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ショウジョウバエ始原生殖細胞の遺伝子発現制御における細胞内代謝経路の役割

公募研究

研究領域生命素子による転写環境とエネルギー代謝のクロストーク制御
研究課題/領域番号 24116527
研究種目

新学術領域研究(研究領域提案型)

配分区分補助金
審査区分 生物系
研究機関大学共同利用機関法人自然科学研究機構(岡崎共通研究施設)

研究代表者

林 良樹  大学共同利用機関法人自然科学研究機構(岡崎共通研究施設), 岡崎統合バイオサイエンスセンター, 助教 (30508817)

研究期間 (年度) 2012-04-01 – 2014-03-31
研究課題ステータス 完了 (2013年度)
配分額 *注記
18,720千円 (直接経費: 14,400千円、間接経費: 4,320千円)
2013年度: 9,360千円 (直接経費: 7,200千円、間接経費: 2,160千円)
2012年度: 9,360千円 (直接経費: 7,200千円、間接経費: 2,160千円)
キーワード始原生殖細胞 / ショウジョウバエ / メタボローム解析 / 解糖系 / メチオニン代謝 / 細胞死 / エピゲノム制御 / ヒストン修飾 / メタボロミクス / TCA回路
研究概要

多くの動物種において生殖系列の前駆細胞(始原生殖細胞:PGC)は、他の体細胞に比べて抑制的なクロマチン状態、低い転写活性、潜在的な分化多能生など様々な発生学的特徴を持つことが知られている。本研究では、このPGCの発生学的特徴の形成にあたって、PGCがもつ細胞内代謝状態が果たす役割の解明を目指す。
研究の第一歩として、PGCがもつ細胞内代謝状態を明らかにするために、セルソーターおよびCE-MSベースのメタボロミクスを用いた、PGCに対する単一細胞種in vivoメタボロミクスを行った。その結果、PGCでは他の体細胞に比べて解糖系が亢進していること、さらにPGCの発生が進むに従って解糖系が減弱することが明らかとなった。またPGCと体細胞を比較した場合、PGCにおいてはメチオニン(Met)の一次代謝産物であるS-アデノシルメチオニン(SAM)の含有量が著しく低いことが明らかとなった。そこで、PGC中における解糖系の亢進およびSAM合成抑制が、PGCの発生過程において果たす役割を明らかにするために、これら代謝経路を制御する因子をコードする遺伝子の発現を観察した。その結果、PGCにおいては体細胞に比べて、Gapdh1やPyKといった解糖系遺伝子の発現が高いこと、さらにSAM合成に必要なSam-Sの発現が低いことが明らかとなった。このことは、上記のPGCに特徴的な細胞内代謝状態が遺伝子発現レベルで制御されていることを強く示唆している。
次にこれら代謝経路のPGCの発生過程における機能を明らかにするために、解糖系中間代謝酵素についてはその機能をRNAiにより阻害すること、そしてSam-SについてはPGC中での強制発現することを試みた。このうち、解糖系については解析を終えており、解糖系はPGCの細胞死誘導に必要であることを明らかにした。

現在までの達成度 (区分)
理由

25年度が最終年度であるため、記入しない。

今後の研究の推進方策

25年度が最終年度であるため、記入しない。

報告書

(2件)
  • 2013 実績報告書
  • 2012 実績報告書
  • 研究成果

    (11件)

すべて 2014 2013 2012 その他

すべて 雑誌論文 (2件) (うち査読あり 2件) 学会発表 (8件) (うち招待講演 3件) 備考 (1件)

  • [雑誌論文] Analysys of Drosophila glucuronyl C-5 epimerase: implication of developmental roles of heparan sulfate sulfation compensation and 2-O sulfated glucuronic acid.2013

    • 著者名/発表者名
      Dejima, K., Takemura, M., Nakato, E., Peterson, J., Hayashi, Y., Toyoda, A., Toyoda, H., Nakato, H.
    • 雑誌名

      J. Biol. Chem.

      巻: 288 号: 48 ページ: 34384-34393

    • DOI

      10.1074/jbc.m113.499269

    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Glypicans regulate JAK/STAT signaling and distribution of the Unpaired morphogen.2012

    • 著者名/発表者名
      Y. Hayashi1, T. R. Sexton, K. Dejima, D. W. Perry, M. Takemura, S. Kobayashi, H. Nakato, and D. A. Harrison
    • 雑誌名

      Development

      巻: 139 号: 22 ページ: 4162-4171

    • DOI

      10.1242/dev.078055

    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] ショウジョウバエ始原生殖細胞の発生過程における解糖系の新規役割2014

    • 著者名/発表者名
      林 良樹、野田 千代、小林 悟
    • 学会等名
      第3回発生過程におけるエネルギー代謝を考える会
    • 発表場所
      熊本大学発生医学研究所(熊本)
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] ショウジョウバエ始原生殖細胞の発生過程における解糖系の新規役割2013

    • 著者名/発表者名
      林 良樹、野田 千代、小林 悟
    • 学会等名
      日本発生学会秋季シンポジウム
    • 発表場所
      神戸しあわせの村(兵庫)
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] ショウジョウバエ始原生殖細胞の発生過程における解糖系の新規役割2013

    • 著者名/発表者名
      林 良樹、野田 千代、小林 悟
    • 学会等名
      第一回がんと代謝研究会
    • 発表場所
      慶應義塾大学先端生命科学研究所(山形)
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] ショウジョウバエ始原生殖細胞の発生過程における解糖系の新規役割2013

    • 著者名/発表者名
      林 良樹、野田 千代、小林 悟
    • 学会等名
      日本動物学会第84回大会
    • 発表場所
      岡山大学(岡山)
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] Role of Glycolysis in Primordial-Germ-Cell Development in Drosophila embryos.2013

    • 著者名/発表者名
      Hayashi, Y., Noda, C., Kobayashi, S.
    • 学会等名
      第46回日本発生生物学会大会
    • 発表場所
      くにびきメッセ(島根)
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] ショウジョウバエ配偶子形成過程におけるヘパラン硫酸プロテオグリカンの役割2012

    • 著者名/発表者名
      林 良樹
    • 学会等名
      第85回日本生化学会大会
    • 発表場所
      福岡国際会議場(福岡県)
    • 年月日
      2012-12-14
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] ショウジョウバエ始原生殖細胞の発生過程における細胞内代謝の新規役割2012

    • 著者名/発表者名
      林 良樹
    • 学会等名
      第35回日本分子生物学会年会
    • 発表場所
      福岡国際会議場(福岡県)
    • 年月日
      2012-12-11
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] ショウジョウバエ始原生殖細胞の発生過程における細胞内代謝の新規役割2012

    • 著者名/発表者名
      林 良樹
    • 学会等名
      日本動物学会第83回大会
    • 発表場所
      大阪大学(大阪府)
    • 年月日
      2012-09-13
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [備考] 基礎生物学研究所プレスリリース

    • URL

      http://www.nibb.ac.jp/press/2012/12/04.html

    • 関連する報告書
      2012 実績報告書

URL: 

公開日: 2013-05-15   更新日: 2019-07-29  

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