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生命分子システムにおける動的秩序形成と高次機能発現の研究に関する総括

成果取りまとめ

研究領域生命分子システムにおける動的秩序形成と高次機能発現
研究課題/領域番号 18H05203
研究種目

新学術領域研究(研究領域提案型)

配分区分補助金
研究機関大学共同利用機関法人自然科学研究機構(新分野創成センター、アストロバイオロジーセンター、生命創成探究

研究代表者

加藤 晃一  大学共同利用機関法人自然科学研究機構(新分野創成センター、アストロバイオロジーセンター、生命創成探究, 生命創成探究センター, 教授 (20211849)

研究分担者 佐藤 啓文  京都大学, 工学研究科, 教授 (70290905)
研究期間 (年度) 2018-04-01 – 2019-03-31
研究課題ステータス 完了 (2018年度)
配分額 *注記
3,900千円 (直接経費: 3,000千円、間接経費: 900千円)
2018年度: 3,900千円 (直接経費: 3,000千円、間接経費: 900千円)
キーワード動的秩序 / 生命分子 / 超分子 / 高次機能 / 集合離散
研究実績の概要

本申請課題は、本領域研究の成果を公開し広く発信するとともに、本領域研究で培ってきた異分野連携・融合を基軸とした学術の推進および学理の啓発を目的とした。本領域の研究成果に関して、領域ホームページやニュースレターでの発信、アウトリーチ活動、マスメディアへの掲載等を通じて社会に広く公開するとともに、主に以下の活動を通じて、異分野融合の推進と本領域研究の啓発に努めた。
1.国際シンポジウムの開催: Frontier Bioorganization Forum 2018を主催し、本領域の研究成果に基づく学理の啓発を行うとともに、日本・韓国・台湾の先端的研究者との交流を通じて、近年その重要性が謳われている国際共同研究の実施に対してインセンティブを与えた。本領域を基軸とした異分野間の有機的な研究ネットワークを構築し、更なる国際共同研究の発展に努めた。
2.出版物の刊行: 本領域の研究成果の集大成として総説を刊行し、国内外の研究者・研究領域に対して成果を発信した。昨年度までに、本領域研究を通じて進展した計測手法に関してはBiochimica et Biophysica Acta の特集号として既に刊行してきた。したがって、今年度は、理論・計算系アプローチの成果をまとめて、Journal of Computer Chemistry, Japanの特集号を刊行した。国内外の研究者に対して、領域活動と研究成果に関する情報発信を行うことができた。

現在までの達成度 (段落)

平成30年度が最終年度であるため、記入しない。

今後の研究の推進方策

平成30年度が最終年度であるため、記入しない。

報告書

(1件)
  • 2018 実績報告書
  • 研究成果

    (27件)

すべて 2019 2018 その他

すべて 国際共同研究 (5件) 雑誌論文 (18件) (うち国際共著 1件、 査読あり 18件、 オープンアクセス 10件) 学会発表 (2件) (うち国際学会 2件、 招待講演 2件) 備考 (1件) 学会・シンポジウム開催 (1件)

  • [国際共同研究] National Institutes of Health/The Scripps Research/University of California(米国)

    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
  • [国際共同研究] Max Planck Institute/Free University of Berlin(ドイツ)

    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
  • [国際共同研究] National Chiao Tung University/Academia Sinica(台湾)

    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
  • [国際共同研究] Chimie Paris Teck(フランス)

    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
  • [国際共同研究] University of Cambridge/University of Edinburgh(英国)

    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
  • [雑誌論文] A Kinetics Study of Ligand Substitution Reaction on Dinuclear Platinum Complexes: Stochastic Versus Deterministic Approach2019

    • 著者名/発表者名
      T. Iioka, S. Takahashi, Y. Yoshida, Y. Matsumura, S. Hiraoka, and H. Sato
    • 雑誌名

