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天然変性タンパク質をハブとするカルビン回路高次複合体の構造解析

公募研究

研究領域細胞シグナリング複合体によるシグナル検知・伝達・応答の構造的基礎
研究課題/領域番号 25121719
研究種目

新学術領域研究(研究領域提案型)

配分区分補助金
審査区分 生物系
研究機関大阪大学

研究代表者

松村 浩由  大阪大学, 工学(系)研究科(研究院), 准教授 (30324809)

研究期間 (年度) 2013-04-01 – 2015-03-31
研究課題ステータス 完了 (2014年度)
配分額 *注記
8,840千円 (直接経費: 6,800千円、間接経費: 2,040千円)
2014年度: 4,420千円 (直接経費: 3,400千円、間接経費: 1,020千円)
2013年度: 4,420千円 (直接経費: 3,400千円、間接経費: 1,020千円)
キーワードカルビン回路 / 天然変性タンパク質 / 超分子複合体 / 阻害複合体 / 調節機構 / 天然変性蛋白質
研究実績の概要

カルビン回路高次複合体の形成によるカルビン回路酵素の協調的な阻害、ならびに天然変性蛋白質CP12の段階的折り畳み機構を解明するために、ホスホリブロキナーゼ(PRK)単体のX線結晶構造解析に続いて、PRKの反応機構を決定すべくPRK基質アナログ複合体の構造解析を行った。その結果、PRKのリン酸転移反応機構を解明できた。さらに、グリセルアルデヒド 3-リン酸デヒドロゲナーゼ(GAPDH)とCP12に、どのようにPRKが結合し、さらにCP12が連続して折りたたまれるのかを解明すべく、CP12の部位特異的変位体を5種作成し、Native-PAGEによる結合実験と表面プラズモン共鳴法を用いたキネティクス解析を行った。

現在までの達成度 (段落)

26年度が最終年度であるため、記入しない。

今後の研究の推進方策

26年度が最終年度であるため、記入しない。

報告書

(2件)
  • 2014 実績報告書
  • 2013 実績報告書
  • 研究成果

    (16件)

すべて 2015 2014 2013

すべて 雑誌論文 (9件) (うち査読あり 9件、 謝辞記載あり 2件、 オープンアクセス 1件) 学会発表 (7件) (うち招待講演 3件)

  • [雑誌論文] The N-terminal acidic residue of the cytosolic helix 8 of an odorant receptor is responsible for different response dynamics via G-protein2015

    • 著者名/発表者名
      T. Kawasaki, T. Saka, S. Mine, E. Mizohata, T. Inoue, H. Matsumura, T. Sato
    • 雑誌名

      FEBS Lett.

      巻: 589 号: 10 ページ: 1136-1143

    • DOI

      10.1016/j.febslet.2015.03.025

    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] A comparative analysis of microgravity and earth grown thermostable T1 lipase crystals using HDPCG apparatus2015

    • 著者名/発表者名
      R.N. Abd Rahman, M.S. Ali, S. Sugiyama, A.T. Leow, T. Inoue, M. Basri, A.B. Salleh, and H. Matsumura
    • 雑誌名

      Protein Pept. Lett.

      巻: 22 ページ: 173-179

    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Crystal structure of FtsA from Staphylococcus aureus2014

    • 著者名/発表者名
      J. Fujita, Y. Maeda, C. Nagao, Y. Tsuchiya, Y. Miyazaki, M. Hirose, E. Mizohata, Y. Matsumoto, T. Inoue, K. Mizuguchi, and H. Matsumura
    • 雑誌名

      FEBS Lett.

      巻: 588 号: 10 ページ: 1879-1885

    • DOI

      10.1016/j.febslet.2014.04.008

    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
    • 査読あり / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Structural basis for the recognition-evasion arms race between Tomato mosaic virus and the resistance gene Tm-12014

    • 著者名/発表者名
      K. Ishibashi, Y. Kezuka, C. Kobayashi, M. Kato, T. Inoue, T. Nonaka, M. Ishikawa, H. Matsumura, and E. Katoh
    • 雑誌名

      Proc. Natl. Acad. Sci. USA

      巻: 111 号: 33

    • DOI

      10.1073/pnas.1407888111

    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Strategy for cold adaptation of the tryptophan xynthase a subunit from the psychrophile Shewanella frigidimarina K14-2: crystal structure and physicochemical properties2014

