細胞機能を司るオルガネラ・ゾーンの解読

• 研究領域: 細胞機能を司るオルガネラ・ゾーンの解読
• 研究課題/領域番号: 22H04899
• 研究種目: 新学術領域研究(研究領域提案型)
• 配分区分: 補助金
• 審査区分: 生物系
• 研究機関: 東京医科歯科大学
• 研究代表者: 清水 重臣 東京医科歯科大学, 難治疾患研究所, 教授 (70271020)
• 研究期間 (年度): 2022-04-01 – 2023-03-31
• 研究課題ステータス: 完了 (2022年度)
• 配分額: 3,900千円 (直接経費: 3,000千円、間接経費: 900千円); 2022年度: 3,900千円 (直接経費: 3,000千円、間接経費: 900千円)
• キーワード: オルガネラ / ミトコンドリア / ゴルジ体 / 小胞体

研究開始時の研究の概要

５年間の以下に示す研究成果に関して、資料を整理し、冊子体の報告書としてまとめ、国内の大学や研究機関ならびに関連する研究者に送付する予定である。即ち、（１）計画研究班および公募班の研究成果、（２）総括班による研究支援の実績と作製された研究資材のまとめ、（３）国内シンポジウムおよび国際シンポジウム、（４）共同研究、（５）若手研究支援および各班の構成員のプロモーションの状況、（６）広報およびアウトリーチ活動に関して、とりまとめを行う。

研究実績の概要

オルガネラ・ゾーン研究を継続する上で、研究者間の連携を維持すること、情報交換を行うことを目的に、オルガネラゾーンセミナーを毎月オンラインで開催し、2023年3月までに通算21回のオンラインセミナーを開催した。これを基盤として、領域内外の研究者との議論、情報の相互交換、共同研究の推進を図ることができた。
また、新型コロナ感染症の影響で前年度に開催できなかった国際シンポジウムを立教大学において開催し、オルガネラ研究の第一人者であるPietro De Camilli教授、Alissa M Weaver教授、Jaakko Saraste教授、Byung Il Lee教授、Fabien Alpy教授を含めて、約100名の国内外の研究者が参加した。同シンポジウムでは、招聘した教授からの講演を聴取するとともに、最新のオルガネラ解析技術などに関する意見交換を行い、共同研究を打ち合わせた。
さらに、各計画班、公募班の先生方からの情報提供を受けて、５年間の領域の研究を総括を行うとともに、事後評価報告書の作成を行なった。また、報告書に対するフィードバックを行い、オルガネラゾーン研究の更なる研究の進捗を図った。

現在までの達成度 (段落)

