素の開発
β-galactosidaseを対象に他の分岐型β-1,6への改変に取り組むとともに、Aspergillus fijiensis由来β-fructofuranosidaseを対象に直鎖型β-2,1から分岐型β-1,6への改変を試みる。
②グリコシルアクセプターの多様化
初年度とは異なる種類の糖アクセプターに対する反応性を検証し、引き続き新規オリゴ糖の開発と機能性評価を進めていく。

報告書

(1件)
  • 2023 実績報告書
  • 研究成果

    (22件)

すべて 2024 2023

すべて 雑誌論文 (5件) (うち査読あり 5件、 オープンアクセス 3件) 学会発表 (13件) (うち国際学会 1件) 産業財産権 (4件)

  • [雑誌論文] Engineering a monobody specific to monomeric Cu/Zn‐superoxide dismutase associated with amyotrophic lateral sclerosis2024

    • 著者名/発表者名
      Amesaka Hiroshi、Hara Mizuho、Sakai Yuki、Shintani Atsuko、Sue Kaori、Yamanaka Tomoyuki、Tanaka Shun‐ichi、Furukawa Yoshiaki
    • 雑誌名

      Protein Science

      巻: 33 号: 4

    • DOI

      10.1002/pro.4961

    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Conformation state-specific monobodies regulate the functions of flexible proteins through conformation trapping2023

    • 著者名/発表者名
      Ibuki Nakamura, Hiroshi Amesaka, Mizuho Hara, Kento Yonezawa, Keisuke Okamoto, Hironari Kamikubo, Shun-ichi Tanaka, Takashi Matsuo
    • 雑誌名

      Protein Sci.

      巻: 32 号: 12

    • DOI

      10.1002/pro.4813

    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Structures of a FtsZ single protofilament and a double-helical tube in complex with a monobody2023

    • 著者名/発表者名
      Junso Fujita, Hiroshi Amesaka, Takuya Yoshizawa, Kota Hibino, Natsuki Kamimura, Natsuko Kuroda, Takamoto Konishi, Yuki Kato, Mizuho Hara, Tsuyoshi Inoue, Keiichi Namba, Shun-ichi Tanaka, Hiroyoshi Matsumura
    • 雑誌名

      Nature Communications

      巻: 14 号: 1 ページ: 4073-4073

    • DOI

      10.1038/s41467-023-39807-5

    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] An efficient selenium transport pathway of selenoprotein P?utilizing a high-affinity ApoER2 receptor variant and being independent of selenocysteine lyase2023

    • 著者名/発表者名
      Mizuno Ayako、Toyama Takashi、Ichikawa Atsuya、Sakai Naoko、Yoshioka Yuya、Nishito Yukina、Toga Renya、Amesaka Hiroshi、Kaneko Takayuki、Arisawa Kotoko、Tsutsumi Ryouhei、Mita Yuichiro、Tanaka Shun-ichi、Noguchi Noriko、Saito Yoshiro
    • 雑誌名

      Journal of Biological Chemistry

      巻: 299 号: 8 ページ: 105009-105009

    • DOI

      10.1016/j.jbc.2023.105009

    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] ガラクトオリゴ糖の製造に有用な担子菌酵母のβ-グリコシダーゼ : 遺伝子クローニングと立体構造解析から明らかになった特徴について2023

    • 著者名/発表者名
      石川英司、田中俊一
    • 雑誌名

      日本農芸化学会誌『化学と生物』

      巻: 61 ページ: 274-280

    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] 人工結合タンパク質を用いた細胞分裂タンパク質FtsZの構造解析2023

    • 著者名/発表者名
      上村菜月、藤田純三、雨坂心人、吉澤拓也、黒田奈津子、原瑞穂、井上豪、難波啓一、田中俊一、松村浩由
    • 学会等名
      第36回日本放射光学会年会・放射光科学合同シンポジウム
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
  • [学会発表] 人工結合タンパク質を用いた糖鎖切断酵素の立体構造解析2023

    • 著者名/発表者名
      的場美希、高島晶、藤田純三、雨坂心人、吉澤拓也、難波啓一、田中俊一、松村浩由
    • 学会等名
      第36回日本放射光学会年会・放射光科学合同シンポジウム
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
  • [学会発表] 大腸菌ホスホエノールピルビン酸カルボキシラーゼのエフェクター作用機構解明に向けた構造解析2023

    • 著者名/発表者名
      三宅智哉、西村和樹、藤田純三、雨坂心人、吉澤拓也、難波啓一、田中俊一、松村浩由
    • 学会等名
      第36回日本放射光学会年会・放射光科学合同シンポジウム
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
  • [学会発表] 抗体様タンパク質「モノボディ」を用いた構造変化過程への摂動による酵素活性制御2023

    • 著者名/発表者名
      中村 伊武輝、雨坂 心人、原 瑞穂、米澤 健人、上久保 裕生、田中 俊一、廣田 俊、松尾 貴史
    • 学会等名
      日本化学会第103春季年会
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
  • [学会発表] HSbody, a heat sterilizable antibody mimetic2023

