システム生物学的アプローチによる希少がんの分子病態解明と臨床病態の予測

公募研究

研究領域	システム的統合理解に基づくがんの先端的診断、治療、予防法の開発
研究課題/領域番号	25134719
研究種目	新学術領域研究(研究領域提案型)
配分区分	補助金
審査区分	複合領域
研究機関	独立行政法人国立がん研究センター
研究代表者	谷内田真一独立行政法人国立がん研究センター, 研究所, ユニット長 (20359920)
研究期間 (年度)	2013-04-01 – 2015-03-31
研究課題ステータス	完了 (2014年度)
配分額 *注記	13,000千円 (直接経費: 10,000千円、間接経費: 3,000千円) 2014年度: 6,500千円 (直接経費: 5,000千円、間接経費: 1,500千円) 2013年度: 6,500千円 (直接経費: 5,000千円、間接経費: 1,500千円)
キーワード	希少がん / エクソン解析 / コピー数解析
研究実績の概要	希少がんであり難治がんであるファーター乳頭部がんを研究対象とした。希少であることから、本邦6施設と米国・ジョンズホプキンス大学から研究試料を収集した。全施設の研究倫理審査委員会の承認を得た後に研究を開始した。 Discovery setとして60症例を全エクソン・シークエンス解析とコピー数解析（CGHアレイ）を行った。全エクソン解析はSureSelct-Illuminaプラットホームを用いて行った。全エクソン解析の結果、高頻度の変異が検出された92遺伝子をがん関連候補遺伝子として抽出した。 Validation setとして、日米の172例のファーター乳頭部がんを研究対象とし、92遺伝子のTargeted deep sequencingを行った。Targeted deep sequencingは、HaloPlex-Illuminaプラットホームを用いて行った。さらに全例で、CDX2、MUC2、MUC1とCK20の市販の抗体を用いて、免疫組織化学染色を行い、Intestinal typeとPancreatobiliary typeに亜分類を行った。上記の解析の結果、Intestinal typeは大腸がんに類似した遺伝子異常、Pancreatobiliary typeは膵臓がんに類似した遺伝子異常のパターンを示した。並行して、非ファーター乳頭部十二指腸がんの網羅的遺伝子解析も行い。ファーター乳頭部がんと比較検討した。
現在までの達成度 (段落)	26年度が最終年度であるため、記入しない。
今後の研究の推進方策	26年度が最終年度であるため、記入しない。