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ミトコンドリアゲノムによる核遺伝子のエピジェネティック制御機構の解明

公募研究

研究領域ゲノム・遺伝子相関:新しい遺伝学分野の創成
研究課題/領域番号 24113517
研究種目

新学術領域研究(研究領域提案型)

配分区分補助金
審査区分 生物系
研究機関福井県立大学

研究代表者

村井 耕二  福井県立大学, 生物資源学部, 教授 (70261097)

研究期間 (年度) 2012-04-01 – 2014-03-31
研究課題ステータス 完了 (2013年度)
配分額 *注記
10,140千円 (直接経費: 7,800千円、間接経費: 2,340千円)
2013年度: 5,070千円 (直接経費: 3,900千円、間接経費: 1,170千円)
2012年度: 5,070千円 (直接経費: 3,900千円、間接経費: 1,170千円)
キーワードミトコンドリアゲノム / 花成 / エピジェネティック制御 / コムギ / 細胞質置換
研究概要

連続戻し交配によって近縁野生種Aegilops geniculata細胞質(ミトコンドリアゲノム)を導入した細胞質置換コムギ系統は、生育不良を引き起こすことなく、花成(栄養成長から生殖成長への移行)が遅延する。コムギの花成では、AP1/FUL-like MADSボックス転写因子をコードするVRN1遺伝子が中心的な役割を担う。花成促進遺伝子であるVRN1は、その発現をエピジェネティックに抑制されており、低温にあうことによってエピジェネティック状態が変化し、発現レベルが上昇する(春化現象)。本研究では、Ae. geniculata細胞質置換系統において、ミトコンドリア原因遺伝子がVRN1のエピジェネティック発現制御にどのように影響するかを明らかにし、その分子機構に迫る。
<VRN1遺伝子発現およびエピジェネティックス解析>プロモーター領域のDNAメチル化解析、およびヒストン修飾の免疫沈降法(ChIP法)解析により、ミトコンドリアからのMRSにより、春化によるVRN1遺伝子のエピジェネティック抑制の解除が阻止されることが証明された。
<ミトコンドリア原因遺伝子の探索>RNA-seq解析の結果、正常細胞質ミトコンドリアゲノムで春化処理した植物で特異的に発現するミトコンドリア遺伝子(新規orf)を4つ同定した。これらのorfと相同な領域を持つorfが、細胞質置換系統のミトコンドリアゲノムにも見出された。現在私たちは、春化における低温センサーがミトコンドリアに存在し、ミトコンドリアから特異的な遺伝子発現とMRSが生じ、VRN1のエピジェネティック制御に影響を及ぼすとする「ミトコンドリア春化センサー仮説」を提唱している。この仮説は、核と細胞質の不調和によるVRN1のエピジェネティック抑制解除の阻止をうまく説明できる。

現在までの達成度 (区分)
理由

25年度が最終年度であるため、記入しない。

今後の研究の推進方策

25年度が最終年度であるため、記入しない。

報告書

(2件)
  • 2013 実績報告書
  • 2012 実績報告書
  • 研究成果

    (14件)

すべて 2014 2013 2012

すべて 雑誌論文 (4件) (うち査読あり 4件) 学会発表 (10件) (うち招待講演 1件)

  • [雑誌論文] Level of VERNALIZATION 1 expression is correlated with earliness in extra early-flowering mutant wheat lines2014

    • 著者名/発表者名
      Nishiura, A., Y. Kazama, T. Abe, N. Mizuno, S. Nasuda and K. Murai
    • 雑誌名

      Breeding Science

      巻: 63

    • NAID

      130004690763

    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Homeotic genes and the ABCDE model for floral organ formation in wheat2013

    • 著者名/発表者名
      Murai, K.
    • 雑誌名

      Plants

      巻: 2 号: 3 ページ: 379-395

    • DOI

      10.3390/plants2030379

    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Identification of a novel homologfor a calmodulin-binding protein that is upregulated in alloplasmic wheat showing pistillody.2013