    • 著者名/発表者名
      H. Amesaka, M. Hara, A. Hirata, M. Fujihashi, K. Takano, S-i. Tanaka
    • 学会等名
      11th Asia Oceania Human Proteome Organization (AOHUPO) and 7th Asia Oceania Agricultural Proteomics Organization (AOAPO) Congress
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] PPIsを介した柔軟なタンパク質の機能制御:人工結合タンパク質の適用可能性の検証2023

    • 著者名/発表者名
      中村 伊武輝、雨坂 心人、原 瑞穂、米澤 健人、廣田 俊、上久保 裕生、田中 俊一、松尾 貴史
    • 学会等名
      第49回生体分子科学討論会
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
  • [学会発表] HSbody, a heat sterilizable antibody-mimetic based on the human cold shock domain -加熱殺菌処理可能なヒト由来抗体模倣分子の創生-2023

    • 著者名/発表者名
      雨坂心人、原瑞穂、平田あずみ、藤橋雅宏、高野和文、田中俊一
    • 学会等名
      第23回日本蛋白質科学会
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
  • [学会発表] Aspergillus niger由来prolyl endopeptidaseのN結合型糖鎖の役割2023

    • 著者名/発表者名
      巽敬太、山田聖樹、矢野真実子、吉澤拓也、高野和文、松村浩由、田中俊一
    • 学会等名
      第23回日本蛋白質科学会
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
  • [学会発表] 抗体ミメティック「モノボディ」を用いた構造変化トラップによる柔軟性タンパク質の機能制御2023

    • 著者名/発表者名
      中村 伊武輝、雨坂 心人、原 瑞穂、米澤 健人、上久保 裕生、田中 俊一、廣田 俊、松尾 貴史
    • 学会等名
      第23回日本蛋白質科学会
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
  • [学会発表] 毒性ペプチド(PR)nによるKapβ2の相分離抑制機能の阻害機構の解明2023

    • 著者名/発表者名
      谷本峰成、笹原直哉、井手郁佳、雨坂心人、原瑞穂、田中俊一、吉澤拓也、松村浩由
    • 学会等名
      第23回日本蛋白質科学会
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
  • [学会発表] ホスホエノールピルビン酸カルボキシラーゼのエフェクター作用機構2023

    • 著者名/発表者名
      西村和樹、三宅智哉、藤田純三、雨坂心人、戸谷俊太郎、原瑞穂、吉澤拓也、難波啓一、田中俊一、松村浩由
    • 学会等名
      第23回日本蛋白質科学会
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
  • [学会発表] 結晶構造解析によるグルテン分解酵素の基質認識機構の解明2023

    • 著者名/発表者名
      山田聖樹、巽敬太、矢野真実子、吉澤拓也、田中俊一、松村浩由
    • 学会等名
      第23回日本蛋白質科学会
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
  • [学会発表] セレノシステイン含有リコンビナントヒトセレノプロテインPの大腸菌生産とその機能性評価2023

    • 著者名/発表者名
      栂蓮弥、雨坂心人、越智杏奈、高野和文、三原久明、斎藤芳朗、田中俊一
    • 学会等名
      第96回日本生化学会
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
  • [産業財産権] ホスホエノールピルビン酸カルボキシラーゼを活性化することができるポリペプチド2023

    • 発明者名
      松村浩由、上原了、田中俊一、他
    • 権利者名
      松村浩由、上原了、田中俊一、他
    • 産業財産権種類
      特許
    • 産業財産権番号
      2023-211404
    • 出願年月日
      2023
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
  • [産業財産権] 抗体模倣分子2023

    • 発明者名
      田中俊一、雨坂心人、原瑞穂、古川良明
    • 権利者名
      田中俊一、雨坂心人、原瑞穂、古川良明
    • 産業財産権種類
      特許
    • 産業財産権番号
      2023-121962
    • 出願年月日
      2023
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
  • [産業財産権] 抗体模倣分子2023

    • 発明者名
      田中俊一、栂蓮弥、雨坂心人、斎藤芳郎、外山喬士、杉浦ひかり
    • 権利者名
      田中俊一、栂蓮弥、雨坂心人、斎藤芳郎、外山喬士、杉浦ひかり
    • 産業財産権種類
      特許
    • 産業財産権番号
      2023-043603
    • 出願年月日
      2023
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
  • [産業財産権] フラクトシル化マルチトールおよびその製造方法2023

    • 発明者名
      田中俊一、矢野真実子、上野慶一、宮武拓未
    • 権利者名
      田中俊一、矢野真実子、上野慶一、宮武拓未
    • 産業財産権種類
      特許
    • 産業財産権番号
      2023-007058
    • 出願年月日
      2023
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書

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公開日: 2023-04-13   更新日: 2024-12-25  

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