• 研究課題をさがす
  • 研究者をさがす
  • KAKENの使い方
  1. 前のページに戻る

糖タンパク質選別輸送装置の超分子形成および作動機構の解明

公募研究

研究領域細胞シグナリング複合体によるシグナル検知・伝達・応答の構造的基礎
研究課題/領域番号 25121730
研究種目

新学術領域研究(研究領域提案型)

配分区分補助金
審査区分 生物系
研究機関名古屋市立大学

研究代表者

佐藤 匡史  名古屋市立大学, 大学院薬学研究科, 准教授 (80532100)

研究期間 (年度) 2013-04-01 – 2015-03-31
研究課題ステータス 完了 (2014年度)
配分額 *注記
4,680千円 (直接経費: 3,600千円、間接経費: 1,080千円)
2014年度: 2,340千円 (直接経費: 1,800千円、間接経費: 540千円)
2013年度: 2,340千円 (直接経費: 1,800千円、間接経費: 540千円)
キーワード構造生物学 / 積荷受容体 / 糖タンパク質 / X線結晶構造解析 / NMR解析
研究実績の概要

分泌経路の入り口である小胞体では、糖鎖を目印とした品質管理システムを通じて、タンパク質の立体構造形成、分解、および選別輸送が行われている。例えば、モノグルコシル化された糖鎖を有する糖タンパク質は立体構造形成の途上にあることを示唆している。
小胞体-ゴルジ体間における糖タンパク質の選別輸送は、細胞内レクチンERGIC-53による糖鎖認識と、カルシウム結合タンパク質MCFD2によるポリペプチド鎖認識が協働することにより担われている。本年度は、ERGIC53-MCFD2複合体の作動メカニズムを解明するために、MCFD2によるポリペプチド鎖認識の構造基盤を明らかにすることを目指した。そこでNMRおよび等温カロリメトリーによる相互作用解析を実施し、ERGIC53-MCFD2複合体による血液凝固因子のポリペプチド鎖認識の構造基盤に関する情報を収集した。
さらに本研究では、立体構造が未完成の糖タンパク質に選択的にモノグルコシル化するフォールディングセンサー酵素UGGTの基質認識ドメインの一部に関して3次元構造情報を得ることに初めて成功した。

現在までの達成度 (段落)

26年度が最終年度であるため、記入しない。

今後の研究の推進方策

26年度が最終年度であるため、記入しない。

報告書

(2件)
  • 2014 実績報告書
  • 2013 実績報告書
  • 研究成果

    (44件)

すべて 2015 2014 2013 その他

すべて 雑誌論文 (10件) (うち査読あり 10件、 オープンアクセス 3件、 謝辞記載あり 3件) 学会発表 (34件) (うち招待講演 3件)

  • [雑誌論文] Conformational dynamics of oligosaccharides characterized by paramagnetism-assisted NMR spectroscopy in conjunction with molecular dynamics simulation2015

    • 著者名/発表者名
      Ying Zhang
    • 雑誌名

      Adv. Exp. Med. Biol.

      巻: 842 ページ: 217-230

    • DOI

      10.1007/978-3-319-11280-0_14

    • ISBN
      9783319112794, 9783319112800
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Emerging structural insights into glycoprotein quality control coupled with N-glycan processing in the endoplasmic reticulum2015

    • 著者名/発表者名
      T.Satoh, T.Yamaguchi, and K.Kato
    • 雑誌名

      Molecules

      巻: 20 号: 2 ページ: 2475-2491

    • DOI

      10.3390/molecules20022475

    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Recent advances in glycoprotein production for structural biology: toward tailored design of glycoforms2014

    • 著者名/発表者名
      Y.Kamiya, T.Satoh, and K.Kato
    • 雑誌名

      Curr. Opin. Struct. Biol.

      巻: 26 ページ: 44-53

    • DOI

      10.1016/j.sbi.2014.03.008

    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Crystal structure of archaeal homolog of proteasome-assembly chaperone PbaA2014

    • 著者名/発表者名
      Arunima Sikar
    • 雑誌名

      Biochem. Biophys. Res. Commun.

