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ヒトゲノムにおけるAlu配列の遺伝性疾患,遺伝的多様性に与える影響に関する研究

公募研究

研究領域ゲノムを支える非コードDNA領域の機能
研究課題/領域番号 26114708
研究種目

新学術領域研究(研究領域提案型)

配分区分補助金
審査区分 生物系
研究機関岐阜大学

研究代表者

深尾 敏幸  岐阜大学, 医学(系)研究科(研究院), 教授 (70260578)

研究期間 (年度) 2014-04-01 – 2016-03-31
研究課題ステータス 完了 (2015年度)
配分額 *注記
11,050千円 (直接経費: 8,500千円、間接経費: 2,550千円)
2015年度: 5,590千円 (直接経費: 4,300千円、間接経費: 1,290千円)
2014年度: 5,460千円 (直接経費: 4,200千円、間接経費: 1,260千円)
キーワードAlu配列 / 非コードDNA / スプライシング / エクソン認識 / 遺伝子再構成 / 遺伝子内欠失 / Alu element
研究実績の概要

Alu配列はヒトゲノム中の100万コピー以上もあるとされ、全ゲノムの約10%を占める。Alu 配列は霊長類の進化とともに出現した。Alu配列はこれまで意味のない配列と考えられてきたが、最近その機能についての知見がすこしづつ報告されてきている。イントロン内のAlu配列が近傍エクソンのスプライシングに与える影響について解析した。
ACAT1遺伝子イントロン9へ、元々イントロン6に存在したAlu配列のタンデムに並んだ配列を逆方向(AluYc―AluSz-AluSxの順)で挿入した場合、mini―gene splicing実験でエクソン10をスキップさせることを見いだしていた。このAluYc―AluSz-AluSxを1つのAluSxのみとしてもエクソン10スキップが生じた。一方同じイントロン10の上流に存在した正方向のAluJoを取り除くと、エクソン10をスキップする効率は低下した。続いてAluSxの位置をエクソン10に近づけるとスキップする効果が強くなった。このようにイントロン上の逆方向に挿入されたAlu配列はその位置、周りのAluの存在に影響されつつエクソン10スキップを来すことが明らかになった。
HMG-CoA lyase欠損症について、MLPA法を確立し、通常の遺伝子解析で一方の変異を同定出来なかった2例についてMLPA法で解析し、1例ではヘテロ接合でのエクソン2-4の欠失を証明し、その切断点のイントロン1側がAlu配列内であることを明らかにした。またもう1例ではMLPA法の結果から、Alu配列の関与する遺伝子再構成ではなく、Uniparental disomyが病因であることが示唆され、マイクロアレイ解析にて証明することが出来き,平成27年度に論文化できた。

現在までの達成度 (段落)

27年度が最終年度であるため、記入しない。

今後の研究の推進方策

27年度が最終年度であるため、記入しない。

報告書

(2件)
  • 2015 実績報告書
  • 2014 実績報告書
  • 研究成果

    (14件)

すべて 2015 2014

すべて 雑誌論文 (4件) (うち国際共著 1件、 査読あり 4件、 オープンアクセス 2件、 謝辞記載あり 1件) 学会発表 (9件) (うち国際学会 4件、 招待講演 4件) 図書 (1件)

  • [雑誌論文] Inborn errors of ketone body utilization2015

    • 著者名/発表者名
      Hori T, Yamaguchi S, Shintaku H, Horikawa R, Shigematsu Y, Hakayanagi M, Fukao T
    • 雑誌名

      Pediatr Int

      巻: 57 号: 1 ページ: 51-48

    • DOI

      10.1111/ped.12585

    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Application of multiplex ligation-dependent probe amplification, and identification of a heterozygous Alu-associated deletion and a uniparental disomy of chromosome 1 in two patients with 3-hydroxy-3-methylglutaryl-CoA lyase deficiency2015

    • 著者名/発表者名
      Aoyama Y, Yamamoto T, Sakaguchi N, Ishige M, Tanaka T, Ichihara T, Ohara K, Kouzan H, Kinosada Y, Fukao T.
    • 雑誌名

      International Journal of Molecular Medicine

      巻: 35 号: 6 ページ: 1554-1560

    • DOI

      10.3892/ijmm.2015.2184

    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Application of Multiplex ligation-dependent probe amplification and identification of a heterozygous Alu-associated deletion and a uniparental disomy of chromosome 1 in two Japanese patients with 3-hydroxy-3-methylglutaryl-CoA lyase deficiency.2015

