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心発生に必要なATP量を確保するための転写環境の解明

公募研究

研究領域生命素子による転写環境とエネルギー代謝のクロストーク制御
研究課題/領域番号 24116514
研究種目

新学術領域研究(研究領域提案型)

配分区分補助金
審査区分 生物系
研究機関大阪大学

研究代表者

二村 圭祐  大阪大学, 医学(系)研究科(研究院), 助教 (00462713)

研究期間 (年度) 2012-04-01 – 2014-03-31
研究課題ステータス 完了 (2013年度)
配分額 *注記
9,360千円 (直接経費: 7,200千円、間接経費: 2,160千円)
2013年度: 4,680千円 (直接経費: 3,600千円、間接経費: 1,080千円)
2012年度: 4,680千円 (直接経費: 3,600千円、間接経費: 1,080千円)
キーワード転写 / エピジェネティクス / 心臓発生 / 心臓 / ゲノム
研究概要

心臓は胚発生において最初に発生する器官であり発生初期から拍動を開始し死ぬまで拍動を続けるため、組織量あたり最もATPを生産し、かつ消費する。さらに、心臓発生において1本のheart tubeがloopingと呼ばれる複雑な形態形成運動を行なうことで心臓の形が作られるため、その運動のエネルギー源としてATPが十分量あることが必須である。しかしATP産生関連遺伝子を大量に発現させる転写機構は解明されていない。そこで本研究では、ヒストン修飾因子とそれに結合する転写因子群を軸にして、心臓発生におけるATP産生関連遺伝子を大量に発現させる転写環境を解明し、転写環境の破綻によるATP量の変動が心筋細胞の分化・増殖、心臓の形態形成や拍動に与える影響を明らかにすることを試みた。その結果、次世代シークエンサーによってゲノムワイドな遺伝子発現変動を同定するRNA-seq法により、ヒストンH3の36番目のリジンのメチル化酵素Whsc1がATP産生関連遺伝子群の発現量を制御することを見出した。さらにWhsc1の欠損による、胎仔心臓でのゲノムワイドなヒストン修飾プロファイルの変化をクロマチン免疫沈降法と次世代シークエンサーを組み合わせたChIP-seq法によって同定した。その結果、Whsc1欠損の胎仔心臓ではゲノムワイドにH3K36のメチル化が低下することが明らかになった。本研究によって、Whsc1の欠損により転写を抑制するH3K36のメチル化が低下し、その結果、ATP産生関連遺伝子群の遺伝子発現が増加することが示唆された。

現在までの達成度 (区分)
理由

25年度が最終年度であるため、記入しない。

今後の研究の推進方策

25年度が最終年度であるため、記入しない。

報告書

(2件)
  • 2013 実績報告書
  • 2012 実績報告書
  • 研究成果

    (16件)

すべて 2014 2013 2012 その他

すべて 雑誌論文 (6件) (うち査読あり 6件) 学会発表 (10件) (うち招待講演 4件)

  • [雑誌論文] Karyopherin alpha2 is essential for rRNA transcription and protein synthesis in proliferative keratinocytes2013

    • 著者名/発表者名
      Umegaki-Arao N, Tamai K, Nimura K, Serada S, Naka T, Nakano H, Katayama I
    • 雑誌名

      PLoS One

      巻: 8 号: 10 ページ: e76416-e76416

    • DOI

      10.1371/journal.pone.0076416

    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] WHSC1 links transcription elongation to HIRA-mediated histone H3.3 deposition in activated genes.2013

    • 著者名/発表者名
      Sarai N., Nimura K., Tamura T., Kanno T., Patel M.C., Heightman T. D., Ura K. and Ozata K.
    • 雑誌名

      EMBO J

      巻: 32 号: 17 ページ: 2392-2406

    • DOI

      10.1038/emboj.2013.176

    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Residual Prostate Cancer Cells after Docetaxel Therapy Increase the Tumorigenic Potential via Constitutive Signaling of CXCR4, ERK1/2 and c-Myc2013

