• 研究課題をさがす
  • 研究者をさがす
  • KAKENの使い方
  1. 前のページに戻る

F1-ATPaseによるエネルギー変換と非平衡揺らぎ

公募研究

研究領域ゆらぎと構造の協奏:非平衡系における普遍法則の確立
研究課題/領域番号 26103528
研究種目

新学術領域研究(研究領域提案型)

配分区分補助金
審査区分 理工系
研究機関中央大学

研究代表者

宗行 英朗  中央大学, 理工学部, 教授 (80219865)

研究期間 (年度) 2014-04-01 – 2016-03-31
研究課題ステータス 完了 (2015年度)
配分額 *注記
10,140千円 (直接経費: 7,800千円、間接経費: 2,340千円)
2015年度: 5,200千円 (直接経費: 4,000千円、間接経費: 1,200千円)
2014年度: 4,940千円 (直接経費: 3,800千円、間接経費: 1,140千円)
キーワード生体エネルギー変換 / 分子モーター / ゆらぎ / F1-ATPase
研究実績の概要

2015年度は,長時間安定したピントを維持して観察を行うための顕微鏡システムの開発を行った.今のところ10分前後の連続した観察を安定して行えており,十分な性能を持つものが出来たと考えている.
一方,ATPase活性が落ちた変異体でどのように回転の性質が変わるかを検討すれば,化学反応と力学的な動きの共役に関する知見が得られることを期待してβE190D変異体の回転について,外部トルク依存性などを調べた.
βE190D変異体は,加水分解反応に重要なグルタミン酸(E)をアスパラギン酸(D)に置換することにより触媒活性が1/100に低下したもので,F1-ATPaseの変異体の中では最もよく調べられたものの一つである.しかし,この変異体に外部トルクをかけると大きくばらついたストールトルクが得られ,それらはすべてATPの加水分解の自由エネルギー差から期待されるものより低くなっていた.以上の結果は,E190D変異が加水分解反応に影響するだけでなく,モーターの機械的な安定性を低下させ,回転にスリップが起こったことを示唆している.実際に熱処理を行って野生型と比較したところ,74℃で安定性が明らかに低下しており,また,γサブユニットのないα3β3複合体の安定性をゲル濾過で調べたところ,βE190D変異はα3β3複合体を安定に形成できないことが分かった.図らずも,ATPase活性の低下した変異体の回転への影響が,分子全体の機械的な強度の不安定化という形で現れたのであるが,F1-ATPaseがβサブユニットでのATP加水分解活性とγサブユニットの回転をカップルすることを考えると,加水分解活性に重要なアミノ酸残基が機械的な動きに関してもそれを支える形で重要な役割を果たすのは合理的なのかも知れない.
このほかに光駆動型プロトンポンプであるプロテオロドプシンのポンプ活性の研究をおこない,pHによって輸送方向の逆転が起こることを示唆する結果を得た.

現在までの達成度 (段落)

27年度が最終年度であるため、記入しない。

今後の研究の推進方策

27年度が最終年度であるため、記入しない。

報告書

(2件)
  • 2015 実績報告書
  • 2014 実績報告書
  • 研究成果

    (21件)

すべて 2016 2015 2014 その他

すべて 雑誌論文 (4件) (うち査読あり 4件、 オープンアクセス 3件、 謝辞記載あり 1件) 学会発表 (14件) 図書 (2件) 備考 (1件)

  • [雑誌論文] Formation of M-Like Intermediates in Proteorhodopsin in Alkali Solutions (pH less than 8.5) Where the Proton Release Occurs First in Contrast to the Sequence at Lower pH2016

    • 著者名/発表者名
      Tamogami J, Sato K, Kurokawa S, Yamada T, Nara T, Demura M, Miyauchi S, Kikukawa T, Muneyuki E, Kamo N
    • 雑誌名

