研究領域 | ゲノムアダプテーションのシステム的理解 |
研究課題/領域番号 |
25125701
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研究種目 |
新学術領域研究(研究領域提案型)
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配分区分 | 補助金 |
審査区分 |
生物系
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研究機関 | 北海道大学 |
研究代表者 |
村上 洋太 北海道大学, 理学(系)研究科(研究院), 教授 (20260622)
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研究期間 (年度) |
2013-04-01 – 2015-03-31
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研究課題ステータス |
完了 (2014年度)
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配分額 *注記 |
11,700千円 (直接経費: 9,000千円、間接経費: 2,700千円)
2014年度: 5,850千円 (直接経費: 4,500千円、間接経費: 1,350千円)
2013年度: 5,850千円 (直接経費: 4,500千円、間接経費: 1,350千円)
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キーワード | エピゲノム / クロマチン / エピジェネティック制御 / クロマチンン構造 |
研究実績の概要 |
jmjCドメインをもちヘテロクロマチン局在を示す分裂酵母Epe1はヘテロクロマチン・ユークロマチン境界の確立、ヘテロクロマチン内転写の活性化、ヘテロクロマチンの安定化など様々な機能を持つ。Epe1の機能に関し、本研究では以下の知見を得た。 1) Epe1のjmjCドメインから下流のC末領域の種々の欠失変異を作成し、境界形成に必須のドメイン、ヘテロクロマチンタンパク質Swi6/HP1と相互作用するドメイン、ヘテロクロマチン安定化に必要なドメインを同定した。 2) Epe1欠損株のChIP-seqを用いたゲノム全体のヘテロクロマチン分布の解析から、Epe1の欠損により、ユークロマチン領域に 異所的なヘテロクロマチンが形成されることを見いだした。この異所的ヘテロクロマチン形成について、解析をすすめ以下の知見を得ている。① 異所的ヘテロクロマチンはユークロマチンの特定の領域に形成されやすいが、その形成はepe1破壊株のクローンごとに異なり、stochasticに形成が起きると思われる。② 異所的ヘテロクロマチンによる遺伝子発現抑制により、表現型にばらつきが生じる。③ 異所的ヘテロクロマチンは世代を超えて伝わる。④ 異所的ヘテロクロマチン形成はRNAiに依存せずHDAC (Sir2, Clr3), Swi6に依存する。 これらの結果はEpe1がゲノムを異所的なヘテロクロマチンン形成から保護する役割を持つことを示している。
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現在までの達成度 (段落) |
26年度が最終年度であるため、記入しない。
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今後の研究の推進方策 |
26年度が最終年度であるため、記入しない。
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