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材料科学からアプローチするバイオクレプティックス

公募研究

研究領域生物多様性を規範とする革新的材料技術
研究課題/領域番号 25120512
研究種目

新学術領域研究(研究領域提案型)

配分区分補助金
審査区分 複合領域
研究機関独立行政法人海洋研究開発機構

研究代表者

出口 茂  独立行政法人海洋研究開発機構, 海洋生命理工学研究開発センター, 研究開発センター長 (40344296)

研究期間 (年度) 2013-04-01 – 2015-03-31
研究課題ステータス 完了 (2014年度)
配分額 *注記
7,280千円 (直接経費: 5,600千円、間接経費: 1,680千円)
2014年度: 3,770千円 (直接経費: 2,900千円、間接経費: 870千円)
2013年度: 3,510千円 (直接経費: 2,700千円、間接経費: 810千円)
キーワードセルラーゼ / セルロース / ナノファイバー / バイオセンシング / 深海
研究実績の概要

SPOT(Surface Pitting Observation Technology)と呼ばれる、従来法とは異なる原理に基づいたセルラーゼ活性のセンシング手法を開発した。本手法はセルロースナノファイバーからなるヒドロゲルを基質に用い、ゲル表面に数十pLのセルラーゼ溶液を滴下した際に加水分解によって形成されるピットの体積を指標としてセルロースの酵素加水分解をセンシングする。
平成25年度の研究で、SPOTによるセルラーゼ活性検出機構を解明するためには、測定の時間分解能を向上させる必要があることが明確になった。そこで平成26年度は高速スキャンを特徴とする3D顕微鏡を用いた新たな実験システムを構築した。新システムでは、試料ステージ上に設置したナノファイバー基板の温度制御を可能にしたことに加えて、基板からの水の蒸発とそれに伴う基板表面の変形を抑制するための加湿チャンバーを構築した。ゼラチン/プロテアーゼを新たなモデル系に用いた実験では、4つのピットの体積を約20秒程度で測定可能であり(従来システムでは1つのピットの体積測定に約5分)、測定の時間分解能を大幅に向上させることに成功した。加えて酵素の基板中における拡散、基板との反応、さらには基板の幾何学形状を合わせて考慮した数理モデルを構築し、その数値シミュレーションによってピット形成メカニズムを再現することにも成功した。
また平成25年度までに、SPOTを用いて深海環境から単離したセルラーゼ生産菌GE09株からセルラーゼ遺伝子をクローニングした。平成26年度は組換え酵素のキャラクタリゼーションを行い、低温での活性(10℃から活性が認められ35℃で活性消失)や添加塩濃度に依存した比活性の上昇など、深海環境に適応した酵素であることを示唆する知見を得た。

現在までの達成度 (段落)

26年度が最終年度であるため、記入しない。

今後の研究の推進方策

26年度が最終年度であるため、記入しない。

報告書

(2件)
  • 2014 実績報告書
  • 2013 実績報告書
  • 研究成果

    (31件)

すべて 2015 2014 2013 その他

すべて 雑誌論文 (1件) 学会発表 (27件) (うち招待講演 13件) 図書 (3件)

  • [雑誌論文] 「ビーナスの花かご」とバイオミメティクス2015

    • 著者名/発表者名
      出口 茂
    • 雑誌名

      日本歯科医師会雑誌

      巻: 67 ページ: 886-887

    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] Ultra-Sensitive Assay of Cellulose Hydrolysis by Using Nanofibrous Substrates Combined with 3D Profilometry2015

    • 著者名/発表者名
      Shigeru Deguchi
    • 学会等名
      Gordon Research Conference on Cellulosomes, Cellulases & Other Carbohydrate Modifying Enzymes
    • 発表場所
      Proctor Academy、アンドーバー、アメリカ
    • 年月日
      2015-08-02 – 2015-08-07
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] ナノファイバー基質表面での酵素加水分解に伴うピット形成2015

    • 著者名/発表者名
      津留美紀子、山本美希、阪口 秀、出口 茂
    • 学会等名
      セルロース学会第22回年次大会
    • 発表場所
      北海道大学、北海道札幌市
    • 年月日
      2015-07-09 – 2015-07-10
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] 深海生物の特異な生存戦略に基づくバイオミメティクス2015

