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病原微生物におけるヘム獲得システムの構造基盤

公募研究

研究領域細胞シグナリング複合体によるシグナル検知・伝達・応答の構造的基礎
研究課題/領域番号 25121739
研究種目

新学術領域研究(研究領域提案型)

配分区分補助金
審査区分 生物系
研究機関独立行政法人理化学研究所

研究代表者

杉本 宏  独立行政法人理化学研究所, 放射光科学総合研究センター, 専任研究員 (90344043)

研究期間 (年度) 2013-04-01 – 2015-03-31
研究課題ステータス 完了 (2014年度)
配分額 *注記
4,550千円 (直接経費: 3,500千円、間接経費: 1,050千円)
2014年度: 2,340千円 (直接経費: 1,800千円、間接経費: 540千円)
2013年度: 2,210千円 (直接経費: 1,700千円、間接経費: 510千円)
キーワードヘム / X線結晶構造解析
研究実績の概要

病原菌にとって鉄の獲得は、ヒトへの感染増殖に必須である。そのためにヘム鉄を奪取するシステムや、細胞内外のヘムを感知するシステムを有する。本研究では、病原菌でABCファミリーに属するヘムトランスポーターのX線結晶構造解析による作動原理の解明を目指した。また、ヘム鉄を感知する二成分情報伝達系タンパク質が情報伝達を行うメカニズムの解析を行った。
1. ヘムの輸送システムについては、これまでに決定したヘムトランスポーターBhuUVとペリプラズムヘム結合蛋白質BhuTとの複合体やBhuT単独の結晶構造に加えて、H26年度はBhuUVのヌクレオチドフリー型の構造を決定した。BhuUサブユニット内の膜貫通部位で形成されるヘム輸送経路はペリプラズム側が表面のヘリックスによって閉じており、細胞質側に開いた状態を示した。このような特徴は休止状態と考えられるBhuUV-T複合体構造でも観測されており、輸送経路のゲート構造に大きな違いは見られない。反応サイクルでは、観測された内向きの構造からペリプラズム側に輸送経路が開くような構造への変化によってヘムを受け取れる初期状態に戻ることが示唆される。
2. ヘムセンサーはChrSとChrAという2つのタンパク質から構成される。ChrSは膜貫通領域を含むこともあり、上質な結晶の調製が困難で、構造解析に必要な分解能を示す結晶が得られなかった。ChrSからリン酸基シグナルを受け取る下流因子であるChrAについては 高分解能での構造決定に成功した。ChrAはリン酸化ドメインとDNA結合ドメインの2つのドメインから構成される。転写因子機能の活性化にとって重要となるドメインのオリエンテーションとリンカー領域の構造は他のファミリータンパク質には見られないユニークな特徴を示した。構造比較によりChrAの転写活性制御のメカニズムについての構造基盤が明らかとなった。

現在までの達成度 (段落)

26年度が最終年度であるため、記入しない。

今後の研究の推進方策

26年度が最終年度であるため、記入しない。

報告書

(2件)
  • 2014 実績報告書
  • 2013 実績報告書
  • 研究成果

    (12件)

すべて 2014 2013

すべて 雑誌論文 (1件) (うち査読あり 1件) 学会発表 (11件) (うち招待講演 2件)

  • [雑誌論文] An in vivo Inhibitory Effect on the Heme Uptake of Pseudomonas aeruginosa by Its Hemophore (HasAp) Carrying Synthetic Metal Complexes.2014

    • 著者名/発表者名
      Shirataki, C.; Shoji, O.; Terada, M.; Ozaki, S.; Sugimoto, H.; Shiro, Y.; Watanabe, Y.
    • 雑誌名

      Angw. Chem. Int. Ed.

      巻: 53 号: 11 ページ: 2862-2866

    • DOI

      10.1002/anie.201307889

    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] 病原菌由来ヘムトランスポーターのX線結晶構造解析2014

    • 著者名/発表者名
      中村希、直江洋一、土井章弘、杉本宏、城宜嗣
    • 学会等名
      平成26年度日本結晶学会年会
    • 発表場所
      東京都文京区 東京大学弥生講堂
    • 年月日
      2014-11-01
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] バクテリアのヘム輸送ABCトランスポーターの立体構造と分子機構2014

    • 著者名/発表者名
      杉本 宏
    • 学会等名
      第87回日本生化学会年会
    • 発表場所
      京都府京都市 国立京都国際会館
    • 年月日
      2014-10-17
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Conformational change of Periplasmic Heme-Binding Protein in ABC transporter2014

    • 著者名/発表者名
      Nozomi Nakamura, Youichi Naoe, Akihiro Doi, Hiroshi Sugimoto, Yoshitsugu Shiro
    • 学会等名
      第2回ピコバイオロジー研究所国際シンポジウム
    • 発表場所
      兵庫県赤穂郡 兵庫県立先端科学技術支援センター
    • 年月日
      2014-09-10
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] Conformational change of periplasmic heme-binding protein in ABC transporter.2014

    • 著者名/発表者名
      Nozomi Nakamura, Youichi Naoe, Akihiro Doi, Yoshitsugu Shiro, Hiroshi Sugimoto
    • 学会等名
      IUCr 2014 -23rd Congress
    • 発表場所
      Canada, Montreal
    • 年月日
      2014-08-11
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] Inward-facing conformation of the bacterial heme transporter.2014

    • 著者名/発表者名
      Hiroshi Sugimoto, Youichi Naoe, Nozomi Nakamura, Akihiro Doi, Yoshitsugu Shiro
    • 学会等名
      IUCr 2014 -23rd Congress
    • 発表場所
      Canada, Montreal
    • 年月日
      2014-08-11
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] 病原菌ヘムトランスポーターのX線結晶構造解析2014

    • 著者名/発表者名
      杉本 宏、直江 洋一、中村 希、土井 章弘、城 宜嗣
    • 学会等名
      第41回生体分子科学討論会
    • 発表場所
      福岡県福岡市 九州大学西新プラザ
    • 年月日
      2014-06-06
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] Challenges in the structure determination of membrane proteins by X-ray crystallography.2014

    • 著者名/発表者名
      Hiroshi Sugimoto
    • 学会等名
      EMtech Colloquium
    • 発表場所
      Malaysia, Putrajaya
    • 年月日
      2014-05-26 – 2014-05-27
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 病原菌由来ヘム結合タンパク質における柔軟なヘム認識2014

    • 著者名/発表者名
      中村希, 直江洋一, 杉本宏, 城宜嗣
    • 学会等名
      第6回日本生物物理学会 中国四国支部大会
    • 発表場所
      鳥取県鳥取市 とりぎん文化会館
    • 年月日
      2014-05-17 – 2014-05-18
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] ヘムトランスポーターの結晶構造から見えてきた動的構造と曖昧な分子認識2014

    • 著者名/発表者名
      杉本宏
    • 学会等名
      分子システム研究 第3回春季研究会
    • 発表場所
      滋賀県彦根市 かんぽの宿彦根
    • 年月日
      2014-04-24 – 2014-04-25
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] 病原菌由来ヘム輸送タンパク質の結晶構造2013

    • 著者名/発表者名
      中村 希・直江洋一・杉本 宏・城 宜嗣
    • 学会等名
      日本結晶学会年会
    • 発表場所
      熊本市
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] 病原菌由来へムトランスポーターの機能・構造解析2013

    • 著者名/発表者名
      杉本 宏, 直江 洋一, 沢辺 美亜, 城 宜嗣
    • 学会等名
      蛋白質科学会
    • 発表場所
      鳥取市
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書

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公開日: 2013-05-15   更新日: 2019-07-29  

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