ゲノム解読によるパーキンソン病の選択的神経変性の解明

• 研究領域: シナプス・ニューロサーキットパソロジーの創成
• 研究課題/領域番号: 25110720
• 研究種目: 新学術領域研究(研究領域提案型)
• 配分区分: 補助金
• 審査区分: 生物系
• 研究機関: 神戸大学
• 研究代表者: 佐竹 渉 神戸大学, 医学(系)研究科(研究院), 助教 (50467594)
• 研究期間 (年度): 2013-04-01 – 2015-03-31
• 研究課題ステータス: 完了 (2014年度)
• 配分額: 8,450千円 (直接経費: 6,500千円、間接経費: 1,950千円); 2014年度: 4,290千円 (直接経費: 3,300千円、間接経費: 990千円); 2013年度: 4,160千円 (直接経費: 3,200千円、間接経費: 960千円)
• キーワード: パーキンソン病 / エクソーム / 神経遺伝 / 神経内科学 / 人類遺伝学 / ゲノム医科学 / 孤発性神経疾患

研究実績の概要

パーキンソン病（PD）は、神経系統変性をきたし、シナプス病態とサーキット選択性が疾患発症・進展のキーとなる疾患である。まだ未発見のPD遺伝子を発見することは、本症のシナプス病態・サーキット選択性の解明の一助となりうる。本申請では、新たなPD遺伝子発見のため、新技術である次世代シークエンサーをPD遺伝子探索に応用。特に、エクソンに存在する、疾患への効果サイズの大きいRare variantリスクに焦点をあて、PDゲノムの全エクソン配列（エクソーム）を解読し、新規のPD遺伝子を同定。さらに、PD発症に関与するシナプス病態・サーキット選択性をゲノムの視点から解明する。また、ショウジョウバエモデルを用いることにより、in vivo モデル病態を再現する。
本年度は、前年度に引き続いて、全エクソン配列解読をさらに進めると同時に、全エクソン関連解析を行い、対照群にくらべ、患者群で多い、一塩基の変化を抽出した。前年度作出したショウジョウバエモデルを解析し、分子生物学的な病態解析を行った。

現在までの達成度 (段落)

