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ブルーム遺伝子欠損とDNA二重鎖切断の組み合わせによるゲノム不安定性の解析

公募研究

研究領域ゲノムアダプテーションのシステム的理解
研究課題/領域番号 25125714
研究種目

新学術領域研究(研究領域提案型)

配分区分補助金
審査区分 生物系
研究機関大阪大学

研究代表者

竹田 潤二  大阪大学, 医学(系)研究科(研究院), 教授 (50163407)

研究期間 (年度) 2013-04-01 – 2015-03-31
研究課題ステータス 完了 (2014年度)
配分額 *注記
11,180千円 (直接経費: 8,600千円、間接経費: 2,580千円)
2014年度: 5,590千円 (直接経費: 4,300千円、間接経費: 1,290千円)
2013年度: 5,590千円 (直接経費: 4,300千円、間接経費: 1,290千円)
キーワードBlm遺伝子欠損 / DNA二重鎖切断 / ゲノム不安定性 / ゲノムアダプテーション
研究実績の概要

ブルーム遺伝子欠損状態のゲノム不安定性に関し、ブルーム遺伝子を一過性にオフに転換できるシステムを用いている。その上に今回は外的ストレスとして放射線を利用し、ゲノムワイドに二重鎖切断を導入した。ブルーム遺伝子がオフで放射線を照射した時のゲノム状態を同じ新学術領域の瀬々准教授がゲノム再構成を特異的に感度よく検出できる新規アルゴリズム、COSMOS、を構築し、全ゲノムを解析した。その結果、ブルーム遺伝子欠損状態に特異的にゲノムのある領域に集中してゲノム再構成が認められた。さらに全ゲノムに対するCGHを施行したところ、再構成を起こしている領域でコピー数が正常に比べ増加していることが判明した。このことは、ブルーム遺伝子欠損状態で誘導されるゲノム再構成は、ガンゲノムでよく観察されるchromothripsisによるゲノム再構成ではなく、複製を伴うchromoanasynthesis によるゲノム再構成であることが強く示唆された。

現在までの達成度 (段落)

26年度が最終年度であるため、記入しない。

今後の研究の推進方策

26年度が最終年度であるため、記入しない。

報告書

(2件)
  • 2014 実績報告書
  • 2013 実績報告書
  • 研究成果

    (5件)

すべて 2014 2013

すべて 雑誌論文 (1件) (うち査読あり 1件、 オープンアクセス 1件) 学会発表 (4件) (うち招待講演 2件)

  • [雑誌論文] Enhancement of microhomology-mediated genomic rearrangements by transient loss of mouse Bloom syndrome helicase.2013

    • 著者名/発表者名
      Yamanishi A., Yusa K., Horie K., Tokunaga M., Kusano K., Kokubu C. and Takeda J
    • 雑誌名

      Genome Research

      巻: 23 号: 9 ページ: 1462-1473

    • DOI

      10.1101/gr.152744.112

    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [学会発表] Blm遺伝子欠損状態における放射線照射によるゲノム再構成の亢進について2014

    • 著者名/発表者名
      山西 絢子
    • 学会等名
      第37回日本分子生物学会年会
    • 発表場所
      横浜市、日本
    • 年月日
      2014-11-27
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] Generation of gene-trapped haploid ES cell bank2014

    • 著者名/発表者名
      竹田 潤二
    • 学会等名
      Systems Biology of Gene Regulation and Genome Editing
    • 発表場所
      蘇州、中国
    • 年月日
      2014-09-09 – 2014-09-12
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] 哺乳動物において順遺伝学的手法は有用か?2014

    • 著者名/発表者名
      竹田 潤二
    • 学会等名
      第33回分子病理学研究会 宮城蔵王シンポジウム
    • 発表場所
      宮城県、日本
    • 年月日
      2014-07-26
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Gene discovery by transposons in diploid and haploid ES cells2013

    • 著者名/発表者名
      竹田 潤二
    • 学会等名
      Conference on Transposition and Genome Engineering 2013
    • 発表場所
      Budapest, Hungary
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
    • 招待講演

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公開日: 2013-05-15   更新日: 2019-07-29  

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