      巻: 453 号: 3 ページ: 493-497

    • DOI

      10.1016/j.bbrc.2014.09.114

    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Mode of substrate recognition by the Josephin domain of ataxin-3, which has an endo-type deubiquitinase activity2014

    • 著者名/発表者名
      T.Satoh, A.Sumiyoshi, M.Yagi-Utsumi, E.Sakata, H.Sasakawa, E.Kurimoto, Y.Yamaguchi, W.Li, C.A.P. Joazeiro, T.Hirokawa, and K.Kato
    • 雑誌名

      FEBS Lett.

      巻: 588 号: 23 ページ: 4422-4430

    • DOI

      10.1016/j.febslet.2014.10.013

    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Structural insight into substrate recognition by the endoplasmic reticulum folding-sensor enzyme: crystal structure of third thioredoxin-like domain of UDP-glucose:glycoprotein glucosyltransferase2014

    • 著者名/発表者名
      T.Zhu, T.Satoh, and K.Kato
    • 雑誌名

      Sci. Rep.

      巻: 4 号: 1 ページ: 7322-7322

    • DOI

      10.1038/srep07322

    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Structural basis for disparate sugar-binding specificities in the homologous cargo receptors ERGIC-53 and VIP362014

    • 著者名/発表者名
      Tadashi Satoh, Kousuke Suzuki, Takumi Yamaguchi, and Koichi Kato
    • 雑誌名

      PLoS ONE

      巻: 9 号: 2 ページ: e87963-e87963

    • DOI

      10.1371/journal.pone.0087963

    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] ATPase activity and ATP-dependent conformational change in the co-chaperone HOP.2014

    • 著者名/発表者名
      Yamamoto S, Subedi GP, Hanashima S, Satoh T, Otaka M, Wakui H, Sawada KI, Yokota SI, Yamaguchi Y, Kubota H, Itoh H.
    • 雑誌名

      Journal of Biological Chemistry

      巻: 289 号: 14 ページ: 9880-9886

    • DOI

      10.1074/jbc.m114.553255

    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Structural Basis for Proteasome Formation Controlled by an Assembly Chaperone Nas22014

    • 著者名/発表者名
      Satoh T, Saeki Y, Hiromoto T, Wang YH, Uekusa Y, Yagi H, Yoshihara H, Yagi-Utsumi M, Mizushima T, Tanaka K, Kato K
    • 雑誌名

      Structure

      巻: (掲載確定) 号: 5 ページ: 731-743

    • DOI

      10.1016/j.str.2014.02.014

    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Recognition of Bisecting N-Acetylglucosamine: Structural basis for asymmetric interaction with the mouse lectin dendritic cell inhibitory receptor 22013

    • 著者名/発表者名
      Masamichi Nagae
    • 雑誌名

      J. Biol. Chem.

      巻: 288 号: 47 ページ: 33598-33610

    • DOI

      10.1074/jbc.m113.513572

    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] Structural basis for sugar trimming reactions by glucosidase II involved glycoprotein quality control system2015

    • 著者名/発表者名
      Tadashi Satoh
    • 学会等名
      The 5th Yonsei-IMS Joint Workshop: “Multilateral approaches for investigating biomolecular structures and functions”
    • 発表場所
      箱根
    • 年月日
      2015-01-31
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] Structural aspects of glycoprotein folding sensor enzyme (UGGT): A combined X-ray crystallography and small angle X-ray scattering study2015

    • 著者名/発表者名
      Tong Zhu
    • 学会等名
      The 5th Yonsei-IMS Joint Workshop: “Multilateral approaches for investigating biomolecular structures and functions”
    • 発表場所
      箱根
    • 年月日
      2015-01-31
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] Structural basis for recognition of the terminal glucose tag of N-glycans as fate-determinant of glycoproteins in cells2014

    • 著者名/発表者名
      Koichi Kato
    • 学会等名
      The 7th Korea-Japan Seminars on Biomolecular Sciences: Experiments and Simulations
    • 発表場所
      Seoul, Korea
    • 年月日
      2014-11-26
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] UDP-glucose: glycoprotein glucosyltransferase (UGGT) possesses three-tandem thioredoxin-like domains2014

    • 著者名/発表者名
      Tong Zhu
    • 学会等名
      第87回 日本生化学会大会
    • 発表場所
      京都
    • 年月日
      2014-10-18
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] Structural insights into glycoprotein processing mechanisms in ER quality control system2014

