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染色体活性制御と偽ヘテロクロマチン化の相関

公募研究

研究領域ゲノム・遺伝子相関:新しい遺伝学分野の創成
研究課題/領域番号 26113714
研究種目

新学術領域研究(研究領域提案型)

配分区分補助金
審査区分 生物系
研究機関近畿大学

研究代表者

佐渡 敬  近畿大学, 農学部, 教授 (70321601)

研究期間 (年度) 2014-04-01 – 2016-03-31
研究課題ステータス 完了 (2015年度)
配分額 *注記
19,890千円 (直接経費: 15,300千円、間接経費: 4,590千円)
2015年度: 10,010千円 (直接経費: 7,700千円、間接経費: 2,310千円)
2014年度: 9,880千円 (直接経費: 7,600千円、間接経費: 2,280千円)
キーワードエピジェネティクス / ヘテロクロマチン
研究実績の概要

変異型Xist RNAが構築する偽ヘテロクロマチンのヒストン修飾についてChIP-seq解析を行うにはマウス初期胚では十分な材料が得られないため、これに代わる材料として変異胚から樹立したES細胞(ESC)の利用を検討した.その中で生じた最も大きな問題は、メスのESCが培養過程でX染色体を1本欠失し、XOとなる細胞が無視できない頻度で出現することであった.そのため、ESCを利用した解析はこれまでのところ期待通りには進展していない.その打開策として、ESCに変わる新たな材料としてEpiSCの樹立する準備を進めている.
一方、変異Xist RNAが引き起こすサイレンシングの異常の程度を明らかにするため、変異胚を用いたRNA-seqを計画した.胎盤を形成する胚体外組織と胎児を形成する胚体組織の間にはX染色体不活性化の仕組みに違いがあるため、それぞれを分けて解析を行っている.胚体外組織については予定しているシーケンシングの大半を終了し、得られたリードの解析を進めている.胚体組織ついては、順次シーケンシングを行っている状態である.これまでに得られた胚体外組織の解析からは、不活性化すべきX染色体を不活性化できないと、X連鎖遺伝子の発現が2倍になるという単純なものではなく、X連鎖遺伝子にも常染色体連鎖遺伝子にも発現レベルが上昇するもの、減少するものが多数観察された.これはX染色体不活性化が単純に雌雄間のX連鎖遺伝子量の差を補償するためだけの機構にとどまらず、ゲノムワイドの遺伝子発現に大きなインパクトを持つものであることを示唆している.このRNA-seq解析を早急に終え、X染色体不活性化の生物学的意義に関するこの新たな考え方を迅速に成果として公表できるよう努める.

現在までの達成度 (段落)

27年度が最終年度であるため、記入しない。

今後の研究の推進方策

27年度が最終年度であるため、記入しない。

報告書

(2件)
  • 2015 実績報告書
  • 2014 実績報告書
  • 研究成果

    (29件)

すべて 2015 2014

すべて 雑誌論文 (4件) (うち国際共著 1件、 査読あり 4件、 オープンアクセス 4件、 謝辞記載あり 2件) 学会発表 (25件) (うち招待講演 5件)

  • [雑誌論文] A new Xist allele driven by a constitutively active promoter is dominated by Xist locus environment and exhibits the parent-of-origin effects.2015

    • 著者名/発表者名
      Amakawa Y, Sakata Y, Hoki Y, Arata S, Shioda S, Fukagawa T, Sasaki H, Sado T.
    • 雑誌名

      Development.

      巻: 142 ページ: 4299-4308

    • DOI

      10.1242/dev.128819

    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] An Xist Activating Antisense RNA Required for X-chromosome Inactivation.2015

    • 著者名/発表者名
      Sarkar, M., Gayen, S., Kumar, S., Maclary, E., Buttigieg, E., Hinten, M., Kumari, A., Harris, C., Sado, T., and *Kalantry, S.
    • 雑誌名

      Nature comm.

      巻: 6 号: 1 ページ: 8564-8564

    • DOI

      10.1038/ncomms9564

    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著 / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Current view of the potential roles of proteins enriched on the inactive X chromosome2014

    • 著者名/発表者名
      Nakajima, T., Sado, T.
    • 雑誌名

      Genes & Genetic Systems

      巻: 89 号: 4 ページ: 151-157

    • DOI

      10.1266/ggs.89.151

    • NAID

      130004750052

    • ISSN
      1341-7568, 1880-5779
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] X Chromosome Reactivation Dynamics Reveal Stages of Reprogramming to Pluripotency2014

    • 著者名/発表者名
      Pasque, V., Tchieu, J., Karnik, R., Uyeda, M., Dimashkie, M.S., Case, D., Papp, B., Bonora, G., Patel, S., Ho, R., Schmidt, R., McKee, R., Sado, T., Tada, T., Meissner, A. and Plath, K.
    • 雑誌名

