生命分子システムにおける動的秩序形成と高次機能発現の研究推進のための国際活動支援

2018 年度 実績報告書

• 研究領域: 生命分子システムにおける動的秩序形成と高次機能発現
• 研究課題/領域番号: 15K21708
• 研究機関: 大学共同利用機関法人自然科学研究機構(新分野創成センター、アストロバイオロジーセンター、生命創成探究
• 研究代表者: 加藤 晃一 大学共同利用機関法人自然科学研究機構(新分野創成センター、アストロバイオロジーセンター、生命創成探究, 生命創成探究センター, 教授 (20211849)
• 研究分担者: 佐藤 啓文 京都大学, 工学研究科, 教授 (70290905) ; 平岡 秀一 東京大学, 大学院総合文化研究科, 教授 (10322538) ; 上久保 裕生 奈良先端科学技術大学院大学, 先端科学技術研究科, 教授 (20311128) ; 寺嶋 正秀 京都大学, 理学研究科, 教授 (00188674) ; 芳坂 貴弘 北陸先端科学技術大学院大学, 先端科学技術研究科, 教授 (30263619) ; 佐藤 宗太 東京大学, 大学院理学系研究科(理学部), 特任准教授 (40401129) ; 岡本 祐幸 名古屋大学, 理学研究科, 教授 (70185487) ; 稲垣 直之 奈良先端科学技術大学院大学, 先端科学技術研究科, 教授 (20223216)
• 研究期間 (年度): 2015-11-06 – 2019-03-31
• キーワード: 生命分子 / 超分子 / 動的秩序 / 高次機能 / 集合離散

研究実績の概要

本領域は領域発足当初より、分野間の垣根を超えた共同研究を推進するとともに、国内外への情報発信を広く実施してきた。本年度は、本領域の成果報告を行うとともに、引き続き海外の卓越した研究者との活発な意見交換を通じて、本領域の活動を国際的により一層進展させた。
また、共同研究のための消耗品等の購入や旅費など、国際共同研究にかかる経費の一部を国際活動支援班の経費から援助することで効果的に研究を推進し、国際的ネットワークの発展に務めた。さらに、国際共同研究を加速するための国際ワークショップを開催し、本領域の研究を海外にも波及させた。本年度はFrontier Bioorganization Forum 2018を岡崎にて主催し、日本・韓国・台湾の3国を中心に、アジアにおける研究者ネットワークの拡大および本領域の成果を広く発信することが出来た。さらに、若手による異分野融合型の国際共同研究企画としてYoung Scientists Forum 2018を開催し、若手研究者間における国際連携の強化、および若手を通じた本領域研究活動の啓発にも取り組んだ。

