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長鎖ノンコーディングRNAのクロマチンターゲティング

公募研究

研究領域動的クロマチン構造と機能
研究課題/領域番号 26116515
研究種目

新学術領域研究(研究領域提案型)

配分区分補助金
審査区分 生物系
研究機関近畿大学

研究代表者

佐渡 敬  近畿大学, 農学部, 教授 (70321601)

研究期間 (年度) 2014-04-01 – 2016-03-31
研究課題ステータス 完了 (2015年度)
配分額 *注記
10,400千円 (直接経費: 8,000千円、間接経費: 2,400千円)
2015年度: 5,200千円 (直接経費: 4,000千円、間接経費: 1,200千円)
2014年度: 5,200千円 (直接経費: 4,000千円、間接経費: 1,200千円)
キーワードクロマチン / ノンコーディングRNA
研究実績の概要

当該研究ではクロマチンのエピジェネティック制御に重要な役割を果たすと考えられるlncRNAがどのように標的クロマチン領域をターゲティングし,その効果を発揮するのかを理解することを目的とした.具体的には,哺乳類のメスの細胞でX染色体を覆い,そのヘテロクロマチン化を引き起こすXist RNAとその局在制御に関与することが示されたhnRNP Uに着目して解析を行ってきた.hnRNP Uの完全機能欠損マウスは報告されていなかったので,条件的ノックアウトマウスを作製した.完全機能欠損アレルへ変換後,ヘテロ接合体同士を交配し,ホモ接合体の表現型を解析した.その結果,ホモ接合体は着床前後の時期に致死となることがわかった.また,分離比からヘテロ接合体のうち離乳に達するものは期待される頻度の20%程度であることが示唆された.
胚発生に重篤な影響をもたらす単純な機能阻害では解析が困難と思われたので,タモキシフェン投与により条件的にhnRNP Uの機能を阻害できるコンディショナルアレルを持つメスの胚線維芽細胞(MEF)あるいはメスのES細胞を胚盤胞から樹立し,胚に代わる解析系を確立することを試みた.その結果得られたこれらの細胞で, hnRNP Uの機能を条件的に阻害してみると,いずれの場合も雌雄の別なく細胞は数日で死ぬことから,hnRNP Uは細胞の生存に不可欠であることがわかった.メスの細胞でhnRNP Uを阻害した後,細胞が死ぬまでの間に免疫RNA-FISHを行うと,不活性X染色体に局在するXist RNAは失われ,H3K27me3の集積も観察されなくなったことから,hnRNP UがXist RNAのクロマチンターゲティングに不可欠であることが確認された.hnRNP Uが他のlncRNAのクロマチンターゲティングにも関与するかについては,解析中のため現時点では不明である

現在までの達成度 (段落)

27年度が最終年度であるため、記入しない。

今後の研究の推進方策

27年度が最終年度であるため、記入しない。

報告書

(2件)
  • 2015 実績報告書
  • 2014 実績報告書
  • 研究成果

    (29件)

すべて 2015 2014

すべて 雑誌論文 (4件) (うち国際共著 1件、 査読あり 4件、 オープンアクセス 4件、 謝辞記載あり 2件) 学会発表 (25件) (うち招待講演 5件)

  • [雑誌論文] A new Xist allele driven by a constitutively active promoter is dominated by Xist locus environment and exhibits the parent-of-origin effects.2015

    • 著者名/発表者名
      Amakawa Y, Sakata Y, Hoki Y, Arata S, Shioda S, Fukagawa T, Sasaki H, Sado T.
    • 雑誌名

      Development.

      巻: 142 ページ: 4299-4308

    • DOI

      10.1242/dev.128819

    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] An Xist Activating Antisense RNA Required for X-chromosome Inactivation.2015

    • 著者名/発表者名
      Sarkar, M., Gayen, S., Kumar, S., Maclary, E., Buttigieg, E., Hinten, M., Kumari, A., Harris, C., Sado, T., and *Kalantry, S.
    • 雑誌名

      Nature comm.

      巻: 6 号: 1 ページ: 8564-8564

    • DOI

      10.1038/ncomms9564

    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著 / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Current view of the potential roles of proteins enriched on the inactive X chromosome2014

    • 著者名/発表者名
      Nakajima, T., Sado, T.
    • 雑誌名

      Genes & Genetic Systems

      巻: 89 号: 4 ページ: 151-157

    • DOI

      10.1266/ggs.89.151

    • NAID

      130004750052

    • ISSN
      1341-7568, 1880-5779
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] X Chromosome Reactivation Dynamics Reveal Stages of Reprogramming to Pluripotency2014

    • 著者名/発表者名
      Pasque, V., Tchieu, J., Karnik, R., Uyeda, M., Dimashkie, M.S., Case, D., Papp, B., Bonora, G., Patel, S., Ho, R., Schmidt, R., McKee, R., Sado, T., Tada, T., Meissner, A. and Plath, K.
    • 雑誌名