      Biochemistry

      巻: 55 号: 7 ページ: 1036-1048

    • DOI

      10.1021/acs.biochem.5b01196

    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Single molecule thermodynamics of ATP synthesis by F 1 -ATPase2015

    • 著者名/発表者名
      Shoichi Toyabe, Eiro Muneyuki
    • 雑誌名

      New Journal of Physics

      巻: 17 号: 1 ページ: 1-7

    • DOI

      10.1088/1367-2630/17/1/015008

    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] CHARMM Force-fields with Modified Polyphosphate Parameters Allow Stable Simulation of the ATP-Bound Structure of Ca2+-ATPase2014

    • 著者名/発表者名
      Yasuaki Komuro, Suyong Re, Chigusa Kobayashi, Eiro Muneyuki and Yuji Sugita
    • 雑誌名

      Journal of Chemical Theory and Computation

      巻: 10 号: 9 ページ: 4133-4142

    • DOI

      10.1021/ct5004143

    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
    • 査読あり / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Torque generation of Enterococcus hirae V-ATPase2014

    • 著者名/発表者名
      Ueno H, Minagawa Y, Hara M, Rahman S, Yamato I, Muneyuki E, Murata T, and Iino R
    • 雑誌名

      The Journal of Biological Chemistry

      巻: 289 号: 45 ページ: 31212-31223

    • DOI

      10.1074/jbc.m114.598177

    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [学会発表] 好熱菌F1のβE190残基は構造を安定化することにより,F1の高効率エネルギー変換に貢献する2016

    • 著者名/発表者名
      田中真奈,河上知広,中山洋平,鳥谷部祥一,上野博史,工藤成史,宗行英朗
    • 学会等名
      生体運動研究合同班会議 2016
    • 発表場所
      キャンパスプラザ京都
    • 年月日
      2016-01-08
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] F1-ATPaseのP-loop変異体TF1(βG158A)のリン酸解離角度の解明2016

    • 著者名/発表者名
      成田宏夏,星名仁志,吉田光,中山洋平,鳥谷部祥一,上野博史,宗行英朗
    • 学会等名
      生体運動研究合同班会議 2016
    • 発表場所
      キャンパスプラザ京都
    • 年月日
      2016-01-08
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] TF1bE190 residue contributes to high energy transduction efficiency by stabilizing the structure of the enzyme.2015

    • 著者名/発表者名
      田中 真奈, 河上 知広, 中山 洋平, 鳥谷部 祥一, 上野 博史, 工藤 正史, 宗行 英朗
    • 学会等名
      第53回日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      金沢大学角間キャンパス(石川)
    • 年月日
      2015-09-13
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] The relationship between F1-ATPase P-loop mutant TF1(βG158A) and Pi release2015

    • 著者名/発表者名
      成田 宏夏, 星名 仁志, 吉田 光, 伊藤 亜由美, 伊藤 丈太郎, 中山 洋平, 鳥谷部 祥一, 上野 博史, 宗行 英朗
    • 学会等名
      第53回日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      金沢大学角間キャンパス(石川)
    • 年月日
      2015-09-13
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] pH dependence of the photoinduced proton transfer in proteorhodopsin under alkaline conditions2015

    • 著者名/発表者名
      田母神 淳, 佐藤 慶太郎, 黒川 少名, 山田 匠, 奈良 敏文, 出村 誠, 菊川 峰志, 宗行 英朗, 加茂 直樹
    • 学会等名
      第53回日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      金沢大学角間キャンパス(石川)
    • 年月日
      2015-09-13
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] Rotation of β E190D Mutant of F1-ATPase2015

    • 著者名/発表者名
      E. Muneyuki, M. Tanaka, T. Kawakami, H. Ueno, Y. Nakayama, S. Toyabe
    • 学会等名
      International Symposium on Fluctuation and Structure out of Equilibrium 2015
    • 発表場所
      Inamori Hall, Shiran-Kaikan, Kyoto University
    • 年月日
      2015-08-23
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] 回転分子モーターF1-ATPaseの機能解析2015

