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アミノ酸代謝を制御するハブ分子の多面性の理解に向けた天然物化学遺伝学

公募研究

研究領域天然物ケミカルバイオロジー:分子標的と活性制御
研究課題/領域番号 26102726
研究種目

新学術領域研究(研究領域提案型)

配分区分補助金
審査区分 理工系
研究機関京都大学

研究代表者

西村 慎一  京都大学, 薬学研究科(研究院), 助教 (30415260)

研究期間 (年度) 2014-04-01 – 2016-03-31
研究課題ステータス 完了 (2015年度)
配分額 *注記
5,720千円 (直接経費: 4,400千円、間接経費: 1,320千円)
2015年度: 2,860千円 (直接経費: 2,200千円、間接経費: 660千円)
2014年度: 2,860千円 (直接経費: 2,200千円、間接経費: 660千円)
キーワード天然物化学 / 代謝 / 化学遺伝学
研究実績の概要

生体内の分子は相互作用をすることでネットワークを形成し、それが生命システムをつくる。ネットワークの中心に存在するハブタンパク質は、多くの分子と相互作用し、多様な機能を発揮する。天然物リガンドには何故か、こういったハブタンパク質を標的とするものが多いようである。ハブタンパク質を阻害すれば周辺ネットワークに大きな摂動が生じるが、一対一対応を想定した既存の鍵と鍵穴モデルの適用ではハブタンパク質のマルチな機能を区別して解析することは不可能である。同じハブタンパク質を標的にしていても構造多様性を有し、少しずつ異なる表現型を示す天然物リガンドを使い分けることでハブタンパク質の機能解析を効果的に推進することを目標に、本研究ではアミノ酸代謝を変調するリガンドの探索とその作用機序解析を推進した。すなわち分裂酵母を単一のアミノ酸を窒素源として培養し、特定のアミノ酸に選択的に生育阻害や形態変化を誘導する微生物培養液抽出物をスクリーニングにより取得後、活性本体を精製・構造解析を行った。その結果、特定のアクチン重合阻害剤やFKBPの阻害化合物がセリンの資化を選択的に阻害すること、二価イオンに親和性を示すイオノフォアが化合物によってプロリンやグルタミン酸の資化を優先的に阻害することを見出し、プロリンの資化を抑える化合物として真菌から新規リポペプチドを同定した。アクチン重合阻害剤は多数知られているが特定の化合物のみがアミノ酸選択性を発揮すること、イオノフォアについてもin vitroでのイオン選択性だけでは説明できないアミノ酸選択性を示すことを見出しており、細胞レベルでの詳細な機能解明により、アミノ酸代謝の制御メカニズムの一端が明らかになると期待できる。プロリンの資化を優先的に阻害する新規リポペプチドは、活性型と不活性型が取得できており、プロリン代謝を解析する優れたツール化合物になると期待できる。

現在までの達成度 (段落)

27年度が最終年度であるため、記入しない。

今後の研究の推進方策

27年度が最終年度であるため、記入しない。

報告書

(2件)
  • 2015 実績報告書
  • 2014 実績報告書
  • 研究成果

    (9件)

すべて 2016 2015 2014

すべて 雑誌論文 (7件) (うち査読あり 5件、 謝辞記載あり 4件) 学会発表 (2件) (うち国際学会 1件)

  • [雑誌論文] Marine sponge cyclic peptide theonellamide A disrupts lipid bilayer integrity without forming distinct membrane pores.2016

    • 著者名/発表者名
      1.Espiritu, R. A., Cornelio, K., Kinoshita, M., Matsumori, N., Murata, M., Nishimura, S., Kakeya, H., Yoshida, M. & Matsunaga, S.
    • 雑誌名

      Biochim. Biophys. Acta

      巻: 1858 号: 6 ページ: 1373-1379

    • DOI

      10.1016/j.bbamem.2016.03.019

    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Structure elucidation of verucopeptin, a potent HIF-1 inhibitory polyketide-hexapeptide hybrid metabolite from an actinomycete.2015

    • 著者名/発表者名
      2.Yoshimura, A., Nishimura, S., Otsuka, S., Hattori, A. & Kakeya, H.
    • 雑誌名

      Org. Lett.

      巻: 17 号: 21 ページ: 5364-5367

    • DOI

      10.1021/acs.orglett.5b02718

    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 査読あり / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Saccharothriolides A-C, novel phenyl-substituted 10-membered macrolides isolated from a rare actinomycete Saccharothrix sp.2015

    • 著者名/発表者名
      3.Lu, S., Nishimura, S., Hirai, G., Ito, M., Kawahara, T., Izumikawa, M., Sodeoka, M., Shin-ya, K., Tsuchida, T. & Kakeya, H.
    • 雑誌名

      Chem Commun

      巻: 51 号: 38 ページ: 8074-8077

    • DOI

      10.1039/c5cc01953b

    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 査読あり / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] ステロール標的抗真菌剤の活性発現における細胞膜輸送バランスの重要性2015

    • 著者名/発表者名
      西村慎一 & 掛谷秀昭
    • 雑誌名

      バイオサイエンスとインダストリー

      巻: 73 ページ: 383-385

    • NAID

      40020591850

    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [雑誌論文] 5-Alkyl-1,2,3,4-tetrahydroquinolines, New Membrane-Interacting Lipophilic Metabolites Produced by Combined Culture of Streptomyces nigrescens and Tsukamurella pulmonis.2015

    • 著者名/発表者名
      Sugiyama R, Nishimura S, Ozaki T, Asamizu S, Onaka H, Kakeya H.
    • 雑誌名

      Org Lett.

      巻: 印刷中 号: 8 ページ: 1918-1921

    • DOI

      10.1021/acs.orglett.5b00607

    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
    • 査読あり / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] 生体膜微小環境への挑戦:膜ステロールに作用する海洋天然物セオネラミド2015

    • 著者名/発表者名
      西村慎一, 掛谷秀昭
    • 雑誌名

      CSJカレントレビュー「生物活性分子のケミカルバイオロジー」

      巻: 19 ページ: 102-108

    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [雑誌論文] Balance of exocytosis and endocytosis determines the efficiency of sterol-targeting antibiotics.2014

    • 著者名/発表者名
      Nishimura, S., Tokukura, M., Ochi, J., Yoshida, M. & Kakeya H.
    • 雑誌名

      Chem. Biol.

      巻: 21 号: 12 ページ: 1690-1699

    • DOI

      10.1016/j.chembiol.2014.10.014

    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
    • 査読あり / 謝辞記載あり
  • [学会発表] 5-Alkyl-1,2,3,4-tetrahydroquinolines (5aTHQs), new membrane-interacting lipophilic metabolites, produced by combined-culture of Streptomyces nigrescens and Tsukamurella pulmonis.2015

    • 著者名/発表者名
      Sugiyama, R., Nishimura, S., Ozaki, T., Asamizu, S., Onaka, H., Kakeya, H.
    • 学会等名
      The International Chemical Congress of Pacific Basin Societies 2015 (PACIFICHEM 2015)
    • 発表場所
      Honolulu, HA, USA
    • 年月日
      2015-12-15
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Marine natural products targeting cell membrane.2014

    • 著者名/発表者名
      Nishimura, S., Sugiyama, R., Matsumori, N., Kakeya, H.
    • 学会等名
      International Chemical Biology Society 2014
    • 発表場所
      San Francisco
    • 年月日
      2014-11-17 – 2014-11-19
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書

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公開日: 2014-04-04   更新日: 2018-03-28  

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