    • 著者名/発表者名
      出口 茂
    • 学会等名
      日本化学会第95回春季年会
    • 発表場所
      日本大学理工学部船橋キャンパス、千葉県船橋市
    • 年月日
      2015-03-26 – 2015-03-29
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] ナノファイバー基質表面でのピット形成を利用した酵素活性の超高感度アッセイ2015

    • 著者名/発表者名
      津留美紀子、出口 茂
    • 学会等名
      日本化学会第95回春季年会
    • 発表場所
      日本大学理工学部船橋キャンパス、千葉県船橋市
    • 年月日
      2015-03-26 – 2015-03-29
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] White Nanobiotechnology for Deep-Sea Bioprospecting2014

    • 著者名/発表者名
      Shigeru Deguchi, Mikiko Tsudome, Kohsuke Uchimura, Tohru Kobayashi
    • 学会等名
      AsiaNano 2014
    • 発表場所
      Ramada Plaza Jeju Hotel、済州市、韓国
    • 年月日
      2014-10-26 – 2014-10-29
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Biomimetic initiatives from deep-sea organisms at JAMSTEC2014

    • 著者名/発表者名
      Remi Tsubaki, Shigeru Deguchi
    • 学会等名
      Biomimetics meets Museum: French-German-Japan Workshop on Mariage d’Histoire Naturelle et Nanotechnology
    • 発表場所
      パリ自然史博物館、パリ、フランス
    • 年月日
      2014-10-16
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] オカッパリで挑む深海研究 ~極限環境生物圏にインスパイヤードされたソフトマテリアルの創成~2014

    • 著者名/発表者名
      出口 茂
    • 学会等名
      関西大学先端科学技術推進機構講演会
    • 発表場所
      関西大学、大阪府吹田市
    • 年月日
      2014-10-03
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 高分子からアプローチするバイオクレプティクス2014

    • 著者名/発表者名
      出口 茂、津留美紀子、内村康祐、小林 徹
    • 学会等名
      第63回高分子討論会
    • 発表場所
      長崎大学、長崎県長崎市
    • 年月日
      2014-09-24 – 2014-09-26
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 高分子ナノファイバーを利用した深海微生物資源の開拓2014

    • 著者名/発表者名
      出口 茂
    • 学会等名
      29th Summer University in Hokkaido
    • 発表場所
      定山渓ビューホテル、北海道札幌市
    • 年月日
      2014-08-29 – 2014-08-30
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 3D可視化技術を用いたセルロース酵素加水分解過程の超高感度・リアルタイムアッセイ2014

    • 著者名/発表者名
      津留美紀子、出口 茂
    • 学会等名
      第63回高分子学会年次大会
    • 発表場所
      名古屋国際会議場、愛知県名古屋市
    • 年月日
      2014-05-28 – 2014-05-30
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] White Nanobiotechnology for Elucidating Functional Diversity of Extremophiles in the Deep Sea2014

    • 著者名/発表者名
      Shigeru Deguchi
    • 学会等名
      Department Seminar at the University of Porto
    • 発表場所
      University of Porto、ポルト、ポルトガル
    • 年月日
      2014-05-21
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Elucidating Functional Diversity of Deep-Sea Extremophiles2014

    • 著者名/発表者名
      Shigeru Deguchi
    • 学会等名
      Joint International Symposium on “Nature-Inspired Technology (ISNIT) 2014” and “Engineering Neo-Biomimetics V”
    • 発表場所
      Hokkaido University、北海道
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] White Nanobiotechnology for Prospecting Unidentified Bioresource in the Deep-Sea2014

    • 著者名/発表者名
      Shigeru Deguchi
    • 学会等名
      The 7th Kyoto International Forum for Energy and Environment (KIFEE) Symposium
    • 発表場所
      Doshisha University、京都府
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] レーザー計測技術を用いた大腸菌コロニー形成過程の3次元リアルタイム解析2014

    • 著者名/発表者名
      津留美紀子
    • 学会等名
      日本農芸化学会2014年度大会
    • 発表場所
      明治大学生田キャンパス、東京都
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] 3D Laser Profilometric Sensing of Cellulose Hydrolysis and Its Application for Prospecting the Deep-Sea Bioresource2013

