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銅輸送タンパク質キャディーを用いたチロシナーゼ反応機構の解明

公募研究

研究領域感応性化学種が拓く新物質科学
研究課題/領域番号 25109530
研究種目

新学術領域研究(研究領域提案型)

配分区分補助金
審査区分 理工系
研究機関広島大学

研究代表者

的場 康幸  広島大学, 医歯薬保健学研究院(薬), 准教授 (90363051)

研究期間 (年度) 2013-04-01 – 2015-03-31
研究課題ステータス 完了 (2014年度)
配分額 *注記
7,280千円 (直接経費: 5,600千円、間接経費: 1,680千円)
2014年度: 3,640千円 (直接経費: 2,800千円、間接経費: 840千円)
2013年度: 3,640千円 (直接経費: 2,800千円、間接経費: 840千円)
キーワードチロシナーゼ / 銅 / 結晶構造解析 / ラマンスペクトル
研究実績の概要

チロシナーゼは、活性中心に2つの銅イオン(二核銅)を有する酸化酵素であり、チロシンを水酸化しドーパへと変換する反応と、ドーパを脱水素してドーパキノンへと変換する反応を触媒する。申請者は、チロシナーゼに特異的な銅輸送タンパク質(キャディーと命名)との複合体として、チロシナーゼの三次元構造を決定した。本構造中において、キャディーのTyr98残基が、チロシナーゼの基質結合部位に位置している。最近、キャディーのTyr98残基がチロシナーゼの触媒作用により、ドーパキノンへと変換されうることを発見した。本研究ではチロシナーゼ・キャディー複合体を利用し、二核銅含有酵素チロシナーゼの反応機構の解明を目指す。
ラマンスペクトルを測定した結果、チロシナーゼをオキシ型に変換すると、初期段階でμ-η2:η2-ペルオキソ二核銅(II)が形成し、最終的にドーパセミキノン・Cu(II)複合体が生じることが明らかになった。さらに、X線結晶構造解析を用いた検討からは、チロシナーゼ・キャディー複合体の結晶中でオキシ型チロシナーゼを形成させると、Tyr98残基のオルト位に濃い電子密度が観測され、結晶中でもチロシナーゼ反応が進行していることが強く示唆された。また、オルト位に濃い電子密度が生じるのに先立って、2つの銅イオンのうちCuAと名付けた銅イオンが、Tyr98残基の水酸基の方に移動することが判明した。
これまでの検討から、キャディーのTyr98残基に対するチロシナーゼの大まかな反応機構を提唱することができた。次の課題として、Tyr98残基に対するチロシナーゼの反応性を弱めることで、短寿命の反応中間体を捉えることを試みた。具体的には、キャディーのTyr98残基をフッ化チロシンに置換することに取り組んだ。現時点で、無細胞タンパク質合成システムを用いて、チロシナーゼ・キャディー複合体を取得することに成功した。

現在までの達成度 (段落)

26年度が最終年度であるため、記入しない。

今後の研究の推進方策

26年度が最終年度であるため、記入しない。

報告書

(2件)
  • 2014 実績報告書
  • 2013 実績報告書
  • 研究成果

    (18件)

すべて 2014 2013

すべて 雑誌論文 (5件) (うち査読あり 4件、 オープンアクセス 1件) 学会発表 (12件) (うち招待講演 4件) 図書 (1件)

  • [雑誌論文] An alternative allosteric regulation mechanism of an acidophilic L-lactate dehydrogenase from Enterococcus mundtii 15-1A2014

    • 著者名/発表者名
      Y. Matoba, M. Miyasako, K. Matsuo, Kosuke Oda, M. Noda, F. Higashikawa, T. Kumagai, M. Sugiyama
    • 雑誌名

      FEBS Open Bio.

      巻: 4 号: 1 ページ: 834-847

    • DOI

      10.1016/j.fob.2014.08.006

    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] D-サイクロセリン生合成機構の解明と非天然型アミノ酸合成への応用2014

    • 著者名/発表者名
      的場 康幸
    • 雑誌名

      Institute for Fermentation, Osaka, Research Communications

      巻: 28 ページ: 134-134

    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [雑誌論文] Crystallographic and mutational analyses of tannase from Lactobacillus plantarum.2013

    • 著者名/発表者名
      Matoba Y, Tanaka N, Noda M, Higashikawa F, Kumagai T, Sugiyama M.
    • 雑誌名

      Proteins

      巻: 81 号: 11 ページ: 2052-2058

    • DOI

      10.1002/prot.24355

    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Crystallographic study to determine the substrate specificity on an L-serine-acetylating enzyme found in the D-cycloserine biosynthetic pathway2013

    • 著者名/発表者名
      Oda, K., Matoba, Y., Kumagai, T., Noda, M., and Sugiyama, M
    • 雑誌名

      J. Bacteriol

      巻: 195 号: 8 ページ: 1741-1749

    • DOI

      10.1128/jb.02085-12

    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Establishment of an in vitroD-cycloserine-synthesizing system by using O-ureido-L-serine synthase and D-cycloserine synthetase found in the biosynthetic pathway2013