令和4年度が最終年度であるため、記入しない。

今後の研究の推進方策

令和4年度が最終年度であるため、記入しない。

研究成果

• [国際共同研究] Penn State University/Washington University/Harvard University(米国)
• [国際共同研究] Yonsei University(韓国)
• [国際共同研究] Barcelona University(スペイン)
• [雑誌論文] Absence of ULK1 decreases AMPK activity in the kidney, leading to chronic kidney disease progression (2023)
  • 著者名/発表者名: Tomoki Yanagi, Hiroaki Kikuchi, Koichiro Susa, Naohiro Takahashi, Naohiro Takahashi, Hiroki Bamba, Takefumi Suzuki, Yuta Nakano, Tamami Fujiki, Yutaro Mori, Fumiaki Ando, Shintaro Mandai, Takayasu Mori, Koh Takeuchi, Shinya Honda, Satoru Torii, Shigeomi Shimizu, Tatemitsu Rai, Shinichi Uchida, Eisei Sohara
  • 雑誌名: Genes to Cells 巻: 28 号: 1 ページ: 5-14
  • DOI: 10.1111/gtc.12989
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Nickel particles are present in Crohn's disease tissue and exacerbate intestinal inflammation in IBD susceptible mice. (2022)
  • 著者名/発表者名: Hiroki Matsuda, Yoichi Nibe-Shirakihara, Akiko Tamura, Emi Aonuma, Satoko Arakawa, Kana Otsubo, Yasuhiro Nemoto, Takashi Nagaishi, Kiichiro Tsuchiya, Shigeomi Shimizu, Averil Ma, Mamoru Watanabe, Motohiro Uo, Ryuichi Okamoto, Shigeru Oshima.
  • 雑誌名: Biochemical and Biophysical Research Communications. 巻: 592 ページ: 74-80
  • DOI: 10.1016/j.bbrc.2021.12.111
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] FLIP-based autophagy-detecting technique reveals closed autophagic compartments (2022)
  • 著者名/発表者名: Sakurai Hajime Tajima、Arakawa Satoko、Noguchi Saori、Shimizu Shigeomi
  • 雑誌名: Scientific Reports 巻: 12 号: 1 ページ: 22452-22452
  • DOI: 10.1038/s41598-022-26430-5
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Nanaomycin E inhibits NLRP3 inflammasome activation by preventing mitochondrial dysfunction (2022)
  • 著者名/発表者名: Matsui Yudai、Takemura Naoki、Shirasaki Yoshitaka、Takahama Michihiro、Noguchi Yoshihiko、Ikoma Kenta、Pan Yixi、Nishida Shuhei、Taura Manabu、Nakayama Akiyoshi、Funatsu Takashi、Misawa Takuma、Harada Yoshie、Sunazuka Toshiaki、Saitoh Tatsuya
  • 雑誌名: International Immunology 巻: 34 号: 10 ページ: 505-518
  • DOI: 10.1093/intimm/dxac028
  • 査読あり / 国際共著
• [雑誌論文] Oridonin suppresses particulate-induced NLRP3-independent IL-1α release to prevent crystallopathy in the lung. (2022)
  • 著者名/発表者名: Ikoma K, Takahama M, Kimishima A, Pan Y, Taura M, Nakayama A, Arai M, Takemura N, Saitoh T.
  • 雑誌名: Int Immunol. 巻: 34 号: 10 ページ: 493-504
  • DOI: 10.1093/intimm/dxac018
  • 査読あり / 国際共著
• [雑誌論文] Cellular ESCRT components are recruited to regulate the endocytic trafficking and RNA replication compartment assembly during classical swine fever virus infection (2022)
  • 著者名/発表者名: Liu Chun-chun、Liu Ya-yun、Zhou Jiang-fei、Chen Xi、Chen Huan、Hu Jia-huan、Chen Jing、Zhang Jin、Sun Rui-cong、Wei Jian-chao、Go Yun Young、Morita Eiji、Zhou Bin
  • 雑誌名: PLOS Pathogens 巻: 18 号: 2 ページ: 1010294-1010294
  • DOI: 10.1371/journal.ppat.1010294
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] Impact of Nuclear Envelope Stress on Physiological and Pathological Processes in Central Nervous System (2022)
  • 著者名/発表者名: Kamikawa Yasunao、Saito Atsushi、Imaizumi Kazunori
  • 雑誌名: Neurochemical Research 巻: 47 号: 9 ページ: 2478-2487
  • DOI: 10.1007/s11064-022-03608-x
• [雑誌論文] Compartmentalization of casein kinase 1 γ CSNK1G controls the intracellular trafficking of ceramide (2022)
  • 著者名/発表者名: Goto A, Sakai s, Mizuike A, Yamaji T, Hanada K
  • 雑誌名: iScience 巻: 25 号: 7 ページ: 164624-164624
  • DOI: 10.1016/j.isci.2022.104624
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Hyperosmotic Stress Induces Phosphorylation of CERT and Enhances Its Tethering Throughout the Endoplasmic Reticulum (2022)
  • 著者名/発表者名: Shimasaki K, Kumagai K, Sakai S, Yamaji T, Hanada K
  • 雑誌名: Int J Mol Sci 巻: 23 号: 7 ページ: 4025-4025
  • DOI: 10.3390/ijms23074025
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Omega-3 fatty acid epoxides produced by PAF-AH2 in mast cells regulate pulmonary vascular remodeling (2022)
  • 著者名/発表者名: Moriyama Hidenori、Endo Jin、Kataoka Masaharu、Shimanaka Yuta、Kono Nozomu、他13人、Arai Hiroyuki、Sano Motoaki
  • 雑誌名: Nature Communications 巻: 13 号: 1 ページ: 3013-3013
  • DOI: 10.1038/s41467-022-30621-z
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Role of the orphan transporter SLC35E1 in the nuclear egress of herpes simplex virus 1 (2022)