26年度が最終年度であるため、記入しない。

今後の研究の推進方策

26年度が最終年度であるため、記入しない。

研究成果

• [雑誌論文] CHCHD2 mutations in autosomal dominant late-onset Parkinson’s disease: a genome-wide linkage and sequencing study. (2015)
  • 著者名/発表者名: Funayama M, Ohe K, Amo T, Furuya N, Yamaguchi J, Saiki S, Yuanzhe L, Ogaki K, Ando M, Yoshinon H, Tomiyama H, Nishioka K, Hasegawa K, Saiki H, Satake W, Mogushi K, Sasaki R, Kokubo Y, Kuzuhara S, Toda T, Mizuno Y, Uchiyama Y, Ohno K, Hattori N.
  • 雑誌名: Lancet Neurol 巻: 14 号: 3 ページ: 274-282
  • DOI: 10.1016/s1474-4422(14)70266-2
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] ABCG2 variant has opposing effects on onset ages of Parkinson's disease and gout. (2015)
  • 著者名/発表者名: Matsuo H, Tomiyama H, Satake W, Chiba T, Onoue H, Kawamura Y, Nakayama A, ShimizuS, Sakiyama M, Funayama M, Nishioka K, Shimizu T, Kaida K, Kamakura K, Toda T, Hattori N, ShinomiyaN.
  • 雑誌名: Ann Clin Transl Neurol 巻: 2 号: 3 ページ: 302-306
  • DOI: 10.1002/acn3.167
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Variants associated with Gaucher disease in multiple system atrophy (2015)
  • 著者名/発表者名: Mitsui J, Matsukawa T, Sasaki H, Yabe I, Nakahara Y, Momose Y, Takahashi Y, Hara K, Kakita A, Yamada M, Takahashi H, Onodera O, Nishizawa M, Watanabe H, Nakashima K, Ito H, Izumi Y, Kaji R, Kato T, Tsuji S, et al.
  • 雑誌名: Ann Clin Transl Neurol. 巻: 2 号: 4 ページ: 417
  • DOI: 10.1002/acn3.185
  • URL: https://localhost/en/publications/c946bad2-a238-4d0e-a396-6d33b3922ab7
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Novel calmodulin mutations associated with congenital arrhythmia susceptibility. (2014)
  • 著者名/発表者名: Makita N, Tsuji Y（39人中21番目）et al
  • 雑誌名: Circ Cardiovasc Genet. 巻: 7 号: 4 ページ: 466-474
  • DOI: 10.1161/circgenetics.113.000459
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] A case of Bardet-Biedl syndrome complicated with intracranial hypertension in a Japanese child. (2014)
  • 著者名/発表者名: Saida K, Inaba Y, Hirano M, Satake W, Toda T, Suzuki Y, Sudo A, Noda S, Hidaka Y, Hirabayashi K, Imai H, Kurokawa T, Koike K.
  • 雑誌名: Brain Dev 巻: 印刷中 号: 8 ページ: 721-724
  • DOI: 10.1016/j.braindev.2013.10.013
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] YY1 binds to α-synuclein 3'-flanking region SNP and stimulates antisense noncoding RNA expression. (2013)
  • 著者名/発表者名: Mizuta I, Takafuji K, Ando Y, Satake W, Kanagawa M, Kobayashi K, Nagamori S, Shinohara T, Ito C, Yamamoto M, Hattori N, Murata M, Kanai Y, Murayama S, Nakagawa M, Toda T.
  • 雑誌名: J Hum Genet 巻: 58 号: 11 ページ: 711-719
  • DOI: 10.1038/jhg.2013.90
  • 査読あり
• [雑誌論文] Mutations in COQ2 in familial and sporadic multiple-system atrophy the multiple-system atrophy research collaboration (2013)
  • 著者名/発表者名: Mitsui J, et. al.
  • 雑誌名: N Engl J Med 巻: 369 号: 3 ページ: 233
  • DOI: 10.1056/nejmoa1212115
  • 査読あり
• [雑誌論文] 神経・精神疾患の動向 神経疾患と遺伝子 (2013)
  • 著者名/発表者名: 佐竹 渉ら
  • 雑誌名: 日本医師会雑誌神経・精神疾患診療マニュアル 巻: 142
• [雑誌論文] 遺伝性疾患の遺伝子検査 (2013)
  • 著者名/発表者名: 佐竹 渉
  • 雑誌名: Modern Physician 巻: 33 ページ: 625-628
• [雑誌論文] ゲノム多様性と神経変性疾患 (2013)
  • 著者名/発表者名: 佐竹 渉ら
