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RNAポリメラーゼIIとRNA・クロマチンのクロストーク

公募研究

研究領域高精細アプローチで迫る転写サイクル機構の統一的理解
研究課題/領域番号 25118502
研究種目

新学術領域研究(研究領域提案型)

配分区分補助金
審査区分 生物系
研究機関北海道大学

研究代表者

村上 洋太  北海道大学, 理学(系)研究科(研究院), 教授 (20260622)

研究期間 (年度) 2013-04-01 – 2015-03-31
研究課題ステータス 完了 (2014年度)
配分額 *注記
11,700千円 (直接経費: 9,000千円、間接経費: 2,700千円)
2014年度: 5,850千円 (直接経費: 4,500千円、間接経費: 1,350千円)
2013年度: 5,850千円 (直接経費: 4,500千円、間接経費: 1,350千円)
キーワード遺伝子発現制御 / エピジェネティクス / クロマチン / ヒストン修飾 / 分裂酵母
研究実績の概要

ヒストンH3Lys36(H3K36) のメチル化は真核細胞で広く保存され、エピジェネティックな制御に重要と考えられる。出芽酵母での研究からこのメチル化はヒストン脱アセチル化酵素の呼び込みを介して遺伝子内の不正な転写を抑制する機能があることが示されているが、それ以外の生物での解析は進んでいない。高等真核生物に近いクロマチン制御システムをもつ分裂酵母を用いて唯一のH3K36 メチル化酵素であるSet2 に着目して解析をおこない、これまでにSet2 は出芽酵母Set2 と同様にC 末領域に存在するSRI ドメインを介して転写途中のRNA ポリメラーII と結合し、転写と共役してH3K36 のトリメチル化をおこうこと、および、出芽酵母ではH3K36 のジメチル化、トリメチル化ともにが不正転写抑制に機能するが、分裂酵母ではトリメチル化のみが、不正転写とくにアンチセンス転写の抑制に機能し、ジメチル化には抑制能がない事をみいだしていた。
本年度は以下の知見を得た。
1. ユークロマチン領域ではH3K36 トリメチル化は、標的遺伝子の転写抑制に機能する。
2. ヘテロクロマチンでは転写抑制ではなく、転写されたRNA の分解により遺伝子発現抑制をおこなう。
これらの結果は、はじめてトリメチル化特異的なH3K36 メチル化機能を明確にしめすとともに、RNA 分解を介した遺伝子抑制という新たな遺伝子抑制メカニズムを明らかにしたもので、H3K36 ジメチル化酵素とトリメチル化酵素をそれぞれ複数持つ高等真核生物での、H3K36 メチル化機能を理解する上で重要な知見であり、エピジェネティクス研究分野に貢献する成果である。

現在までの達成度 (段落)

26年度が最終年度であるため、記入しない。

今後の研究の推進方策

26年度が最終年度であるため、記入しない。

報告書

(2件)
  • 2014 実績報告書
  • 2013 実績報告書
  • 研究成果

    (12件)

すべて 2014 2013 その他

すべて 雑誌論文 (4件) (うち査読あり 4件、 オープンアクセス 1件) 学会発表 (6件) (うち招待講演 4件) 備考 (2件)

  • [雑誌論文] A novel method for purification of the endogenously expressed fission yeast Set2 complex.2014

    • 著者名/発表者名
      Suzuki S
    • 雑誌名

      Protein Expression and Purification.

      巻: 97 ページ: 44-49

    • DOI

      10.1016/j.pep.2014.02.005

    • 関連する報告書
      2014 実績報告書 2013 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Mediator Directs Co-transcriptional Heterochromatin Assembly by RNA Interference-Dependent and - Independent Pathways2013

    • 著者名/発表者名
      Oya E, Kato H, Chikashige Y, Tsutsumi C, Hiraoka Y, Murakami Y
    • 雑誌名

      PLoS Genet

      巻: 9 号: 8 ページ: 1003677-1003677

    • DOI

      10.1371/journal.pgen.1003677

    • NAID

      120006539376

    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Spt6 prevents transcription-coupled loss of posttranslationally modified histone H3.2013

    • 著者名/発表者名
      Kato H, Okazaki K, Iida T, Nakayama J, Murakami Y, Urano T.
    • 雑誌名

      Sci Rep.

      巻: 3 号: 1 ページ: 2186-2186

    • DOI

      10.1038/srep02186

    • NAID

      120006539377

    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Nonmuscle myosin II folds into a 10S form via two portions of tail for dynamic subcellular loacalization.2013

    • 著者名/発表者名
      Kiboku T.
    • 雑誌名

      Genes to Cells.

      巻: 18(2) 号: 2 ページ: 90-109

    • DOI

      10.1111/gtc.12021

    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] H3K36 tri-methylation but not H3K36 di-methylation is required for gene silencing in Schizosaccharomyces pombe2014

    • 著者名/発表者名
      Suzuki, S., Shimada, A., Takahata, S. Murakami, Y.
    • 学会等名
      11th EMBL Conference - Transcription and Chromatin
    • 発表場所
      Hidelberg, Germany
    • 年月日
      2014-08-23 – 2014-08-26
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] Regulation of RNAi-directed heterochromatin by CTD-phosphorylation of RNA polymerase II2013

    • 著者名/発表者名
      Takuya K., Hermand, D., Obuse C., Shuman, S., and Murakami, Y.
    • 学会等名
      7th International Fission Yeast Meeting
    • 発表場所
      University of London (UK)
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] ヒストンH2A/H2BシャペロンFACT複合体によるヘテロクロマチンサイレンシング機構2013

    • 著者名/発表者名
      高畑信也、千田早織、村上洋太
    • 学会等名
      第65回日本細胞生物学会大会
    • 発表場所
      ウインク愛知(愛知県)
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] JmjCドメインタンパク質Epe1は異所的ヘテロクロマチンを解消する2013

    • 著者名/発表者名
      反田真登、島田篤、平内孝拡、近重裕二、高畑信也、村上洋太
    • 学会等名
      第31回染色体ワークショップ
    • 発表場所
      ホテルおかだ(神奈川県)
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] ヘテロクロマチン形成に必要なsiRNAは転写と共役して核膜近傍で合成される。2013

    • 著者名/発表者名
      梶谷卓也、川上慶、大屋恵梨子、D. Hermand, 村上洋太
    • 学会等名
      第36回日本分子生物学会年会
    • 発表場所
      神戸国際会議場(兵庫県)
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Heterochromatic silencing defect in FACT mutant is concomitant with impaired H2A/H2B reorganization2013

    • 著者名/発表者名
      Takahata, S., Chida, S., and Murakami, Y.
    • 学会等名
      第36回日本分子生物学会年会
    • 発表場所
      神戸国際会議場(兵庫県)
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
    • 招待講演
  • [備考] 北海道大学大学院理学研究院化学部門生物有機化学研究室ホームページ

    • URL

      http://wwwchem.sci.hokudai.ac.jp/~bo/index.html

    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [備考] 北海道大学生物有機化学研究室

    • URL

      http://barato.sci.hokudai.ac.jp/~bo/

    • 関連する報告書
      2013 実績報告書

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公開日: 2013-05-15   更新日: 2019-07-29  

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