  • 著者名/発表者名: Fumio Maeda, Akihisa Kato, Kosuke Takeshima, Misato Shibazaki, Ryota Sato, Takuma Shibata, Kensuke Miyake, Hiroko Kozuka-Hata, Masaaki Oyama, Eigo Shimizu, Seiya Imoto, Satoru Miyano, Shungo Adachi, Tohru Natsume, Koh Takeuchi, Yuhei Maruzuru, Naoto Koyanagi, Jun Arii, Yasushi Kawaguchi
  • 雑誌名: Journal of Virology 巻: - 号: 10 ページ: 10-10
  • DOI: 10.1128/jvi.00306-22
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Hippo-TAZ signaling is the master regulator of the onset of triple-negative basal-like breast cancers. (2022)
  • 著者名/発表者名: Soyama H, Nishio M, Otani J, Sakuma T, Takao S, Hara S, Masuda T, Mimori K, Toyokuni S, Lydon JP, Nakao K, Nishina H, Fukumoto T, Maehama T, Suzuki A.
  • 雑誌名: Proc Natl Acad Sci U S A 巻: 119 号: 29 ページ: 1-10
  • DOI: 10.1073/pnas.2123134119
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] Compartment-specific tuning of dendritic feature selectivity by intracellular Ca ²⁺ release (2022)
  • 著者名/発表者名: O’Hare Justin K.、Gonzalez Kevin C.、Herrlinger Stephanie A.、Hirabayashi Yusuke、Hewitt Victoria L.、Blockus Heike、Szoboszlay Miklos、Rolotti Sebi V.、Geiller Tristan C.、Negrean Adrian、Chelur Vikas、Polleux Franck、Losonczy Attila
  • 雑誌名: Science 巻: 375 号: 6586 ページ: 382-382
  • DOI: 10.1126/science.abm1670
• [雑誌論文] GET pathway mediates transfer of mislocalized tail-anchored proteins from mitochondria to the ER (2022)
  • 著者名/発表者名: Matsumoto Shunsuke、Ono Suzuka、Shinoda Saori、Kakuta Chika、Okada Satoshi、Ito Takashi、Numata Tomoyuki、Endo Toshiya
  • 雑誌名: Journal of Cell Biology 巻: 221 号: 6 ページ: 202-202
  • DOI: 10.1083/jcb.202104076
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Quality-controlled ceramide-based GPI-anchored protein sorting into selective ER exit sites (2022)
  • 著者名/発表者名: Rodriguez-Gallardo Sofia、Sabido-Bozo Susana、Ikeda Atsuko、Araki Misako、Okazaki Kouta、Nakano Miyako、Aguilera-Romero Auxiliadora、Cortes-Gomez Alejandro、Lopez Sergio、Waga Miho、Nakano Akihiko、Kurokawa Kazuo、Muniz Manuel、Funato Kouichi
  • 雑誌名: Cell Reports 巻: 39 号: 5 ページ: 110768-110768
  • DOI: 10.1016/j.celrep.2022.110768
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] The TGN/EE SNARE protein SYP61 and the ubiquitin ligase ATL31 cooperatively regulate plant responses to carbon/nitrogen conditions in Arabidopsis (2022)
  • 著者名/発表者名: Yoko Hasegawa, Thais Huarancca Reyes, Tomohiro Uemura, Anirban Baral, Akari Fujimaki, Yongming Luo, Yoshie Morita, Yasushi Saeki, Shugo Maekawa, Shigetaka Yasuda, Koki Mukuta, Yoichiro Fukao, Keiji Tanaka, Akihiko Nakano, Junpei Takagi, Rishikesh P Bhalerao, Junji Yamaguchi, Takeo Sato
  • 雑誌名: THE PLANT CELL 巻: 34 号: 4 ページ: 1354-1374
  • DOI: 10.1093/plcell/koac014
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] CDP-ribitol prodrug treatment ameliorates ISPD-deficient muscular dystrophy mouse model (2022)
  • 著者名/発表者名: Tokuoka Hideki、Imae Rieko、Nakashima Hitomi、Manya Hiroshi、Masuda Chiaki、Hoshino Shunsuke、Kobayashi Kazuhiro、Lefeber Dirk J.、Matsumoto Riki、Okada Takashi、Endo Tamao、Kanagawa Motoi、Toda Tatsushi
  • 雑誌名: Nature Communications 巻: 13 号: 1 ページ: 1847-1847
  • DOI: 10.1038/s41467-022-29473-4
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] Genome-wide CRISPR screen reveals CLPTM1L as a lipid scramblase required for efficient glycosylphosphatidylinositol biosynthesis (2022)
  • 著者名/発表者名: Wang Yicheng、Menon Anant K.、Maki Yuta、Liu Yi-Shi、Iwasaki Yugo、Fujita Morihisa、Guerrero Paula A.、Silva Daniel Varon、Seeberger Peter H.、Murakami Yoshiko、Kinoshita Taroh
  • 雑誌名: Proceedings of the National Academy of Sciences 巻: 119 号: 14 ページ: 7211-7211
  • DOI: 10.1073/pnas.2115083119
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] O-GlcNAcylation Regulates β1,4-GlcNAc-branched N-glycan Biosynthesis Via the OGT/SLC35A3/GnT-IV Axis. (2022)
  • 著者名/発表者名: Song, W., Isaji, T., Nakano, M., Liang C., Fukuda, T.and Gu, J.
  • 雑誌名: FASEB J. 巻: 36 号: 2 ページ: 210-210
  • DOI: 10.1096/fj.202101520r
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [学会発表] Biological roles of GOMED (2023)
  • 著者名/発表者名: Shigeomi Shimizu
  • 学会等名: Organellar Zone International Symposium
  • 国際学会 / 招待講演
• [備考] オルガネラゾーン ホームページ
  • URL: https://www.tmd.ac.jp/organellezone/index.html
• [学会・シンポジウム開催] Organellar Zone International Symposium (2023)