  • 雑誌名: 細胞 巻: 45 ページ: 120-123
• [雑誌論文] ゲノムワイド関連解析からの知見とさらなる孤発性パーキンソン病遺伝子の発見へ向けて PARK16、BST1、α-synuclein、LRRK2、Tau (2013)
  • 著者名/発表者名: 佐竹 渉ら
  • 雑誌名: 医学のあゆみ 巻: 247 ページ: 1075-1078
• [学会発表] 孤発性パーキンソン病のエクソーム関連解析と第2期SNP-GWAS (2014)
  • 著者名/発表者名: 佐竹渉、重水大智、鈴木穣 、山本健、富山弘幸、高橋篤、村田美穂、服部信孝、田中敏博 、角田達彦 、久保充明、辻省次、松本直通 、菅野純夫、戸田 達史
  • 学会等名: 日本人類伝学会第59回大会
  • 発表場所: 東京
  • 年月日: 2014-11-20 – 2014-11-22
• [学会発表] Risk genes and genome research of sporadic Parkinson’s disease (2014)
  • 著者名/発表者名: Satake W, Toda T
  • 学会等名: The 20th International Congress of Personalized Medicine
  • 発表場所: Tokyo
  • 年月日: 2014-11-15
  • 招待講演
• [学会発表] Exome Association Study and 2nd SNP-GWAS of Japanese Parkinson’s disease (2014)
  • 著者名/発表者名: Satake W et al1.Satake W, Shigemizu D, Suzuki Y, Yamamoto K, Tomiyama H, Yamamoto M, Murata M, Hattori N, Tsunoda T, Kubo M, Tsuji S, Nakamura Y, Sugano S, Toda T.
  • 学会等名: American Society of Human Genetics Annual meeting
  • 発表場所: San Diego
  • 年月日: 2014-10-18 – 2014-10-22
• [学会発表] Exome Association Study and 2nd SNP-GWAS of Japanese Parkinson’s disease (2014)
  • 著者名/発表者名: Satake W, Hasegawa K, Murata M, Hattori N, Toda T.
  • 学会等名: Genetic Epidemiology of Parkinson's disease Annual meeting
  • 発表場所: Vancouver
  • 年月日: 2014-09-10 – 2014-09-12
• [学会発表] Exome sequencing of Parkinson's disease in order to identify genetic variants with high disease-risk (2014)
  • 著者名/発表者名: Satake W, Ando Y, Tomiyama H, Kashihara K, Mochizuki H, Murayama S, Takeda A, Hasegawa K, Tsuji S, Yamamoto M, Murata M, Hattori N, Toda T.
  • 学会等名: The MDS 18th International Congress of Parkinson's Disease and Movement Disorders
  • 発表場所: Stockholm
  • 年月日: 2014-06-08 – 2014-06-12
• [学会発表] パーキンソン病感受性遺伝子α-synuiclein SNPとnoncoding RNA (2014)
  • 著者名/発表者名: 水田依久子、佐竹渉、村山繁雄、金川基、小林千浩、高藤和輝、永森収志、山本光利、服部信孝、村田美穂、金井好克、水野敏樹、中川正法、戸田達史
  • 学会等名: 第55回日本神経学会学術大会
  • 発表場所: 福岡
  • 年月日: 2014-05-21 – 2014-05-24
• [学会発表] Exome sequencing of Parkinson's disease in order to identify genetic variants with high disease-risk (2014)
  • 著者名/発表者名: Satake W et al
  • 学会等名: New Frontier of Molecular Neuropathology
  • 発表場所: Tokyo, Japan
• [学会発表] Search for rare-variant risks of Parkinson’s disease by sequencing of candidate genes and exome sequencing (2013)
  • 著者名/発表者名: Satake W et al
  • 学会等名: The MDS 17th International Congress of Parkinson's Disease and Movement Disorders
  • 発表場所: Sydney, Australia
• [学会発表] Exome sequencing of Parkinson's disease in order to identify genetic variants with high disease-risk (2013)
  • 著者名/発表者名: Satake W et al
  • 学会等名: American Society of Human Genetics Annual meeting
  • 発表場所: Boston, USA
• [学会発表] エクソーム解読・一塩基多型解析によるパーキンソン病の遺伝背景の解明 (2013)
  • 著者名/発表者名: 佐竹渉ら
  • 学会等名: 2013年度包括脳ネットワーク夏のワークショップ
  • 発表場所: 名古屋
• [学会発表] 剖検脳を用いた孤発性パーキンソン病感受性遺伝子の解析 (2013)
  • 著者名/発表者名: 上田健博ら
  • 学会等名: 第54回日本神経学会学術大会
  • 発表場所: 東京
• [備考] 神戸大学神経内科
  • URL: http://www.med.kobe-u.ac.jp/im3/rinsyo/shinkei/index.html
• [備考] 神戸大学分子脳科学
  • URL: http://www.med.kobe-u.ac.jp/clgene/
• [備考] 神戸大学遺伝子診療部
  • URL: http://www.hosp.kobe-u.ac.jp/consultation/guide/department/idenshi.html