    • 著者名/発表者名
      Hatano K, Yamaguchi S, Nimura K, Murakami K, Nagahara A, Fujita K, Uemura M, Nakai Y, Tsuchiya M, Nakayama M, Nonomura N, *Kaneda Y.
    • 雑誌名

      Mol Cancer Research

      巻: 11 号: 9 ページ: 1088-1100

    • DOI

      10.1158/1541-7786.mcr-13-0029-t

    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] The Transcription Factors Tbx18 and Wt1 Control the Epicardial Epithelial-Mesenchymal Transition through Bi-Directional Regulation of Slug in Murine Primary Epicardial Cells.2013

    • 著者名/発表者名
      Takeichi M
    • 雑誌名

      PLoS One.

      巻: 8 号: 2 ページ: e57829-e57829

    • DOI

      10.1371/journal.pone.0057829

    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Androgen-regulated transcriptional control of sialyltransferases in prostate cancer cells2012

    • 著者名/発表者名
      Nonomura N, Takayama H, et al
    • 雑誌名

      PLoS One

      巻: e31234 号: 2 ページ: 1570-1573

    • DOI

      10.1371/journal.pone.0031234

    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Essential role for miR-196a in brown adipogenesis of white fat progenitor cells.2012

    • 著者名/発表者名
      Mori M, Nakagami H, Rodriguez-Araujo G, Nimura K, Kaneda Y.
    • 雑誌名

      PLoS Biol

      巻: 10(4) 号: 4 ページ: e1001314-e1001314

    • DOI

      10.1371/journal.pbio.1001314

    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] 心臓発生における遺伝子発現制御機構2014

    • 著者名/発表者名
      二村圭祐
    • 学会等名
      発生過程におけるエネルギー代謝を考える会
    • 発表場所
      熊本
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 心発生における転写環境の解明2013

    • 著者名/発表者名
      二村圭祐
    • 学会等名
      若手ワークショップ@鬼怒川
    • 発表場所
      栃木
    • 年月日
      2013-01-24
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] Transcription regulation in heart development2013

    • 著者名/発表者名
      二村圭祐
    • 学会等名
      転写代謝システム班会議
    • 発表場所
      淡路島
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] Transcription regulation in heart development2012

    • 著者名/発表者名
      二村圭祐
    • 学会等名
      日本分子生物学会
    • 発表場所
      福岡
    • 年月日
      2012-12-11
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] A cardiac transcription factor links chromatin conformation to transcription termination2012

    • 著者名/発表者名
      二村圭祐
    • 学会等名
      EMBO Conference
    • 発表場所
      ドイツ
    • 年月日
      2012-11-17
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] Transcription regulation in heart development2012

    • 著者名/発表者名
      二村圭祐
    • 学会等名
      生命医薬情報学連合大会
    • 発表場所
      東京
    • 年月日
      2012-10-15
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] 心臓発生における転写制御機構2012

    • 著者名/発表者名
      二村圭祐
    • 学会等名
      大阪大学生命機能研究科コロキウム
    • 発表場所
      大阪
    • 年月日
      2012-10-10
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 心発生における転写環境の解明2012

    • 著者名/発表者名
      二村圭祐
    • 学会等名
      転写代謝システム班会議
    • 発表場所
      筑波
    • 年月日
      2012-07-02
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] 心臓発生における転写制御機構

    • 著者名/発表者名
      二村圭祐
    • 学会等名
      大阪大学若手研究フォーラム
    • 発表場所
      大阪
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 先天性疾患における転写制御機構

    • 著者名/発表者名
      二村圭祐
    • 学会等名
      千葉大学 Medical Science Frontier Forum
    • 発表場所
      千葉
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
    • 招待講演

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公開日: 2013-05-15   更新日: 2019-07-29  

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