研究成果

• [国際共同研究] National Institutes of Health/The Scripps Research/University of California(米国)
  • 国名: 米国
  • 外国機関名: National Institutes of Health/The Scripps Research/University of California
• [国際共同研究] Max Planck Institute/Free University of Berlin(ドイツ)
  • 国名: ドイツ
  • 外国機関名: Max Planck Institute/Free University of Berlin
• [国際共同研究] National Chiao Tung University/Academia Sinica(その他の国・地域)
  • 国名: その他の国・地域
  • 外国機関名: National Chiao Tung University/Academia Sinica
• [国際共同研究] Yonsei University/Korea Institute For Advanced Study/Ewha Womans University(韓国)
  • 国名: 韓国
  • 外国機関名: Yonsei University/Korea Institute For Advanced Study/Ewha Womans University
• [国際共同研究] University of Cambridge/University of Edinburgh(英国)
  • 国名: 英国
  • 外国機関名: University of Cambridge/University of Edinburgh
• [国際共同研究]
  • 他の国数: 1
• [雑誌論文] Determination of the Structural Ensemble of the Molten Globule State of a Protein by Computer Simulations (2019)
  • 著者名/発表者名: Shimizu Masahiro、Kajikawa Yukihito、Kuwajima Kunihiro、Dobson Christopher M.、Okamoto Yuko
  • 雑誌名: Proteins: Structure, Function, and Bioinformatics 巻: - ページ: -
  • DOI: 10.1002/prot.25688
  • 査読あり / 国際共著
• [雑誌論文] Self-Assembly Processes of Octahedron-Shaped Pd6L4 Cages (2019)
  • 著者名/発表者名: Komine Shohei、Takahashi Satoshi、Kojima Tatsuo、Sato Hirofumi、Hiraoka Shuichi
  • 雑誌名: Journal of the American Chemical Society 巻: 141 ページ: 3178～3186
  • DOI: 10.1021/jacs.8b12890
  • 査読あり
• [雑誌論文] Self-assembly process of a quadruply interlocked palladium cage (2019)
  • 著者名/発表者名: Tateishi Tomoki、Yasutake Yuichi、Kojima Tatsuo、Takahashi Satoshi、Hiraoka Shuichi
  • 雑誌名: Communications Chemistry 巻: 2 ページ: 25
  • DOI: 10.1038/s42004-019-0123-6
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Temperature-controlled repeatable scrambling and induced-sorting of building blocks between cubic assemblies (2019)
  • 著者名/発表者名: Zhan Yi-Yang、Kojima Tatsuo、Ishii Kentaro、Takahashi Satoshi、Haketa Yohei、Maeda Hiromitsu、Uchiyama Susumu、Hiraoka Shuichi
  • 雑誌名: Nature Communications 巻: 10 ページ: 1440
  • DOI: 10.1038/s41467-019-09495-1
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Self-assembly processes of octahedron-shaped Pd6L12 cages (2019)
  • 著者名/発表者名: Komine Shohei、Tateishi Tomoki、Kojima Tatsuo、Nakagawa Haruna、Hayashi Yasuhiro、Takahashi Satoshi、Hiraoka Shuichi
  • 雑誌名: Dalton Transactions 巻: 48 ページ: 4139～4148
  • DOI: 10.1039/C8DT04931A
  • 査読あり
• [雑誌論文] A stochastic model study on the self-assembly process of a Pd2L4 cage consisting of rigid ditopic ligands (2019)
  • 著者名/発表者名: Takahashi Satoshi、Sasaki Yuya、Hiraoka Shuichi、Sato Hirofumi
  • 雑誌名: Physical Chemistry Chemical Physics 巻: - ページ: -
  • DOI: 10.1039/C8CP06102E
  • 査読あり
• [雑誌論文] Self-assembly Processes of Pd(II)- and Pt(II)-linked Discrete Self-assemblies Revealed by QASAP (2018)
  • 著者名/発表者名: Hiraoka Shuichi
  • 雑誌名: Israel Journal of Chemistry 巻: - ページ: -
  • DOI: 10.1002/ijch.201800073
  • 査読あり
• [雑誌論文] A kinetics study of ligand substitution reaction on dinuclear platinum complexes: Stochastic versus deterministic approach (2018)
  • 著者名/発表者名: Iioka Tatsuya、Takahashi Satoshi、Yoshida Yuichiro、Matsumura Yoshihiro、Hiraoka Shuichi、Sato Hirofumi
  • 雑誌名: Journal of Computational Chemistry 巻: 40 ページ: 279～285
  • DOI: 10.1002/jcc.25588
  • 査読あり
• [学会発表] Mechanistic insights on the dynamics of proteasome formation (2019)
  • 著者名/発表者名: Koichi Kato and Tadashi Sato
  • 学会等名: 2019 EWU-NCU joint symposium
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] What is life? What is ExCELLS? (2018)
  • 著者名/発表者名: Koichi Kato
  • 学会等名: Frontier Bioorganization Forum 2018