      Cell

      巻: 159 号: 7 ページ: 1681-1697

    • DOI

      10.1016/j.cell.2014.11.040

    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
  • [学会発表] 哺乳類X染色体のエピジェネティクス2015

    • 著者名/発表者名
      佐渡 敬
    • 学会等名
      第38回日本分子生物学会年会 第88回日本生化学大会 合同年会
    • 発表場所
      兵庫県神戸市(神戸ポートアイランド)
    • 年月日
      2015-12-01
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] SmcHD1機能欠損マウス胚におけるX染色体不活性化2015

    • 著者名/発表者名
      榊原 祐樹,佐々木 裕之,Blewitt Marnie,佐渡 敬
    • 学会等名
      第38回日本分子生物学会年会 第88回日本生化学大会 合同年会
    • 発表場所
      兵庫県神戸市(神戸ポートアイランド)
    • 年月日
      2015-12-01
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] Xist RNAの核内係留因子を探索する系の確立2015

    • 著者名/発表者名
      千木 雄太,佐々木 裕之,佐渡 敬
    • 学会等名
      第38回日本分子生物学会年会 第88回日本生化学大会 合同年会
    • 発表場所
      兵庫県神戸市(神戸ポートアイランド)
    • 年月日
      2015-12-01
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] 部分的機能欠損Xistアレルからの発現様式の組織差2015

    • 著者名/発表者名
      中島達郎,保木裕子,佐々木裕之,佐渡 敬
    • 学会等名
      第38回日本分子生物学会年会 第88回日本生化学大会 合同年会
    • 発表場所
      兵庫県神戸市(神戸ポートアイランド)
    • 年月日
      2015-12-01
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] 機能欠損型Xist RNAによって構築される偽ヘテロクロマチン2015

    • 著者名/発表者名
      佐渡 敬
    • 学会等名
      第38回日本分子生物学会年会 第88回日本生化学大会 合同年会
    • 発表場所
      兵庫県神戸市(神戸ポートアイランド)
    • 年月日
      2015-12-01
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] アレル特異的ChIP-seqによるマウス不活性X染色体のクロマチン動態の解析2015

    • 著者名/発表者名
      長尾恒治,榊原祐樹,柴田幸子,野澤竜介,坂口武久,木村宏,佐渡敬,小布施力史
    • 学会等名
      第38回日本分子生物学会年会 第88回日本生化学大会 合同年会
    • 発表場所
      兵庫県神戸市(神戸ポートアイランド)
    • 年月日
      2015-12-01
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 胚性幹細胞における単アレル性発現遺伝子の由来とその転写制御2015

    • 著者名/発表者名
      大石裕晃,鵜木元香,福田渓,堀恭平,前之原章司,千葉初音,佐渡敬,佐々木裕之
    • 学会等名
      第38回日本分子生物学会年会 第88回日本生化学大会 合同年会
    • 発表場所
      兵庫県神戸市(神戸ポートアイランド)
    • 年月日
      2015-12-01
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] 部分的機能欠損Xist アレルによるX染 色体不活性化の異常2015

    • 著者名/発表者名
      中島達郎,保木裕子,佐々木裕之,佐渡 敬
    • 学会等名
      日本遺伝学会第87回大会
    • 発表場所
      宮城県仙台市(東北大学)
    • 年月日
      2015-09-24
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] マウス着床前胚におけるXist の差次的発現2015

    • 著者名/発表者名
      佐渡 敬,酒田祐佳,尼川裕 子,保木裕子,深川竜郎,佐々 木裕之
    • 学会等名
      日本遺伝学会第87回大会
    • 発表場所
      宮城県仙台市(東北大学)
    • 年月日
      2015-09-24
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] 部分的機能欠損Xistアレルからの発現様式の組織差2015

    • 著者名/発表者名
      中島達郎,保木裕子,佐々木裕之,佐渡 敬
    • 学会等名
      第9回日本エピジェネティクス研究会
    • 発表場所
      東京都千代田区(学術総合センター)
    • 年月日
      2015-05-25
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] SmcHD1機能欠損マウス胚における X染色体不活性化2015

    • 著者名/発表者名
      榊原祐樹,Blewitt Marnie,佐々 木裕之,佐渡 敬
    • 学会等名
      第9回日本エピジェネティクス研究会
    • 発表場所
      東京都千代田区(学術総合センター)
    • 年月日
      2015-05-25
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] アリル特異的ChIP-seq法によるマウス不活性X染色体のクロマチン動態の解明2014

    • 著者名/発表者名
      長尾恒治,柴田幸子,野澤竜介,木村 宏,佐渡 敬,小布施力史
    • 学会等名
      第37回日本分子生物学会年会
    • 発表場所
      神奈川(パシフィコ横浜)
    • 年月日
      2014-11-25 – 2014-11-27
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] ZFP57による単アレル性遺伝子発現の制御機構2014