      Cell

      巻: 159 号: 7 ページ: 1681-1697

    • DOI

      10.1016/j.cell.2014.11.040

    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
  • [学会発表] 哺乳類X染色体のエピジェネティクス2015

    • 著者名/発表者名
      佐渡 敬
    • 学会等名
      第38回日本分子生物学会年会 第88回日本生化学大会 合同年会
    • 発表場所
      兵庫県神戸市(神戸ポートアイランド)
    • 年月日
      2015-12-01
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] SmcHD1機能欠損マウス胚におけるX染色体不活性化2015

    • 著者名/発表者名
      榊原 祐樹,佐々木 裕之,Blewitt Marnie,佐渡 敬
    • 学会等名
      第38回日本分子生物学会年会 第88回日本生化学大会 合同年会
    • 発表場所
      兵庫県神戸市(神戸ポートアイランド)
    • 年月日
      2015-12-01
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] Xist RNAの核内係留因子を探索する系の確立2015

    • 著者名/発表者名
      千木 雄太,佐々木 裕之,佐渡 敬
    • 学会等名
      第38回日本分子生物学会年会 第88回日本生化学大会 合同年会
    • 発表場所
      兵庫県神戸市(神戸ポートアイランド)
    • 年月日
      2015-12-01
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] 部分的機能欠損Xistアレルからの発現様式の組織差2015

    • 著者名/発表者名
      中島達郎,保木裕子,佐々木裕之,佐渡 敬
    • 学会等名
      第38回日本分子生物学会年会 第88回日本生化学大会 合同年会
    • 発表場所
      兵庫県神戸市(神戸ポートアイランド)
    • 年月日
      2015-12-01
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] 機能欠損型Xist RNAによって構築される偽ヘテロクロマチン2015

    • 著者名/発表者名
      佐渡 敬
    • 学会等名
      第38回日本分子生物学会年会 第88回日本生化学大会 合同年会
    • 発表場所
      兵庫県神戸市(神戸ポートアイランド)
    • 年月日
      2015-12-01
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] アレル特異的chIP-seqによるマウス不活性X染色体のクロマチン動態の解析2015

    • 著者名/発表者名
      長尾恒治,榊原祐樹,柴田幸子,野澤竜介,坂口武久,木村宏,佐渡敬,小布施力史
    • 学会等名
      第38回日本分子生物学会年会 第88回日本生化学大会 合同年会
    • 発表場所
      兵庫県神戸市(神戸ポートアイランド)
    • 年月日
      2015-12-01
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 胚性幹細胞における単アレル性発現遺伝子の由来とその転写制御2015

    • 著者名/発表者名
      大石裕晃,鵜木元香,福田渓,堀恭平,前之原章司,千葉初音,佐渡敬,佐々木裕之
    • 学会等名
      第38回日本分子生物学会年会 第88回日本生化学大会 合同年会
    • 発表場所
      兵庫県神戸市(神戸ポートアイランド)
    • 年月日
      2015-12-01
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] 部分的機能欠損Xist アレルによるX染 色体不活性化の異常2015

    • 著者名/発表者名
      中島達郎,保木裕子,佐々木裕之,佐渡 敬
    • 学会等名
      日本遺伝学会第87回大会
    • 発表場所
      宮城県仙台市(東北大学)
    • 年月日
      2015-09-24
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] マウス着床前胚におけるXist の差次的発現2015

    • 著者名/発表者名
      佐渡 敬,酒田祐佳,尼川裕 子,保木裕子,深川竜郎,佐々 木裕之
    • 学会等名
      日本遺伝学会第87回大会
    • 発表場所
      宮城県仙台市(東北大学)
    • 年月日
      2015-09-24
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] 部分的機能欠損Xistアレルからの発現様式の組織差2015

    • 著者名/発表者名
      中島達郎,保木裕子,佐々木裕之,佐渡 敬
    • 学会等名
      第9回日本エピジェネティクス研究会
    • 発表場所
      東京都千代田区(学術総合センター)
    • 年月日
      2015-05-25
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] SmcHD1機能欠損マウス胚における X染色体不活性化2015

    • 著者名/発表者名
      榊原祐樹,Blewitt Marnie,佐々 木裕之,佐渡 敬
    • 学会等名
      第9回日本エピジェネティクス研究会
    • 発表場所
      東京都千代田区(学術総合センター)
    • 年月日
      2015-05-25
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] アリル特異的ChIP-seq法によるマウス不活性X染色体のクロマチン動態の解明2014

    • 著者名/発表者名
      長尾恒治,柴田幸子,野澤竜介,木村 宏,佐渡 敬,小布施力史
    • 学会等名
      第37回日本分子生物学会年会
    • 発表場所
      神奈川(パシフィコ横浜)
    • 年月日
      2014-11-25 – 2014-11-27
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] ZFP57による単アレル性遺伝子発現の制御機構2014

