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染色体オーケストレーションシステム

成果取りまとめ

研究領域染色体オーケストレーションシステム
研究課題/領域番号 20H05601
研究種目

新学術領域研究(研究領域提案型)

配分区分補助金
審査区分 生物系
研究機関東京大学

研究代表者

白髭 克彦  東京大学, 定量生命科学研究所, 教授 (90273854)

研究分担者 中川 優里  東京大学, 定量生命科学研究所, 特任助教 (80772152)
研究期間 (年度) 2020-04-01 – 2021-03-31
研究課題ステータス 完了 (2020年度)
配分額 *注記
3,900千円 (直接経費: 3,000千円、間接経費: 900千円)
2020年度: 3,900千円 (直接経費: 3,000千円、間接経費: 900千円)
キーワード染色体高次構造 / ゲノム / 染色体機能
研究開始時の研究の概要

本研究領域において、これまで異分野の研究者が十分な連携の元で研究を推進してきた。本申請では、各計画研究と公募研究の統括、評価を行うばかりでなく、本研究領域の研究成果の還元のために、環境整備、情報収集、広報活動を積極的に行なうことを目的とする。
具体的には以下の通りである。(1)成果報告書の作成、(2)最終年度シンポジウム、(3)染色体OS情報プラットフォームの公開と整備、(4)研究成果の一般社会への情報発信

研究実績の概要

本研究領域において、これまで異分野の研究者が十分な連携の元で研究を推進してきた。本課題では、各計画研究と公募研究の統括、評価を行うばかりでなく、本研究領域の研究成果の還元のために、環境整備、情報収集、広報活動を積極的に行なってきた。具体的には以下の通りである。
(1)領域のホームページに(http://www.chromosomeos.com/)は公開して、これまでの研究成果を掲載することで、広く情報共有を行った。
(2)若手のためのシンポジウム開催を行った。本領域の目玉の1つは、外国人アドバイザー(評価者; John Diffley, Frank Uhlmann, Susan Gasser, Camilla Sjogren博士)の参画である。アドバイザーの中でもFrank Uhlmann博士, Susan Gasser博士によるキャリアセミナーを今年度は2月6日、7日に開催し、 Camilla Sjogren博士によるコロナ禍によるインタビュー動画を作成し配信による開催を行った。
(3)染色体OS情報プラットフォームの整備 本プラットフォームは、各動的過程における染色体動態のデータベースとその動態を体系的に注釈、可視化するツールである。染色体OSの分子 基盤を明らかにする本プラットフォームは、基礎生物学のみならず、再生医療、疾病予測、創薬等、応用科学分野に対しても大きな波及効果を もたらすことが期待される。<HPアドレス> http://chromosomeos.bio.titech.ac.jp/top/ 汎用性の高い環境を整備し、本研究領域のさらなる発展を図ることを目的として、プラットフォームの整備と公開を行った。
(4)研究成果の一般社会への情報発信として、上述したプラットフォームの整備も含めて、研究成果については積極的な情報発信を行った。情報発信の形態としては、サイエンススクー ルを開催し、研究成果のビジュアル的なアーカイブをしたWEBサイト(https://www.chromosome-structure-archives.com/)の開設などを一般向けに行った。

現在までの達成度 (段落)

令和2年度が最終年度であるため、記入しない。

今後の研究の推進方策

令和2年度が最終年度であるため、記入しない。

報告書

(1件)
  • 2020 実績報告書
  • 研究成果

    (7件)

すべて 2022 その他

すべて 国際共同研究 (3件) 雑誌論文 (1件) (うち国際共著 1件、 査読あり 1件、 オープンアクセス 1件) 備考 (3件)

  • [国際共同研究] カロリンスカ研究所(スウェーデン)

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
  • [国際共同研究] FMI(スイス)

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
  • [国際共同研究] クリック研究所/オックスフォード大学(英国)

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
  • [雑誌論文] Cohesin-dependent chromosome loop extrusion is limited by transcription and stalled replication forks.2022

    • 著者名/発表者名
      Jeppsson K, Sakata T, Nakato R, Milanova S, Shirahige K, Bjorkegren C.
    • 雑誌名

      Sci Adv.

      巻: 8(23) 号: 23

    • DOI

      10.1126/sciadv.abn7063

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [備考] 染色体OS 領域サイト

    • URL

      http://www.chromosomeos.com/

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
  • [備考] 染色体OS Chromosome Structure Archives

    • URL

      https://www.chromosome-structure-archives.com/

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
  • [備考] 染色体OS 情報解析システム(解析パイプライン・データシェアリングシステム)

    • URL

      http://chromosomeos.bio.titech.ac.jp/top/

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書

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公開日: 2020-04-28   更新日: 2023-12-25  

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