      Journal of Computational Chemistry

      巻: 40 号: 1 ページ: 281-287

    • DOI

      10.1002/jcc.25588

    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] 常磁性NMR法と計算科学を組み合わせた糖鎖の動的コンホメーション解析2018

    • 著者名/発表者名
      矢木 宏和、加藤 晃一
    • 雑誌名

      生化学

      巻: 90 号: 2 ページ: 198-202

    • DOI

      10.14952/SEIKAGAKU.2018.900198

    • NAID

      40021617499

    • ISSN
      0037-1017
    • 年月日
      2018-04-25
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Structural insights on the dynamics of proteasome formation2018

    • 著者名/発表者名
      Kato Koichi、Satoh Tadashi
    • 雑誌名

      Biophysical Reviews

      巻: 10 号: 2 ページ: 597-604

    • DOI

      10.1007/s12551-017-0381-4

    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] 分子動力学計算とNMR計測を用いた糖鎖の配座空間探査2018

    • 著者名/発表者名
      YAMAGUCHI Takumi、WATANABE Tokio、YAGI Hirokazu、KATO Koichi
    • 雑誌名

      Journal of Computer Chemistry, Japan

      巻: 17 号: 1 ページ: 1-7

    • DOI

      10.2477/jccj.2018-0011

    • NAID

      130006528562

    • ISSN
      1347-1767, 1347-3824
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Molecular Dynamics of Gangliosides2018

    • 著者名/発表者名
      Yamaguchi Takumi、Kato Koichi
    • 雑誌名

      Gangliosides (S.Sonnino and A.Prinetti ed.), Methods in Molecular Biology, Humana Press (New York)

      巻: 1804 ページ: 411-417

    • DOI

      10.1007/978-1-4939-8552-4_20

    • ISBN
      9781493985517, 9781493985524
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] NMR Characterization of the Dynamic Conformations of Oligosaccharides2018

    • 著者名/発表者名
      Kato Koichi、Yagi Hirokazu、Yamaguchi Takumi
    • 雑誌名

      Modern Magnetic Resonance, 2nd Edition,

      巻: - ページ: 737-754

    • DOI

      10.1007/978-3-319-28388-3_35

    • ISBN
      9783319283876, 9783319283883
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Structural Aspects of ER Glycoprotein Quality-Control System Mediated by Glucose Tagging2018

    • 著者名/発表者名
      Satoh Tadashi、Kato Koichi
    • 雑誌名

      Glycobiophysics

      巻: - ページ: 149-169

    • DOI

      10.1007/978-981-13-2158-0_8

    • ISBN
      9789811321573, 9789811321580
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Structure and Dynamics of Immunoglobulin G Glycoproteins2018

    • 著者名/発表者名
      Yagi Hirokazu、Yanaka Saeko、Kato Koichi
    • 雑誌名

      Advances in experimental medicine and biology

      巻: 1104 ページ: 219-235

    • DOI

      10.1007/978-981-13-2158-0_11

    • ISBN
      9789811321573, 9789811321580
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] 集合シャペロンを介したプロテアソーム形成機構2018

    • 著者名/発表者名
      佐藤匡史,加藤晃一
    • 雑誌名

      医学のあゆみ

      巻: 276 ページ: 949-953

    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Effects of a Hydrophilic/Hydrophobic Interface on Amyloid-β Peptides Studied by Molecular Dynamics Simulations and NMR Experiments2018

    • 著者名/発表者名
      Itoh Satoru G.、Yagi-Utsumi Maho、Kato Koichi、Okumura Hisashi
    • 雑誌名

      The Journal of Physical Chemistry B

      巻: 123 号: 1 ページ: 160-169

    • DOI

      10.1021/acs.jpcb.8b11609

    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] シトクロム<i>c</i>の多量体形成に関する理論的研究2018

    • 著者名/発表者名
      根木 秀佳、吉田 紀生、廣田 俊、東 雅大
    • 雑誌名

      Journal of Computer Chemistry, Japan

      巻: 17 号: 1 ページ: 8-13

    • DOI

      10.2477/jccj.2018-0006

    • NAID

      130006528632

    • ISSN
      1347-1767, 1347-3824
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] 基板上で遊走•増殖する細胞集団のモデリング2018