    • 著者名/発表者名
      Shigeru Deguchi
    • 学会等名
      3rd International Conference on Bio-Sensing Technology
    • 発表場所
      Melia Sitges、スペイン
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] Cellulase Activity Assay Using Pit Formation on Nanofibrous Cellulose Matrix2013

    • 著者名/発表者名
      Shigeru Deguchi
    • 学会等名
      62nd SPSJ (The Society of Polymer Science, Japan) Annual Meeting
    • 発表場所
      Kyoto International Conference Center、京都府
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] ナノファイバーセルロースを基質に用いた酵素加水分解速度の超高感度測定2013

    • 著者名/発表者名
      出口 茂
    • 学会等名
      セルロース学会第20回年次大会
    • 発表場所
      京都大学宇治キャンパス おうばくプラザ、京都府
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] 複合エマルションを鋳型にした多孔質セルロースマイクロ粒子の調製2013

    • 著者名/発表者名
      出口 茂
    • 学会等名
      セルロース学会第20回年次大会
    • 発表場所
      京都大学宇治キャンパス おうばくプラザ、京都府
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] ナノファイバーセルロースを用いた深海微生物資源のプロスペクティング2013

    • 著者名/発表者名
      津留美紀子
    • 学会等名
      セルロース学会第20回年次大会
    • 発表場所
      京都大学宇治キャンパス おうばくプラザ、京都府
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] 深海微生物が生産するセルロース分解酵素2013

    • 著者名/発表者名
      内村康祐
    • 学会等名
      セルロース学会第20回年次大会
    • 発表場所
      京都大学宇治キャンパス おうばくプラザ、京都府
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] Ultra-Sensitive Functional Screening of Cellulolytic Microorganisms Using Surface Pitting on Nanofiber Matrix2013

    • 著者名/発表者名
      Shigeru Deguchi
    • 学会等名
      Enzyme Engineering XXII: Emerging Topics in Enzyme Engineering
    • 発表場所
      Toyama International Conference Center、富山県
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] Ultra-Sensitive Kinetic Measurements of Enzymatic Hydrolysis of Cellulose Using Surface Pitting on Nanofibrous Matrix2013

    • 著者名/発表者名
      Shigeru Deguchi
    • 学会等名
      EPNOE 2013 International Polysaccharide Conference
    • 発表場所
      Nice Acropolis Convention and Exhibition Center、フランス
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] セルロースナノファイバーを用いた酵素分解プロセスの超高感度3D分析2013

    • 著者名/発表者名
      津留美紀子
    • 学会等名
      第22回ポリマー材料フォーラム
    • 発表場所
      タワーホール船堀、東京都
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] コロニー成長過程のリアルタイム三次元解析

    • 著者名/発表者名
      津留美紀子
    • 学会等名
      日本農芸化学会関東支部2013年度大会
    • 発表場所
      慶応大学日吉キャンパス、神奈川県
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] 白いナノバイオテクノロジーが明らかにした深海生物資源の新たな有用性

    • 著者名/発表者名
      出口 茂
    • 学会等名
      第3回次世代の物質科学・ナノサイエンスを探る
    • 発表場所
      北海道大学、北海道
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 陸っぱり深海研究

    • 著者名/発表者名
      出口 茂
    • 学会等名
      第6回豊田理研懇話会
    • 発表場所
      豊田理化学研究所、愛知県
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 白いナノバイオテクノロジーが解き明かす深海生物資源の新たな姿

    • 著者名/発表者名
      出口 茂
    • 学会等名
      第2回グリーンテクノロジー研究セミナー
    • 発表場所
      法政大学、東京都
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
    • 招待講演
  • [図書] セルロースナノファイバーの調製、分散・複合化と製品応用2015

    • 著者名/発表者名
      出口 茂、津留美紀子
    • 総ページ数
      535
    • 出版者
      技術情報協会
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [図書] Aqua extrema and vita incognita deep below the waves2014

    • 著者名/発表者名
      Shigeru Deguchi, Keigo Kinoshita, Takaaki Kubota
    • 総ページ数
      497
    • 出版者
      Connor Court
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [図書] Optical reactors for microscopic visualization of chemical processes in sub- and supercritical water2014

    • 著者名/発表者名
      Shigeru Deguchi, Sada-atsu Mukai
    • 総ページ数
      474
    • 出版者
      Springer
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書

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公開日: 2013-05-15   更新日: 2019-07-29  

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