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不完全なDNAメチル化に伴うクロマチンタンパク質のユビキチン化とその役割

公募研究

研究領域ゲノム複製・修復・転写のカップリングと普遍的なクロマチン構造変換機構
研究課題/領域番号 25131717
研究種目

新学術領域研究(研究領域提案型)

配分区分補助金
審査区分 生物系
研究機関名古屋市立大学

研究代表者

西山 敦哉  名古屋市立大学, 医学(系)研究科(研究院), 講師 (50378840)

研究期間 (年度) 2013-04-01 – 2015-03-31
研究課題ステータス 完了 (2014年度)
配分額 *注記
11,180千円 (直接経費: 8,600千円、間接経費: 2,580千円)
2014年度: 5,590千円 (直接経費: 4,300千円、間接経費: 1,290千円)
2013年度: 5,590千円 (直接経費: 4,300千円、間接経費: 1,290千円)
キーワードDNAメチル化 / UHRF1 / DNMT1 / ユビキチン / DNA複製 / クロマチン / DUB / USP7 / Usp7 / Uhrf1 / ヒストンH3 / ユビキチン化 / 脱ユビキチン化
研究実績の概要

ゲノムDNA上のDNAメチル化パターンはDNA複製時に、DNA情報同様に正確に娘DNAに伝達される必要がある。これはDNAメチル化酵素1 (DNMT1)を中心とする維持DNAメチル化機構により制御されており、この分子機構の破綻は異常な発生・分化をもたらす。また、近年ではがん細胞において異常なDNAメチル化パターンが高頻度で報告されており、維持DNAメチル化の分子メカニズムの解明は重要な課題と考えられる。申請者は、これまで維持DNAメチル化を試験管内で再現可能であるツメガエル卵抽出液由来の無細胞系を主に用いて、ヒストンH3のUHRF1ユビキチンリガーゼによるユビキチン化がDNMT1のメチル化部位へのリクルートに重要な役割を果たすことを報告してきた。また、その過程でDNMT1とともに脱ユビキチン化酵素であるUSP7がDNAメチル化部位で機能するという知見を得た。
26年度はDNAメチル化における脱ユビキチン化酵素の役割について検討した。またDNMT1とUSP7の相互作用領域について詳細な解析を行なった。まず脱ユビキチン化酵素(DUB)の特異的阻害剤を卵抽出液に加え、そのDNA複製及び維持DNAメチル化に対する影響を調べたところ、DUB阻害剤存在下においてDNA複製はほぼ正常に進行する一方、DNAへのメチル基の取り込みは大きく減少した。これと一致して、DUB阻害剤処理に伴い、クロマチン上におけるDnmt1とユビキチン化H3の過剰な蓄積が観察された。これはDUB活性がDNMT1のユビキチン化H3によるメチル化部位へのリクルート以降のプロセス、例えばDNMT1の活性化などに重要であることを示唆している。また欠失変異体を用いた解析から、USP7がこれまで機能が不明であったDNMT1のBAHドメインを介して、DNMT1と相互作用することが示された。

現在までの達成度 (段落)

26年度が最終年度であるため、記入しない。

今後の研究の推進方策

26年度が最終年度であるため、記入しない。

報告書

(2件)
  • 2014 実績報告書
  • 2013 実績報告書
  • 研究成果

    (6件)

すべて 2014 2013

すべて 雑誌論文 (1件) (うち査読あり 1件) 学会発表 (5件) (うち招待講演 4件)

  • [雑誌論文] Uhrf1-dependent H3K23 ubiquitylation couples maintenance DNA methylation and replication2013

    • 著者名/発表者名
      Nishiyama, A
    • 雑誌名

      Nature

      巻: 502 号: 7470 ページ: 249-253

    • DOI

      10.1038/nature12488

    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] 染色体恒常性制御におけるDNAメチル化維持機構の役割2014

    • 著者名/発表者名
      西山敦哉
    • 学会等名
      第37回分子生物学会年会ワークショップ、細胞周期を通じた染色体恒常性制御のニューフロンティア
    • 発表場所
      パシフィコ横浜(横浜市)
    • 年月日
      2014-11-25 – 2014-11-27
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] DNAメチル化維持とカップルしたヒストンH3ユビキチン化の制御機構2014

    • 著者名/発表者名
      西山敦哉
    • 学会等名
      大阪大学蛋白研セミナー「染色体伝承の分子背景:複製から染色体分離まで」
    • 発表場所
      大阪大学蛋白質研究所 (大阪府、吹田市)
    • 年月日
      2014-09-25 – 2014-09-26
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Regulation of DNA methylation-coupled histone H3 ubiquitylation2014

    • 著者名/発表者名
      Atsuya Nishiyama, Luna Yamaguchi, Makoto Nakanishi
    • 学会等名
      Replication, repair and transcription; coupling mechanisms and chromatin dynamics for genome integrity
    • 発表場所
      京都大学時計台記念館(京都府)
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] ヒストンH3のユビキチン化とDNA維持メチル化制御2013

    • 著者名/発表者名
      西山敦哉
    • 学会等名
      平成25年度遺伝研研究会「クロマチンによる遺伝情報のエピジェネティック制御機構」
    • 発表場所
      国立遺伝学研究所(静岡県)
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Uhrf1依存的なヒストンH3のユビキチン化を介したDNA維持メチル化制御機構2013

    • 著者名/発表者名
      西山敦哉、山口留奈、Jafar Sharif, 城村由和、川村猛、中西圭子、島村真太郎、有田恭平、児玉龍彦、石川冬木、古関明彦、中西真
    • 学会等名
      第36回分子生物学会年会ワークショップ「タンパク質翻訳後修飾を介した超分子複合体形成とゲノム機能制御」
    • 発表場所
      神戸国際会議場(兵庫県)
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
    • 招待講演

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公開日: 2013-05-15   更新日: 2019-07-29  

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