    • 著者名/発表者名
      佐藤匡史
    • 学会等名
      第87回 日本生化学会大会
    • 発表場所
      京都
    • 年月日
      2014-10-15
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Structural basis for the glycan-processing mechanisms in glycoprotein quality control system2014

    • 著者名/発表者名
      佐藤匡史
    • 学会等名
      第52回 日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      札幌
    • 年月日
      2014-09-26
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 小胞体グルコシダーゼIIの基質認識メカニズムの構造基盤2014

    • 著者名/発表者名
      年森隆泰
    • 学会等名
      第33回 日本糖質学会年会
    • 発表場所
      名古屋
    • 年月日
      2014-08-11
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] Structural basis for substrate recognition mechanism of ER glucosidase II2014

    • 著者名/発表者名
      Tadashi Satoh
    • 学会等名
      23rd Congress and General Assembly of the International Union of Crystallography (IUCr 2014)
    • 発表場所
      Montreal, Canada
    • 年月日
      2014-08-07
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] 糖タンパク質の細胞内プロセッシングに関わるグルコシダーゼⅡの基質認識メカニズム2014

    • 著者名/発表者名
      年森隆泰
    • 学会等名
      第12回 次世代を担う若手のためのフィジカル・ファーマフォーラム
    • 発表場所
      箱根
    • 年月日
      2014-07-14
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] 小胞体品質管理システムに関わるグルコシダーゼIIの基質認識機構2014

    • 著者名/発表者名
      佐藤 匡史
    • 学会等名
      第14回 日本蛋白質科学会年会
    • 発表場所
      横浜
    • 年月日
      2014-06-26
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] 糖タンパク質選別輸送装置の超分子形成および作動機構の解明2014

    • 著者名/発表者名
      佐藤 匡史
    • 学会等名
      平成26年度新学術領域「構造細胞生物学」全体会議・総括班会議
    • 発表場所
      ルスツ、北海道
    • 年月日
      2014-06-15
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] カーゴレセプターERGIC-53/MCFD2複合体による糖タンパク質認識メカニズムの構造基盤2014

    • 著者名/発表者名
      鈴木康介
    • 学会等名
      第78回 日本生化学会中部支部例会
    • 発表場所
      名古屋
    • 年月日
      2014-05-24
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] 糖タンパク質品質管理に関わるグルコシダーゼIIの基質認識メカニズムの構造基盤2014

    • 著者名/発表者名
      年森隆泰
    • 学会等名
      第78回 日本生化学会中部支部例会
    • 発表場所
      名古屋
    • 年月日
      2014-05-24
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] Structural insights into substrate recognition mechanism of glycoprotein processing enzyme ER glucosidase II2014

    • 著者名/発表者名
      Tadashi Satoh
    • 学会等名
      The 4th Asia Pacific Protein Association (APPA) Conference
    • 発表場所
      Jeju, Korea
    • 年月日
      2014-05-18
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] Structural insights into proteasome orchestration mechanism through a proteasome assembly factor Nas2

    • 著者名/発表者名
      Tadashi Satoh
    • 学会等名
      8th Asian Biophysics Association Symposium (ABA Jeju 2013)
    • 発表場所
      Jeju, Korea
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] 糖タンパク質選別輸送装置の超分子形成および作動機構の解明

    • 著者名/発表者名
      佐藤匡史
    • 学会等名
      平成25年度 新学術領域「構造細胞生物学」全体会議・総括班会議
    • 発表場所
      清里
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] ERGIC-53/MCFD2 複合体による糖鎖認識の構造基盤

    • 著者名/発表者名
      佐藤匡史
    • 学会等名
      第59回 日本薬学会東海支部会
    • 発表場所
      名古屋
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] Mechanistic insights into the proteasome orchestration by a proteasome assembly chaperone Nas2

    • 著者名/発表者名
      Tadashi Satoh
    • 学会等名
      7th International Conference on Structural Genomics (ICSG2013-SLS)
    • 発表場所
      札幌
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] Structural basis underlying the redox-dependent domain rearrangement of the substrate-binding region of protein disulfide isomerase

    • 著者名/発表者名
      Koya Inagaki
    • 学会等名
      7th International Conference on Structural Genomics (ICSG2013-SLS)
    • 発表場所
      札幌
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] 積荷受容体ERGIC-53/MCFD2による糖鎖認識の構造基盤