    • 著者名/発表者名
      大石裕晃,鵜木元香,福田 渓,佐渡 敬,佐々木裕之
    • 学会等名
      第37回日本分子生物学会年会
    • 発表場所
      神奈川(パシフィコ横浜)
    • 年月日
      2014-11-25 – 2014-11-27
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] ほ乳類X染色体のヘテロクロマチン化機構の理解へ向けて2014

    • 著者名/発表者名
      佐渡 敬
    • 学会等名
      第1回北陸エピジェネティクス研究会
    • 発表場所
      石川(金沢大学)
    • 年月日
      2014-11-18
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 変異Xist RNAがつくるヘテロクロマチン様構造の詳細2014

    • 著者名/発表者名
      酒田祐佳,保木裕子,佐々木裕之,佐渡 敬
    • 学会等名
      ワークショップ「マウス遺伝学が牽引する最先端生命科学」,日本遺伝学会第85回大会
    • 発表場所
      滋賀(長浜バイオ大学)
    • 年月日
      2014-09-19
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Xist RNAの核内係留に寄与する領域の探索2014

    • 著者名/発表者名
      千木雄太,佐々木裕之,佐渡 敬
    • 学会等名
      日本遺伝学会第86回大会
    • 発表場所
      滋賀(長浜バイオ大学)
    • 年月日
      2014-09-17 – 2014-09-19
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] 部分的機能欠損XistアレルによるX染色体不活性化の異常2014

    • 著者名/発表者名
      中島達郎,保木裕子,佐々木裕之,佐渡 敬
    • 学会等名
      日本遺伝学会第86回大会
    • 発表場所
      滋賀(長浜バイオ大学)
    • 年月日
      2014-09-17 – 2014-09-19
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] SmcHD1機能欠損マウス胚におけるX染色体不活性化2014

    • 著者名/発表者名
      榊原祐樹,佐々木裕之,Marnie Blewitt,佐渡 敬
    • 学会等名
      日本遺伝学会第86回大会
    • 発表場所
      滋賀(長浜バイオ大学)
    • 年月日
      2014-09-17 – 2014-09-19
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] ZFP57による単アレル性遺伝子発現の制御機構2014

    • 著者名/発表者名
      大石裕晃,鵜木元香,福田 渓,佐渡 敬,佐々木裕之
    • 学会等名
      日本遺伝学会第85回大会
    • 発表場所
      滋賀(長浜バイオ大学)
    • 年月日
      2014-09-17 – 2014-09-19
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] 部分的機能欠損XistアレルによるX染色体不活性化の異常2014

    • 著者名/発表者名
      中島達郎,保木裕子,佐々木裕之,佐渡 敬
    • 学会等名
      第8回日本エピジェネティクス研究会年会
    • 発表場所
      東京(東京大学)
    • 年月日
      2014-05-25 – 2014-05-27
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] 変異Xist RNAがもたらすX染色体クロマチンドメインの変化2014

    • 著者名/発表者名
      酒田祐佳,保木裕子,佐々木裕之,佐渡 敬
    • 学会等名
      第8回日本エピジェネティクス研究会年会
    • 発表場所
      東京(東京大学)
    • 年月日
      2014-05-25 – 2014-05-27
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] Xist RNAの輸送制御機構解明へ向けた系の確立2014

    • 著者名/発表者名
      千木雄太,佐々木裕之,佐渡 敬
    • 学会等名
      第8回日本エピジェネティクス研究会年会
    • 発表場所
      東京(東京大学)
    • 年月日
      2014-05-25 – 2014-05-27
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] ヒトおよびマウスにおける不活性X染色体凝縮機構2014

    • 著者名/発表者名
      小布施力史,長尾恒治,野澤竜介,磯部真也,佐渡 敬,木村 宏
    • 学会等名
      第8回日本エピジェネティクス研究会年会
    • 発表場所
      東京(東京大学)
    • 年月日
      2014-05-25 – 2014-05-27
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] マウスES細胞においてZfp57が単アレル性遺伝子発現制御に果たす役割の解析2014

    • 著者名/発表者名
      大石裕晃,鵜木元香,福田 渓,前之原章司,伊川正人,佐渡 敬,佐々木裕之
    • 学会等名
      第8回日本エピジェネティクス研究会年会
    • 発表場所
      東京(東京大学)
    • 年月日
      2014-05-25 – 2014-05-27
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] SmcHD1機能欠損マウス胚におけるX染色体不活性化2014

    • 著者名/発表者名
      榊原祐樹,佐々木裕之,Marnie Blewitt,佐渡 敬
    • 学会等名
      第8回日本エピジェネティクス研究会年会
    • 発表場所
      東京(東京大学)
    • 年月日
      2014-05-25 – 2014-05-27
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書

URL: 

公開日: 2014-04-04   更新日: 2018-03-28  

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