    • 著者名/発表者名
      Daisuke Mitsuya, Shun-ichi Tanaka, Hiroyoshi Matsumura, Naoto Urano, Kazufumi Takano, Kyoko Ogasahara, Michiyo Kakehira, Katsuhide Yutani, Masami Ishida
    • 雑誌名

      The Journal of Biochemistry

      巻: 155 号: 2 ページ: 73-82

    • DOI

      10.1093/jb/mvt098

    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Structural insights into the function of a thermostable copper-containing nitrite reductase2014

    • 著者名/発表者名
      Y Fukuda, et al.
    • 雑誌名

      The Journal of Biochemistry

      巻: 155 号: 2 ページ: 123-135

    • DOI

      10.1093/jb/mvt107

    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Structure of peroxiredoxin from anaerobic hyperthermophilic archaeon Pyrococcus horikoshii2013

    • 著者名/発表者名
      T. Nakamura*, A. Mori, M. Niiyama, H. Matsumura, C. Tokuyama, J. Morita, K. Uegaki and T. Inoue
    • 雑誌名

      Acta. Cryst.

      巻: F69 号: 7 ページ: 719-722

    • DOI

      10.1107/s1744309113014036

    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Expression, purification, crystallization and preliminary crystallographic study of FtsA from methicillin-resistant Staphylococcus aureus2013

    • 著者名/発表者名
      J. Fujita, Y. Miyazaki, M. Hirose, C. Nagao, E. Mizohata, Y. Matsumoto, K. Mizuguchi, T. Inoue, and H. Matsumura
    • 雑誌名

      Acta. Cryst.

      巻: F69 号: 8 ページ: 895-898

    • DOI

      10.1107/s1744309113017727

    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] 転写制御因子Tup1-N 末端ドメインのX線結晶構造とその複合体形成メカニズム2013

    • 著者名/発表者名
      中村太一、松村浩由、井上豪、日下菜花、田中直子、向由起夫
    • 雑誌名

      日本結晶学会誌

      巻: 55 ページ: 110-115

    • NAID

      10031168499

    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] MRSA由来細胞分裂タンパク質FtsAの構造―機能相関解析2014

    • 著者名/発表者名
      藤田純三、前田陽子、齋藤有紀、清水伸隆、野田勝紀、長尾知生子、土屋裕子、溝端栄一、内山進、松本佳巳、水口賢司、井上豪、松村浩由
    • 学会等名
      日本結晶学会
    • 発表場所
      東京
    • 年月日
      2014-11-01 – 2014-11-03
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] MRSA由来細胞分裂タンパク質FtsAのX線結晶構造解析2014

    • 著者名/発表者名
      藤田純三、前田陽子、宮﨑祐満、廣瀬未果、溝端栄一、井上豪、松村浩由
    • 学会等名
      日本蛋白質科学会
    • 発表場所
      横浜
    • 年月日
      2014-06-25 – 2014-06-27
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] CP12-GAPDH-PRK複合体形成によるカルビン回路調節機構の解明2014

    • 著者名/発表者名
      松村浩由、清水伸隆、木津奈都子、吉田将康、荒武将弘、溝端栄一、田茂井政宏、和田野晃、重岡成、井上豪
    • 学会等名
      日本農芸化学会大会
    • 発表場所
      東京
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] Structural basis for assembly of the CP12-GAPDH-PRK complex2014

    • 著者名/発表者名
      Hiroyoshi Matsumura, Nobutaka Shimizu, Natsuko Kizu, Masayasu Yoshida, Masahiro Aratake, Eiichi Mizohata, Masahiro Tamoi, Akira Wadano, Sshigeru Shigeoka, Tsuyoshi Inoue
    • 学会等名
      日本農芸化学会2014年度大会
    • 発表場所
      富山
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] カルビン回路調節システムの構造基盤2013

    • 著者名/発表者名
      松村浩由
    • 学会等名
      アグリバイオシンポジウム 2013
    • 発表場所
      奈良
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] SAXS and XRD analyses of the Calvin cycle regulatory complexes2013

    • 著者名/発表者名
      Hiroyoshi Matsumura, Nobutaka Shimizu Tsuyoshi Inoue
    • 学会等名
      日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      京都
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 結晶解析と溶液散乱による相関解析2013

    • 著者名/発表者名
      松村 浩由
    • 学会等名
      タンパク質X線溶液散乱講習会
    • 発表場所
      筑波
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
    • 招待講演

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公開日: 2013-05-15   更新日: 2019-07-29  

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