    • 著者名/発表者名
      山本 量一、Molina John J.、Schneider Simon K.
    • 雑誌名

      Journal of Computer Chemistry, Japan

      巻: 17 号: 1 ページ: 14-19

    • DOI

      10.2477/jccj.2018-0003

    • NAID

      130006528633

    • ISSN
      1347-1767, 1347-3824
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] 高速原子間力顕微鏡によるタンパク質の動態可視化と画像解析2018

    • 著者名/発表者名
      内橋 貴之
    • 雑誌名

      Journal of Computer Chemistry, Japan

      巻: 17 号: 1 ページ: 20-30

    • DOI

      10.2477/jccj.2018-0001

    • NAID

      130006528631

    • ISSN
      1347-1767, 1347-3824
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] 歯車状両親媒性分子からなるナノキューブの置換基効果と溶媒効果の理論的研究2018

    • 著者名/発表者名
      増子 貴子、平岡 秀一、長嶋 雲兵、立川 仁典
    • 雑誌名

      Journal of Computer Chemistry, Japan

      巻: 17 号: 1 ページ: 31-37

    • DOI

      10.2477/jccj.2018-0010

    • NAID

      130006528560

    • ISSN
      1347-1767, 1347-3824
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] クライオ電子顕微鏡によるタンパク質の動的構造解析2018

    • 著者名/発表者名
      ソン チホン, 村田 和義
    • 雑誌名

      Journal of Computer Chemistry, Japan

      巻: 17 号: 1 ページ: 38-45

    • DOI

      10.2477/jccj.2018-0007

    • NAID

      130006549640

    • ISSN
      1347-1767, 1347-3824
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] 連続滴定X線溶液散乱測定を志向した<i>μ</i>流路型自動サンプリングシステムの開発2018

    • 著者名/発表者名
      KAMIKUBO Hironari
    • 雑誌名

      Journal of Computer Chemistry, Japan

      巻: 17 号: 1 ページ: 57-64

    • DOI

      10.2477/jccj.2018-0008

    • NAID

      130006555814

    • ISSN
      1347-1767, 1347-3824
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Classical Molecular Dynamics Simulation to Understand Role of a Zinc Ion for Aggregation of Amyloid-β Peptides2018

    • 著者名/発表者名
      Hiroaki Nishizawa and Hisashi Okumura
    • 雑誌名

      Journal of Computer Chemistry, Japan

      巻: 17 号: 1 ページ: 76-79

    • DOI

      10.2477/jccj.2018-0005

    • NAID

      130006555813

    • ISSN
      1347-1767, 1347-3824
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Basic Cell Size Dependence of Displacement for a Solvation Motor in a Lennard-Jones Solvent2018

    • 著者名/発表者名
      Tokunaga Ken, Akiyama Ryo
    • 雑誌名

      Journal of Computer Chemistry, Japan

      巻: 17 号: 1 ページ: 80-84

    • DOI

      10.2477/jccj.2018-0004

    • NAID

      130006555812

    • ISSN
      1347-1767, 1347-3824
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [学会発表] What is life? What is ExCELLS?2018

    • 著者名/発表者名
      Koichi Kato
    • 学会等名
      Frontier Bioorganization Forum 2018
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] In situ structural characterization of antibody interactions2018

    • 著者名/発表者名
      Koichi Kato
    • 学会等名
      The 18th KIAS Conference on Protein Structure and Function
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [備考] 生命分子システムにおける動的秩序形成と高次機能発現

    • URL

      http://seimei.ims.ac.jp/

    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
  • [学会・シンポジウム開催] Frontier Bioorganization Forum 2018: Dynamical ordering and integrated functions of biomolecular systems2018

    • 関連する報告書
      2018 実績報告書

URL: 

公開日: 2018-04-23   更新日: 2022-08-18  

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