    • 著者名/発表者名
      大石裕晃,鵜木元香,福田 渓,佐渡 敬,佐々木裕之
    • 学会等名
      第37回日本分子生物学会年会
    • 発表場所
      神奈川(パシフィコ横浜)
    • 年月日
      2014-11-25 – 2014-11-27
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] ほ乳類X染色体のヘテロクロマチン化機構の理解へ向けて2014

    • 著者名/発表者名
      佐渡 敬
    • 学会等名
      第1回北陸エピジェネティクス研究会
    • 発表場所
      石川(金沢大学)
    • 年月日
      2014-11-18
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 変異Xist RNAがつくるヘテロクロマチン様構造の詳細2014

    • 著者名/発表者名
      酒田祐佳,保木裕子,佐々木裕之,佐渡 敬
    • 学会等名
      ワークショップ「マウス遺伝学が牽引する最先端生命科学」,日本遺伝学会第85回大会
    • 発表場所
      滋賀(長浜バイオ大学)
    • 年月日
      2014-09-19
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Xist RNAの核内係留に寄与する領域の探索2014

    • 著者名/発表者名
      千木雄太,佐々木裕之,佐渡 敬
    • 学会等名
      日本遺伝学会第86回大会
    • 発表場所
      滋賀(長浜バイオ大学)
    • 年月日
      2014-09-17 – 2014-09-19
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] 部分的機能欠損XistアレルによるX染色体不活性化の異常2014

    • 著者名/発表者名
      中島達郎,保木裕子,佐々木裕之,佐渡 敬
    • 学会等名
      日本遺伝学会第86回大会
    • 発表場所
      滋賀(長浜バイオ大学)
    • 年月日
      2014-09-17 – 2014-09-19
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] SmcHD1機能欠損マウス胚におけるX染色体不活性化2014

    • 著者名/発表者名
      榊原祐樹,佐々木裕之,Marnie Blewitt,佐渡 敬
    • 学会等名
      日本遺伝学会第86回大会
    • 発表場所
      滋賀(長浜バイオ大学)
    • 年月日
      2014-09-17 – 2014-09-19
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] ZFP57による単アレル性遺伝子発現の制御機構2014

    • 著者名/発表者名
      大石裕晃,鵜木元香,福田 渓,佐渡 敬,佐々木裕之
    • 学会等名
      日本遺伝学会第86回大会
    • 発表場所
      滋賀(長浜バイオ大学)
    • 年月日
      2014-09-17 – 2014-09-19
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] 部分的機能欠損XistアレルによるX染色体不活性化の異常2014

    • 著者名/発表者名
      中島達郎,保木裕子,佐々木裕之,佐渡 敬
    • 学会等名
      第8回日本エピジェネティクス研究会年会
    • 発表場所
      東京(東京大学)
    • 年月日
      2014-05-25 – 2014-05-27
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] 変異Xist RNAがもたらすX染色体クロマチンドメインの変化2014

    • 著者名/発表者名
      酒田祐佳,保木裕子,佐々木裕之,佐渡 敬
    • 学会等名
      第8回日本エピジェネティクス研究会年会
    • 発表場所
      東京(東京大学)
    • 年月日
      2014-05-25 – 2014-05-27
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] Xist RNAの輸送制御機構解明へ向けた系の確立2014

    • 著者名/発表者名
      千木雄太,佐々木裕之,佐渡 敬
    • 学会等名
      第8回日本エピジェネティクス研究会年会
    • 発表場所
      東京(東京大学)
    • 年月日
      2014-05-25 – 2014-05-27
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] ヒトおよびマウスにおける不活性X染色体凝縮機構2014

    • 著者名/発表者名
      小布施力史,長尾恒治,野澤竜介,磯部真也,佐渡 敬,木村 宏
    • 学会等名
      第8回日本エピジェネティクス研究会年会
    • 発表場所
      東京(東京大学)
    • 年月日
      2014-05-25 – 2014-05-27
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] マウスES細胞においてZfp57が単アレル性遺伝子発現制御に果たす役割の解析2014

    • 著者名/発表者名
      大石裕晃,鵜木元香,福田 渓,前之原章司,伊川正人,佐渡 敬,佐々木裕之
    • 学会等名
      第8回日本エピジェネティクス研究会年会
    • 発表場所
      東京(東京大学)
    • 年月日
      2014-05-25 – 2014-05-27
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] SmcHD1機能欠損マウス胚におけるX染色体不活性化2014

    • 著者名/発表者名
      榊原祐樹,佐々木裕之,Marnie Blewitt,佐渡 敬
    • 学会等名
      第8回日本エピジェネティクス研究会年会
    • 発表場所
      東京(東京大学)
    • 年月日
      2014-05-25 – 2014-05-27
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書

URL: 

公開日: 2014-04-04   更新日: 2018-03-28  

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