    • 著者名/発表者名
      Yamamoto, M., N. Shitsukawa, M. Yamada, K. Kato, S. Takumi, K. Kawaura, Y. OgiharaandK. Murai
    • 雑誌名

      Planta

      巻: 237 号: 4 ページ: 1001-1013

    • DOI

      10.1007/s00425-012-1812-x

    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Effect of Ppd-1 on the expression of flowering-time genes in vegetative and reproductive growth stages of wheat2012

    • 著者名/発表者名
      Kitagawa, S. et al.
    • 雑誌名

      Genes and Genetic Systems

      巻: 87 ページ: 161-168

    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] 一粒系コムギの極早生突然変異体(extra early-flowering)における花成形質と花成関連遺伝子の発現パターンの解析2013

    • 著者名/発表者名
      西浦愛子ら
    • 学会等名
      日本育種学会第123回講演会
    • 発表場所
      東京農業大学
    • 年月日
      2013-03-27
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] Epigenetic regulation of flowering-time genes controlled by mitochondrial genome2013

    • 著者名/発表者名
      Murai, K. and K. Kato
    • 学会等名
      Workshop on Molecular Mechanisms Controlling Flower Development
    • 発表場所
      Presqu’ile de Giens, Cote d’Azur, France
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] 細胞質置換コムギ系統における花成関連遺伝子のエピジェネティック制御に関与するミトコンドリア遺伝子の探索2013

    • 著者名/発表者名
      村井耕二, 尾関美穂, 加藤啓介, 北川哲, Yadav Gyawali, 寺地徹
    • 学会等名
      日本遺伝学会第85回大会
    • 発表場所
      横浜市、慶応義塾大学日吉キャンパス
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] 様々な日本コムギ品種の出穂期および種子稔性に及ぼすAegilops geniculataおよびAe. mutica細胞質の効果2013

    • 著者名/発表者名
      村井耕二, 黒坂真素美
    • 学会等名
      日本育種学会第124回講演会
    • 発表場所
      鹿児島市、鹿児島大学
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] ミトコンドリアゲノムによる核遺伝子のエピジェネティック制御 ~細胞質置換コムギにおける花成関連遺伝子~2013

    • 著者名/発表者名
      村井耕二
    • 学会等名
      第6回北陸合同バイオシンポジウム
    • 発表場所
      石川県七尾市、国民宿舎能登小牧台
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] ミトコンドリアゲノムによる花成促進遺伝子VRN1のエピジェネティック制御2013

    • 著者名/発表者名
      村井耕二
    • 学会等名
      第8回ムギ類研究会
    • 発表場所
      神戸市、神戸大学
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] ミトコンドリアゲノムによる花成関連遺伝子のエピジェネティック制御2012

    • 著者名/発表者名
      村井耕二
    • 学会等名
      第35回日本分子生物学会年会 ワークショップ「有性生殖におけるゲノム・遺伝子相関」
    • 発表場所
      福岡国際会議場
    • 年月日
      2012-12-11
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] A large scale mutant panel of wheat developed by heavy-ion beam mutagenesis and its application for genetic research2012

    • 著者名/発表者名
      Murai, K. et al.
    • 学会等名
      8th International Symposium on Swift Heavy Ions in Matter
    • 発表場所
      京都大学
    • 年月日
      2012-10-24
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] イオンビーム照射による一粒系コムギにおける大規模ミュータントパネルの作成と花成突然変異体のスクリーニング2012

    • 著者名/発表者名
      西浦愛子ら
    • 学会等名
      日本育種学会第122回講演会
    • 発表場所
      京都産業大学
    • 年月日
      2012-09-14
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] A large-scale mutant panel of einkorn wheat developed by heavy-ion beam mutagenesis and its application for flowering-time mutant screening2012

    • 著者名/発表者名
      Murai, K. et al.
    • 学会等名
      22th International Triticeae Mapping Initiative Workshop
    • 発表場所
      Fargo, North Dakota, USA
    • 年月日
      2012-06-25
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書

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公開日: 2013-05-15   更新日: 2019-07-29  

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