    • 著者名/発表者名
      Uda, N., Matoba, Y., Kumagai, T., Oda, K., Noda, M., and Sugiyama, M
    • 雑誌名

      Antimicrob. Agents Chemother

      巻: 57 号: 6 ページ: 2603-2612

    • DOI

      10.1128/aac.02291-12

    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] Production of the unnatural and optically active amino acids using the enzymes found in the D-cycloserine biosynthetic pathway2014

    • 著者名/発表者名
      的場 康幸
    • 学会等名
      ノボザイムズバイオフォーラム2014
    • 発表場所
      千葉市 クロスウェーブ幕張
    • 年月日
      2014-10-24
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 放線菌チロシナーゼの成熟化と反応機構2014

    • 著者名/発表者名
      的場 康幸
    • 学会等名
      第27回生物無機化学夏季セミナー
    • 発表場所
      兵庫県姫路市 書写山円教寺
    • 年月日
      2014-08-29 – 2014-08-31
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 二核銅酵素チロシナーゼの構造生物化学的研究2014

    • 著者名/発表者名
      的場 康幸
    • 学会等名
      大阪大学理学部舩橋研究室セミナー
    • 発表場所
      大阪大学理学部
    • 年月日
      2014-07-30
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 二核銅酵素チロシナーゼの構造化学的研究と無機触媒開発への期待2014

    • 著者名/発表者名
      的場 康幸
    • 学会等名
      第5回次世代材料・テクノロジー研究会
    • 発表場所
      名古屋工業大学2号館
    • 年月日
      2014-07-09
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] XFEL連続フェムト秒結晶構造解析:構造生物学の新時代2014

    • 著者名/発表者名
      溝端 栄一、福田 庸太、鈴木 守、南後 恵理子、菅原 道泰、矢橋 牧名、登野 健介、城地 保昌、島村 達郎、潘 東青、シャバス レオナルド、西澤 知宏、松村 浩由、林 高史、的場 康幸、杉山 成、村田 道雄、高木 淳一、井上 豪、岩田 想
    • 学会等名
      第14回日本タンパク質科学会年会
    • 発表場所
      ワークピア横浜/横浜産貿ホール マリネリア
    • 年月日
      2014-06-25 – 2014-06-27
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] D-サイクロセリン生合成機構の解明と非天然型アミノ酸合成への応用2014

    • 著者名/発表者名
      的場 康幸
    • 学会等名
      公益財団法人発酵研究所 第8回助成研究報告会
    • 発表場所
      大阪府豊中市 千里ライフサイエンスセンター
    • 年月日
      2014-06-05
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] Lactobacillus plantarumタンナーゼのX線結晶構造2013

    • 著者名/発表者名
      田中 尚美, 的場 康幸, 野田 正文, 熊谷 孝則, 杉山 政則
    • 学会等名
      日本乳酸菌学会2013年度大会
    • 発表場所
      北海道大学学術交流会館
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] X線結晶構造に基づいたD-サイクロセリン合成酵素DcsGの触媒機構の解明2013

    • 著者名/発表者名
      宇田 成利, 的場 康幸, 小田 康祐, 熊谷 孝則, 野田 正文, 杉山 政則
    • 学会等名
      2013年度(第28回)日本放線菌学会大会
    • 発表場所
      メルパルク広島
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] ロイシルブラストサイジンSを脱アミノアシル化する酵素の同定2013

    • 著者名/発表者名
      桑田 祥, 的場 康幸, 小田 康祐, 野田 正文, 熊谷 孝則, 杉山 政則
    • 学会等名
      2013年度(第65回)日本生物工学会大会
    • 発表場所
      広島国際会議場
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] O-ウレイド-L-セリン合成酵素DcsDの活性発現に重要なアミノ酸残基の特定2013

    • 著者名/発表者名
      宇田 成利, 的場 康幸, 小田 康祐, 熊谷 孝則, 野田 正文, 杉山 政則
    • 学会等名
      2013年度(第65回)日本生物工学会大会
    • 発表場所
      広島国際会議場
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] 自然免疫の抑制に関わるセンダイウイルスCタンパク質と宿主転写因子STAT1の構造生物学的解析2013

    • 著者名/発表者名
      小田 康祐, 的場 康幸, 川端 凉子, 入江 崇, 福士 雅也, 坂口 剛正
    • 学会等名
      第61回日本ウィルス学会学術集会
    • 発表場所
      神戸国際会議場
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] センダイウイルスCタンパク質と宿主転写因子STAT1の複合体構造2013

    • 著者名/発表者名
      小田 康祐, 的場 康幸, 江田 優子, 川端 涼子, 入江 崇, 福士 雅也, 坂口 剛正
    • 学会等名
      第36回(2013年)日本分子生物学会
    • 発表場所
      神戸ポートピアホテル
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [図書] Microbial Production: From Genome Design to Cell Engineering2014

    • 著者名/発表者名
      Matoba Y, Sugiyama M
    • 総ページ数
      8
    • 出版者
      Springer Japan
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書

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公開日: 2013-05-15   更新日: 2019-07-29  

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