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] NMR characterization of conformational dynamics and molecular assemblies of proteins (2018)
  • 著者名/発表者名: Maho Yagi-Utsumi, Koichi Kato
  • 学会等名: ExCELLS Young Scientists Forum 2018
  • 国際学会
• [学会発表] KaiC ATP hydrolysis regulates KaiA-KaiC interaction through the conformational changes in its C-terminal segments in the cyanobacterial circadian clock system (2018)
  • 著者名/発表者名: Yasuhiro Yunoki, Hirokazu Yagi, Maho Yagi-Utsumi, Kentaro Ishii, Reiko Murakami, Susumu Uchiyama, Koichi Kato
  • 学会等名: ExCELLS Young Scientists Forum 2018
  • 国際学会
• [学会発表] FUT9-dependent Lewis X modification is mediated through the specific amino acid sequence of LAMP-1 (2018)
  • 著者名/発表者名: Taiki Saito, Hirokazu Yagi, Shingo Tsuge, Chu-Wei Kuo, Kay-Hooi Khoo, Koichi Kato
  • 学会等名: ExCELLS Young Scientists Forum 2018
  • 国際学会
• [学会発表] Development of high binding affinity oligosaccharide for lectin by reshaping of its conformational space (2018)
  • 著者名/発表者名: Tatsuya Suzuki, Saeko Yanaka,Tokio Watanabe, Gengwei Yan,Tadashi Satoh, Hirokazu Yagi, Takumi Yamaguchi, Koichi Kato
  • 学会等名: ExCELLS Young Scientists Forum 2018
  • 国際学会
• [学会発表] Characterization of interaction between IgG-Fc and Fc receptor glycoproteins using nuclear magnetic resonance and small-angle neutron scattering (2018)
  • 著者名/発表者名: Rina Yogo, Saeko Yanaka, Hirokazu Yagi, Rintaro Inoue, Masaaki Sugiyama, Koichi Kato
  • 学会等名: ExCELLS Young Scientists Forum 2018
  • 国際学会
• [学会発表] Native mass spectrometry: mass spectrometry for molecular complex assembled by weak interaction (2018)
  • 著者名/発表者名: Kentaro Ishii, Koichi Kato, Susumu Uchiyama
  • 学会等名: ExCELLS Young Scientists Forum 2018
  • 国際学会
• [学会発表] Application of coordination chemistry approach to structuralanalysis of carbohydrate chains of biological interest (2018)
  • 著者名/発表者名: 加藤晃一，山口拓実
  • 学会等名: 43rd International Conference on Coordination Chemistry（ICCC2018）
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] An integrative structural study of antibody (2018)
  • 著者名/発表者名: Koichi Kato
  • 学会等名: The 6th International Symposium on Drug Discovery and Design by NMR
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] In situ structural characterization of antibody interactions (2018)
  • 著者名/発表者名: Koichi Kato
  • 学会等名: KIAS Conference on Protein Structure and Function
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] Development of high-affinity glycan for lectin by reshaping of its structural dynamics (2018)
  • 著者名/発表者名: Tatsuya Suzuki, Saeko Yanaka, Tokio Watanabe, Gengwei Yan, Tadashi Satoh, Hirokazu Yagi, Takumi Yamaguchi, Koichi Kato
  • 学会等名: 2018 Japan&Korea Joint Seminars on Biomolecular Sciences
  • 国際学会
• [学会発表] Characterization of dynamics and functions of antibodies (2018)
  • 著者名/発表者名: Rina Yogo, Saeko Yanaka, Hirokazu Yagi, Rintaro Inoue, Masaaki Sugiyama, Koichi Kato
  • 学会等名: 2018 Japan&Korea Joint Seminars on Biomolecular Sciences
  • 国際学会
• [学会発表] NMR analysis of conformational dynamics of linear Lys48-linked ubiquitin chains (2018)
  • 著者名/発表者名: Methanee Hiranyakorn, Saeko Yanaka, Maho Yagi-Utsumi, Koichi Kato
  • 学会等名: 2018 Japan&Korea Joint Seminars on Biomolecular Sciences
  • 国際学会
• [学会発表] NMR analyses of conformational dynamics and molecular assemblies of amyloid-β (2018)
  • 著者名/発表者名: Maho Yagi-Utsumi, Koichi Kato
  • 学会等名: 2018 Japan&Korea Joint Seminars on Biomolecular Sciences
  • 国際学会
• [備考] 生命分子システムにおける動的秩序形成と高次機能発現
  • URL: http://seimei.ims.ac.jp/
• [学会・シンポジウム開催] Frontier Bioorganization Forum 2018: Dynamical ordering and integrated functions of biomolecular systems (2019)