| 研究領域 | ゲノム・遺伝子相関：新しい遺伝学分野の創成 |
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| 研究課題/領域番号 |
24113511
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| 研究種目 |
新学術領域研究(研究領域提案型)
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| 配分区分 | 補助金 |
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| 審査区分 |
生物系
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| 研究機関 | 大学共同利用機関法人自然科学研究機構(新分野創成センター) (2013)
京都大学 (2012) |
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研究代表者 |
郷 康広 大学共同利用機関法人自然科学研究機構(新分野創成センター), 新分野創成センター, 特任准教授 (50377123)
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| 研究期間 (年度) |
2012-04-01 – 2014-03-31
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| 研究課題ステータス |
完了 (2013年度)
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| 配分額 *注記 |
11,180千円 (直接経費: 8,600千円、間接経費: 2,580千円)
2013年度: 5,590千円 (直接経費: 4,300千円、間接経費: 1,290千円)
2012年度: 5,590千円 (直接経費: 4,300千円、間接経費: 1,290千円)
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| キーワード | ゲノム / 進化 / 霊長類 / トランスクリプトーム / エピジェネティクス |
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| 研究概要 |
生物は生殖を経るたびに異なるゲノムと出会い調和と軋轢のバランスの上で自らのゲノムを形成していく。父親であるオスゲノムと母親であるメスゲノムの出会う場が子供ゲノムであり、その子供ゲノムにおいてどのように調和と軋轢のバランスが調製されているかを、父親・母親由来アリルを識別し、発現レベル、エピジェネティックレベルでのアリル間の「ゆらぎ」の様相を解明することを目的とし研究を開始した。最終年度である平成25年度は、これまでのデータの解析を行った。以下、これまでに配列解読を行ったデータである。1. ヒト1組（３個体）親子トリオトランスクリプトームデータ（平均4.8Gbp）。2. チンパンジー6組（12個体）トリオトランスクリプトームデータ（平均49.3Gbp）。3. チンパンジー1組（3個体）全ゲノムデータ（平均502Gbp）。4. チンパンジー5組（10個体）エキソームデータ（平均6.4Gbp）。
ヒトの親子トリオゲノムデータに関してはトランスクリプトームデータと同じ親子トリオのデータを公共ゲノムデータベースから取得して用いた。
これらのデータを用いて以下の結果を得た。１．親子トリオそれぞれのエキソーム（ゲノム）データとトランスクリプトームデータを組み合わせることで、父親・母親由来アリルを識別し、発現レベルでのアリル間のゆらぎの様相を的確に捉えることを可能とした。２．父親アリル・母親アリルを識別できるサイトのうち約8～12％のサイトがどちらかの親由来のアリルに偏った発現パターンを示した。３．父親・母親由来の発現アリルに偏りは認められなかった。４．アリル間の発現のゆらぎを示すサイトは種間（ヒトとチンパンジー）だけでなく種内（チンパンジー）でも共通性がほとんど見られなかったが、共通性が見られたものはインプリント遺伝子の候補遺伝子と考えられた。
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| 現在までの達成度 (区分) |
理由
25年度が最終年度であるため、記入しない。
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| 今後の研究の推進方策 |
25年度が最終年度であるため、記入しない。
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