    • 著者名/発表者名
      佐藤匡史
    • 学会等名
      第32回日本糖質学会年会
    • 発表場所
      大阪
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] Bacterial expression and EM analysis of UDP-glucose glycosyltransferase from a thermophilic fungus

    • 著者名/発表者名
      Tong Zhu
    • 学会等名
      糖鎖科学中部拠点 第11回若手の力フォーラム
    • 発表場所
      名古屋
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] EM tomography analysis of ER folding sensor enzyme UDP-glucose: glycoprotein glucosyltransferase

    • 著者名/発表者名
      Tong Zhu
    • 学会等名
      平成25年度 生理学研究所研究会「電子顕微鏡機能イメージングの医学・生物学への応用」
    • 発表場所
      岡崎
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] Interaction mode of a proteasome assembly chaperone Nas2 with the proteasome Rpt5 subunit

    • 著者名/発表者名
      Ying-Hui Wang
    • 学会等名
      山田研究会・統合バイオサイエンスシンポジウム
    • 発表場所
      伊良湖
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] Overall structure of ER folding sensor UDP-glucose: glycoprotein glucosyltransferase revealed by EM tomography

    • 著者名/発表者名
      Tong Zhu
    • 学会等名
      山田研究会・統合バイオサイエンスシンポジウム
    • 発表場所
      伊良湖
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] Redox-dependent conformational changes of the substrate-binding region of protein disulfide isomerase

    • 著者名/発表者名
      Koya Inagaki
    • 学会等名
      山田研究会・統合バイオサイエンスシンポジウム
    • 発表場所
      伊良湖
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] Structural basis for proteasome formation mediated by assembly chaperone Nas2

    • 著者名/発表者名
      Tadashi Satoh
    • 学会等名
      6th Japan-Korea Seminars on Biomolecular Science : Experiments and Simulation
    • 発表場所
      岡崎
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] An archaeal homolog of proteasome assembly chaperone forms a homotetramer and functions as proteasome activator

    • 著者名/発表者名
      Kentaro Kumoi
    • 学会等名
      6th Japan-Korea Seminars on Biomolecular Science : Experiments and Simulation
    • 発表場所
      岡崎
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] NMR characterization of the interaction of a proteasome assembly chaperone Nas2 with the proteasome Rpt5 subunit

    • 著者名/発表者名
      Ying-Hui Wang
    • 学会等名
      SOKENDAI Asian Winter School "Innovations and Challenges in Molecular Science: From Basics to Cutting-edge Researches”
    • 発表場所
      岡崎
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] Structural basis for disparate sugar-binding specificities in the homologous cargo receptors ERGIC-53 and VIP36

    • 著者名/発表者名
      Tadashi Satoh
    • 学会等名
      Yonsei-IMS Seminars on Biomolecular Sciences : Protein Structures and Diseases
    • 発表場所
      Busan, Korea
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] The structural biology study on ER folding sensor UDP-glucose:glycoprotein glucosyltransferase (UGGT)

    • 著者名/発表者名
      Tong Zhu
    • 学会等名
      Yonsei-IMS Seminars on Biomolecular Sciences : Protein Structures and Diseases
    • 発表場所
      Busan, Korea
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] Structural-architecture of the ER glycoprotein folding sensor UDP-glucose:glycoprotein glucosyltransferase (UGGT)

    • 著者名/発表者名
      Tong Zhu
    • 学会等名
      2013年度 生物物理中部支部会
    • 発表場所
      岡崎
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] 小胞体品質管理に関わるグルコシダーゼIIの基質認識機構の構造基盤

    • 著者名/発表者名
      年森隆泰
    • 学会等名
      2013年度 生物物理中部支部会
    • 発表場所
      岡崎
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] プロテインジスルフィドイソメラーゼの機能発現におけるミクロ‐マクロ相関の探査

    • 著者名/発表者名
      稲垣宏弥
    • 学会等名
      2013年度 生物物理中部支部会
    • 発表場所
      岡崎
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] 小胞体糖タンパク質フォールディング装置を構成するタンパク質群の構造生物学研究

    • 著者名/発表者名
      佐藤匡史
    • 学会等名
      日本薬学会134年会
    • 発表場所
      熊本
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書

URL: 

公開日: 2013-05-15   更新日: 2019-07-29  

サービス概要 検索マニュアル よくある質問 お知らせ 利用規程 科研費による研究の帰属

Powered by NII kakenhi