    • 著者名/発表者名
      6. Aoyama Y, Yamamoto T, Sakaguchi N, Ishige M, Tanaka T, Ichihara T, Ohara K, Kouzan H, Kinosada Y, Fukao T
    • 雑誌名

      Int J Mol Med

      巻: 未定

    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
    • 査読あり / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Ketone body metabolism and its defects.2014

    • 著者名/発表者名
      Fukao T, Mitchell G, Saas JO, Hori T, Orii K, Aoyama Y
    • 雑誌名

      J Inherited Metab Dis

      巻: 37 号: 4 ページ: 541-551

    • DOI

      10.1007/s10545-014-9704-9

    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [学会発表] Metabolism of ketone bodies and its defects2015

    • 著者名/発表者名
      Fukao T
    • 学会等名
      X Congreso Latinamericano De Errores Innatos Del Metabolisomo Y Pesquisa Neonatal
    • 発表場所
      Santiago (Chile)
    • 年月日
      2015-11-17
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Organic academia and beta-oxidation defects: expanded neonatal screening in Japan2015

    • 著者名/発表者名
      Fukao T
    • 学会等名
      X Congreso Latinamericano De Errores Innatos Del Metabolisomo Y Pesquisa Neonatal
    • 発表場所
      Santiago (Chile)
    • 年月日
      2015-11-17
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Two patients with atypical form and one with infantile form of HSD10 disease were identified in Japan2015

    • 著者名/発表者名
      Fukao T, Sasai H, Aoyama Y, Akiba K, Goto M, Hasegawa Y, Kobayashi M, Ida H, Akagawa S, Hasegawa Y, Yamaguchi S, Shigematsu Y
    • 学会等名
      Annual symposium of the society for the study of inborn erroros of metabolism
    • 発表場所
      Lyon (France)
    • 年月日
      2015-09-01
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Ketolysis and Ketogenesis Defects2015

    • 著者名/発表者名
      Fukao T
    • 学会等名
      XIII Metabolic Diseases and Nutrition Congress
    • 発表場所
      Adana (Turkey)
    • 年月日
      2015-04-14
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] HMG-CoAリアーゼ(HMGCL)遺伝子のMLPA法確立とHMGCL欠損症1症例における Uniparental disomyの同定2014

    • 著者名/発表者名
      青山友佳,山本俊至,坂口直美,石毛美夏,田中藤樹,市原朋子,大原克明,深尾敏幸
    • 学会等名
      第56回日本先天代謝異常学会
    • 発表場所
      仙台
    • 年月日
      2014-11-12 – 2014-11-15
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] ACAT1遺伝子のイントロン9へのAlu挿入はエクソン10の認識に影響を与える2014

    • 著者名/発表者名
      深尾敏幸、堀友博、笹井英雄、大塚博樹、青山友佳
    • 学会等名
      第56回日本先天代謝異常学会
    • 発表場所
      仙台
    • 年月日
      2014-11-12 – 2014-11-15
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] Clinical Importance of ketone body metabolism and its defects.2014

    • 著者名/発表者名
      Fukao T
    • 学会等名
      International Conference on Inborn Errors of Metabolism and 3rd National Conference of ISIEM
    • 発表場所
      Hyderabad (India)
    • 年月日
      2014-09-19 – 2014-09-21
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Alu elements insertions into intron 9 affect exon 10 recognition with a suboptimal splice acceptor site in human ACAT1 gene.2014

    • 著者名/発表者名
      Fukao T, Hori T, Sasai H, Ohtsuka H, Kimura T, Aoyama Y
    • 学会等名
      Annual symposium of the society for the study of inborn errors of metabolism
    • 発表場所
      Innsbruck (Austria)
    • 年月日
      2014-09-02 – 2014-09-05
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] HMG-CoAリアーゼ欠損症においてMLPA法を用いた1症例におけるUniparental disomyの同定2014

    • 著者名/発表者名
      青山友佳、市原朋子、山本俊至,大原克明,深尾敏幸
    • 学会等名
      日本マススクリーニング学会
    • 発表場所
      広島
    • 年月日
      2014-08-22 – 2014-08-23
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [図書] 16章 インターメアと疾患―機能性をもつAlu配列.全体のタイトル:ゲノムを司るインターメア 非コードDNAの新たな展開2015

    • 著者名/発表者名
      深尾敏幸
    • 総ページ数
      14
    • 出版者
      化学同人
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書

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公開日: 2014-04-04   更新日: 2018-03-28  

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