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非コードDNAの相同染色体の認識と対合における役割

公募研究

研究領域ゲノムを支える非コードDNA領域の機能
研究課題/領域番号 26114725
研究種目

新学術領域研究(研究領域提案型)

配分区分補助金
審査区分 生物系
研究機関国立研究開発法人情報通信研究機構

研究代表者

丁 大橋  国立研究開発法人情報通信研究機構, 未来ICT研究所バイオICT研究室, 主任研究員 (50359080)

研究期間 (年度) 2014-04-01 – 2016-03-31
研究課題ステータス 完了 (2015年度)
配分額 *注記
11,050千円 (直接経費: 8,500千円、間接経費: 2,550千円)
2015年度: 5,590千円 (直接経費: 4,300千円、間接経費: 1,290千円)
2014年度: 5,460千円 (直接経費: 4,200千円、間接経費: 1,260千円)
キーワード染色体 / 減数分裂 / 対合 / 分裂酵母 / 非コードDNA
研究実績の概要

減数分裂期前期の相同染色体の相互認識・対合は相同組換えの前提条件で、しかし、相同染色体同士がどのようにお互いに見つけて対合する分子メカニズムはほとんど不明である。申請者が分裂酵母において、減数分裂期に転写され、転写されるsme2遺伝子ローカスに集積する非コードRNA、meiRNAが相同染色体を積極的に繋ぎとめる役割をしていることを発見した。本申請研究では、染色体相互認識における染色体集積RNAの作用機構ならびに分子メカニズムの解明を目的としている。昨年までの研究で、sme2ローカスにドット状集積するSmpタンパク質(sme2 localised proteins)を10個(smp1~10)同定し、そのうち5個がsme2ローカスのロバストな対合に必要であることを明らかにした。このsmpタンパクの特徴はsme2ローカス以外にも染色体上に2~4個ドットを作ることで、それらのドットのローカスがsme2対合サイトと同様に相同染色体の相互認識に寄与する期待が高まる。今年度において、ゲノムワイドlacO/lacI-GFP株ライブラリを用いて候補タンパク質のmCherry標識タンパク質の2重染色株を作り、生細胞蛍光顕微鏡観察により共局在ローカスを二つ同定した。その結果、いずれのローカスもsmpタンパクの結合の高いゲノムローカスで、染色体1と3にそれぞれ一つ存在する。smpタンパク質の破壊株では、これらのローカスの対合が下がったので、smpに依存した対合サイトであることを示唆した。今後、これらのローカスでRNAの転写産物の滞留があるかどうか、さらに対合にどのように貢献するのかを詳しく解析していきたい。

現在までの達成度 (段落)

27年度が最終年度であるため、記入しない。

今後の研究の推進方策

27年度が最終年度であるため、記入しない。

報告書

(2件)
  • 2015 実績報告書
  • 2014 実績報告書
  • 研究成果

    (12件)

すべて 2016 2015 2014 その他

すべて 雑誌論文 (3件) (うち査読あり 3件、 オープンアクセス 2件、 謝辞記載あり 1件) 学会発表 (7件) (うち国際学会 2件) 備考 (2件)

  • [雑誌論文] A cohesion-based platform for homologous chromosome pairing in meiosis2016

    • 著者名/発表者名
      Da-Qiao Ding, Tokuko Haraguchi, Yasushi Hiraoka
    • 雑誌名

      Current Genetics

      巻: 印刷中 号: 3 ページ: 499-502

    • DOI

      10.1007/s00294-016-0570-x

    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Meiotic cohesion-based chromosome structure is essential for homologous chromosome pairing in Schizosaccharomyces pombe2015

    • 著者名/発表者名
      Ding DQ, Matsuda A, Okamasa K, Nagahama Y, Haraguchi T, Hiraoka Y
    • 雑誌名

      Chromosoma

      巻: special issue 号: 2 ページ: 1-10

    • DOI

      10.1007/s00412-015-0551-8

    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Highly condensed chromatins are formed adjacent to subtelomeric and decondensed silent chromatin in fission yeast.2015

    • 著者名/発表者名
      Matsuda A, Chikashige Y, Ding DQ, Ohtsuki C, Mori C, Asakawa H, Kimura H, Haraguchi T, Hiraoka Y.
    • 雑誌名

      Nature Communication

      巻: 6 号: 1 ページ: 1-12

    • DOI

      10.1038/ncomms8753

    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
  • [学会発表] 3D-SIM Analysis of Meiotic Chromosome Structure in Live Cells of S. pombe EMBO Conference on Meiosis2015

    • 著者名/発表者名
      丁大橋
    • 学会等名
      EMBO Conference on Meiosis
    • 発表場所
      オックスフォード大学、イギリス
    • 年月日
      2015-09-01
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] 相同染色体認識における 非コードDNAの役割2015

    • 著者名/発表者名
      丁大橋
    • 学会等名
      第9回非コードDNA班会議
    • 発表場所
      兵庫県淡路島夢舞台
    • 年月日
      2015-08-05
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] 3D-SIM Analysis of Meiotic Chromosome Structure in Live Cells of S.pombe2015

    • 著者名/発表者名
      丁大橋
    • 学会等名
      Pombe 2015 8TH INTERNATIONAL FISSION YEAST MEETING
    • 発表場所
      兵庫県神戸市生田神社会館
    • 年月日
      2015-06-22
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] A role for chromosomal RNA bodies in fission yeast meiosis2014

    • 著者名/発表者名
      平岡 泰
    • 学会等名
      第37回日本分子生物学会年会
    • 発表場所
      神奈川県横浜市みなとみらい
    • 年月日
      2014-11-27
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] 分裂酵母減数分裂期前期染色体構造の解析2014

    • 著者名/発表者名
      丁 大橋
    • 学会等名
      第37回日本分子生物学会年会
    • 発表場所
      神奈川県横浜市みなとみらい
    • 年月日
      2014-11-26
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] 相同染色体対合における非コードDNAの役割2014

    • 著者名/発表者名
      丁 大橋
    • 学会等名
      新学術領域研究 「ゲノムを支える非コードDNA領域の機能」 2014年第7回領域会議
    • 発表場所
      神奈川県湯河原温泉ホテルあかね
    • 年月日
      2014-07-14
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] Fine structures of meiosis-specific chromosome and homologous chromosome pairing in S. pombe2014

    • 著者名/発表者名
      丁 大橋
    • 学会等名
      Gordon Research Conferences Meiosis
    • 発表場所
      Colby-Saweyer College, New London, NH, USA
    • 年月日
      2014-06-02
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [備考] Cell Magic

    • URL

      http://www2.nict.go.jp/advanced_ict/bio/w131103/CellMagic/index.html

    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [備考] CellMagic

    • URL

      http://www2.nict.go.jp/advanced_ict/bio/w131103/CellMagic/

    • 関連する報告書
      2014 実績報告書

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公開日: 2014-04-04   更新日: 2018-03-28  

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