    • 著者名/発表者名
      宗行 英朗
    • 学会等名
      新学術領域「ゆらぎと構造」+「分子ロボティクス」合同研究会
    • 発表場所
      東京大学本郷キャンパス理学部1号館小柴ホール
    • 年月日
      2015-06-27
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] 外力存在下のF1-ATPaseの回転観察2015

    • 著者名/発表者名
      菊池洋輔,鳥谷部祥一,上野博史,宗行英朗
    • 学会等名
      2015年生体運動研究合同班会議
    • 発表場所
      東京 学習院大学
    • 年月日
      2015-01-07 – 2015-01-09
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] 改良した多リン酸力場を用いた ATP/ADP 結合状態の筋小胞体カルシウムポンプの分子動力学計算2014

    • 著者名/発表者名
      小室 靖明, 李 秀栄, 小林 千草, 宗行 英朗, 杉田 有治
    • 学会等名
      第52回日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      北海道大学
    • 年月日
      2014-09-25 – 2014-09-27
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] F1-ATPase のP-loop変異体TF1(βG158A)に対するリン酸の阻害効果2014

    • 著者名/発表者名
      星名 仁志, 吉田 光, 伊藤 亜由美, 伊藤 丈太郎, 鳥谷部 祥一, 上野 博史, 宗行 英朗
    • 学会等名
      第52回日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      北海道大学
    • 年月日
      2014-09-25 – 2014-09-27
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] Nucleotide binding to TF1 β subunit in relation to the effect of Pi2014

    • 著者名/発表者名
      長埜 陸, 小原 清志, 上野 博史, 宗行 英朗
    • 学会等名
      第52回日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      北海道大学
    • 年月日
      2014-09-25 – 2014-09-27
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] Rotor-Stator Interactions in V1 and Vo from Enterococcus hirae V-ATPase2014

    • 著者名/発表者名
      上野 博史, 皆川 慶嘉, 原 舞雪, 山登 一郎, 野地 博行, 村田 武士, 飯野 亮太, 宗行 英朗
    • 学会等名
      第52回日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      北海道大学
    • 年月日
      2014-09-25 – 2014-09-27
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] Observation of the rotation of F1-ATPase under the constant external torque2014

    • 著者名/発表者名
      菊池 洋輔, 上野 博史, 中山 隆宏, 宗行 英朗, 鳥谷部 祥一
    • 学会等名
      第52回日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      北海道大学
    • 年月日
      2014-09-25 – 2014-09-27
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] TF1 β;E190D変異体の外部トルク依存性2014

    • 著者名/発表者名
      田中 真奈, 河上 知広, 鳥谷部 祥一, 上野 博史, 工藤 正史, 宗行 英朗
    • 学会等名
      第52回日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      北海道大学
    • 年月日
      2014-09-25 – 2014-09-27
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [図書] DOJIN BIOSCIENCE SERIES 17 一分子生物学 (原田 慶恵 石渡 信一 編 )2014

    • 著者名/発表者名
      上野博史, 鳥谷部祥一, 宗行英朗
    • 総ページ数
      14
    • 出版者
      化学同人
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [図書] 化学フロンティアシリーズ 23 1分子ナノバイオ計測 (野地博行 編 )2014

    • 著者名/発表者名
      鳥谷部祥一,宗行英朗
    • 総ページ数
      8
    • 出版者
      化学同人
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [備考] 最近の研究から

    • URL

      http://www.phys.chuo-u.ac.jp/j/muneyuki/?%BA%C7%B6%E1%A4%CE%B8%A6%B5%E6%A4%AB%A4%E9

    • 関連する報告書
      2014 実績報告書

URL: 

公開日: 2014-04-04   更新日: 2018-03-28  

サービス概要 検索マニュアル よくある質問 お知らせ 利用規程 科研費による研究の帰属

Powered by NII kakenhi