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「深層学習に基づく水和理論」を用いたタンパク質シミュレーションの高速化

公募研究

研究領域「学習物理学」の創成-機械学習と物理学の融合新領域による基礎物理学の変革
研究課題/領域番号 25H01505
研究種目

学術変革領域研究(A)

配分区分補助金
審査区分 学術変革領域研究区分(Ⅱ)
研究機関東北大学

研究代表者

吉留 崇  東北大学, 工学研究科, 准教授 (90456830)

研究期間 (年度) 2025-04-01 – 2027-03-31
研究課題ステータス 交付 (2025年度)
配分額 *注記
3,900千円 (直接経費: 3,000千円、間接経費: 900千円)
2025年度: 1,820千円 (直接経費: 1,400千円、間接経費: 420千円)
キーワード水和 / タンパク質 / 深層学習 / シミュレーション
研究開始時の研究の概要

独自の「深層学習に基づく高速な水和理論」(Ito & Yoshidome, IUPAB 2024、吉留、第4回学術変革領域「学習物理」物性関係討論会 2025)を発展させ、高速なタンパク質シミュレーション手法を開発する。既存のタンパク質全原子シミュレーションでは数十万個の運動方程式を数値的に解くことになり、タンパク質折り畳みの時間スケールに到達することが極めて困難である。これに対し本研究では、独自の水和理論の導入により、水分子の運動方程式計算を不要にすることでタンパク質シミュレーションを高速化し、タンパク質折り畳みの時間スケールへの到達を目指す。

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公開日: 2025-04-17   更新日: 2025-06-20  

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